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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
27/09/2023 |
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Data da última atualização: |
27/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, I. P. de; AZEVEDO, B. R. de; COELHO, A. S. G.; SOUZA, T. L. P. O. de; VALDISSER, P. A. M. R.; GOMES-MESSIAS, L. M.; FUNICHELI, B. W.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
ISABELA PAVANELLI DE SOUZA, bolsista CNPAF; BEATRIZ ROSA DE AZEVEDO, bolsista CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; THIAGO LIVIO PESSOA OLIV DE SOUZA, CNPAF; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; LUCAS MATIAS GOMES-MESSIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; BRENO OSVALDO FUNICHELI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Whole-genome resequencing of common bean elite breeding lines. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, 12721, 2023. |
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ISSN: |
2045-2322 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39399-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The expansion of bean genome technologies has prompted new perspectives on generating resources and knowledge essential to research and implementing biotechnological tools for the practical operations of plant breeding programs. This study aimed to resequence the entire genome (whole genome sequencing?WGS) of 40 bean genotypes selected based on their significance in breeding programs worldwide, with the objective of generating an extensive database for the identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs). Over 6 million SNPs were identified, distributed across the 11 bean chromosomes. After quality variant filtering, 420,509 high-quality SNPs were established, with an average of 38,228 SNPs per chromosome. These variants were categorized based on their predicted effects, revealing that the majority exerted a modifier impact on non-coding genome regions (94.68%). Notably, a significant proportion of SNPs occurred in intergenic regions (62.89%) and at least one SNP was identified in 58.63% of the genes annotated in the bean genome. Of particular interest, 7841 SNPs were identified in 85% of the putative plant disease defense-related genes, presenting a valuable resource for crop breeding efforts. These findings provide a foundation for the development of innovative and broadly applicable technologies for the routine selection of superior genotypes in global bean improvement and germplasm characterization programs. |
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Thesagro: |
Feijão; Genoma; Melhoramento. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Breeding; Breeding lines; Genome; Genotype; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1156925/1/sr-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Meio Ambiente. Para informações adicionais entre em contato com cnpma.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
11/10/2017 |
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Data da última atualização: |
11/10/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
WEBER, O. B.; SOUZA, C. C. M. de; GONDIN, D. M. F.; TERAO, D.; CORREIA, D. |
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Afiliação: |
OLMAR BALLER WEBER, CNPAT; C. C. M. de SOUZA. |
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Título: |
Contribuição de bactérias diazotróficas na produção do abacaxizeiro Cayenne champac. |
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Ano de publicação: |
2003 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE INTERAMERICANA DE HORTICULTURA TROPICAL, 49., Fortaleza, 2003. Anais... Fortaleza: ABH, 2003. p.142 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de bactérias diazotróficas no desempenho do abacaxizeiro Cayenne Champac, utilizando mudas micropropagadas. O experimento em parcelas subdivididas, instalado em área irrigada de um Argissolo no Município de Pacajús, CE, consistiu de duas doses de N (300 e 180 kg.ha-1.ano-1) e três condições para as mudas (inoculadas de bactérias relacionada a Burkholderia cepacia, AB213, e Asaia bogorensis, AB219, e plantas controles, sem inoculação bacteriana), com três repetições e 15 plantas úteis na subparcela. As mudas, após o enraizamento in vitro, receberam suspensões de 108 células bacterianas e foram aclimatadas, durante cinco meses, em tubetes na casa de vegetação. Após isso, elas foram transferidas para pequenas covas no campo, no espaçamento de 0,3 x 0,3 m. A adubação de base consistiu na aplicação de superfosfato triplo (80 kg.ha-1.ano-1 de P2O5) e micronutrientes (100 kg.ha-1.ano-1 de FTE-BR12). As doses de uréia como fonte de N e de cloreto de potássio (400 kg.ha-1.ano-1 de K2O) foram fracionadas em quatro aplicações ao ano. As plantas adubadas com a maior dose de N apresentaram melhor desempenho e a colheita dos abacaxis começou após 15 meses do plantio. Nessa parcela, plantas colonizadas pelo isolado AB219 apresentaram os maiores abacaxis, pesando 1,968kg. Este peso superou em 10,8 % o das plantas colonizadas pelo AB202 e em 17,2 % o das plantas controles, utilizando a mesma adubação. Os resultados permitem sugerir que mudas micropropagadas do abacaxizeiro Cayenne Champac têm melhor desempenho no campo quando colonizadas por bactérias diazotróficas. MenosO objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de bactérias diazotróficas no desempenho do abacaxizeiro Cayenne Champac, utilizando mudas micropropagadas. O experimento em parcelas subdivididas, instalado em área irrigada de um Argissolo no Município de Pacajús, CE, consistiu de duas doses de N (300 e 180 kg.ha-1.ano-1) e três condições para as mudas (inoculadas de bactérias relacionada a Burkholderia cepacia, AB213, e Asaia bogorensis, AB219, e plantas controles, sem inoculação bacteriana), com três repetições e 15 plantas úteis na subparcela. As mudas, após o enraizamento in vitro, receberam suspensões de 108 células bacterianas e foram aclimatadas, durante cinco meses, em tubetes na casa de vegetação. Após isso, elas foram transferidas para pequenas covas no campo, no espaçamento de 0,3 x 0,3 m. A adubação de base consistiu na aplicação de superfosfato triplo (80 kg.ha-1.ano-1 de P2O5) e micronutrientes (100 kg.ha-1.ano-1 de FTE-BR12). As doses de uréia como fonte de N e de cloreto de potássio (400 kg.ha-1.ano-1 de K2O) foram fracionadas em quatro aplicações ao ano. As plantas adubadas com a maior dose de N apresentaram melhor desempenho e a colheita dos abacaxis começou após 15 meses do plantio. Nessa parcela, plantas colonizadas pelo isolado AB219 apresentaram os maiores abacaxis, pesando 1,968kg. Este peso superou em 10,8 % o das plantas colonizadas pelo AB202 e em 17,2 % o das plantas controles, utilizando a mesma adubação. Os resultados permitem sugerir que mudas mic... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Abacaxi; Bactéria. |
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Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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