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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
27/09/2023 |
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Data da última atualização: |
27/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, I. P. de; AZEVEDO, B. R. de; COELHO, A. S. G.; SOUZA, T. L. P. O. de; VALDISSER, P. A. M. R.; GOMES-MESSIAS, L. M.; FUNICHELI, B. W.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
ISABELA PAVANELLI DE SOUZA, bolsista CNPAF; BEATRIZ ROSA DE AZEVEDO, bolsista CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; THIAGO LIVIO PESSOA OLIV DE SOUZA, CNPAF; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; LUCAS MATIAS GOMES-MESSIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; BRENO OSVALDO FUNICHELI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Whole-genome resequencing of common bean elite breeding lines. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, 12721, 2023. |
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ISSN: |
2045-2322 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39399-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The expansion of bean genome technologies has prompted new perspectives on generating resources and knowledge essential to research and implementing biotechnological tools for the practical operations of plant breeding programs. This study aimed to resequence the entire genome (whole genome sequencing?WGS) of 40 bean genotypes selected based on their significance in breeding programs worldwide, with the objective of generating an extensive database for the identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs). Over 6 million SNPs were identified, distributed across the 11 bean chromosomes. After quality variant filtering, 420,509 high-quality SNPs were established, with an average of 38,228 SNPs per chromosome. These variants were categorized based on their predicted effects, revealing that the majority exerted a modifier impact on non-coding genome regions (94.68%). Notably, a significant proportion of SNPs occurred in intergenic regions (62.89%) and at least one SNP was identified in 58.63% of the genes annotated in the bean genome. Of particular interest, 7841 SNPs were identified in 85% of the putative plant disease defense-related genes, presenting a valuable resource for crop breeding efforts. These findings provide a foundation for the development of innovative and broadly applicable technologies for the routine selection of superior genotypes in global bean improvement and germplasm characterization programs. |
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Thesagro: |
Feijão; Genoma; Melhoramento. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Breeding; Breeding lines; Genome; Genotype; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1156925/1/sr-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
30/09/2016 |
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Data da última atualização: |
24/05/2017 |
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Autoria: |
SILVA, A. A. da; ANDRADE, M. C.; CARVALHO, R. de C.; NEIVA, I. P.; SANTOS, D. C.; MALUF, W. R. |
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Afiliação: |
ALEX ANTÔNIO DA SILVA, UFLA; MARCELA CARVALHO ANDRADE, UFLA; REGIS DE CASTRO CARVALHO, UFLA; IRÃ PINHEIRO NEIVA, UFLA; DANIELA COSTA SANTOS, UFLA; WILSON ROBERTO MALUF, UFLA. |
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Título: |
Resistência à Helicoverpa armigera em genótipos de tomateiro obtidos do cruzamento de Solanum lycopersicum com Solanum galapagense. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 7, p. 801-808, jul. 2016. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Resistance to Helicoverpa armigera in tomato genotypes obtained from the crossing of Solanum lycopersicum x Solanum galapagense. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi verificar a resistência à lagarta Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae), em genótipos de tomateiro obtidos do cruzamento interespecífico de Solanum lycopersicum x S. galapagense, e a associação dessa resistência com a densidade de tricomas glandulares do tipo IV. Genótipos da população F2, derivada do cruzamento S. lycopersicum TOM?684 x S. galapagense LA?1401, selecionados quanto à baixa e à alta densidade de tricomas glandulares, respectivamente, foram submetidos a dois testes de resistência à lagarta H. armigera em laboratório, um de antibiose e outro de antixenose. Os genótipos da população F2, com alta densidade de tricomas glandulares do tipo IV (BPX?486?17, BPX?486?62, BPX?486?10, BPX?486?46 e BPX?486?08), apresentam maiores níveis de resistência, tanto por antibiose quanto por antixenose, do que os genótipos com baixa densidade de tricomas glandulares (BPX?486?313 e BPX?486?383) e do que as testemunhas 'Santa Clara' e TOM?684. Os níveis de resistência foram menores do que os do genitor silvestre LA?1401. |
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Palavras-Chave: |
Indirect selection; Leaf trichomes; Manejo integrado de praga; Melhoramento de planta; Pest integrated management; Seleção indireta; Tricoma foliar. |
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Thesaurus NAL: |
Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/148014/1/Resistencia-a-helicoverpa-armigera.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo deste trabalho foi verificar a resistência à lagarta Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae), em genótipos de tomateiro obtidos do cruzamento interespecífico de Solanum lycopersicum x S. galapagense, e a associação dessa resistência com a densidade de tricomas glandulares do tipo IV. Genótipos da população F2, derivada do cruzamento S. lycopersicum TOM?684 x S. galapagense LA?1401, selecionados quanto à baixa e à alta densidade de tricomas glandulares, respectivamente, foram submetidos a dois testes de resistência à lagarta H. armigera em laboratório, um de antibiose e outro de antixenose. Os genótipos da população F2, com alta densidade de tricomas glandulares do tipo IV (BPX?486?17, BPX?486?62, BPX?486?10, BPX?486?46 e BPX?486?08), apresentam maiores níveis de resistência, tanto por antibiose quanto por antixenose, do que os genótipos com baixa densidade de tricomas glandulares (BPX?486?313 e BPX?486?383) e do que as testemunhas 'Santa Clara' e TOM?684. Os níveis de resistência foram menores do que os do genitor silvestre LA?1401.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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