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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
05/11/2021 |
Data da última atualização: |
29/12/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MATOSINHO, C. G. R.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S.; OLIVEIRA, F. S. de; SANTOS, F. G. dos; ARAÚJO, F. M. G.; SALIM, A. C. de M.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; PIRES, D. E. V.; CARVALHO, M. R. S. |
Afiliação: |
CAROLINA GUIMARÃES RAMOS MATOSINHO, Universidade Federal de Minas Gerais; IZINARA CRUZ ROSSE, Universidade Federal de Ouro Preto; PABLO AUGUSTO SOUZA FONSECA, University of Guelph; FRANCISLON SILVA DE OLIVEIRA, Fiocruz; FAUSTO GONÇALVES DOS SANTOS, Fiocruz; FLÁVIO MARCOS GOMES ARAÚJO, Fiocruz; ANNA CHRISTINA DE MATOS SALIM, Fiocruz; BEATRIZ CORDENONSI LOPES, Epamig; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; RUI DA SILVA VERNEQUE, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; GUILHERME OLIVEIRA, Instituto Tecnológico Vale; DOUGLAS EDUARDO VALENTE PIRES, University of Melbourne; MARIA RAQUEL SANTOS CARVALHO, Universidade Federal de Minas Gerais. |
Título: |
Identifcation and in silico characterization of structural and functional impacts of genetic variants in milk protein genes in the Zebu breeds Guzerat and Gyr. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 6, 524, 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11250-021-02970-2 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Whole genome sequencing of bovine breeds has allowed identifcation of genetic variants in milk protein genes. However, functional repercussion of such variants at a molecular level has seldom been investigated. Here, the results of a multistep Bioinformatic analysis for functional characterization of recently identifed genetic variants in Brazilian Gyr and Guzerat breeds is described, including predicted efects on the following: (i) evolutionary conserved nucleotide positions/regions; (ii) protein function, stability, and interactions; (iii) splicing, branching, and miRNA binding sites; (iv) promoters and transcription factor binding sites; and (v) collocation with QTL. Seventy-one genetic variants were identifed in the caseins (CSN1S1, CSN2, CSN1S2, and CSN3), LALBA, LGB, and LTF genes. Eleven potentially regulatory variants and two missense mutations were identifed. LALBA Ile60Val was predicted to afect protein stability and fexibility, by reducing the number the disulfde bonds established. LTF Thr546Asn is predicted to generate steric clashes, which could mildly afect iron coordination. In addition, LALBA Ile60Val and LTF Thr546Asn afect exonic splicing enhancers and silencers. Consequently, both mutations have the potential of afecting immune response at individual level, not only in the mammary gland. Although laborious, this multistep procedure for classifying variants allowed the identifcation of potentially functional variants for milk protein genes. |
Palavras-Chave: |
In silico variant analysis. |
Thesagro: |
Bovino; Caseína; Leite; Proteína. |
Thesaurus Nal: |
Casein; Cattle; Lactoferrin; Milk proteins. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
Marc: |
LEADER 02787naa a2200433 a 4500 001 2135816 005 2021-12-29 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11250-021-02970-2$2DOI 100 1 $aMATOSINHO, C. G. R. 245 $aIdentifcation and in silico characterization of structural and functional impacts of genetic variants in milk protein genes in the Zebu breeds Guzerat and Gyr.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aWhole genome sequencing of bovine breeds has allowed identifcation of genetic variants in milk protein genes. However, functional repercussion of such variants at a molecular level has seldom been investigated. Here, the results of a multistep Bioinformatic analysis for functional characterization of recently identifed genetic variants in Brazilian Gyr and Guzerat breeds is described, including predicted efects on the following: (i) evolutionary conserved nucleotide positions/regions; (ii) protein function, stability, and interactions; (iii) splicing, branching, and miRNA binding sites; (iv) promoters and transcription factor binding sites; and (v) collocation with QTL. Seventy-one genetic variants were identifed in the caseins (CSN1S1, CSN2, CSN1S2, and CSN3), LALBA, LGB, and LTF genes. Eleven potentially regulatory variants and two missense mutations were identifed. LALBA Ile60Val was predicted to afect protein stability and fexibility, by reducing the number the disulfde bonds established. LTF Thr546Asn is predicted to generate steric clashes, which could mildly afect iron coordination. In addition, LALBA Ile60Val and LTF Thr546Asn afect exonic splicing enhancers and silencers. Consequently, both mutations have the potential of afecting immune response at individual level, not only in the mammary gland. Although laborious, this multistep procedure for classifying variants allowed the identifcation of potentially functional variants for milk protein genes. 650 $aCasein 650 $aCattle 650 $aLactoferrin 650 $aMilk proteins 650 $aBovino 650 $aCaseína 650 $aLeite 650 $aProteína 653 $aIn silico variant analysis 700 1 $aROSSE, I. C. 700 1 $aFONSECA, P. A. S. 700 1 $aOLIVEIRA, F. S. de 700 1 $aSANTOS, F. G. dos 700 1 $aARAÚJO, F. M. G. 700 1 $aSALIM, A. C. de M. 700 1 $aLOPES, B. C. 700 1 $aARBEX, W. A. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aPEIXOTO, M. G. C. D. 700 1 $aVERNEQUE, R. da S. 700 1 $aMARTINS, M. F. 700 1 $aSILVA, M. V. G. B. 700 1 $aOLIVEIRA, G. 700 1 $aPIRES, D. E. V. 700 1 $aCARVALHO, M. R. S. 773 $tTropical Animal Health and Production$gv. 53, n. 6, 524, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
17/04/2024 |
Data da última atualização: |
17/04/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
KARAM, D.; BORGHI, E.; SILVA, J. R. de O.; GONÇALO, T. P.; FREITAS, T. da G. R. |
Afiliação: |
DECIO KARAM, CNPMS; EMERSON BORGHI, CNPMS; JÚLIA RESENDE OLIVEIRA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; TÚLIO PORTO GONÇALO, GROWER CONHECIMENTO AGRONÔMICO; TAMIRIS DA GRAÇA ROCHA FREITAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO JOÃO DEL-REI. |
Título: |
Cultivo intercalar antecipado de milho segunda safra nas entrelinhas da soja para condições de solos com fertilidade construída na região sudoeste do estado de Goiás. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO NACIONAL DE MILHO SAFRINHA, 17., 2023, Campo Grande, MS. Preservar e produzir: anais. Maracaju: Fundação MS, 2023. |
Páginas: |
p. 107-108. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Um dos maiores desafios à produtividade do milho segunda safra encontra-se no ajuste da semeadura dentro do calendário agrícola de menor risco em relação às condições ambientais. Considerando a cultura do milho e o município de Rio Verde, GO, como exemplo, as épocas de semeadura recomendadas pelo Zoneamento Agrícola de Risco Climático para a semeadura em segunda safra com baixo risco (20%) inicia em janeiro e finaliza em 20 de fevereiro. A partir desta data, em solos arenosos ou de textura média, o risco aumenta para 30% ou 40%, motivo pelo qual muitos técnicos e produtores mencionam que, ao semear no último decêndio de fevereiro, já representa queda de produtividade do milho. O sistema Antecipe – cultivo intercalar antecipado, sistema de cultivo desenvolvido pela Embrapa ao longo de 15 anos de pesquisa em diferentes regiões de produção de milho segunda safra no Brasil, surge como uma oportunidade de antecipar a semeadura do milho em até 20 dias antes da colheita da soja (SILVA et al., 2021, Anais do XVI SNMS, p. 33-34). O presente trabalho objetivou avaliar a implantação de 2 sistemas de semeadura do milho nas características agronômicas e na produtividade de milho segunda safra, assim como a produtividade de grãos e o retorno econômico do sistema Antecipe na região de Rio Verde, GO, por dois anos agrícolas consecutivos. O experimento foi realizado na Estação de Pesquisa do Grupo Associado de Pesquisa do Sudoeste Goiano (GAPES), em Rio Verde, GO, durante os anos agrícolas 2020/2021 e 2021/2022. Segundo Thornthwaite (1948), o clima de Rio Verde, GO, é classificado em B4 rB’4a’ (úmido, pequena deficiência hídrica, mesotérmico e evapotranspiração no verão menor que 48%). O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, com os tratamentos sendo dispostos em faixas e as repetições (5) alocadas aleatoriamente em cada tratamento, uma vez que todos os tratos culturais na soja e no milho segunda safra ocorreram mecanicamente. Os tratamentos consistiram de 2 sistemas de cultivo: Sistema 1 – Semeadura intercalar mecanizada de milho nas entrelinhas de soja (Antecipe), com corte das plantas de milho em razão da passagem da colhedora no momento da colheita da soja; Sistema 2 –Colheita da soja após maturidade fisiológica e semeadura do milho. A área total do experimento foi de 0,8 hectares. Para cada cultivar, em cada ano agrícola, a unidade experimental apresentou área útil de 0,4 ha (250 m de comprimento x 16 m de largura). Foram selecionadas cultivares de ciclos contrastantes, justamente para verificar o potencial de ganho pelo sistema Antecipe, principalmente em semeaduras tardias de milho segunda safra nas cultivares com maior GMR. MenosUm dos maiores desafios à produtividade do milho segunda safra encontra-se no ajuste da semeadura dentro do calendário agrícola de menor risco em relação às condições ambientais. Considerando a cultura do milho e o município de Rio Verde, GO, como exemplo, as épocas de semeadura recomendadas pelo Zoneamento Agrícola de Risco Climático para a semeadura em segunda safra com baixo risco (20%) inicia em janeiro e finaliza em 20 de fevereiro. A partir desta data, em solos arenosos ou de textura média, o risco aumenta para 30% ou 40%, motivo pelo qual muitos técnicos e produtores mencionam que, ao semear no último decêndio de fevereiro, já representa queda de produtividade do milho. O sistema Antecipe – cultivo intercalar antecipado, sistema de cultivo desenvolvido pela Embrapa ao longo de 15 anos de pesquisa em diferentes regiões de produção de milho segunda safra no Brasil, surge como uma oportunidade de antecipar a semeadura do milho em até 20 dias antes da colheita da soja (SILVA et al., 2021, Anais do XVI SNMS, p. 33-34). O presente trabalho objetivou avaliar a implantação de 2 sistemas de semeadura do milho nas características agronômicas e na produtividade de milho segunda safra, assim como a produtividade de grãos e o retorno econômico do sistema Antecipe na região de Rio Verde, GO, por dois anos agrícolas consecutivos. O experimento foi realizado na Estação de Pesquisa do Grupo Associado de Pesquisa do Sudoeste Goiano (GAPES), em Rio Verde, GO, durante os anos agrícolas 2... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Sistema Antecipe. |
Thesagro: |
Milho; Produtividade; Safrinha; Semeadura. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1163706/1/Cultivo-intercalar-antecipado-de-milho-de-segunda-safra.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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