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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
07/12/2007 |
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Data da última atualização: |
11/05/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MELO, R. C.; RIBEIRO, C.; MURRAY, C. S.; VELOSO, C. J. M.; SILVEIRA, C. H. da; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; CARCERONI, R. L.; SANTORO, M. M. |
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Afiliação: |
UFMG; UFMG; UFMG; UFMG; UFMG; GORAN NESHICH, CNPTIA; UFMG; UFMG; UFMG. |
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Título: |
Finding protein-protein interaction patterns by contact map matching. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 4, p. 946-963, 2007. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
We propose a novel method for defining patterns of contacts present in protein-protein complexes. A new use of the traditional contact maps (more frequently used for representation of the intra-chain contacts) is presented for analysis of inter-chain contacts. Using an algorithm based on image processing techniques, we can compare protein-protein interaction maps and also obtain a dissimilarity score between them. The same algorithm used to compare the maps can align the contacts of all the complexes and be helpful in the determination of a pattern of conserved interactions at the interfaces. We present an example for the application of this method by analyzing the pattern of interaction of bovine pancreatic trypsin inhibitors and trypsins, chymotrypsins, a thrombin, a matriptase, and a kallikrein - all classified as serine proteases. We found 20 contacts conserved in trypsins and chymotrypsins and 3 specific ones are present in all the serine protease complexes studied. The method was able to identify important contacts for the protein family studied and the results are in agreement with the literature. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Contact maps; Interação proteína-proteína; Mapas de contato; Serine proteases. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; protein-protein interactions; Serine proteinases. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159705/1/AP-Finding-2007.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
08/04/2015 |
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Data da última atualização: |
08/04/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
FEITOZA, E. de A.; SILVA, T. A. da; SILVA, M. P. da; SANTOS, C. T. G. P. dos; KIILL, L. H. P. |
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Afiliação: |
EDSÂNGELA DE ARAÚJO FEITOZA, Bolsista FUNBIO/MMA; TAMIRES ALMEIDA DA SILVA, Bolsista FUNBIO/MMA; MARA POLINE DA SILVA, Bolsista FUNBIO/MMA; CARLA TAMIRES GOMES PEREIRA DOS SANTOS, Bolsista da Embrapa Semiárido Petrolina; LUCIA HELENA PIEDADE KIILL, CPATSA. |
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Título: |
Interações de plantas e abelhas da Caatinga no Polo Petrolina, PE - Juazeiro, BA. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 9., 2014, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2014. |
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Páginas: |
p. 35-40. |
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Série: |
(Embrapa Semiárido. Documentos, 261). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar a rede de interações de plantas e abelhas da Caatinga, observadas em Petrolina, PE e Juazeiro, BA, nos projetos desenvolvidos pela Embrapa Semiárido, com foco na polinização de espécies nativas. As informações taxonômicas, local de coleta e espécie vegetal visitada foram retiradas das etiquetas dos espécimes depositados na coleção do Laboratório de Ecologia do Trópico Semiárido (LETSA) da Unidade. Foram analisados 165 espécimes de 38 espécies de abelhas que estavam em associação com 27 espécies de plantas. Entre as famílias de abelhas, Apidae se destacou com 76% (n=29) do total de espécimes. As abelhas eussociais Apis mellifera e Trigona spinipes foram registradas em 12 e nove espécies vegetais, respectivamente, enquanto Melitoma segmentaria, Melitomella grisescens, Augochlora sp. 1 e sp. 2 foram observadas somente em flores do gênero Ipomoea. A rede de interações mostrou que as abelhas Apidae são importantes polinizadores das plantas da Caatinga e que há relações oligoléticas entre abelhas Halictidae, Emphorini e Antophoridae com flores do gênero Ipomoea. |
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Palavras-Chave: |
Plantas da caatinga. |
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Thesagro: |
Abelha; Anacardiaceae; Convolvulaceae; Espécie Nativa; Inseto; Leguminosae; Polinização. |
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Thesaurus NAL: |
Apidae. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/121952/1/Resumo-04.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 9., 2014, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido$c2014
300 $ap. 35-40.
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520 $aEste trabalho foi desenvolvido com o objetivo de caracterizar a rede de interações de plantas e abelhas da Caatinga, observadas em Petrolina, PE e Juazeiro, BA, nos projetos desenvolvidos pela Embrapa Semiárido, com foco na polinização de espécies nativas. As informações taxonômicas, local de coleta e espécie vegetal visitada foram retiradas das etiquetas dos espécimes depositados na coleção do Laboratório de Ecologia do Trópico Semiárido (LETSA) da Unidade. Foram analisados 165 espécimes de 38 espécies de abelhas que estavam em associação com 27 espécies de plantas. Entre as famílias de abelhas, Apidae se destacou com 76% (n=29) do total de espécimes. As abelhas eussociais Apis mellifera e Trigona spinipes foram registradas em 12 e nove espécies vegetais, respectivamente, enquanto Melitoma segmentaria, Melitomella grisescens, Augochlora sp. 1 e sp. 2 foram observadas somente em flores do gênero Ipomoea. A rede de interações mostrou que as abelhas Apidae são importantes polinizadores das plantas da Caatinga e que há relações oligoléticas entre abelhas Halictidae, Emphorini e Antophoridae com flores do gênero Ipomoea.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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