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| Registros recuperados : 665 | |
| 581. |  | MATEUS, R. G.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; JANK, L.; SANTOS, M. F.; DIAS, A. M.; MARTINS, L. B. Seleção de híbridos superiores de Brachiaria decumbens para caracteres agronômicos do Programa de Melhoramento da Embrapa Gado de Corte. In: WORKSHOP MELHORAMENTO VEGETAL: CONTRIBUIÇÕES, AVANÇOS E PERSPECTIVAS PARA O CERRADO BRASILEIRO, 2., 2016. Anais... Campo Grande, MS: SBMP, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 582. | | QUEIROZ JÚNIOR, J. M.; BARRIOS, S. C. L.; MATEUS, R. G.; SANTOS, I. C. dos; GONÇALVES, T. D.; GOMES, L. L.; VALLE, C. B. do. Seleção de híbridos superiores de Brachiaria decumbens para caracteres agronômicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro: resumos das palestras. p. 633| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 583. | | FERREIRA, R. C. U.; RESENDE, R. M. S.; ASSIS, G. M. L. de; VALENTIM, J. F.; JANK, L.; VALLE, C. B. do. Seleção de amendoim forrageiro para cultivo em Mato Grosso do Sul. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE,5., 2009, Campo Grande, MS. [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 584. | | ALMEIDA, M. C. C.; CHIARI, L.; GALVÃO, A. R. T.; ZORZATTO, C.; VALLE, C. B. do; LEGUIZAMON, G. O. de C. Seleção assistida por marcadores moleculares para apomixia em híbridos de Braquiaria humidicola. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. 2 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 585. | | VIGNA, B. B. Z.; JUNGMANN, L.; VALLE, C. B. do; FEIJO, G. L. D.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. Segregation rates in a F1 population of the hexaploid Brachiaria humidicola. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON THE MOLECULAR BREEDING OF FORAGE AND TURF: MBFT, 2010, 6., 2010, Buenos Aires. [Resumos...]. Buenos Aires: Ediciones INTA, 2010. 128 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 586. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; LEGUIZÁMON, G. O. de C.; JANK, L.; RESENDE, R. M. S.; PAGLIARINI, M. S. Search of RAPD molecular markers linked to apomixis in Brachiaria humidicola. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE REPRODUÇÃO SEXUAL EM PLANTAS, 20., 2008, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 240 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 259). Capa e conteúdo em inglês. Título em inglês: XX International Congress on Sexual Plant Reproduction. p. 211-213 CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 587. | | VALERIO, J. R.; VALLE, C. B. do; CHERMOUTH, k. da S.; SOUZA, M. S. de; PISTORI, M. G. B.; OLIVEIRA, M. da C. M. Selection of Brachiaria hybrids presenting antibiosis to the pasture spittlebug Notozulia entreriana (Berg)(Hemiptera: Cercopidae). In:SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE MELHORAMENTO DE FORRAGEIRAS, 2., 2009, Campo Grande, MS. [Anais]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. II SIMF. Comitê editorial: Liana Jank; Lucimara Chiari; Rosângela Maria Simeão Resende. 3 p. 1 CD-ROM. Resumo M25.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 589. | | RESENDE, R. M. S.; RESENDE, M. D. V. de; VALLE, C. B. do; JANK, L.; TORRES JÚNIOR, R. A. de A.; CANÇADO, L. J. Selection efficiency in Brachiaria hybrids using a posteriori blocking. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, MG, v. 7, p. 296-303, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 590. | | PEREIRA, A. V.; SOUZA SOBRINHO, F. de; VALLE, C. B. do; LEDO, F. J. da S.; BOTREL, M. de A.; OLIVEIRA, J. da S. e; XAVIER, D. F. Selection of interspecific Brachiaria hybrids to intensify milk production on pastures. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 5, n. 1, p. 99-104, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Gado de Leite. |
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| 593. | | DÉO, T. G.; CHIARI, L.; VILELA, M. de M.; SANTOS, M. F.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; JANK, L. Validação de um gene candidato ligado à apomixia em uma população segregante de Brachiaria decumbens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro: resumos das palestras. p. 635| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 594. | | SILVEIRA, E. S.; SANTOS, M. F.; CARROMEU, C.; JANK, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; SIMEÃO, R. M. Utilização de drone com diferentes Ground Sample Distance para obtenção de dados fenotípicos de forrageiras. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 15., 2019, Campo Grande, MS. [Resumos dos trabalhos...]. Brasília, DF: Embrapa, 2019 80 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 264). Comitê Organizador: Marlene de Barros Coelho; Lenita Ramires dos Santos; Rodrigo Carvalho Alva; Lucimara Chiari; Thais Basso Amaral. 30-31| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 595. | | EUCLIDES, V. P. B.; MACEDO, M. C. M.; VALLE, C. B. do; DIFANTE, G. dos S.; BARBOSA, R. A.; CACERE, E. R. Valor nutritivo da forragem e produção animal em pastagens de Brachiaria brizantha. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 44, n.1, p. 98-106, jan. 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 596. | | ZORZATTO, C.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; MELLO, M. V. de; FARIA, M. A. de; ROCHA, M. da; LEGUIZÁMON, G. O. C. Variabilidade genética de acessos de Brachiaria dictyoneura utilizando RAPD. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 2., 2006, Campo Grande, MS. Anais [da]... 2. ed. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2006. 1 p. 1 CD-ROM. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 597. | | SALGADO, L. R.; CHIARI, L.; VALLE, C. B. do; CANCADO, L. J.; VALLE, J. V. R. DO; LEGUIZAMON, G. O. de C. Variabilidade genética de acessos de Brachiaria humidicola utilizando a técnica de RAPD. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 1., 2005, Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2005. 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 598. | | SILVEIRA, M. C. T. da; NASCIMENTO JUNIOR, D. do; SILVA, S. C. da; EUCLIDES, V. P. B.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; VALLE, C. B. do. Variáveis morfogênicas e estruturais passíveis de incorporação no atual protocolo de avaliação e seleção de cultivares de gramíneas tropicais. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. O avanço científico e tecnológico na produção animal: anais. Jaboticabal: Sociedade Brasileira de Zootecnia: UNESP, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, 2007. 3 p. 1 CD-ROM. Forragicultura. E583. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 599. | | BARBOSA-FERREIRA, M; VALLE, C. B. do; BRUM, K. B.; OLIVEIRA, N. M. R.; FERREIRA, V. B. N.; GARCEZ, V. S.; RIET-CORREA, F.; LEMOS, R. A. A. de. Antinutritional factors in plants. Steroidal saponin (Protodioscin) in Brachiraria spp. Preliminary data. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forages for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal production: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 1 CD-ROM. III SIMF. p 322-332. 11 p. 1 CD-ROM III SIMF| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 600. | | MATIAS, F. I.; BARRIOS, S. C. L.; BEARARI, L. M.; MEIRELES, K. G. X.; MATEUS, R. G.; AMARAL, P. N. C. do; ALVES, G. F.; VALLE, C. B. do; FRITSCHE-NETO, R. Contribution of Additive and Dominance Effects on Agronomical and Nutritional Traits, and Multivariate Selection on Urochloa spp. Hybrids. Crop Science, v. 58, n. 6, p. 2444-2458, November/December, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Registros recuperados : 665 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
07/12/2021 |
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Data da última atualização: |
20/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
MARTINS, F. B.; MORAES, A. C. L.; AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; CHIARI, L.; SIMEÃO, R. M.; BARRIOS, S. C. L.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, A. P. DE. |
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Afiliação: |
FELIPE BITENCOURT MARTINS, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; ALINE COSTA LIMA MORAES, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; ALEXANDRE HILD AONO, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; REBECCA CAROLINE ULBRICHT FERREIRA, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; ROSANGELA MARIA SIMEAO, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; MATEUS FIGUEIREDO SANTOS, CNPGC; LIANA JANK, CNPGC; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; BIANCA BACCILI ZANOTTO VIGNA, CPPSE; ANETE PEREIRA DE SOUZA, Center for Molecular Biology and Genetic Engineering; UNICAMP. |
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Título: |
A semi-automated SNP-based approach for contaminant identification in biparental Polyploid Populations of tropical forage grasses. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v.12, article 737919, 2021. |
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Páginas: |
19 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3389/fpls.2021.737919 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Artificial hybridization plays a fundamental role in plant breeding programs since it generates new genotypic combinations that can result in desirable phenotypes. Depending on the species and mode of reproduction, controlled crosses may be challenging, and contaminating individuals can be introduced accidentally. In this context, the identification of such contaminants is important to avoid compromising further selection cycles, as well as genetic and genomic studies. The main objective of this work was to propose an automated multivariate methodology for the detection and classification of putative contaminants, including apomictic clones (ACs), self-fertilized individuals, half-siblings (HSs), and full contaminants (FCs), in biparental polyploid progenies of tropical forage grasses. We established a pipeline to identify contaminants in genotyping-by-sequencing (GBS) data encoded as allele dosages of single nucleotide polymorphism (SNP) markers by integrating principal component analysis (PCA), genotypic analysis (GA) measures based on Mendelian segregation, and clustering analysis (CA). The combination of these methods allowed for the correct identification of all contaminants in all simulated progenies and the detection of putative contaminants in three real progenies of tropical forage grasses, providing an easy and promising methodology for the identification of contaminants in biparental progenies of tetraploid and hexaploid species. The proposed pipeline was made available through the polyCID Shiny app and can be easily coupled with traditional genetic approaches, such as linkage map construction, thereby increasing the efficiency of breeding programs. MenosArtificial hybridization plays a fundamental role in plant breeding programs since it generates new genotypic combinations that can result in desirable phenotypes. Depending on the species and mode of reproduction, controlled crosses may be challenging, and contaminating individuals can be introduced accidentally. In this context, the identification of such contaminants is important to avoid compromising further selection cycles, as well as genetic and genomic studies. The main objective of this work was to propose an automated multivariate methodology for the detection and classification of putative contaminants, including apomictic clones (ACs), self-fertilized individuals, half-siblings (HSs), and full contaminants (FCs), in biparental polyploid progenies of tropical forage grasses. We established a pipeline to identify contaminants in genotyping-by-sequencing (GBS) data encoded as allele dosages of single nucleotide polymorphism (SNP) markers by integrating principal component analysis (PCA), genotypic analysis (GA) measures based on Mendelian segregation, and clustering analysis (CA). The combination of these methods allowed for the correct identification of all contaminants in all simulated progenies and the detection of putative contaminants in three real progenies of tropical forage grasses, providing an easy and promising methodology for the identification of contaminants in biparental progenies of tetraploid and hexaploid species. The proposed pipeline was made ava... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Allele dosage; Apomictic clones; Clustering analysis; GBS; Half sibling; Self fertilization; Shiny. |
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Thesaurus NAL: |
Principal component analysis. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/228605/1/SemiAutomatedSNP.pdf
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Marc: |
LEADER 02794naa a2200373 a 4500
001 2138071
005 2021-12-20
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.3389/fpls.2021.737919$2DOI
100 1 $aMARTINS, F. B.
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260 $c2021
300 $a19 p.
520 $aArtificial hybridization plays a fundamental role in plant breeding programs since it generates new genotypic combinations that can result in desirable phenotypes. Depending on the species and mode of reproduction, controlled crosses may be challenging, and contaminating individuals can be introduced accidentally. In this context, the identification of such contaminants is important to avoid compromising further selection cycles, as well as genetic and genomic studies. The main objective of this work was to propose an automated multivariate methodology for the detection and classification of putative contaminants, including apomictic clones (ACs), self-fertilized individuals, half-siblings (HSs), and full contaminants (FCs), in biparental polyploid progenies of tropical forage grasses. We established a pipeline to identify contaminants in genotyping-by-sequencing (GBS) data encoded as allele dosages of single nucleotide polymorphism (SNP) markers by integrating principal component analysis (PCA), genotypic analysis (GA) measures based on Mendelian segregation, and clustering analysis (CA). The combination of these methods allowed for the correct identification of all contaminants in all simulated progenies and the detection of putative contaminants in three real progenies of tropical forage grasses, providing an easy and promising methodology for the identification of contaminants in biparental progenies of tetraploid and hexaploid species. The proposed pipeline was made available through the polyCID Shiny app and can be easily coupled with traditional genetic approaches, such as linkage map construction, thereby increasing the efficiency of breeding programs.
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700 1 $aSOUZA, A. P. DE
773 $tFrontiers in Plant Science$gv.12, article 737919, 2021.
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Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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