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Biblioteca(s):  Embrapa Arroz e Feijão.
Data corrente:  08/11/2024
Data da última atualização:  08/11/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  CARVALHO, I. C. B.; CARVALHO, A. M. S.; WENDLAND, A.; ROSSATO, M.
Afiliação:  IAN C. BISPO CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALICE MARIA SILVA CARVALHO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ADRIANE WENDLAND FERREIRA, CNPAF; MAURICIO ROSSATO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA.
Título:  Colorimetric LAMP assay for detection of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in cassava through genomics: a new approach to an old problem.
Ano de publicação:  2024
Fonte/Imprenta:  Plant Disease, v. 108, n. 10, p. 2993-3000, Oct. 2024.
ISSN:  1943-7692
DOI:  https://doi.org/10.1094/PDIS-08-23-1507-RE
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Bacterial blight caused by Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) is considered the main bacterial disease that affects cassava, causing significant losses when not properly managed. In the present study, a fast, sensitive, and easy-to-apply method to detect Xpm via colorimetric loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was developed. To ensure the use of a unique-to-the-target pathovar core region for primer design, 74 complete genomic sequences of Xpm together with different bacterial species and pathovars were used for comparative genomics. A total of 42 unique genes were used to design 27 LAMP primer sets, from which nine primers were synthesized, and only one (Xpm_Lp1 primer set) showed sufficient efficiency in preliminary tests. The sensitivity, assessed by a serial dilution of the type strain (IBSBF 278) DNA, yielded high sensitivity, detecting up to 100 fg. The LAMP primers showed high specificity, did not cross-react with other bacterial species or other pathovars tested, and amplified only the Xpm isolates. Tests confirmed the high efficiency of the protocol using infected or inoculated macerated cassava leaves without the need for additional sample treatment. The LAMP test developed in this study was able to detect Xpm in a fast, simple, and sensitive way, and it can be used to monitor the disease under laboratory and field conditions.
Palavras-Chave:  Bacterial blight; Xanthomonas phaseoli pv manihotis.
Thesagro:  Mandioca; Xanthomonas Phaseoli.
Thesaurus Nal:  Bacterial diseases of plants; Cassava; Comparative genomic hybridization; Genomics; Loop-mediated isothermal amplification.
Categoria do assunto:  H Saúde e Patologia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF)
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CNPAF37076 - 1UPCAP - DD20242024
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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Au Brésil, une reconnaissance récente des agriculture familiales, le choix d´une polítique duale. In: CONFÉRENCE DE PARIS, 2005, Paris. Agricultures familiales & mondes à venir: actes. Paris: CIRAD, 2007. p. 31-32.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Fruticultura irrigada: experiências dos Vales do São Francisco e Parnaíba. Item, Brasília, DF, n. 67, p. 45-46, 3. trim. 2005. Seminário II.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Cenário atual e perspectivas da agricultura no Nordeste. In: SIMPÓSIO SOBRE MANEJO DE PLANTAS DANINHAS NO NORDESTE, 2., 2013, Campina Grande. Desafios, avanços e soluções no manejo de plantas daninhas: palestras. Brasília, DF: Embrapa: SBCPD, 2013.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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4.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. A dinâmica dos serviços na fruticultura irrigada do Pólo Petrolina-PE/Juazeiro-BA. In: CONGRESSO MUNDIAL DE SOCIOLOGIA RURAL, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ECONOMIA E SOCIOLOGIA RURAL, 38., 2000, Rio de Janeiro. Anais... Campinas: UNICAMP; Auburn: IRSA; BrasÍIia, DF: SOBER, 2000. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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5.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Dinâmica e crise da fruticultura irrigada no Vale do São Francisco. In: SILVA, A. G. da; CAVALCANTI, J. S. B.; WANDERLEY, M. de N. B. (Org.). Diversificação dos espaços rurais e dinâmicas territoriais no Nordeste do Brasil. João Pessoa: Zarinha Centro de Cultura, 2009. p. 69-95.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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6.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Desenvolvimento com base na valorização da natureza e dos recursos locais. Raízes - Revista de Ciências Sociais e Econômicas, v. 21, n. 1, p. 164-165, jan./jun. 2002.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
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7.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Evolucao recente da cadeia de frutas frescas no Polo Petrolina-PE/Juazeiro-BA. Cadernos de Debate, Campinas, v. 7, p. 10-18, 1999.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
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8.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. A exportação de frutas frescas no Chile e Brasil. In: CONGRESSO MUNDIAL DE SOCIOLOGIA RURAL, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ECONOMIA E SOCIOLOGIA RURAL, 38., 2000, Rio de Janeiro. Anais... Campinas: UNICAMP; Auburn: IRSA; Brasília, DF: SOBER, 2000. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Embrapa pesquisa cultivos alternativos com potencial econômico para áreas irrigadas. Jornal da Fruta, v. 15, n. 182, p. 14, mar. 2007.
Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Projetos de irrigação e o desenvolvimento do Submédio do Vale do São Francisco. In: SEMANA DE CIÊNCIAS SOCIAIS DA UNIVASF, 1., 2012, Juazeiro, BA. As ciências sociais no Nordeste: um desafio. Curitiba: CRV, 2012. p. 69-78
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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11.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Mercados de trabajo femenino en la fruticultura irrigada en el Submedio del Valle de São Francisco: caso de Brasil. In: SOTO BAQUERO, F.; KLEIN, E. (Coord.). Empleo y condiciones de trabajo de mujeres temporeras agrícola. Roma: FAO, 2012. cap. 2, p.85-141. il.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Sistema integrado de produção usando o efluente de dessalinização. In: THE INTERNATIONAL DESALINATION ASSOCIATION WORLD CONGRESS, 2017, São Paulo. Water reuse & desalination ensure your water future: [proceedings...]. São Paulo: International Desalination Association, 2017.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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13.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Une experience de recherche-action en matiere de credit agricole a Massaroca. In: CARON, P.; SABOURIN, E.(Coord.). Paysans du sertao: mutations des agricultures familiales dans le Nordeste du Bresil. Montpellier: CIRAD; Embrapa, 2001. p. 165-179.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Uma experiência de pesquisa-ação em matéria de crédito agrícola em Massaroca. In: CARON, P.; SABOURIN, E. (Ed.). Camponeses do Sertão: mutação das agriculturas familiares no Nordeste do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; CIRAD, 2003. p. 217-236.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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15.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da. Trabalho feminino na fruticultura irrigada no Submédio do Vale do São Francisco. In: OLIVEIRA, L. M. S. R. de; FLORES, F. T. (Org.). Mulheres em perspectivas: relações de gênero, trabalho e saúde. Curitiba: CRV, 2014. p. 75-93.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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16.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da; SAUTIER, D. Prática de pesquisa e disseminação de tecnologias para a agricultura do Semi-Arido do Nordeste do Brasil. In: SEMINARIO INTERNACIONAL DE TECNOLOGIAS APROPRIADAS PARA O DESENVOLVIMENTO SUSTENTADO, 1996, Campina Grande. Anais... Brasilia, DF: ABIPTI, 1997. p. 187-197.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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17.Imagem marcado/desmarcadoCARON, P.; SILVA, P. C. G. da. Pequena producao e desenvolvimento sustentavel no tropico semi-arido: a necessidade de um sistema de credito adaptado. In: CONFERENCIA INTERNACIONAL SOBRE IMPACTOS DE VARIACOES CLIMATICAS E DESENVOLVIMENTO SUSTENTAVEL EM REGIOES SEMI-ARIDAS-ICID, 1992, Fortaleza. Anais... Fortaleza: Governo do Estado do Ceara: Fundacao Grupo Esquel Brasil, 1992. v.8, p. 2529-2541.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoCORREIA, R. C.; SILVA, P. C. G. da. Aspectos socioeconômicos da viticultura. In: LEÃO, P. C. de S. (Ed.). Uva de mesa: produção - aspectos técnicos. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2001. cap. 1, p. 9-11. (Frutas do Brasil, 13).
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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19.Imagem marcado/desmarcadoTONNEAU, J. P.; SILVA, P. C. G. da. Aprendizagem coletiva e desenvolvimento da agricultura familiar no Sertão da Bahia. Raízes - Revista de Ciências Sociais e Econômicas, v. 22, n. 1, p. 88-98, jan./jun. 2003.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
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20.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. C. G. da; GUIMARÃES FILHO, C. Eixo tecnológico da ecorregião Nordeste. In: SOUSA, I. S. F. de (Ed.). Agricultura familiar na dinâmica da pesquisa agropecuária. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica, 2006. cap. 3. p. 109-161.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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