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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
19/01/2022 |
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Data da última atualização: |
19/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SUELA, M. M.; AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; RESENDE, M. D. V. de. |
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Afiliação: |
MATHEUS M. SUELA, UFV; CAMILA FERREIRA AZEVEDO, UFV; MOYSÉS NASCIMENTO, UFV; ANA CAROLINA CAMPANA NASCIMENTO, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPCa. |
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Título: |
Regional heritability mapping and genome-wide association identify loci for rice traits. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 62, n. 1, p. 1-48, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1002/csc2.20706 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Although genome-wide association studies (GWAS) based on single-marker analysis have been widely applied in plant breeding programs, the effectivity of the methodology is still undermined by high false-positive rates and the limited power to detect associations. Bayesian methods estimated marker effects simultaneously proved to be efficient, indicating genes with important effects. Regional heritability mapping (RHM) on the other hand determines the genome region (group of markers) associated with the phenotype, consider population structure and familial relatedness and is more powerful to detect quantitative trait loci (QTL) and reduced false-positive rates than single marker methodologies. A single-marker mixed model (SM-MM), bayesian approach and RHM were used for 11 traits in 413 rice accessions genotyped for 44,100 SNP markers. Using RHM in regions of 0.21Mb and 0.69 Mb, respectively, detected 5 and 7 associated regions with 163 and 569 single nucleotide polymorphisms (SNPs), bayesian method with regions of 0.21Mb and 0.69 Mb detected regions for all traits, whereas SM-MM detected 4 single SNP?trait associations. For the 11 traits, RHM explained around 25-40 and 25-76% using genome regions of 0.21 and 0.69Mb, respectively, and SM-MM using single markers explained 1?7% of the genomic heritability. Regional heritability mapping was more effective than SM-MM in capturing major proportions of genomic heritability. The regions found in this study were within or close to the QTL noted in the Q-TARO and Gramene QTL databases. MenosAlthough genome-wide association studies (GWAS) based on single-marker analysis have been widely applied in plant breeding programs, the effectivity of the methodology is still undermined by high false-positive rates and the limited power to detect associations. Bayesian methods estimated marker effects simultaneously proved to be efficient, indicating genes with important effects. Regional heritability mapping (RHM) on the other hand determines the genome region (group of markers) associated with the phenotype, consider population structure and familial relatedness and is more powerful to detect quantitative trait loci (QTL) and reduced false-positive rates than single marker methodologies. A single-marker mixed model (SM-MM), bayesian approach and RHM were used for 11 traits in 413 rice accessions genotyped for 44,100 SNP markers. Using RHM in regions of 0.21Mb and 0.69 Mb, respectively, detected 5 and 7 associated regions with 163 and 569 single nucleotide polymorphisms (SNPs), bayesian method with regions of 0.21Mb and 0.69 Mb detected regions for all traits, whereas SM-MM detected 4 single SNP?trait associations. For the 11 traits, RHM explained around 25-40 and 25-76% using genome regions of 0.21 and 0.69Mb, respectively, and SM-MM using single markers explained 1?7% of the genomic heritability. Regional heritability mapping was more effective than SM-MM in capturing major proportions of genomic heritability. The regions found in this study were within or close to the ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Arroz; Melhoramento Genético Vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Bayesian theory; Genomics; Plant breeding; Rice. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| Registros recuperados : 24 | |
| 11. |  | RESENDE, A. V. de; MARTINS, E. de S.; LIMA, T. M.; FALEIRO, A. S. G.; JOSÉ, M. R.; MUNIZ, D. H. de F.; SILVA, G. D. da. Avaliação preliminar do potencial das rochas carbonáticas como fontes de nutrientes na agricultura. In: LIMA, T. M.; MENEZES, R. G. de; SILVA, G. D. da; BAHIA, R. B. C.; SOUZA JÚNIOR, L. C.; RESENDE, A. V. de; MARTINS, E. de S.; SAES, G. S.; PINHO, F. E. C.; NEDER, R. D.; SANTOS, A. A.; SANTOS JÚNIOR, W. A. dos; GOMES, L. P.; SILVA, S. N. da; ORMOND, M. M.; GANZER, E. B.; FALEIRO, A. S. G.; JOSÉ, M. R.; MUNIZ, D. H. de F.; FREITAS, L. L.; PINHEIRO, J. M. Avaliação de rochas calcárias e fosfatadas para insumos agrícolas do Estado de Mato Grosso. Cuiabá: CPRM: METAMAT, 2008. p. 135-178.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 13. | | RESENDE, A. V. de; MARTINS, E. de S.; LIMA, T. M.; FALEIRO, A. S. F.; JOSÉ, M. R.; MUNIZ, D. H. de F.; SILVA, G. D. da. Avaliação preliminar de rochas do Estado de Mato Grosso como fontes de nutrientes na agricultura. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 14. | | SILVA, J. M. L. da; BARROS, I. de; PACHECO, E. P.; CRUZ, T. S.; DANTAS, E. do N.; SILVA, G. D. da. Erosão hídrica laminar nos sistemas de cultivo de milho no agreste sergipano. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 3., 2013, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 1 CD-ROM. p. 56-63| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 15. | | BELARMINO, K. da S.; BRUNO, R. de L. A.; BRAGA JÚNIOR, J. M.; GONDIM, T. M. de S.; FERREIRA, D. da S.; SILVA, G. D. da. Influência da inflorescência no vigor de sementes de mamona cv BRS-Nordestina. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 16. | | SILVA, G. D. da; OLIVEIRA, L. D. da S.; VALE, C. N. C. do; SILVA, T. G. F. da; MOURA, M. S. B. de. Calibração do ceptômetro e índice de área foliar da videira em diferentes sistemas de condução no Submédio do Vale do São Francisco. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 11., 2016, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2016. p. 299-304. (Embrapa Semiárido. Documentos, 271).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | ANJOS, J. L. dos; PORTELA, J. C.; CINTRA, F. L. D.; NUNES, M. U. C.; CURADO, F. F.; DINIZ, T. A.; SILVA, G. D. da. Compostagem laminar e vermicompostagem em pomar de citros adultos nos Tabuleiros Costeiros de Sergipe. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RESÍDUOS ORGÂNICOS, 3.; ENCONTRO NACIONAL DE SUBSTRATOS PARA PLANTAS, 9., 2014, Vitória. Anais... Vitória: INCAPER; CEDAGRO, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 19. | | SANTOS, M. P. dos; SILVA, G. D. da; MOREIRA, A.; JALES, L. O.; MATOS, E. V.; MOTA, I. de F.; CARVALHO, C. G. P. Desempenho agronômico de nove híbridos de girassol cultivados em segunda safra em Nova Andradina, MS. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE GIRASSOL, 24.; SIMPÓSIO NACIONAL SOBRE A CULTURA DO GIRASSOL, 12., 2023, Campo Verde. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2023. (Embrapa Soja. Eventos técnicos & científicos, 2). RNPG, 2023. Editado por Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, Hugo Soares Kern. p. 53-57. Título em inglês: Agronomic performance of nine sunflower hybrids cultivated as a second crop in Nova Andradina, MS.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 20. | | ANJOS, J. L. dos; SILVA NETO, J. A. da; PORTELA, J. C.; CURADO, F. F.; SCHIEDECK, G.; SILVA, G. D. da. Proporções de composto e vermicomposto em substrato para produção de mudas de Mulungu (Erythrina velutina,Willd). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RESÍDUOS ORGÂNICOS, 3.; ENCONTRO NACIONAL DE SUBSTRATOS PARA PLANTAS, 9., 2014, Vitória. Anais... Vitória: INCAPER; CEDAGRO, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| Registros recuperados : 24 | |
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