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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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Data corrente: |
23/02/2016 |
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Data da última atualização: |
23/02/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
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Afiliação: |
FRANCISCO PEREIRA LOBO, CNPTIA; LEANDRO CARRIJO CINTRA, CNPTIA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; ANDERSON LUIS ALVES, CNPASA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, UnB; NAIARA MILAGRES AUGUSTO DA SILVA, CENARGEN; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN. |
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Título: |
de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. |
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Páginas: |
não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Pôster P0231. |
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Conteúdo: |
The Tambaqui (Colossoma macropomum) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin which has historically been widely exploited by community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate, breed and raise the species in aquaculture systems has led to significant increases in production (>10-fold) over the last ten years. Current production is above 120,000 metric tons per year with a strong growth trend, making it the most important native aquaculture species in Brazil. Data for generating the draft assembly were produced from shotgun libraries with two different insert sizes and mate-paired libraries with four different sizes sequenced (2x150bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered nucleotides were sequenced which amount to 85x mean genome coverage, considering previously published information (C-value = 1,5pg = 1.467Gbp). Sequence assembly was performed with SOAPdenovo and generated 8.924 scaffolds spanning 1.54 Gbp (N50: 2,041,733bp (162 scaffolds), N90: 200,945bp (1009 scaffolds), ~500Mbp of unmapped nucleotides). Gene model prediction is underway with MAKER2 using as extrinsic evidence protein and EST data from phylogenetically related taxa. This represents the first report of a draft genome sequence for this species and will be a valuable source of information for marker detection/selection, genetic improvement, conservation and basic biology studies in this species. |
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Palavras-Chave: |
Sequência genômica. |
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Thesagro: |
Colossoma Macropomum; Tambaqui. |
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Thesaurus Nal: |
Genome assembly; Sequence analysis. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/122093/1/P0231.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
04/12/2009 |
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Data da última atualização: |
30/09/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
Nacional - B |
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Autoria: |
SOUZA, L. A. de; LEMOS, W. de P. |
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Afiliação: |
LINDAUREA ALVES DE SOUZA, CPATU; WALKYMARIO DE PAULO LEMOS, CPATU. |
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Título: |
Prospecção de insetos associados ao açaizeiro (Euterpe oleracea Mart.) em viveiro e proposições de controle. |
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Ano de publicação: |
2004 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista de Ciências Agrárias, Belém, n. 42, p. 231-241, jul./dez. 2004. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Durante um ano, vinte e cinco acessos de açaizeiro (Euterpe oleracea Mart.), pertencentes ao banco de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, foram avaliados em viveiro para se identificar os organismos-praga associados a essa palmácea. As pragas detectadas foram classificadas em três categorias: insetos-praga principais, insetos-praga secundários e outros organismos-praga, de acordo com a importância (potencialidade de causar danos) e freqüência ao longo dos meses amostrados. Os principais insetos-praga do açaizeiro, em viveiros, foram: o pulgão-preto-do-coqueiro [Cerataphis lataniae Boisuval (Hemiptera: Aphididae)]; a mosca-branca [Aleurodicus cocois (Curtis) (Hemiptera: Aleyrodidae)] e as saúvas [Atta spp. (Hymenoptera: Formicidae)]. Os insetos-praga secundários associados ao açaizeiro foram: a cochonilha vírgula [Metilococcus bechii (Newman) (Hemiptera: Diaspididae)]; a mosca-branca [Aleurothrixus floccosus (Mask.) (Hemiptera: Aleyrodidae)] e o gafanhoto [Eutropidacris cristata L. (Orthoptera: Acrididae)]. Além desses insetos, caracóis e lesmas também podem ser considerados organismos com potencialidade de se tornarem pragas do açaizeiro por raspar o limbo dos folíolos mais jovens, danificando-os. Proposições de controle, para cada espécie com potencialidade de danificar o açaizeiro, são apresentadas e discutidas. |
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Palavras-Chave: |
Classes de pragas. |
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Thesagro: |
Açaí; Euterpe Oleracea. |
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Thesaurus NAL: |
Insecta. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38695/1/revista-de-ciencias-agrarias42-231-241.pdf
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Marc: |
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520 $aDurante um ano, vinte e cinco acessos de açaizeiro (Euterpe oleracea Mart.), pertencentes ao banco de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, foram avaliados em viveiro para se identificar os organismos-praga associados a essa palmácea. As pragas detectadas foram classificadas em três categorias: insetos-praga principais, insetos-praga secundários e outros organismos-praga, de acordo com a importância (potencialidade de causar danos) e freqüência ao longo dos meses amostrados. Os principais insetos-praga do açaizeiro, em viveiros, foram: o pulgão-preto-do-coqueiro [Cerataphis lataniae Boisuval (Hemiptera: Aphididae)]; a mosca-branca [Aleurodicus cocois (Curtis) (Hemiptera: Aleyrodidae)] e as saúvas [Atta spp. (Hymenoptera: Formicidae)]. Os insetos-praga secundários associados ao açaizeiro foram: a cochonilha vírgula [Metilococcus bechii (Newman) (Hemiptera: Diaspididae)]; a mosca-branca [Aleurothrixus floccosus (Mask.) (Hemiptera: Aleyrodidae)] e o gafanhoto [Eutropidacris cristata L. (Orthoptera: Acrididae)]. Além desses insetos, caracóis e lesmas também podem ser considerados organismos com potencialidade de se tornarem pragas do açaizeiro por raspar o limbo dos folíolos mais jovens, danificando-os. Proposições de controle, para cada espécie com potencialidade de danificar o açaizeiro, são apresentadas e discutidas.
650 $aInsecta
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653 $aClasses de pragas
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773 $tRevista de Ciências Agrárias, Belém$gn. 42, p. 231-241, jul./dez. 2004.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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