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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
16/11/2011 |
Data da última atualização: |
16/11/2011 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
RABELLO, F. R.; CARAZZOLLE, M. F.; MARTINS, N. F.; CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; SILVA, A. C.; REIS, A. M. dos. |
Afiliação: |
Fernanda R. Rabello, UnB; Marcelo F. Carazzolle, UNICAMP; NATALIA FLORENCIO MARTINS, CENARGEN; Magnólia A. Campos, UFLA; MARILIA SANTOS SILVA, CPAC; Alba Chiesse da Silva, SAPC; ANGELA MEHTA DOS REIS, CENARGEN. |
Título: |
Análise in silico de genes de defesa do café expressos em ramos infectados por Xylella fastidiosa. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Um dos problemas que afetam a cultura do café é o depauperamento da folha do cafeeiro (?Coffee Leaf Scorch? - CLS), causado pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria forma agregados no xilema da planta, impossibilitando a passagem de água e nutrientes. Em virtude da importância econômica da cultura do café para o Brasil e das perdas causadas por X. fastidiosa, uma biblioteca de cDNA (RX1) foi construída utilizando ramos de cafeeiro infectados com esta bactéria e os ESTs (?Expressed sequence tags?) foram incluídos no banco de dados do CafEST (Genoma Funcional de Café). Com o objetivo de identificar genes potencialmente envolvidos nos processos de defesa de cafeeiro infectado com X. fastidiosa, foi realizada uma análise in silico dos ESTs de RX1. Foi analisado um total de 7502 seqüências, que foram agrupadas em 5483 clusters. A análise global baseada em ontologia de função molecular desses clusters revelou que a maior parte dos genes (cerca de 70%) está envolvida com metabolismo e processos fisiológicos celulares. Aproximadamente 1% dos ESTs está envolvido com estresse biótico e 2% com estresse abiótico. Foram encontrados ainda genes relacionados com a resposta a estímulos externos e ao estresse, diferenciação celular, entre outras funções. Dos 5483 clusters da biblioteca RX1, 2254 representam possivelmente genes únicos, pois não foram encontrados nas outras 37 bibliotecas do CafEST, construídas a partir de diferentes tecidos e condições biológicas. Muitos destes genes estão classicamente envolvidos com os processos de defesa da planta, incluindo aqueles que codificam para oxidases, peroxidases, lipoxigenases, proteínas de resistência, entre outros. MenosUm dos problemas que afetam a cultura do café é o depauperamento da folha do cafeeiro (?Coffee Leaf Scorch? - CLS), causado pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria forma agregados no xilema da planta, impossibilitando a passagem de água e nutrientes. Em virtude da importância econômica da cultura do café para o Brasil e das perdas causadas por X. fastidiosa, uma biblioteca de cDNA (RX1) foi construída utilizando ramos de cafeeiro infectados com esta bactéria e os ESTs (?Expressed sequence tags?) foram incluídos no banco de dados do CafEST (Genoma Funcional de Café). Com o objetivo de identificar genes potencialmente envolvidos nos processos de defesa de cafeeiro infectado com X. fastidiosa, foi realizada uma análise in silico dos ESTs de RX1. Foi analisado um total de 7502 seqüências, que foram agrupadas em 5483 clusters. A análise global baseada em ontologia de função molecular desses clusters revelou que a maior parte dos genes (cerca de 70%) está envolvida com metabolismo e processos fisiológicos celulares. Aproximadamente 1% dos ESTs está envolvido com estresse biótico e 2% com estresse abiótico. Foram encontrados ainda genes relacionados com a resposta a estímulos externos e ao estresse, diferenciação celular, entre outras funções. Dos 5483 clusters da biblioteca RX1, 2254 representam possivelmente genes únicos, pois não foram encontrados nas outras 37 bibliotecas do CafEST, construídas a partir de diferentes tecidos e condições biológicas. Muitos destes genes e... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Análise; Bactéria; Café. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46678/1/Analise-in-silico-de-genes.pdf
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Marc: |
LEADER 02428nam a2200217 a 4500 001 1906039 005 2011-11-16 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aRABELLO, F. R. 245 $aAnálise in silico de genes de defesa do café expressos em ramos infectados por Xylella fastidiosa.$h[electronic resource] 260 $aIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café$c2007 520 $aUm dos problemas que afetam a cultura do café é o depauperamento da folha do cafeeiro (?Coffee Leaf Scorch? - CLS), causado pela bactéria Xylella fastidiosa. Esta bactéria forma agregados no xilema da planta, impossibilitando a passagem de água e nutrientes. Em virtude da importância econômica da cultura do café para o Brasil e das perdas causadas por X. fastidiosa, uma biblioteca de cDNA (RX1) foi construída utilizando ramos de cafeeiro infectados com esta bactéria e os ESTs (?Expressed sequence tags?) foram incluídos no banco de dados do CafEST (Genoma Funcional de Café). Com o objetivo de identificar genes potencialmente envolvidos nos processos de defesa de cafeeiro infectado com X. fastidiosa, foi realizada uma análise in silico dos ESTs de RX1. Foi analisado um total de 7502 seqüências, que foram agrupadas em 5483 clusters. A análise global baseada em ontologia de função molecular desses clusters revelou que a maior parte dos genes (cerca de 70%) está envolvida com metabolismo e processos fisiológicos celulares. Aproximadamente 1% dos ESTs está envolvido com estresse biótico e 2% com estresse abiótico. Foram encontrados ainda genes relacionados com a resposta a estímulos externos e ao estresse, diferenciação celular, entre outras funções. Dos 5483 clusters da biblioteca RX1, 2254 representam possivelmente genes únicos, pois não foram encontrados nas outras 37 bibliotecas do CafEST, construídas a partir de diferentes tecidos e condições biológicas. Muitos destes genes estão classicamente envolvidos com os processos de defesa da planta, incluindo aqueles que codificam para oxidases, peroxidases, lipoxigenases, proteínas de resistência, entre outros. 650 $aAnálise 650 $aBactéria 650 $aCafé 700 1 $aCARAZZOLLE, M. F. 700 1 $aMARTINS, N. F. 700 1 $aCAMPOS, M. A. 700 1 $aSILVA, M. S. 700 1 $aSILVA, A. C. 700 1 $aREIS, A. M. dos
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Territorial. Para informações adicionais entre em contato com cnpm.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Territorial. |
Data corrente: |
19/02/2013 |
Data da última atualização: |
10/06/2014 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
STARK, S. C.; LEITOLD, V.; WU, J. L.; HUNTER, M. O.; CASTILHO, C. V. de; COSTA, F. R. C.; MCMAHON, S. M.; PARKER, G. G.; SHIMABUKURO, M. T.; LEFSKY, M. A.; KELLER, M.; ALVES, L. F.; SCHIETTI, J.; SHIMABUKURO, Y. E.; BRANDÃO, D. O.; WOODCOCK, T. K.; HIGUCHI, N.; CAMARGO, P. B. DE; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SALESKA, S. R. |
Afiliação: |
SCOTT C. STARK, UNIVERSITY OF ARIZONA; VERONIKA LEITOLD, UNIVERSITY OF ARIZONA; JIN L. WU, UNIVERSITY OF ARIZONA; MARIA O. HUNTER, UNIVERSITY OF NEW HAMPSHIRE; CAROLINA VOLKMER DE CASTILHO, CPAF-RR; FLÁVIA R. C. COSTA, INPA; SEAN M. MCMAHON, SMITHSONIAN TROPICAL RESEARCH INSTITUTE; GEOFFREY G. PARKER, SMITHSONIAN ENVIRONMENTAL RESEARCH CENTER; MÔNICA TAKAKO SIMABUKURO, INPE; MICHAEL A. LEFSKY, COLORADO STATE UNIVERSITY; MICHAEL KELLER, USDA FOREST SERVICE/EMBRAPA MONITORAMENTO POR SATÉLITE; LUCIANA F. ALVES, INSTITUTO DE BOTÂNICA; JULIANA SCHIETTI, INPA; YOSIO EDEMIR SHIMABUKURO, INPE; DIEGO O. BRANDÃO, INPA; TARA K. WOODCOCK, UNIVERSITY OF ARIZONA; NIRO HIGUCHI, INPA; PLÍNIO B. DE CAMARGO, CENA/USP; RAIMUNDO COSME DE OLIVEIRA JUNIOR, CPATU; SCOTT R. SALESKA, UNIVERSITY OF ARIZONA. |
Título: |
Amazon forest carbon dynamics predicted by profiles of canopy leaf area and light environment. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Ecology Letters, v. 15, n. 12, dez. 2012. |
Páginas: |
p. 1406-1414. |
DOI: |
10.1111/j.1461-0248.2012.0186.x |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Artigo publicado por Pesquisador Visitante da Embrapa Monitoramento por Satélite. |
Conteúdo: |
Tropical forest structural variation across heterogeneous landscapes may control above-ground carbon dynamics. We tested the hypothesis that canopy structure (leaf area and light availability) ? remotely estimated from LiDAR ? control variation in above-ground coarse wood production (biomass growth). Using a statistical model, these factors predicted biomass growth across tree size classes in forest near Manaus, Brazil. The same statistical model, with no parameterisation change but driven by different observed canopy structure, predicted the higher productivity of a site 500 km east. Gap fraction and a metric of vegetation vertical extent and evenness also predicted biomass gains and losses for one-hectare plots. Despite significant site differences in canopy structure and carbon dynamics, the relation between biomass growth and light fell on a unifying curve. This supported our hypothesis, suggesting that knowledge of canopy structure can explain variation in biomass growth over tropical landscapes and improve understanding of ecosystem function. |
Palavras-Chave: |
Biomass growth; Carbon balance; Gap fraction; Leaf area profiles; Remote sensing of canopy structure. |
Thesaurus NAL: |
LiDAR. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02422naa a2200457 a 4500 001 1949933 005 2014-06-10 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1111/j.1461-0248.2012.0186.x$2DOI 100 1 $aSTARK, S. C. 245 $aAmazon forest carbon dynamics predicted by profiles of canopy leaf area and light environment.$h[electronic resource] 260 $c2012 300 $ap. 1406-1414. 500 $aArtigo publicado por Pesquisador Visitante da Embrapa Monitoramento por Satélite. 520 $aTropical forest structural variation across heterogeneous landscapes may control above-ground carbon dynamics. We tested the hypothesis that canopy structure (leaf area and light availability) ? remotely estimated from LiDAR ? control variation in above-ground coarse wood production (biomass growth). Using a statistical model, these factors predicted biomass growth across tree size classes in forest near Manaus, Brazil. The same statistical model, with no parameterisation change but driven by different observed canopy structure, predicted the higher productivity of a site 500 km east. Gap fraction and a metric of vegetation vertical extent and evenness also predicted biomass gains and losses for one-hectare plots. Despite significant site differences in canopy structure and carbon dynamics, the relation between biomass growth and light fell on a unifying curve. This supported our hypothesis, suggesting that knowledge of canopy structure can explain variation in biomass growth over tropical landscapes and improve understanding of ecosystem function. 650 $aLiDAR 653 $aBiomass growth 653 $aCarbon balance 653 $aGap fraction 653 $aLeaf area profiles 653 $aRemote sensing of canopy structure 700 1 $aLEITOLD, V. 700 1 $aWU, J. L. 700 1 $aHUNTER, M. O. 700 1 $aCASTILHO, C. V. de 700 1 $aCOSTA, F. R. C. 700 1 $aMCMAHON, S. M. 700 1 $aPARKER, G. G. 700 1 $aSHIMABUKURO, M. T. 700 1 $aLEFSKY, M. A. 700 1 $aKELLER, M. 700 1 $aALVES, L. F. 700 1 $aSCHIETTI, J. 700 1 $aSHIMABUKURO, Y. E. 700 1 $aBRANDÃO, D. O. 700 1 $aWOODCOCK, T. K. 700 1 $aHIGUCHI, N. 700 1 $aCAMARGO, P. B. DE 700 1 $aOLIVEIRA JUNIOR, R. C. de 700 1 $aSALESKA, S. R. 773 $tEcology Letters$gv. 15, n. 12, dez. 2012.
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