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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
02/01/2014 |
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Data da última atualização: |
22/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; MCMANUS, C. M.; CARNEIRO, P. L.; FACO, O.; SOUZA, C. J. H.; PAIVA, S. R. |
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Afiliação: |
FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; CONCEPTA M. MCMANUS, UFRGS; PAULO LUIS CARNEIRO, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia; OLIVARDO FACO, CNPC; CARLOS J. H. SOUZA, USDA ARS BARC; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen. |
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Título: |
Genetic origin of Brazilian local adapted sheep (Ovis aries) breeds by complete mitochondrial genome data analysis. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Pôster P620. |
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Conteúdo: |
The origin and domestication footprints present in contemporary domestic sheep breeds are of fundamental importance to provide insights regarding the identification of major genetic pools and breeds of importance for conservation. To infer the origin of locally adapted Brazilian sheep, the complete mitochondrial sequence of six animals from three main breeds (Morada Nova, Santa Ines and Brazilian Creole) were assembled from data generated by the International Sheep Genome Consortium. Paired-end DNA sequences (100bp) were generated using a HiSeq2000 platform from shotgun libraries to a depth of genome coverage averaging 12X. mtDNA sequences were identified, aligned and assembled with the Burrows-Wheeler Alignment Tool, using NC_001941 as reference (coverage ranged from 400 to 800X per individual). An additional set of 16 complete mitochondrial genomes available at NCBI (HM236174 to HM236189) was used in the phylogenetic analysis. Consensus sequences were initially processed with the CSA software (Cyclic DNA Sequence Aligner) to rotate them to a common homologous region. Resulting sequences were aligned with prank, using default parameters for DNA sequences, trimmed and cleaned of gaps with Gblocks. Processed sequences were analyzed with Phylyp (1000 bootstraps) and Consence was used to generate a consensus tree from bootstrap results. Phy-fi online tool was used to draw the consensus tree. Obtained results confirm that all Brazilian sheep belong to the B Haplogroup (Europe). Further analyses are underway using mtDNA data generated by the Sheep Hapmap Consortium from a total of 80 animals representing 42 breeds from different regions of the world, to better evaluate the genetic relationship of Brazilian breeds with animals from Europe and Africa. MenosThe origin and domestication footprints present in contemporary domestic sheep breeds are of fundamental importance to provide insights regarding the identification of major genetic pools and breeds of importance for conservation. To infer the origin of locally adapted Brazilian sheep, the complete mitochondrial sequence of six animals from three main breeds (Morada Nova, Santa Ines and Brazilian Creole) were assembled from data generated by the International Sheep Genome Consortium. Paired-end DNA sequences (100bp) were generated using a HiSeq2000 platform from shotgun libraries to a depth of genome coverage averaging 12X. mtDNA sequences were identified, aligned and assembled with the Burrows-Wheeler Alignment Tool, using NC_001941 as reference (coverage ranged from 400 to 800X per individual). An additional set of 16 complete mitochondrial genomes available at NCBI (HM236174 to HM236189) was used in the phylogenetic analysis. Consensus sequences were initially processed with the CSA software (Cyclic DNA Sequence Aligner) to rotate them to a common homologous region. Resulting sequences were aligned with prank, using default parameters for DNA sequences, trimmed and cleaned of gaps with Gblocks. Processed sequences were analyzed with Phylyp (1000 bootstraps) and Consence was used to generate a consensus tree from bootstrap results. Phy-fi online tool was used to draw the consensus tree. Obtained results confirm that all Brazilian sheep belong to the B Haplogroup (Europe). ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Gene mapping; Genomes; Genômica; Mapeamento de genoma; Mitochondrial genetics; Sequência de DNA. |
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Thesagro: |
Ovelha; Ovino; Recurso genético. |
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Thesaurus Nal: |
Genomics; Mitochondrial DNA; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94597/1/P0620.odt
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
16/10/2008 |
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Data da última atualização: |
27/07/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
FRANCHINI, J. C.; SICHIERI, F. R.; TORRES, E. |
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Afiliação: |
Julio Cezar Franchini, CNPSo; Fernando Ribeiro Sichieri Estância JAE Santo Inácio- PR; Eleno Torres, CNPSo. |
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Título: |
Desenvolvimento do sistema radicular de forrageiras e da soja em sistemas de integração lavoura-pecuária no arenito paranaense. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva. PDF 931_2. |
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Conteúdo: |
Esse trabalho teve como objetivo avaliar o desenvolvimento radicular de espécies forrageiras e da soja semeada em sucessão, a produção de massa seca das forrageiras no momento da semeadura da soja e seus reflexos na produtividade da soja em sistemas de integração lavoura-pecuária, no Arenito Caiuá. O sistema com Panicum maximum + Brachiaria ruzizienses se destacou tanto, pela produção de massa seca da parte aérea quanto pelo desenvolvimento radicular. O sistema radicular nesse tratamento apresentou área radicular e comprimento de raízes, 30% e 23%, respectivamente, maior do que a média dos demais tratamentos. Da mesma forma, a massa seca na semeadura da soja foi de 7365 kg/ha superando em 11% a média dos demais tratamentos. A soja, por outro lado, apresentou maior área radicular e comprimento de raízes, 30% e 39%, respectivamente, no tratamento com B. ruzizienses, apenas. Acompanhando o desenvolvimento radicular, a soja apresentou nesse tratamento, produtividade de 3426 kg/ha, 11% maior do que a media dos demais tratamentos. Os resultados indicam que apesar da maior produção de forragem e raízes no sistema P. maximum + B. ruzizienses a presença de apenas B. ruzizienses foi mais favorável ao desenvolvimento radicular e produtividade da soja. As interações entre forrageiras tropicais e a soja em sistemas de integração lavoura-pecuária vão além das quantidades de material vegetal produzido, indicando sinergismo entre espécies, no caso da soja e B. ruzizienses. |
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Palavras-Chave: |
Soybean. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aEsse trabalho teve como objetivo avaliar o desenvolvimento radicular de espécies forrageiras e da soja semeada em sucessão, a produção de massa seca das forrageiras no momento da semeadura da soja e seus reflexos na produtividade da soja em sistemas de integração lavoura-pecuária, no Arenito Caiuá. O sistema com Panicum maximum + Brachiaria ruzizienses se destacou tanto, pela produção de massa seca da parte aérea quanto pelo desenvolvimento radicular. O sistema radicular nesse tratamento apresentou área radicular e comprimento de raízes, 30% e 23%, respectivamente, maior do que a média dos demais tratamentos. Da mesma forma, a massa seca na semeadura da soja foi de 7365 kg/ha superando em 11% a média dos demais tratamentos. A soja, por outro lado, apresentou maior área radicular e comprimento de raízes, 30% e 39%, respectivamente, no tratamento com B. ruzizienses, apenas. Acompanhando o desenvolvimento radicular, a soja apresentou nesse tratamento, produtividade de 3426 kg/ha, 11% maior do que a media dos demais tratamentos. Os resultados indicam que apesar da maior produção de forragem e raízes no sistema P. maximum + B. ruzizienses a presença de apenas B. ruzizienses foi mais favorável ao desenvolvimento radicular e produtividade da soja. As interações entre forrageiras tropicais e a soja em sistemas de integração lavoura-pecuária vão além das quantidades de material vegetal produzido, indicando sinergismo entre espécies, no caso da soja e B. ruzizienses.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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