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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
10/11/2010 |
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Data da última atualização: |
15/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MEGETO, G. A. S.; MEIRA, C. A. A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MASSRUHÁ, S. M. F. S.; GODOY, C. V.; DEL PONTE, E. M. |
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Afiliação: |
GUILHERME A. S. MEGETO, Feagri/Unicamp; CARLOS ALBERTO ALVES MEIRA, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; SILVIA MARIA FONSECA SILVEIRA MASSRUHÁ, CNPTIA; CLAUDIA VIEIRA GODOY, CNPSO; EMERSON M. DEL PONTE, UFRGS. |
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Título: |
Mineração de dados para modelagem e estimativas de risco de epidemias da ferrugem asiática da soja. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP DE EPIDEMIOLOGIA DE DOENÇAS DE PLANTAS, 3., 2010, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2010. |
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Páginas: |
p. 71. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo. |
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Conteúdo: |
A proposta do trabalho é utilizar um processo de mineração de dados (data mining) em informações sobre relatos da dispersão da ferrugem asiática da soja e condições meteorológicas para extrair conhecimentos e identificar fatores que influenciam no risco de estabelecimento das epidemias. Este experimento, em caráter preliminar, teve como base a informação de que a precipitação pluvial é variável chave para as epidemias (Del Ponte et al, 2006). O objetivo foi analisar a estrutura preditiva de um modelo obtido de árvore de decisão, usando variáveis climáticas, para verificar a importância de cada atributo e possibilitar novas direções para futuros experimentos. |
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Palavras-Chave: |
Data mining; Ferrugem asiática da soja; Mineração de dados; Modelagem. |
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Thesaurus Nal: |
Models. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
11/03/2010 |
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Data da última atualização: |
04/05/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; MELLO, S. S.; IBELLI, A. M. G.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
GISELE B. VENERONI, UFSCar, SÃO CARLOS, SP; SARAH L. MEIRELLES, UFSCar, SÃO CARLOS, SP; S. S. MELLO, UNICEP/SÃO CARLOS, SP; ADRIANA M. G. IBELLI, UFSCar, SÃO CARLOS, SP; HENRIQUE N. OLIVEIRA, UNESP/BOTUCATU; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Teste de associação de um SNP do gene IGFBP3 com espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses em bovinos da raça Canchim. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza: Rede Genômica Animal, 2009 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A raça Canchim tem possui pouca gordura de cobertura o que limita o valor da carcaça produzida. O cromossomo 4 já foi associado com deposição de gordura em bovinos. O gene IGFBP3 foi relacionado ao metabolismo de gorduras e encontra-se no cromomosso 4. Este trabalho objetivou identificar polimorfismos no gene IGFBP3, investigar associação desses SNPs com espessura de gordura, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de bovinos da raça Canchim. Um total de 647 animais, compreendendo machos e fêmeas, nascidos de 2003 a 2006, criados em regime de pastagem em oito fazendas localizadas nos estados de SP e GO, foi avaliado para espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de idade. Para a identificação dos SNPS foram calculados os valores genéticos de 113 touros, pais dos animais avaliados para espessura de gordura. Procedeu-se a escolha de 6 touros com maior valor genético e maior acurácia e 6 touros com menor valor genético e maior acurácia para espessura de gordura subcutânea. O DNA desses 12 touros foi utilizado em reações de sequenciamento envolvendo os exons do gene. Identificação de SNPs em indivíduos heterozigotos foi realizada utilizando os programas Phred, Phrap e Consed. O programa BioEdit que usa o algorítmo do programa ClustalW foi utilizado para identificar SNPs entre homozigotos para diferentes alelos de um dado SNP. Os SNPs presentes em exons foram avaliados quanto a alteração de aminoácidos na proteína. Para selecionar o SNP a ser testado na população de 647 animais, um teste exato de Fisher foi aplicado para verificar se houve predominância do alelo de um SNP em algum dos extremos de valor genético para espessura de gordura subcutânea. Associações entre os genótipos do marcador e medidas de espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses foram analisadas com um modelo animal, usando o método de máxima verossimilhança restrita. Foram identificados 9 SNPs no gene IGFBP3, estando 6 contidos em exons. Nenhum dos SNPs apresentaram valor significativo no teste exato de Fisher. Os SNPs contidos no exon 4, no exon 5 e exon 7 provocaram alteração de aminoácidos na proteína sendo assim, o SNP IGBP3_c.4394T>C(p.Trp416Arg contido no exon 4 do gene IGBP3 foi testado em uma população de 647 animais da raça Canchim e não apresentou efeito significativo sobre a variação das características na população em estudo. MenosA raça Canchim tem possui pouca gordura de cobertura o que limita o valor da carcaça produzida. O cromossomo 4 já foi associado com deposição de gordura em bovinos. O gene IGFBP3 foi relacionado ao metabolismo de gorduras e encontra-se no cromomosso 4. Este trabalho objetivou identificar polimorfismos no gene IGFBP3, investigar associação desses SNPs com espessura de gordura, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de bovinos da raça Canchim. Um total de 647 animais, compreendendo machos e fêmeas, nascidos de 2003 a 2006, criados em regime de pastagem em oito fazendas localizadas nos estados de SP e GO, foi avaliado para espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de idade. Para a identificação dos SNPS foram calculados os valores genéticos de 113 touros, pais dos animais avaliados para espessura de gordura. Procedeu-se a escolha de 6 touros com maior valor genético e maior acurácia e 6 touros com menor valor genético e maior acurácia para espessura de gordura subcutânea. O DNA desses 12 touros foi utilizado em reações de sequenciamento envolvendo os exons do gene. Identificação de SNPs em indivíduos heterozigotos foi realizada utilizando os programas Phred, Phrap e Consed. O programa BioEdit que usa o algorítmo do programa ClustalW foi utilizado para identificar SNPs entre homozigotos para diferentes alelos de um dado SNP. Os SNPs presentes em exons foram avaliados quanto a alteração de aminoácidos na proteína. Para selecionar o SNP a ser te... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Raça Canchim; SNP. |
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Thesagro: |
Gado de corte. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38071/1/PROCI-2009.00371.pdf
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Marc: |
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520 $aA raça Canchim tem possui pouca gordura de cobertura o que limita o valor da carcaça produzida. O cromossomo 4 já foi associado com deposição de gordura em bovinos. O gene IGFBP3 foi relacionado ao metabolismo de gorduras e encontra-se no cromomosso 4. Este trabalho objetivou identificar polimorfismos no gene IGFBP3, investigar associação desses SNPs com espessura de gordura, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de bovinos da raça Canchim. Um total de 647 animais, compreendendo machos e fêmeas, nascidos de 2003 a 2006, criados em regime de pastagem em oito fazendas localizadas nos estados de SP e GO, foi avaliado para espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses de idade. Para a identificação dos SNPS foram calculados os valores genéticos de 113 touros, pais dos animais avaliados para espessura de gordura. Procedeu-se a escolha de 6 touros com maior valor genético e maior acurácia e 6 touros com menor valor genético e maior acurácia para espessura de gordura subcutânea. O DNA desses 12 touros foi utilizado em reações de sequenciamento envolvendo os exons do gene. Identificação de SNPs em indivíduos heterozigotos foi realizada utilizando os programas Phred, Phrap e Consed. O programa BioEdit que usa o algorítmo do programa ClustalW foi utilizado para identificar SNPs entre homozigotos para diferentes alelos de um dado SNP. Os SNPs presentes em exons foram avaliados quanto a alteração de aminoácidos na proteína. Para selecionar o SNP a ser testado na população de 647 animais, um teste exato de Fisher foi aplicado para verificar se houve predominância do alelo de um SNP em algum dos extremos de valor genético para espessura de gordura subcutânea. Associações entre os genótipos do marcador e medidas de espessura de gordura subcutânea, área de olho de lombo e peso aos 18 meses foram analisadas com um modelo animal, usando o método de máxima verossimilhança restrita. Foram identificados 9 SNPs no gene IGFBP3, estando 6 contidos em exons. Nenhum dos SNPs apresentaram valor significativo no teste exato de Fisher. Os SNPs contidos no exon 4, no exon 5 e exon 7 provocaram alteração de aminoácidos na proteína sendo assim, o SNP IGBP3_c.4394T>C(p.Trp416Arg contido no exon 4 do gene IGBP3 foi testado em uma população de 647 animais da raça Canchim e não apresentou efeito significativo sobre a variação das características na população em estudo.
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Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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