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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
03/01/2018 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LAGROTTA, M. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. F.; MOTA, R. R. |
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Afiliação: |
Marcos Rodrigues Lagrotta, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; Fabyano Fonseca e Silva, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Moysés Nascimento, UFV; Darlene Ana Souza Duarte, UFV; Camila Ferreira Azevedo, UFV; Rodrigo Reis Mota, University of Liège. |
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Título: |
Computação paralela aplicada à seleção genômica via inferência Bayesiana. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Biometria, Lavras, v. 35, n. 3, p. 440-448, 2017. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Em seleção genômica (SG), o grande número de marcadores moleculares utilizados, bem como a demanda computacional dos modelos bayesianos, fundamentados nos algoritmos Monte Carlo Via Cadeias de Markov, faz com que as análises exijam semanas ou até meses de processamento. A computação paralela representa uma solução natural para este problema, visto que esta subdividi um algoritmo em várias tarefas independentes, as quais podem ser processadas em paralelo, reduzindo o tempo de processamento. Objetivou-se comparar a eficiência de processamento do método BayesCπ programado em paralelo com o seu algoritmo sequencial padrão. Duas estratégias de paralelização foram estudadas. A primeira envolveu a análise de múltiplas cadeias MCMC em paralelo, e a segunda referiu-se à paralelização de uma única cadeia MCMC. Utilizou-se a biblioteca MPI e o pacote OpenMPI associado ao compilador gfortran para execução em paralelo desses algoritmos. Foram utilizados dados simulados considerando 10.000 marcadores SNPs e 4.100 indivíduos. O algoritmo sequencial padrão foi processado em 77,29 horas. Ao usar múltiplas cadeias em paralelo o processamento foi 77% mais rápido (17,75hs), enquanto que a estratégia de paralelização de uma única cadeia apresentou um ganho de desempenho de 15% (65,37hs). Conclui-se que a computação paralela é eficiente e pode ser aplicada à SG. |
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Palavras-Chave: |
Marcadores SNP; Regressão Bayesiana. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic improvement; Statistics. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170170/1/2017-M.Deon-RBM-Computacao.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pantanal. Para informações adicionais entre em contato com cpap.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
25/03/1996 |
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Data da última atualização: |
03/05/2017 |
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Autoria: |
SANTOS, S. A.; PINHEIRO, M. S.; SILVA, R. A.; SEIXAS, G. H. F. |
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Afiliação: |
EMBRAPA. Centro de Pesquisa Agropecuaria do Pantanal (Corumba, MS). |
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Título: |
Composicao corporal em proteina e energia de Caiman crocodilus yacare, em relacao a variacao de peso. |
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Ano de publicação: |
1991 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOLOGIA, 18., 1991, Salvador. Resumos... Salvador: Sociedade Brasileira de Zoologia / UFBA-Instituto de Biologia, 1991. p.322. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A variacao da composicao quimica corporal de um animal e influenciada por fatores geneticos e ambientes e seu conhecimento contribui para o estabelecimento de requerimentos nutricionais. Esta informacao e basica para o manejo nutricional de jacares em cativeiro, visto que produtores rurais tem mostrado grande interesse em produzi-los racionalmente. Diante disso, esse trabalho visou obter informacoes preliminares sobre a composicao proteica e energetica de Caiman crocodilus yacare de acordo com o peso corporal. Foram capturados 20 jacares em ambientes de "baias" e "vazantes" na sub-regiao da Nhecolandia Pantanal Mato-Grossense, com pseo variando de 0,16 a 14,5 kg. Os animais foram medidos, pesados e posteriormente abatidos e dissecados em 4 partes:cabeca, couro, carcaca e visceras. Desse material foram feitas analises quimicas para proteina bruta (N x 6,25) e energia bruta e em seguida calculou-se atraves de uma media ponderada a composicao quimica corporal de cada animal. Para estimar a relacao entre composicao quimica e peso corporal vazio (PCV) foram obtidas as equacoes InY = 2,8861 + 0,0666 InX e InY = 1,4045 + 0,0224 InX para proteina bruta (PB) e energia bruta (EB), respectivamente; onde Y = PB (%) ou EB (ucal/kg) e X = PCV (kg). Os resultados destas analises mostram um aumento de 15,8% e 3,90 ucal/kg no jacare de 0,15 kg para 21,39% e 4,32 ucal/kg no jacare de 14,21 kg de PCV para PB e EB, respectivamente. O acrescimo do percentual de PB em relacao ao aumento de peso decorre de maior quantidade de proteina... MenosA variacao da composicao quimica corporal de um animal e influenciada por fatores geneticos e ambientes e seu conhecimento contribui para o estabelecimento de requerimentos nutricionais. Esta informacao e basica para o manejo nutricional de jacares em cativeiro, visto que produtores rurais tem mostrado grande interesse em produzi-los racionalmente. Diante disso, esse trabalho visou obter informacoes preliminares sobre a composicao proteica e energetica de Caiman crocodilus yacare de acordo com o peso corporal. Foram capturados 20 jacares em ambientes de "baias" e "vazantes" na sub-regiao da Nhecolandia Pantanal Mato-Grossense, com pseo variando de 0,16 a 14,5 kg. Os animais foram medidos, pesados e posteriormente abatidos e dissecados em 4 partes:cabeca, couro, carcaca e visceras. Desse material foram feitas analises quimicas para proteina bruta (N x 6,25) e energia bruta e em seguida calculou-se atraves de uma media ponderada a composicao quimica corporal de cada animal. Para estimar a relacao entre composicao quimica e peso corporal vazio (PCV) foram obtidas as equacoes InY = 2,8861 + 0,0666 InX e InY = 1,4045 + 0,0224 InX para proteina bruta (PB) e energia bruta (EB), respectivamente; onde Y = PB (%) ou EB (ucal/kg) e X = PCV (kg). Os resultados destas analises mostram um aumento de 15,8% e 3,90 ucal/kg no jacare de 0,15 kg para 21,39% e 4,32 ucal/kg no jacare de 14,21 kg de PCV para PB e EB, respectivamente. O acrescimo do percentual de PB em relacao ao aumento de peso d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Chemistry composition; Estrutura; Growth; Manage; Protein; Yacare. |
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Thesagro: |
Composição Química; Crescimento; Energia; Jacaré; Manejo; Nutrição; Peso; Proteína. |
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Thesaurus NAL: |
energy; nutrition; Pantanal. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02556naa a2200361 a 4500
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520 $aA variacao da composicao quimica corporal de um animal e influenciada por fatores geneticos e ambientes e seu conhecimento contribui para o estabelecimento de requerimentos nutricionais. Esta informacao e basica para o manejo nutricional de jacares em cativeiro, visto que produtores rurais tem mostrado grande interesse em produzi-los racionalmente. Diante disso, esse trabalho visou obter informacoes preliminares sobre a composicao proteica e energetica de Caiman crocodilus yacare de acordo com o peso corporal. Foram capturados 20 jacares em ambientes de "baias" e "vazantes" na sub-regiao da Nhecolandia Pantanal Mato-Grossense, com pseo variando de 0,16 a 14,5 kg. Os animais foram medidos, pesados e posteriormente abatidos e dissecados em 4 partes:cabeca, couro, carcaca e visceras. Desse material foram feitas analises quimicas para proteina bruta (N x 6,25) e energia bruta e em seguida calculou-se atraves de uma media ponderada a composicao quimica corporal de cada animal. Para estimar a relacao entre composicao quimica e peso corporal vazio (PCV) foram obtidas as equacoes InY = 2,8861 + 0,0666 InX e InY = 1,4045 + 0,0224 InX para proteina bruta (PB) e energia bruta (EB), respectivamente; onde Y = PB (%) ou EB (ucal/kg) e X = PCV (kg). Os resultados destas analises mostram um aumento de 15,8% e 3,90 ucal/kg no jacare de 0,15 kg para 21,39% e 4,32 ucal/kg no jacare de 14,21 kg de PCV para PB e EB, respectivamente. O acrescimo do percentual de PB em relacao ao aumento de peso decorre de maior quantidade de proteina...
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Embrapa Pantanal (CPAP) |
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