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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrossilvipastoril. |
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Data corrente: |
11/05/2020 |
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Data da última atualização: |
06/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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Autoria: |
TIAGO, A. V.; ROSSI, A. A. B.; PEDRI, E. C. M. de; ROSSI, F. S.; ROCHA, V. D. da; LIMA, J. A.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; SANTOS, L. L. dos; CARDOSO, E. dos S.; SOUZA, S. A. M. |
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Afiliação: |
AUANA VICENTE TIAGO, UNEMAT, Alta Floresta-MT; ANA APARECIDA BANDINI ROSSI, UNEMAT, Alta Floresta-MT; ELIANE CRISTINA MORENO DE PEDRI, UNEMAT, Alta Floersta-MT; FERNANDO SARAGOSA ROSSI, UNEMAT, Alta Floresta-MT; VINICIUS DELGADO DA ROCHA, UFV, Viçosa-MG; JOAMESON ANTUNES LIMA, UNEMAT, Alta Floresta-MT; EULALIA SOLER SOBREIRA HOOGERHEIDE, CPAMT; LARISSA LEMES DOS SANTOS, UNEMAT, Alta Floresta-MT; ELISA DOS SANTOS CARDOSO, UNEMAT, Alta Floresta-MT; SÉRGIO ALESSANDRO MACHADO SOUZA, UNEMAT, Alta Floresta-MT. |
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Título: |
Estrutura genética de mandiocas cultivadas na amazônia norte mato-grossense. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
In: OLIVEIRA JUNIOR, J. M. B. de; CALVÃO, L. B. (Org.). Ciências biológicas: campo promissor em pesquisa 3. Ponta Grosso, PR: Atena, 2020. v. 3. Cap. 14. p. 169-179. |
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DOI: |
http://doi.org/10.22533/at.ed.25720160114 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os marcadores genéticos têm aplicação importante na caracterização da diversidade dos recursos genéticos, pois permitem quantificar a diversidade genética, estimar a endogamia e caracterizar novas espécies. Portanto, o objetivo deste estudo foi avaliar a estrutura genética de etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Alta Floresta, MT, por meio de marcadores microssatélites. Um total de 29 etnovariedades de mandioca foram coletadas. A extração do DNA seguiu protocolo de CTAB. As reações de amplificação foram realizadas com 15 primers SSR marcados com fluorescência. Os dados obtidos foram analisados pelo programa Structure e GenAIEx. O número mais provável de grupos que contribuíram para a composição genética dos cultivos de mandioca foi verificado pelo ΔK, indicando a formação de dois grupos genéticos distintos entre as etnovariedades. A análise de variância molecular (AMOVA) revelou 99% de variação dentro dos grupos obtidos com a análise do Structure (K1 e K2). A baixa variação entre os grupos (1%) também ser confirmada pelo Fst, com valor de 0,009. A análise de Coordenadas Principais (PCoA) contribuiu com os resultados encontrados na análise de estrutura populacional. A PCoA1 explicou 8,13% da variação genética, seguido da PCoA2 com 6,38%. Juntas explicaram 14,51% da variação genética. As etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Alta Floresta, Mato Grosso apresentam estruturação genética. Há variabilidade genética intragrupos, indicando que as etnovariedades cultivadas em roças constituem uma forma de recurso genético que deve ser conservada, pois apresentam potencial para serem utilizadas em programas de melhoramento. MenosOs marcadores genéticos têm aplicação importante na caracterização da diversidade dos recursos genéticos, pois permitem quantificar a diversidade genética, estimar a endogamia e caracterizar novas espécies. Portanto, o objetivo deste estudo foi avaliar a estrutura genética de etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Alta Floresta, MT, por meio de marcadores microssatélites. Um total de 29 etnovariedades de mandioca foram coletadas. A extração do DNA seguiu protocolo de CTAB. As reações de amplificação foram realizadas com 15 primers SSR marcados com fluorescência. Os dados obtidos foram analisados pelo programa Structure e GenAIEx. O número mais provável de grupos que contribuíram para a composição genética dos cultivos de mandioca foi verificado pelo ΔK, indicando a formação de dois grupos genéticos distintos entre as etnovariedades. A análise de variância molecular (AMOVA) revelou 99% de variação dentro dos grupos obtidos com a análise do Structure (K1 e K2). A baixa variação entre os grupos (1%) também ser confirmada pelo Fst, com valor de 0,009. A análise de Coordenadas Principais (PCoA) contribuiu com os resultados encontrados na análise de estrutura populacional. A PCoA1 explicou 8,13% da variação genética, seguido da PCoA2 com 6,38%. Juntas explicaram 14,51% da variação genética. As etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Alta Floresta, Mato Grosso apresentam estruturação genética. Há variabilidade genética intragrupos, indicando que as... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Alta Floresta-MT; Mato Grosso; Microssatelite. |
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Thesagro: |
Manihot Esculenta; Recurso Genético. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic resources. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/212848/1/2020-eulalia-hoogerheida-estrutura-genetica-mandioca-amazonia-norte-mato-grossense.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrossilvipastoril (CPAMT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/04/2010 |
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Data da última atualização: |
16/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
GIBBS, R. A.; TAYLOR, J. F.; VAN TASSELL, C. P.; BARENDSE, W.; EVERSOLE, K. A.; GILL, C. A.; GREEN, R. D.; HAMERNIK, D. L.; KAPPES, S. M.; LIEN, S.; MATUKUMALLI, L. K.; MCEWAN, J. C.; NAZARETH, L. V.; SCHNABEL, R. D.; WEINSTOCK, G. M.; WHEELER, D. A.; AJMONE-MARSAN, P.; BOETTCHER, P. J.; CAETANO, A. R.; GARCIA, J. F.; HANOTTE, O.; MARIANI, P.; SKOW, L. C.; SONSTEGARD, T. S.; WILLIAMS, J. L.; DIALLO, B.; HAILEMARIAM, L.; MARTINEZ, M. L.; MORRIS, C. A.; SILVA, L. O. C. da; SPELMAN, R. J.; MULATU, W.; ZHAO, K.; ABBEY, C. A.; AGABA, M.; ARAUJO, F. R.; BUNCH, R. J.; BURTON, J.; GORNI, C.; OLIVIER, H.; HARRISON, B. E.; LUFF, B.; MACHADO, M. A.; MWAKAYA, J.; PLASTOW, G.; SIM, W.; SMITH, T.; THOMAZ, M. B.; VALENTINI, A.; WILLIAMS, P.; WOMACK, J.; WOOLLIAMS, J. A.; LIU, Y.; QIN, X.; WORLEY, K. C.; GAO, C.; JIANG, H.; MOORE, S. S.; REN, Y.; SONG, X.-Z.; BUSTAMANTE, C. D.; HERNANDEZ, R. D.; MUZNY, D. M.; PATIL, S.; SAN LUCAS, A.; FU, Q.; KENT, M. P.; VEGA, R.; MATUKUMALLI, A.; MCWILLIAM, S.; SCLEP, G.; BRYC, K.; CHOI, J.; GAO, H.; GREFENSTETTE, J. J.; MURDOCH, B.; STELLA, A.; VILLA-ANGULO, R.; WRIGHT, M.; AERTS, J.; JANN, O.; NEGRINI, R.; GODDARD, M. E.; HAYES, B. J.; BRADLEY, D. G.; SILVA, M. V. G. B.; LAU, L. P. L.; LIU, G. E.; LYNN, D. J.; PANZITTA, F.; DODDS, K. G. |
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Afiliação: |
RICHARD A. GIBBS; JEREMY F. TAYLOR; CURTIS P. VAN TASSELL; WILLIAM BARENDSE; KELLYE A. EVERSOLE; CLARE A. GILL; RONNIE D. GREEN; DEBORA L. HAMERNIK; STEVEN M. KAPPES; SIGBJØRN LIEN; LAKSHMI K. MATUKUMALLI; JOHN C. MCEWAN; LYNNE V. NAZARETH; ROBERT D. SCHNABEL; GEORGE M. WEINSTOCK; DAVID A. WHEELER; PAOLO AJMONE-MARSAN; PAUL J. BOETTCHER; ALEXANDRE R. CAETANO; JOSE FERNANDO GARCIA; OLIVIER HANOTTE; PAOLA MARIANI; LOREN C. SKOW; TAD S. SONSTEGARD; JOHN L. WILLIAMS; BOUBACAR DIALLO; LEMECHA HAILEMARIAM; MARIO L MARTINEZ; CHRIS A MORRIS; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; RICHARD J SPELMAN; WOUDYALEW MULATU; KEYAN ZHAO; COLETTE A ABBEY; MORRIS AGABA; FLABIO RIBEIRO DE ARAUJO, CNPGC; ROWAN J BUNCH; JAMES BURTON; CHIARA GORNI; HANOTTE OLIVIER; BLAIR E HARRISON; BILL LUFF; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOEL MWAKAYA; GRAHAM PLASTOW; WARREN SIM; TIMOTHY SMITH; MERLE B THOMAS; ALESSIO VALENTINI; PAUL WILLIAMS; JAMES WOMACK; JOHN A WOOLLIAMS; YUE LIU; XIANG QIN; KIM C WORLEY; CHUAN GAO; HUAIYANG JIANG; STEPHEN S. MOORE; YANRU REN; XING-ZHI SONG; CARLOS D. BUSTAMANTE; RYAN D. HERNANDEZ; DONNA M. MUZNY; SHOBHA PATIL; ANTHONY SAN LUCAS; QING FU; MATTHEW P. KENT; RICHARD VEGA; ARUNA MATUKUMALLI; SEAN MCWILLIAM; GERT SCLEP; KATARZYNA BRYC; JUNGWOO CHOI; HONG GAO; JOHN J. GREFENSTETTE; BRENDA MURDOCH; ALESSANDRA STELLA; RAFAEL VILLA-ANGULO; MARK WRIGHT; JAN AERTS; OLIVER JANN; RICCARDO NEGRINI; MIKE E. GODDARD; BEN J. HAYES; DANIEL G. BRADLEY; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; LILIAN P. L. LAU; GEORGE E. LIU; DAVID J. LYNN; FRANCESCA PANZITTA; KEN G. DODDS. |
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Título: |
Genome-wide survey of SNP variation uncovers the genetic structure of cattle breeds. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Science, v. 324, n. 5926, p. 528-532, 2009. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The imprints of domestication and breed development on the genomes of livestock likely differ from those of companion animals. A deep draft sequence assembly of shotgun reads from a single Hereford female and comparative sequences sampled from six additional breeds were used to develop probes to interrogate 37,470 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 497 cattle from 19 geographically and biologically diverse breeds. These data show that cattle have undergone a rapid recent decrease in effective population size from a very large ancestral population, possibly due to bottlenecks associated with domestication, selection, and breed formation. Domestication and artificial selection appear to have left detectable signatures of selection within the cattle genome, yet the current levels of diversity within breeds are at least as great as exists within humans. |
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Thesagro: |
Genoma; Melhoramento Genético Animal. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711673/1/Genome-Wide-survey-of-SNP-variation-uncovers-the-genetic-structure-of-cattle-breeds.pdf
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Marc: |
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520 $aThe imprints of domestication and breed development on the genomes of livestock likely differ from those of companion animals. A deep draft sequence assembly of shotgun reads from a single Hereford female and comparative sequences sampled from six additional breeds were used to develop probes to interrogate 37,470 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in 497 cattle from 19 geographically and biologically diverse breeds. These data show that cattle have undergone a rapid recent decrease in effective population size from a very large ancestral population, possibly due to bottlenecks associated with domestication, selection, and breed formation. Domestication and artificial selection appear to have left detectable signatures of selection within the cattle genome, yet the current levels of diversity within breeds are at least as great as exists within humans.
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Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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