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1.Imagem marcado/desmarcadoVARELA, E. S.; LIMA, A.; TORATI, L.; BENTES, A. Núcleo de conservação do pirarucu (Arapaima gigas): Embrapa Pesca e Aquicultura. In: PÁDUA, J. G.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; MELLO, S. C. M. de (Ed.). Bancos e coleções de germoplasma da Embrapa: conservação e uso. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2020. p. 139. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 371).

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2.Imagem marcado/desmarcadoALVES, A. L.; VARELA, E. S.; HASHIMOTO, D. T. Genética aplicada à piscicultura. In: RODRIGUES, A. P. O.; LIMA, A. F.; ALVES, A. L.; ROSA, D. K.; TORATI, L. S.; SANTOS, V. R. V. dos (Ed.). Piscicultura de água doce: multiplicando conhecimentos. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 273-300. il.

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3.Imagem marcado/desmarcadoALVES, A. L.; VARELA, E. S.; MORO, G. V.; KIRSCHNIK, L. N. G. Riscos genéticos da produção de híbridos de peixes nativos. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2014. 58 p. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Documentos, 3).

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4.Imagem marcado/desmarcadoTORATI, L. S.; TAGGART, J. B.; VARELA, E. S.; ARARIPE, J.; WEHNER, S.; MIGAUD, H. Genetic diversity and structure in Arapaima gigas populations from Amazon and Araguaia-Tocantins river basins. BMC Genetics, v. 20, n. 13, Jan. 2019.

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5.Imagem marcado/desmarcadoIWASHITA, M. K. P.; ALVES, A. L.; MATAVELI, M.; VARELA, E. S.; KIRSCHNIK, L. N. G. Manejo sanitário para criopreservação de sêmen de reprodutores de peixes nativos. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2015. 27 p. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Documentos, 16).

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6.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, A. F.; RODRIGUES, A. P. O.; VARELA, E. S.; TORATI, L. S.; MACIEL, P. O. A produção do pirarucu em cativeiro. Aquaculture Brasil, n. 8, p. 43-49, set./out. 2017.

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7.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, A. F.; VARELA, E. S.; ALVES, R. R.; TORATI, L. S. Prospecção de medidas morfométricas do pirarucu em tamanho comercial. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA DE PESCA, 17., 2011, Belém, PA. Engenharia de pesca: construindo o desenvolvimento sustentável do setor pesqueiro nacional: [anais]. Belém, PA: AEP: FAEP, 2011.

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8.Imagem marcado/desmarcadoMATAVELI, M.; ALVES, A. L.; KIRSCHNIK, L. N. G.; MORO, G. V.; VARELA, E. S. Broodstock management: cryopreservation parameters to select native tropical fish. In: FENACAM & LACQUA/SARA (WAS)'15.; LATIN AMERICAN & CARIBBEAN AQUACULTURE 15.; SOUTH AMERICAN REGIONAL AQUACULTURE 15.; INTERNATIONAL SHRIMP FARMING SYMPOSIUM, 12.; INTERNATIONAL ACQUACULTURE TRADE SHOW, 12.; INTERNATIONAL AQUACULTURE SYMPOSIUM, 9.; TILAPIA ECONOMIC FORUM, 3., 2015, Fortaleza. Abstracts... Fortaleza: ABCC: World Aquaculture Society, 2015. p. 329.

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9.Imagem marcado/desmarcadoVARELA, E. S.; ALVES, A. L.; BARROSO, A. da S.; TARDIVO, T. F. Parentesco genético em reprodutores de tambaqui (Colossoma macropomum) baseado em marcadores de DNA: perspectivas de manejo genético na ausência de pedigree. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2015. 28 p. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 8).

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10.Imagem marcado/desmarcadoVARELA, E. S.; KIRSCHNIK, L. N. G.; BELCHIOR, L. S.; VILLELA, L. C. V. Núcleos de conservação de peixes. In: MAUÉS, M. do S.; IANELLA, P. (Ed.). Inventário de recursos genéticos animais da Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 85-91. il.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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11.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, A. F.; RODRIGUES, A. P. O.; VARELA, E. S.; TORATI, L. S.; MACIEL, P. O. Pirarucu culture in the Brazilian Amazon: fledgling industry faces technological issues. Global Aquaculture Advocate, Missouri, 2015.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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12.Imagem marcado/desmarcadoHASHIMOTO, D. T.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; MORO, G. V. Genética na piscicultura: marcação e coleta de amostras para análise de DNA. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, [2012]. 1 Folder.

Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Unidades Centrais.

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13.Imagem marcado/desmarcadoIANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Tambaqui (Colossoma macropomum) single nucleotide polymorphism discovery by reduced representation library deep sequencing. In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Aquaculture: the big choice! abstracts. [S.l.: s.n.], 2019. p. 491.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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14.Imagem marcado/desmarcadoIANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Tambaqui (Colossoma macropomum) single nucleotide polymorphism discovery by reduced representation library deep sequencing. In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Abstracts. [S.l.]: Word Aquaculture society, 2019.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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15.Imagem marcado/desmarcadoNOGUEIRA, F.; RÊGO, P. S. do; QUEIROZ, H.; VENERE, P.; VARELA, E. S.; SAMPAIO, I.; SCHNEIDER, H.; ARARIPE, J. Genetic diversity and structuring in the arapaima (Osteoglossiformes, Osteoglossidae) population reveal differences between the Amazon and the Tocantins-Araguaia basins. Anais da Academia Brasileira de Ciências, v. 92, n. 1, e20180496, mar. 2020.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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16.Imagem marcado/desmarcadoPRYSTHON, A.; BERGAMIN, G. T.; VARELA, E. S.; PEDROZA FILHO, M. X.; TORATI, L. S.; LUCHIARI JUNIOR, A. An interdisciplinary evaluation of the best management practices in aquaculture in Tocantins State, Brazil: preliminary results and trends. In: WORLD AQUACULTURE, 2011. Abstract... Natal: World Aquaculture Society, 2011.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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17.Imagem marcado/desmarcadoMORO, G. V.; REZENDE, F. P.; ALVES, A. L.; HASHIMOTO, D. T.; VARELA, E. S.; TORATI, L. S. Espécies de peixe para piscicultura. In: RODRIGUES, A. P. O.; LIMA, A. F.; ALVES, A. L.; ROSA, D. K.; TORATI, L. S.; SANTOS, V. R. V. dos (Ed.). Piscicultura de água doce: multiplicando conhecimentos. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 29-70. il.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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18.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, A. R. B. de; MARTINS JUNIOR, H.; ALVES, A. R.; ARARIPE, J.; OLIVEIRA, N. F. A.; VARELA, E. S. Diversidade e parentesco genético em piracurus (Arapaima gigas) de cativeiro do baixo Amazônas: bases para implantação de um núcleo de conservação in situ. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. p. 63.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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19.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, A. R. B. de; MARTINS JUNIOR, H.; ALVES, A. R.; ARARIPE, J.; OLIVEIRA, N. F. A.; VARELA, E. S. Diversidade e parentesco genético em piracurus (Arapaima gigas) de cativeiro do baixo Amazônas: bases para implantação de um núcleo de conservação in situ. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.

Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.

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20.Imagem marcado/desmarcadoMELO, M. A. D.; SILVA, A. R. B da; VARELA, E. S.; SAMPAIO, I.; TAGLIARO, C. H. Development and characterization of ten microsatellite markers for population studies of the native Brazilian oyster Crassostrea gasar. Conservation Genetics Resources, v. 4, n. 3, p. 583-586, Sept. 2012.

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Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  10/04/2015
Data da última atualização:  21/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.
Afiliação:  FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; ANDERSON LUIS ALVES, CNPASA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, UnB; NAIARA MILAGRES AUGUSTO DA SILVA, CENARGEN; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN.
Título:  de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum).
Ano de publicação:  2015
Fonte/Imprenta:  In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015.
Páginas:  não paginado.
Idioma:  Inglês
Notas:  PAG 2015. Pôster P0231.
Conteúdo:  The Tambaqui (Colossoma macropomum) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin which has historically been widely exploited by community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate, breed and raise the species in aquaculture systems has led to significant increases in production (>10-fold) over the last ten years. Current production is above 120,000 metric tons per year with a strong growth trend, making it the most important native aquaculture species in Brazil. Data for generating the draft assembly were produced from shotgun libraries with two different insert sizes and mate-paired libraries with four different sizes sequenced (2x150bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered nucleotides were sequenced which amount to 85x mean genome coverage, considering previously published information (C-value = 1,5pg = 1.467Gbp). Sequence assembly was performed with SOAPdenovo and generated 8.924 scaffolds spanning 1.54 Gbp (N50: 2,041,733bp (162 scaffolds), N90: 200,945bp (1009 scaffolds), ~500Mbp of unmapped nucleotides). Gene model prediction is underway with MAKER2 using as extrinsic evidence protein and EST data from phylogenetically related taxa. This represents the first report of a draft genome sequence for this species and will be a valuable source of information for marker detection/selection, genetic improvement, conservation and basic biology studies in this species.
Palavras-Chave:  Sequência genômica.
Thesagro:  Colossoma Macropomum; Tambaqui.
Thesaurus NAL:  Genome assembly; Sequence analysis.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/122093/1/P0231.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA18374 - 1UPCRA - DD
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