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| Registros recuperados : 232 | |
| 161. |  | RAFAEL, H. A.; SANTOS, I. F. dos; BARBOSA, T. A. N.; SANTOS, C. A. dos; SOUZA, I. R. P. de; RODRIGUES, G. T.; VILELA, M.; MENDES, S. M. Efeito da idade e da ingestão de milho Bt na sobrevivência e no período letal da lagarta-do-cartucho do milho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 25., 2014, Goiânia. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Sociedade Entomológica do Brasil, 2014. p. 815| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 162. | | VILELA, M.; SANTOS, I. F. dos; SILVA, R. L. L.; MENDES, S. M.; BARBOSA, T. A. N.; CARVALHO, S. S. de S. Efeito da infestação de Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae) na produção de sorgo sacarino. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 163. | | VILELA, M. de F.; CORREIA, J. R.; SANO, S. M.; SEVILHA, A. C.; MACHADO, C. T. de T.; FERNANDES, S. G.; CARRARA, A. A.; FRANZ, C. A. B. Mapeamento e análise da dinâmica de uso e da cobertura do solo em comunidades tradicionais do Alto Rio Pardo, Minas Gerais. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2009. 31 p. (Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa, 236)| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 164. | | PERES, A. C. J.; CASTRO, A. P. G. de; FALEIRO, F. G.; VILELA, M. S.; PIRES, M. de C.; PEIXOTO, J. R. Avaliação da resistência de genótipos de maracujazeiro azedo às doenças fúngicas, sob condições de campo. In: SIMPÓSIO MELHORAMENTO DE PLANTAS, 2016, Brasília, DF. Variabilidade genética, ferramentas e mercado: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2016. p. 43.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 165. | | VILELA, M.; MENDES, S. M.; MARUCCI, R. C.; SILVA, P. D. A da; SILVA, S.; CARVALHO, E. A. R. de; RIBEIRO, A. C. G. Bioecologia de parasitoides da broca-da-cana em sorgo sacarino. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 14., 2015, Teresópolis. [Resumos]. Londrina: Sociedade Entomológica do Brasil, 2015. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 166. | | RAGALZI, C. M.; RESENDE, R. M. S.; TORRES, F. Z. V.; VALLE, C. B. do; LIRA, E. C.; VILELA, M. de M.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; ALVES. Associação genômica ampla na seleção para resistência a Notozulia entreriana em híbridos de Brachiaria. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 26-27. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 167. | | CASTRO, A. P. G. de; PEIXOTO, J. R.; FALEIRO, F. G.; PIRES, M. de C.; VILELA, M. S.; JUNQUEIRA, N. T. V. Avaliação de progênies de maracujazeiro azedo quanto a resistência a bacteriose, sob casa de vegetação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 168. | | VILELA, M. S.; MOREIRA, H. DE S. M.; FARIAS, L. L. P. DE; NUNES, M. DE S.; PEIXOTO, J. R.; FALEIRO, F. G. Avaliação da reação de 32 progênies de maracujá-azedo à septoriose em condições de campo no Distrito Federal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: SBF, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 169. | | CAMPOS, A. V. S.; CASTRO, A. P. G. de; PEIXOTO, J. R.; FALEIRO, F. G.; PIRES, M. de C.; VILELA, M. S. Caracterização molecular de progênies de maracujazeiro azedo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 172. | | OLIVEIRA, C. M. de; FRIZZAS, M. R.; SI, S. C. S. T. da; MENDONÇA, J. S. F. de; SHIRATSUCHI, L. S.; VILELA, M. de F. Perdas provocadas por córos rizófagos em soja e milho no Cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 14., 2012, Curitiba. SEB - 40 anos de avanços da Ciência Entomológica Brasileira: anais web. Curitiba: SEB, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 173. | | SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de A.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA. R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Plant Growth Regulation, v. 83, p. 157-170, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 174. | | SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. Plant Growth Regulation, v. 83, n. 1, p. 157-170, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 176. | | PAULA-MORAES, S. V. de; CARVALHO, G. S.; RAMOS, A. K. B.; VILELA, M. de F.; VILELA, L.; AUAD, A. M.; TAKADA, S.; BARCELLOS, A. de O. Ocorrência da cigarrinha-das-pastagens Mahanarva spectabilis (Distant, 1909) em gramíneas forrageiras e sua distribuição em áreas de cerrado e na amazônia legal. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ; UFPB, 2006. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 177. | | SANTOS, L. M. D.; FERRAZ, G. A. E. S.; XAVIER, L. A. G.; MENICUCCI NETTO, P.; VILELA, M. S.; CARVALHO, M. A. de F. Imagem termográfica obtida por aeronave remotamente pilotada para análise de cafeeiros submetidos a diferentes tratamentos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 50., 2021, On-line. Anais... Campinas: SBEA, 2021. CONBEA 2021. Congresso On-line. 4 p.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 178. | | CASTRO, A. P. G. DE; FALEIRO, F. G.; CARVALHO, D. D. C.; FONSECA, K. G. DA; VILELA, M. de F.; JUNQUEIRA, N. T. V.; CARES, J. E. Genetic variability of Passiflora spp. from commercial fields in the Federal District, Brazil. Ciência Rural, Santa Maria, v. 41, n. 6, p. 996-1002, jun. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 179. | | VILELA, M.; HEBACH, F. C.; CARVALHO, E. A. R. de; MENDES, S. M.; RODRIGUES, G. T.; DIAS, A. S.; SILVA, L. O. Infestação artificial de genótipos de sorgo sacarino em campo com Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 25., 2014, Goiânia. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Sociedade Entomológica do Brasil, 2014. p. 907| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 180. | | VILELA, M. de F.; HURTADO, S. M. C.; RESENDE, A. V. de; CORAZZA, E. J.; MARCHAO, R. L.; OLIVEIRA, C. M. de; GOULART, A. M. C. Mapeamento preliminar de zonas de manejo em sistema de produção de milho-soja no Cerrado. In: INAMASU, R. Y.; NAIME, J. de M.; RESENDE, A. V. de; BASSOI, L. H.; BERNARDI, A. C. de C. (Ed.). Agricultura de precisão: um novo olhar. São Carlos: Embrapa Instrumentação, 2011. p. 189-193.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
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| Registros recuperados : 232 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
10/11/2017 |
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Data da última atualização: |
17/04/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
SALGADO, L. R.; LIMA, R.; SANTOS, B. F. dos; SHIRAKAWA, K. T.; VILELA, M. de M.; ALMEIDA, N. F.; PEREIRA, R. M.; NEPOMUCENO, A. L.; CHIARI, L. |
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Afiliação: |
LEONARDO RIPPEL SALGADO, Embrapa Beef Cattle, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; RODOLPHO LIMA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; BRUNO FERREIRA DOS SANTOS, Federal University of Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; KARINA TAMIE SHIRAKAWA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; MARIANE DE MENDONCA VILELA, CNPGC; NALVO FRANCO ALMEIDA, Federal University of Mato Grosso do Sul, Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil; RODRIGO MATHEUS PEREIRA, Federal University of Grande Dourados, Dourados, Mato Grosso do Sul, Brazil; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; LUCIMARA CHIARI, CNPGC. |
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Título: |
De novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Growth Regulation, v. 83, n. 1, p. 157-170, 2017. |
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DOI: |
10.1007/s10725-017-0291-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Acidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained, providing a reference platform for future biotechnological studies and breeding programs for this species and its close relatives. MenosAcidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Molecular markers; RNA sequencing; Urochloa genus. |
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Thesagro: |
Brachiaria Decumbens. |
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Thesaurus NAL: |
Aluminum. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/166583/1/De-novo-RNA-sequencing-and-analysis.pdf
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Marc: |
LEADER 02506naa a2200289 a 4500
001 2079489
005 2018-04-17
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s10725-017-0291-2$2DOI
100 1 $aSALGADO, L. R.
245 $aDe novo RNA sequencing and analysis of the transcriptome of signalgrass (Urochloa decumbens) roots exposed to aluminum.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aAcidic soils occupy a vast area in the world, and the aluminum (Al) in these soils can directly interact with plant cells and tissues to inhibit their growth and reduce yields. The signalgrass Urochloa decumbens cv. Basilisk (syn. Brachiaria decumbens cv. Basilisk), a widely sown tropical forage grass, is recognized for its high productivity under intensive use, vigorous growth, ease of establishment, and good forage value throughout the year, as well as its exceptional adaptation to infertile acid soils. We sequenced the transcriptome from roots of U. decumbens cv. Basilisk under two conditions, with and without Al, using Illumina paired-end sequencing technology and performed de novo assembly of those reads, which yielded 164,920 transcripts. Of these transcripts, 113,918 were assigned a putative protein function through comparisons with different gene set databases. Additionally, 13,375 simple sequence repeat (SSR) markers were identified. Digital gene expression analyses were conducted to identify 6698 differentially expressed genes between treatments, revealing a great differences in the root transcriptional landscape when exposed to aluminum. An extensive annotation of the differentially expressed genes (DEGs), made possible to identify several transcripts with putative functions correlated to aluminum exposure, most belonging to vesicle transportation, cell wall modifications and metal handling ontologies. In this work, abundant, high-quality transcripts were obtained, providing a reference platform for future biotechnological studies and breeding programs for this species and its close relatives.
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700 1 $aCHIARI, L.
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Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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