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| Registros recuperados : 96 | |
| 61. |  | FACO, O.; VILLELA, L. C. V.; LOBO, R. N. B.; PEREIRA, J. A.; MUNIZ, M. M. M.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de. Estrutura populacional do Núcleo de Conservação de Ovinos da raça Somalis Brasileira da Embrapa Caprinos e Ovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 f. 1 CD-ROM. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304).| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 62. | | VILLELA, L. C. V.; FERNANDES JÚNIOR, G. A.; LOBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; CIRILO, E. F. Estrutura populacional dos Núcleos de Conservação de Caprinos das raças Canindé e Moxotó da Embrapa Caprinos e Ovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. p. 34. 1 CD-ROM. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304).| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 63. | | SANTOS, T. N. M. dos; MUNIZ, M. M. M.; MELO NETO, F. V. de O.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; VILLELA, L. C. V. Estrutura populacional do rebanho caprino da raça Anglo Nubiana da Embrapa Caprinos e Ovinos. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ, 7., 2010, Sobral. Iniciação para o semiárido: [Resumos]. Sobral: Universidade Estadual Vale do Acaraú, 2010. 1 CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 64. | | SANTOS, T. N. M. dos; MELO, F. V. de O.; MUNIZ, M. M. M.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; VILLELA, L. C. V. Estrutura populacional do rebanho caprino da raça Saanen da Embrapa Caprinos e Ovinos. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE ESTADUAL VALE DO ACARAÚ, 7., 2010, Sobral. Iniciação para o semiárido: [Resumos]. Sobral: Universidade Estadual Vale do Acaraú, 2010. 1 CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 65. | | VILLELA, L. C. V.; SCHUCH, A. C.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; KIRSCHNIK, L. N. G.; BELCHIOR, L. S.; FREITAS, L. E. L. de; MATAVELI, M. Implantação do programa de conservação de recursos genéticos de peixes nativos comerciais da Amazônia na Embrapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. p. 85.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 67. | | VILLELA, L. C. V.; KIRSCHNIK, L. N. G.; VARELA, E. S.; ROUTLEDGE, E. A. B.; REZENDE, F. P.; TORATI, L. S.; SHIOTSUKI, L.; FREITAS, L. E. L. Programa de conservação de recursos genéticos de peixes nativos de interesse econômico da Embrapa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 6., 2020. Recursos genéticos e bioeconomia: inovação para um futuro sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 69. | | ATAIDES, K. da S.; SHIOTSUKI, L.; VARELA, E. S.; KIRSCHNIK, L. N. G.; FREITAS, L. E. L. de; VILLELA, L. C. V.; REZENDE, F. P.; TORATI, L. S. Variabilidade fenotípica entre famílias de tambaqui Colossoma macropomum (Teleostei: Serrasalmidae) provenientes de diferentes regiões do Brasil. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador, BA. Anais. Salvador: SBMA, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 70. | | FACÓ, O.; LÔBO, R. N. B.; GOUVEIA, A. M. G.; GUIMARÃES, M. P. S. L. M. de P.; FONSECA, J. F. da; SANTOS, T. N. M. dos; SILVA, M. A. A. da; VILLELA, L. C. V. Breeding plan for commercial dairy goat production systems in southern Brazil. Small Ruminant Research, v. 98, n. 1/3, p. 164-169, Jun. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 71. | | VILLELA, L. C. V.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PONZETTO, J. M.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Complete mitochondrial genome from South American catfish Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmann & Eigenmann) and its impact in Siluriformes phylogenetic tree. Genetica, v. 145, n. 1, p. 51-66, Feb. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 72. | | O'SULLIVAN, F. L. A.; VARELA, E. S.; TORATI, L. S.; KIRSCHNIK, L. N. G.; REZENDE, F. P.; VILLELA, L. C. V.; ALMEIDA, C. K. L.; SENE, M. P. de. Microinjeção em ovos de tambaqui Colossoma macropomum como pré-requisito à edição genômica da espécie. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AQUICULTURA E BIOLOGIA AQUÁTICA, 10., 2023, Florianópolis. Conservar, produzir e inovar: anais eletrônicos. Florianópolis: Aquabio, 2023. Aquaciência 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 73. | | SOUSA, G. G. C. de; REZENDE, F. P.; KIRSCHNIK, L. N. G.; VILLELA, L. C. V.; FREITAS, L. E. L. de; LIMA, S. S. R.; TORATI, L. S.; VARELA, E. S.; SOUSA, A. P. S. de; SHIOTSUKI, L. Dimorfismo sexual no desempenho do tambaqui Colossoma macropomum (Teleostei: Serrasalmidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 7., 2022. Multifuncionalidade e Qualidade de Vida: [anais...]. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 74. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 75. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 76. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484.| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 77. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 78. | | VILLELA, L. C. V.; KIRSCHNIK, L. N. G.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; REZENDE, F. P.; TORATI, L. S.; SHIOTSUKI, L.; FREITAS, L. E. L. de; MATAVELI, M.; SCHUCH, A. C. Estratégias para conservação de recursos genéticos de peixes nativos de interesse econômico. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2020. 32 p. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Documentos, 40).| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 79. | | VARELA, E. S.; BEKAERT, M.; KIRSCHNIK, L. N. G.; TORATI, L. S.; SHIOTSUKI, L.; O'SULLIVAN, F. L. A.; VILLELA, L. C. V.; REZENDE, F. P.; BARROSO, A. da S.; FREITAS, L. E. L. de; TAGGART, J. B.; MIGAUD, H. A high-density linkage map and sex-linked markers for the Amazon tambaqui Colossoma macropomum. BMC Genomics, v. 22, n. 709, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 80. | | LOBO, A. M. B. O.; FACO, O.; LÔBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; VILLELA, L. C. V.; FERNANDES JÚNIOR, G. A.; SANTOS, T. N. M. dos. Desempenho na fase de cria de ovinos puros e F1's das raças Morada Nova e Somalis Brasileira. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE CAPRINOS E OVINOS DE CORTE, 4.; FEIRA NACIONAL DO AGRONEGÓCIO DA CAPRINO-OVINOCULTURA DE CORTE, 3., 2009, João Pessoa. Anais... João Pessoa: EMEPA-PB, 2009. 5 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| Registros recuperados : 96 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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Data corrente: |
23/02/2016 |
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Data da última atualização: |
23/02/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
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Afiliação: |
FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; ANDERSON LUIS ALVES, CNPASA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, UnB; NAIARA MILAGRES AUGUSTO DA SILVA, CENARGEN; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN. |
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Título: |
de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. |
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Páginas: |
não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Pôster P0231. |
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Conteúdo: |
The Tambaqui (Colossoma macropomum) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin which has historically been widely exploited by community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate, breed and raise the species in aquaculture systems has led to significant increases in production (>10-fold) over the last ten years. Current production is above 120,000 metric tons per year with a strong growth trend, making it the most important native aquaculture species in Brazil. Data for generating the draft assembly were produced from shotgun libraries with two different insert sizes and mate-paired libraries with four different sizes sequenced (2x150bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered nucleotides were sequenced which amount to 85x mean genome coverage, considering previously published information (C-value = 1,5pg = 1.467Gbp). Sequence assembly was performed with SOAPdenovo and generated 8.924 scaffolds spanning 1.54 Gbp (N50: 2,041,733bp (162 scaffolds), N90: 200,945bp (1009 scaffolds), ~500Mbp of unmapped nucleotides). Gene model prediction is underway with MAKER2 using as extrinsic evidence protein and EST data from phylogenetically related taxa. This represents the first report of a draft genome sequence for this species and will be a valuable source of information for marker detection/selection, genetic improvement, conservation and basic biology studies in this species. |
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Palavras-Chave: |
Sequência genômica. |
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Thesagro: |
Colossoma Macropomum; Tambaqui. |
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Thesaurus NAL: |
Genome assembly; Sequence analysis. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/122093/1/P0231.pdf
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Marc: |
LEADER 02353naa a2200289 a 4500
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005 2016-02-23
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aLOBO, F. P.
245 $ade novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum).$h[electronic resource]
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300 $anão paginado.
500 $aPôster P0231.
520 $aThe Tambaqui (Colossoma macropomum) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin which has historically been widely exploited by community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate, breed and raise the species in aquaculture systems has led to significant increases in production (>10-fold) over the last ten years. Current production is above 120,000 metric tons per year with a strong growth trend, making it the most important native aquaculture species in Brazil. Data for generating the draft assembly were produced from shotgun libraries with two different insert sizes and mate-paired libraries with four different sizes sequenced (2x150bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered nucleotides were sequenced which amount to 85x mean genome coverage, considering previously published information (C-value = 1,5pg = 1.467Gbp). Sequence assembly was performed with SOAPdenovo and generated 8.924 scaffolds spanning 1.54 Gbp (N50: 2,041,733bp (162 scaffolds), N90: 200,945bp (1009 scaffolds), ~500Mbp of unmapped nucleotides). Gene model prediction is underway with MAKER2 using as extrinsic evidence protein and EST data from phylogenetically related taxa. This represents the first report of a draft genome sequence for this species and will be a valuable source of information for marker detection/selection, genetic improvement, conservation and basic biology studies in this species.
650 $aGenome assembly
650 $aSequence analysis
650 $aColossoma Macropomum
650 $aTambaqui
653 $aSequência genômica
700 1 $aCINTRA, L. C.
700 1 $aVARELA, E. S.
700 1 $aALVES, A. L.
700 1 $aVILLELA, L. C. V.
700 1 $aSILVA, N. M. A. da
700 1 $aPAIVA, S. R.
700 1 $aCAETANO, A. R.
773 $tIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015.
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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