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| Registros recuperados : 230 | |
| 125. |  | RAMBO, L.; SILVA, P. R. F. da; STRIEDER, M. L.; DELATORRE, C. A.; BAYER, C.; ARGENTA, G. Adequação de doses de nitrogênio em milho com base em indicadores de solo e de planta. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 3, p. 401-409, mar. 2008 Título em inglês: Adequacy of side dress nitrogen rates in corn based on soil and plant indicators.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 126. | | HEINZ, K. G. H.; DOMINGUEZ, A. C.; SILVA, P. R.; BOTELHO, T. K. R.; TAVARES, L. B. B. Avaliação da atividade hidrolítica de micro-organismos isolados do processamento de papel. Revista de Estudos Ambientais, Blumenau, v. 16, n. 2, p. 37-47, jul./dez. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 127. | | SILVA, P. R. N. da; VIANA, E. de S.; FERNANDES, J. C.; JESUS, J. L. de; REIS, R. C. Avaliação dos atributos de qualidade do amido de plátanos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 10., 2016: Cruz das Almas, BA. Traduzindo ciência para o mundo : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 128. | | CAETANO-PEREIRA, C.M.; SILVA, P. R.; SILVA, N.; MEIRELLES, W. F.; BRASIL, E. M.; PAGLIARINI, M. S. Avaliação citogenética da microsporogênese de uma nova variedade de milho (BRS 4150). In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia, MG. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos expandidos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlandia, 2000. nao paginado 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 129. | | CAETANO-PEREIRA, C.M.; SILVA, P. R.; SILVA, N.; MEIRELLES, W. F.; BRASIL, E. M.; PAGLIARINI, M. S. Avaliação citogenética da microsporogenese de uma nova variedade de milho (BRS 4150). In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlândia, 2000. p. 157.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 130. | | SOUZA, J. L. de; TEODORO, L.; AMORIM, E. C.; SILVA, P. R. T. da; MOURA FILHO, G. Balanço de energia em cultura do milho irrigado, através de medidas pigeométricas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 13., 2003, Santa Maria. Situação atual e perspectivas da agrometeorologia: anais... Santa Maria: UNIFRA: SBA: UFSM, 2003. p. 57-58.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 132. | | PREEZENHAK, A. P.; RESENDE, J. T. V.; CHAGAS, R. R.; SILVA, P. R.; SCHWARZ, K.; MORALES, R. G. F. Caracterização agronômica de genótipos de minitomate. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 32, n. 3, p. 348-356, jul./set. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 136. | | GROSCH, B.; SOUSA, M. L. F.; MIRANDA, N. B.; SILVA, P. R.; HELM, C. V.; TAVARES, L. B. B. Eficiência do pré-tratamento com licor verde em resíduos do agronegócio para obtenção de açúcares. In: SEMINÁRIO BRASILEIRO DE TECNOLOGIA ENZIMÁTICA, 10., 2012, Blumenau. Livro de resumos. Blumenau: FURB, 2012. CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 137. | | ARGENTA, G.; SILVA, P. R. F. da; FLECK, N. G.; BORTOLINI, C. G.; NEVES, R.; AGOSTINETTO, D. Efeitos do manejo mecânico e químico da aveia-preta no milho em sucessão e no controle do capim-papuã. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 6, p. 851-60, jun. 2001. Título em inglês: Effects of mechanical and chemical management of black oat on maize grown in succession and on alexandergrass control.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 138. | | RAMBO, L.; SILVA, P. R. F. DA; STRIEDER, M. L.; SILVA, A. A. DA; SANGOI, L.; VIEIRA, V. M. Índices nutricionais de N e produtividade de milho em diferentes níveis de manejo e de adubação nitrogenada. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 4, p. 390-397, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Trigo; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 139. | | SERPA, M. da S.; SILVA, P. R. F. da; SANGOI, L.; VIEIRA, V. M.; MARCHESI, D. R. Densidade de plantas em híbridos de milho semeados no final do inverno em ambientes irrigados e de sequeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 4, p. 541-549, abr. 2012. Título em inglês: Plant density of maize hybrids sowed during late winter in irrigated and rainfed environments.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| Registros recuperados : 230 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
27/12/2017 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
POLESE, V.; SOARES, C. de P.; SILVA, P. R. A. da; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S. |
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Afiliação: |
VALÉRIA POLESE, UFRRJ; LEITON DE PAULA SOARES, UFRRJ; PAULA RENATA ALVES DA SILVA, UFRRJ; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB. |
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Título: |
Selection and validation of reference genes for RT-qPCR indicates that juice of sugarcane varieties modulate the expression of C metabolism genes in the endophytic diazotrophic Herbaspirillum rubrisubalbicans strain HCC103. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Antonie van Leeuwenhoekv, 110, n. 12, p. 1555-1568, 2017. |
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ISSN: |
1572-9699 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10482-017-0906-7 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR) is an important tool for evaluating gene expression. However, this technique requires that specific internal normalizing genes be identified for different experimental conditions. To date, no internal normalizing genes are available for validation of data analyses for Herbaspirillum rubrisubalbicans strain HCC103, an endophyte that is part of the sugarcane consortium inoculant. This work seeks to identify and evaluate suitable reference genes for gene expression studies in HCC103 grown until middle log phase in sugarcane juice obtained from four sugarcane varieties or media with three different carbon sources. The mRNA levels of five candidate genes (rpoA, gyrA, dnaG, recA and gmK) and seven target genes involved in carbon metabolism (acnA, fbp, galE, suhB, wcaA, ORF_0127.0101 and _0127.0123) were quantified by RT-qPCR. Analysis of expression stability of these genes was carried out using geNorm and Normfinder software. The results indicated that the HCC103 dnaG and gyrA genes are the most stable and showed adequate relative expression level changes among the different sugarcane juices. The highest expression level was seen for ORF_0127.0101, which encodes a sugar transporter, in juice from sugarcane variety RB867515 and glucose as the carbon source. The suhB gene, encoding SuhB inositol monophosphatase, had a higher relative expression level on 0.5% glucose, 100% sugarcane juice from variety RB867515 and 0.5% aconitate. Together the results suggest that dnaG and gyrA genes are suitable as reference genes for RT-qPCR analysis of strain HCC103 and that juice from different sugarcane varieties modulates the expression of key genes involved in carbon metabolism. MenosQuantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR) is an important tool for evaluating gene expression. However, this technique requires that specific internal normalizing genes be identified for different experimental conditions. To date, no internal normalizing genes are available for validation of data analyses for Herbaspirillum rubrisubalbicans strain HCC103, an endophyte that is part of the sugarcane consortium inoculant. This work seeks to identify and evaluate suitable reference genes for gene expression studies in HCC103 grown until middle log phase in sugarcane juice obtained from four sugarcane varieties or media with three different carbon sources. The mRNA levels of five candidate genes (rpoA, gyrA, dnaG, recA and gmK) and seven target genes involved in carbon metabolism (acnA, fbp, galE, suhB, wcaA, ORF_0127.0101 and _0127.0123) were quantified by RT-qPCR. Analysis of expression stability of these genes was carried out using geNorm and Normfinder software. The results indicated that the HCC103 dnaG and gyrA genes are the most stable and showed adequate relative expression level changes among the different sugarcane juices. The highest expression level was seen for ORF_0127.0101, which encodes a sugar transporter, in juice from sugarcane variety RB867515 and glucose as the carbon source. The suhB gene, encoding SuhB inositol monophosphatase, had a higher relative expression level on 0.5% glucose, 100% sugarcane juice from variety RB867515 and 0.5% aconitate. Toget... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Internal normalizing; Organic acids; Relative expression; Sugar transport. |
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Thesaurus NAL: |
nitrogen fixation. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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520 $aQuantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR) is an important tool for evaluating gene expression. However, this technique requires that specific internal normalizing genes be identified for different experimental conditions. To date, no internal normalizing genes are available for validation of data analyses for Herbaspirillum rubrisubalbicans strain HCC103, an endophyte that is part of the sugarcane consortium inoculant. This work seeks to identify and evaluate suitable reference genes for gene expression studies in HCC103 grown until middle log phase in sugarcane juice obtained from four sugarcane varieties or media with three different carbon sources. The mRNA levels of five candidate genes (rpoA, gyrA, dnaG, recA and gmK) and seven target genes involved in carbon metabolism (acnA, fbp, galE, suhB, wcaA, ORF_0127.0101 and _0127.0123) were quantified by RT-qPCR. Analysis of expression stability of these genes was carried out using geNorm and Normfinder software. The results indicated that the HCC103 dnaG and gyrA genes are the most stable and showed adequate relative expression level changes among the different sugarcane juices. The highest expression level was seen for ORF_0127.0101, which encodes a sugar transporter, in juice from sugarcane variety RB867515 and glucose as the carbon source. The suhB gene, encoding SuhB inositol monophosphatase, had a higher relative expression level on 0.5% glucose, 100% sugarcane juice from variety RB867515 and 0.5% aconitate. Together the results suggest that dnaG and gyrA genes are suitable as reference genes for RT-qPCR analysis of strain HCC103 and that juice from different sugarcane varieties modulates the expression of key genes involved in carbon metabolism.
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653 $aInternal normalizing
653 $aOrganic acids
653 $aRelative expression
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700 1 $aVIDAL, M. S.
773 $tAntonie van Leeuwenhoekv, 110$gn. 12, p. 1555-1568, 2017.
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