Data/hora: 22/09/2024 22:54:10

Biblioteca(s): 	Embrapa Café.	
Data corrente: 	26/10/2011	
Data da última atualização: 	07/10/2014	
Autoria: 	CAÇÃO, S. M. B.; SILVA, N. V.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.	
Afiliação: 	SANDRA MARIA BELLODI CAÇÃO, INCT/Café; NATHÁLIA VOLPI SILVA, CAPES; LUIZ GONZAGA ESTEVES VIEIRA, LBI-IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.	
Título: 	Identificação de clones BAC com marcadores moleculares visando a integração de mapas físicos e genéticos.	
Ano de publicação: 	2011	
Fonte/Imprenta: 	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.	
Idioma: 	Português	
Conteúdo: 	Bibliotecas BAC (Cromossomo Artificial de Bactéria) têm sido muito utilizadas para suporte de trabalhos de mapeamento físico, clonagem posicional, mapeamento comparativo e estudos de evolução de genomas. Visando realizar o mapeamento físico em Coffea arabica, iniciamos a identificação e caracterização de clones BAC de uma biblioteca de C. arabica hibrido timor 832/2. A biblioteca contém 56.832 clones BACs com tamanho médio de 120 Kb, representando uma cobertura de 5,5 vezes o tamanho do genoma do C. arabica. Os clones da biblioteca BAC foram inicialmente agrupados em pools de placa com 384 clones, e superpools contendo 15 pools de placa o que representa 5.760 clones. A identificação do BAC de interesse foi realizada através da seleção por PCR nos superpools e pools, seguida por hibridização em filtros de colônia contendo 384 clones. Para a seleção dos superpools e pools de placas foram utilizados os primers baseados em AFLPs relacionados com lócus de resistência à ferrugem (M-8, SAT-244 e BA-124). Também foram utilizados os marcadores SSR-18 (GL1), SSR-16 (GL2), ACGG-1 (GL3), CCG-3 (GL6), de quatro grupos de ligação do mapa genético parcial de C. arabica (Oliveira et al, 2007) visando identificar e posicionar BAC para cada grupo de ligação. Os BAC selecionados nas hibridizações foram confirmados através de extração individual do clones, seguida por PCR para checar a marca de interesse. Até o momento foram identificados 32 clones BAC para as marcas de resistência a ferrugem e 98 para os 4 grupos de ligação. Os BAC selecionados serão sequenciados para o mapeamento físico da região contendo lócus de resistência à ferrugem.	
Palavras-Chave: 	Cromossomo artificial de bactéria; Mapeamento.	
Thesagro: 	Ferrugem.	
Categoria do assunto: 	--	
URL: 	http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/44611/1/Identificacao-de-clones-BAC.pdf	
Registro original: 	Embrapa Café (CNPCa)	
Exemplares: 	CNPCa - (367-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS