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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Café. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
09/01/2023 |
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Data da última atualização: |
09/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, L. de F.; ALKIMIM, E. R.; BARREIRO, P. R. R. M.; LEICHTWEIS, B. G.; SILVA, A. C. A.; SILVA, R. A. da; SOUSA, T. V.; NASCIMENTO, M.; CAIXETA, E. T. |
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Afiliação: |
LETÍCIA DE FARIA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; EMILLY RUAS ALKIMIM, UNIVERSIDADE FEDERAL TRIÂNGULO MINEIRO; PEDRO RICARDO ROSSI MARQUES BARREIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; BRUNO GRESPAN LEICHTWEIS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; ANA CAROLINA ANDRADE SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; RUANE ALICE DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; TIAGO VIEIRA SOUSA, INSTITUTO FEDERAL DO TRIÂNGULO MINEIRO; MOYSÉS NASCIMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa. |
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Título: |
Genome-wide association study of plant architecture and diseases resistance in Coffea canephora. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Euphytica, v. 218, jun. 2022. |
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Páginas: |
13 p. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genome wide association studies (GWAS) have been traditionally used for the identification and comprehension of loci associate with phenotypic variation and identification of markers useful in genetic breeding programs. The GWAS was used in this work to identify chromosomal regions with significant associations with the main agronomic trait of Coffea canephora. The studied population comprised 165 clones of the two varietal groups Conilon and Robusta and intervarietal hybrids from crosses between these groups. Coffee trees were genotyped using 17 885 single nucleotide polymorphisms (SNP) markers distributed throughout the genome and phenotyped with eight morpho agronomic traits. Significant SNPs were found associated with plant height, diameter of the canopy projection, vegetative vigor, rust incidence, and cercosporiosis incidence. SNP marker distribution was quite uniform, with few gaps in the centromeric regions, with 27.72% and 9.09% present in intergenic and coding regions, respectively; the latter led to 70% amino acid exchanges and 30% silent mutations. Candidate genes, in which SNP markers were inserted, were identified and their function was related to traits of plant architecture and coffee diseases resistance. SNPs with significant associations were found in all chromosomes of the species, especially in chromosomes 0, 2, 6, 9, and 11. This methodology was efficient in C. canephora populations and helped identify several SNPs in candidate genes involved in important biological processes of coffee. Therefore, these SNPs can be used as strategies to accelerate the coffee breeding program through molecular marker assisted selection. MenosGenome wide association studies (GWAS) have been traditionally used for the identification and comprehension of loci associate with phenotypic variation and identification of markers useful in genetic breeding programs. The GWAS was used in this work to identify chromosomal regions with significant associations with the main agronomic trait of Coffea canephora. The studied population comprised 165 clones of the two varietal groups Conilon and Robusta and intervarietal hybrids from crosses between these groups. Coffee trees were genotyped using 17 885 single nucleotide polymorphisms (SNP) markers distributed throughout the genome and phenotyped with eight morpho agronomic traits. Significant SNPs were found associated with plant height, diameter of the canopy projection, vegetative vigor, rust incidence, and cercosporiosis incidence. SNP marker distribution was quite uniform, with few gaps in the centromeric regions, with 27.72% and 9.09% present in intergenic and coding regions, respectively; the latter led to 70% amino acid exchanges and 30% silent mutations. Candidate genes, in which SNP markers were inserted, were identified and their function was related to traits of plant architecture and coffee diseases resistance. SNPs with significant associations were found in all chromosomes of the species, especially in chromosomes 0, 2, 6, 9, and 11. This methodology was efficient in C. canephora populations and helped identify several SNPs in candidate genes involved in importan... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Canephora. |
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Thesaurus Nal: |
Disease resistance; Phenotypic variation; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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001 2150796
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
22/08/2000 |
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Data da última atualização: |
04/04/2012 |
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Autoria: |
PIPOLO, A. E.; DOMIT, L. A.; SILVA FILHO, P. M. da; MIRANDA, L. C.; KIIHL, R. A. de S.; ALMEIDA, L. A. de; VIEIRA, O. V. |
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Título: |
Difusao de cultivares de soja desenvolvidas pela Embrapa Soja, para os estados do Parana, Santa Catarina e Sao Paulo - safra 1998/99. |
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Ano de publicação: |
1999 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIAO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIAO CENTRAL DO BRASIL, 21., 1999, Dourados. Resumos... Dourados: Embrapa Agropecuaria Oeste / Londrina: Embrapa Soja, 1999. |
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Páginas: |
p.47-48. |
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Série: |
(Embrapa Agropecuaria Oeste. Documentos, 7; Embrapa Soja. Documentos, 134). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A Embrapa Soja e a Embrapa Negocios Tecnologicos vem desenvolvendo trabalho de difusao de cultivares de soja desde a safra 1989/90. O objetivo do trabalho e apresentar, para tecnicos e produtores, as vantagens comparativas (adaptabilidade produtiva e resistencia a doencas) das cultivares desenvolvidas pela Embrapa Soja, quando comparadas com as cultivares em uso pelos agricultores. O projeto vem sendo realizado junto a cooperativas e produtores de sementes e consiste, basicamente, na realizacao de uma reuniao de planejamento para a instalacao de Unidades Demostrattivas-UDs, acompanhamento da UD por parte dos pesquisadores da Embrapa, realizacao de Dias de Campo e realizacao de uma reuniao de avaliacao onde sao discutidos pontos positivos e negativos do trabalho. Na safra 1998/99 foram realizados 19 Dias de Campo, com a participacao de 7.712 pessoas, entre agricultores e tecnicos. Paralelamente a este trabalho, tambem foram distribuidas a empresas previamente cadastradas, 80 colecoes com as cultivares da Embrapa Soja, para a instalacao de UDs. Nesses, locais foram realizados 25 Dias de Campo, com a participacao de 11.422 pessoas. A participacao das cultivares da Embrapa Soja, no total da semente produzida no Parana, aumentou de 3% na safra 1989/90, para 63% na safra 1997/98 e manteve-se nesse percentual na safra 1998/99. |
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Palavras-Chave: |
Cultivar; Difusao; Soybean. |
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Thesagro: |
Soja. |
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Thesaurus NAL: |
diffusion; varieties. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02319naa a2200289 a 4500
001 1462115
005 2012-04-04
008 1999 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aPIPOLO, A. E.
245 $aDifusao de cultivares de soja desenvolvidas pela Embrapa Soja, para os estados do Parana, Santa Catarina e Sao Paulo - safra 1998/99.
260 $c1999
300 $ap.47-48.
490 $a(Embrapa Agropecuaria Oeste. Documentos, 7; Embrapa Soja. Documentos, 134).
520 $aA Embrapa Soja e a Embrapa Negocios Tecnologicos vem desenvolvendo trabalho de difusao de cultivares de soja desde a safra 1989/90. O objetivo do trabalho e apresentar, para tecnicos e produtores, as vantagens comparativas (adaptabilidade produtiva e resistencia a doencas) das cultivares desenvolvidas pela Embrapa Soja, quando comparadas com as cultivares em uso pelos agricultores. O projeto vem sendo realizado junto a cooperativas e produtores de sementes e consiste, basicamente, na realizacao de uma reuniao de planejamento para a instalacao de Unidades Demostrattivas-UDs, acompanhamento da UD por parte dos pesquisadores da Embrapa, realizacao de Dias de Campo e realizacao de uma reuniao de avaliacao onde sao discutidos pontos positivos e negativos do trabalho. Na safra 1998/99 foram realizados 19 Dias de Campo, com a participacao de 7.712 pessoas, entre agricultores e tecnicos. Paralelamente a este trabalho, tambem foram distribuidas a empresas previamente cadastradas, 80 colecoes com as cultivares da Embrapa Soja, para a instalacao de UDs. Nesses, locais foram realizados 25 Dias de Campo, com a participacao de 11.422 pessoas. A participacao das cultivares da Embrapa Soja, no total da semente produzida no Parana, aumentou de 3% na safra 1989/90, para 63% na safra 1997/98 e manteve-se nesse percentual na safra 1998/99.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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