Data/hora: 21/06/2024 15:29:50

Biblioteca(s): | Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente: | 10/11/2014
Data da última atualização: | 09/01/2017
Autoria: | VIEIRA, F. D.
Afiliação: | FÁBIO DANILO VIEIRA, CNPTIA.
Título: | Modelos baseados em técnicas de mineração de dados para suporte à certificação racial de ovinos.
Ano de publicação: | 2014
Fonte/Imprenta: | 2014.
Páginas: | 88 p.
Idioma: | Português
Notas: | Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Engenharia Agrícola, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientador: Stanley Robson de Medeiros Oliveira.
Conteúdo: | Resumo: As raças de ovinos localmente adaptadas descendem de animais trazidos durante o período colonial, e durante anos foram submetidas a cruzamentos indiscriminados com raças exóticas. Estas raças de ovinos são consideradas importantes por possuírem características adaptativas às diversas condições ambientais brasileiras. Para evitar a perda deste importante material genético, a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) decidiu incluí-las no seu Programa de Pesquisa em Recursos Genéticos, armazenando-as em seus bancos de germoplasma, sendo que as que possuem maior destaque nacional são as raças Crioula, Morada Nova e Santa Inês. A seleção dos ovinos para compor estes bancos é realizada por meio da avaliação de características morfológicas e produtivas. Entretanto, essa avaliação está sujeita a falhas, pois alguns animais cruzados mantêm características semelhantes àquelas dos animais locais. Desta forma, identificar se os animais depositados nos bancos são ou não pertencentes a uma raça é uma tarefa que exige muita cautela. Em busca de soluções, nos últimos anos houve um aumento significativo no uso de tecnologias que utilizam marcadores moleculares SNP (do inglês Single Nucleotide Polimorphism). No entanto, o grande número de marcadores gerados, que pode chegar a centenas de milhares por animal, torna-se um problema crucial. Para abordar esse problema, o objetivo deste trabalho é desenvolver modelos baseados em técnicas de mineração de dados para selecionar os principais marcadores SNP para as raças Crioula, Morada Nova e Santa Inês. Os dados utilizados neste estudo foram obtidos do Consórcio Internacional de Ovinos e são compostos por 72 animais destas três raças e 49.034 marcadores SNP para cada ovino. O resultado obtido com a conclusão deste trabalho foi um conjunto de modelos preditivos baseados em técnicas de mineração de dados que selecionaram os principais marcadores SNP para identificação das raças estudadas. A partir da intersecção desses modelos identificou-se um subconjunto de 15 marcadores com maior potencial de identificação das raças. Os modelos poderão ser utilizados para certificação das raças de ovinos já depositados nos bancos de germoplasma e de novos animais a serem inclusos, além de subsidiar associações de criadores interessadas em certificar seus animais, bem como o MAPA (Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento) no controle de animais registrados. Os modelos gerados poderão ser estendidos para outras espécies animais de produção.
Palavras-Chave: | Aprendizado de máquina; Data mining; Feature selection; Machine learning; Marcadores moleculares; Microarranjo; Mineração de dados; Penalized regression; Polimorfismo de nucleotídeo único; Predictive modeling; Regressão penalizada; Seleção de atributos; Sheep breeding.
Thesagro: | Ovinocultura.
Thesaurus Nal: | Genetic markers; Microarray technology; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto: | X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/152970/1/VieiraFabioDanilo-M.pdf
Registro original: | Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Exemplares: | CNPTIA - (18030-1) - UPA - TS - PP -  -  - 2014.00003 - DIS