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| Registros recuperados : 16 | |
| 3. |  | ALVES, J. C. da S. F.; DIAS, R. de C. S.; TEIXEIRA, F. A.; DAMACENO, L. S.; GAMA, R. N. C. de S. Germinação de híbridos de melancia triploide submetidos a procedimentos pré-germinativos. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 6., 2011, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2011. (Embrapa Semiárido. Documentos, 238).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 4. | | TEIXEIRA, F. A.; DIAS, R. de C. S.; QUEIROZ, M. A. de; DAMACENO, L. S.; ALVES, J. C. da S. F. Desempenho agronômico de genótipos de melancia sob diferentes ambientes de cultivo. Horticultura Brasileira, v. 30, n. 2, p. S366-S372, jul. 2012. 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos Anais do 52 Congresso Brasileiro de Olericultura, Salvador, jul. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 5. | | BATISTA, P. P.; LIMA, R. S. N. de; SANTOS, C. A. F.; RODRIGUES, M. A.; ALVES, J. C. da S. F. Divergência genética entre populações de cebola potenciais e comerciais para o Nordeste, com base em marcador AFLP. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 25, n. 1, ago. 2007. 1 CD-ROM. Edição dos Anais do 47. Congresso Brasileiro de Olericultura; 4. Simpósio Brasileiro sobre Cucurbitáceas, Porto Seguro, ago. 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 6. | | SOUZA, C. C. B. de; DIAS, R. de C. S.; FABRÍCIO, A. A.; DAMACENO, L. S.; BARBOSA, B. L. R.; ALVES, J. C. da S. F. Avaliação de emergência e precocidade de acessos de melão do Banco de Germoplasma de Cucurbitáceas do Nordeste brasileiro. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 7.; JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FACEPE/UNIVASF, 1., 2012, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2012. p. 103-109. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 248).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | ALVES, J. C. da S. F.; DIAS, R. de C. S.; SOUZA, F. de F.; DAMACENO, L. S.; TEIXEIRA, F. A. Avaliação físico-química de híbridos de melancia sem sementes. Horticultura Brasileira, v. 30, n. 2, p. S4439-S4444, jul. 2012. 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos Anais do 52 Congresso Brasileiro de Olericultura, Salvador, jul. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 8. | | ALVES, J. C. da S. F.; DIAS, R. de C. S.; AMARAL, C. M. do; SOUZA, R. N. C. de; MENEZES, E. A. Multiplicação e avaliação preliminar de acessos de melão quanto à resistência ao cancro das hastes. In: ENCONTRO DA REDE DE RECURSOS GENÉTICOS VEGETAIS DO ESTADO DA BAHIA, 3.; SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS DE PLANTAS CULTIVADAS NO NORDESTE BRASILEIRO, 2., 2008, Vitória da Conquista. Resumos expandidos... Vitória da Conquista: UESB, 2008. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 9. | | GAMA, R. N. C. de S.; DIAS, R. de C. S.; ALVES, J. C. da S. F; DAMACENO, L. S.; TEIXEIRA, F. A.; AMARAL, C. M. do. Seleção de porta-enxertos para cultivares de melancia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 10. | | ALVES, J. C. da S. F.; DIAS, R. de C. S.; SOUZA, R. N. C. de; AMARAL, C. M. do; SILVA, C. M. de J.; DAMACENO, L. S.; TEIXEIRA, F. A. Germinação em híbrido de melancia triplóide submetido a tratamentos mecânicos pré-germinativos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para produção de alimentos e bioenergia. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 11. | | OLIVEIRA, J. B. de; DIAS, R. de C. S.; ALVES, J. C. da S. F; DAMASCENO, L. S.; SANTOS, J. S. dos; LIMA, R. da S.; LUBARINO, P. C. da C.; ANDRADE, K. M. N. S. S. Desenvolvimento e precocidade das plantas de melancia submetidas a diferentes substratos e épocas de transplantio. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 8., 2013, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2013. p. 267-272. (Embrapa Semiárido. Documentos, 253).| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 12. | | DIAS, R. de C. S.; QUEIROZ, M. A. de; SOUZA, R. N. de; AMARAL, C. M. do; ALVES, J. C. da S. F.; GOEDERT, C. O.; CAJUEIRO, E. V. de M. Diagnóstico do banco ativo de germoplasma de cucurbitáceas para o Nordeste Brasileiro: Número e procedência dos acessos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.329.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | DIAS, R. de C. S.; QUEIROZ, M. A. de; SOUZA, R. N. de; AMARAL, C. M. do; ALVES, J. C. da S. F.; GOEDERT, C, O.; CAJUEIRO, E. V. de M. Diagnóstico do banco ativo de germoplasma de cucurbitáceas para o Nordeste brasileiro: número e procedência dos acessos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 329.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 14. | | DIAS, R. de C. S.; QUEIRÓZ, M. A. de; AMARAL, C. M. do; SOUZA, R. N. C. de; ALVES, J. C. da S. F.; DAMASCERNO, L. S.; TEIXEIRA, F. A. Seleção de acessos de cucurbitaceas quanto à resistência aos patógenos do solo. In: ENCONTRO DA REDE DE RECURSOS GENÉTICOS VEGETAIS DO ESTADO DA BAHIA, 3.; SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS DE PLANTAS CULTIVADAS NO NORDESTE BRASILEIRO, 2., 2008, Vitória da Conquista. Resumos expandidos... Vitória da Conquista: UESB, 2008. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 15. | | DIAS, R. de C. S.; DAMACENO, L. S.; AMARAL, C. M. do; ALVES, J. C. da S. F; OLIVEIRA, C. A. V. de; SOUZA, R. N. C. de; SOUZA, S. O. de. Qualidade e vida útil pós-colheita de melancia para o mercado interno em condições ambientes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para produção de alimentos e bioenergia. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 16. | | DAMACENO, L. S.; DIAS, R. de C. S.; AMARAL, C. M. do; TEIXEIRA, F. A.; ALVES, J. C. da S. F.; SOUZA, R. N. C. de; SILVA, C. M. de J.; SOUZA. S. O. de. Qualidade e vida útil pós-colheita de melão orgânico tipo amarelo armazenado sob condições ambientes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para produção de alimentos e bioenergia. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| Registros recuperados : 16 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
24/08/2018 |
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Data da última atualização: |
20/11/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
SOUZA, L. M. de; SANTOS, L. H. B. dos; ROSA, J. R. B. F.; SILVA, C. C. da; MANTELLO, C. C.; CONSON, A. R. O.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FIALHO, J. de F.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, P. de S.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F.; LE GUEN, V.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
LIVIA M. DE SOUZA, UNICAMP; LUCIANO H. B. DOS SANTOS, UNICAMP; JOÃO R. B. F. ROSA, USP/ESALQ; CARLA C. DA SILVA, UNICAMP; CAMILA C. MANTELLO, UNICAMP; ANDRE R. O. CONSON, UNICAMP; ERIVALDO J. SCALOPPI JUNIOR, IAC; JOSEFINO DE FREITAS FIALHO, CPAC; MARIO LUIZ T. DE MORAES, UNESP; PAULO DE S. GONÇALVES, IAC; GABRIEL R. A. MARGARIDO, USP/ESALQ; ANTONIO A. F. GARCIA, USP/ESALQ; VINCENT LE GUEN, CIRAD; ANETE P. DE SOUZA, UNICAMP. |
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Título: |
Linkage disequilibrium and population structure in wild and cultivated populations of rubber tree (Hevea brasiliensis). |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 9, article 815, 03 July 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3389/fpls.2018.00815 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Among rubber tree species, which belong to the Hevea genus of the Euphorbiaceae family, Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr.de Juss.) Muell. Arg. is the main commercial source of natural rubber production worldwide. Knowledge of the population structure and linkage disequilibrium (LD) of this species is essential for the efficient organization and exploitation of genetic resources. Here, we obtained single-nucleotide polymorphisms (SNPs) using a genotyping-by-sequencing (GBS) approach and then employed the SNPs for the following objectives: (i) to identify the positions of SNPs on a genetic map of a segregating mapping population, (ii) to evaluate the population structure of a germplasm collection, and (iii) to detect patterns of LD decay among chromosomes for future genetic association studies in rubber tree. A total of 626 genotypes, including both germplasm accessions (368) and individuals from a genetic mapping population (254), were genotyped. A total of 77,660 and 21,283 SNPs were detected by GBS in the germplasm and mapping populations, respectively. The mapping population, which was previously mapped, was constructed with 1,062 markers, among which only 576 SNPs came from GBS, reducing the average interval between two adjacent markers to 4.4 cM. SNPs from GBS genotyping were used for the analysis of genetic structure and LD estimation in the germplasm accessions. Two groups, which largely corresponded to the cultivated and wild populations, were detected using STRUCTURE and via principal coordinate analysis. LD analysis, also using the mapped SNPs, revealed that non-random associations varied along chromosomes, with regions of high LD interspersed with regions of low LD. Considering the length of the genetic map (4,693 cM) and the mean LD (0.49 for cultivated and 0.02 for wild populations), a large number of evenly spaced SNPs would be needed to perform genome-wide association studies in rubber tree, and the wilder the genotypes used, the more difficult the mapping saturation. MenosAbstract: Among rubber tree species, which belong to the Hevea genus of the Euphorbiaceae family, Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr.de Juss.) Muell. Arg. is the main commercial source of natural rubber production worldwide. Knowledge of the population structure and linkage disequilibrium (LD) of this species is essential for the efficient organization and exploitation of genetic resources. Here, we obtained single-nucleotide polymorphisms (SNPs) using a genotyping-by-sequencing (GBS) approach and then employed the SNPs for the following objectives: (i) to identify the positions of SNPs on a genetic map of a segregating mapping population, (ii) to evaluate the population structure of a germplasm collection, and (iii) to detect patterns of LD decay among chromosomes for future genetic association studies in rubber tree. A total of 626 genotypes, including both germplasm accessions (368) and individuals from a genetic mapping population (254), were genotyped. A total of 77,660 and 21,283 SNPs were detected by GBS in the germplasm and mapping populations, respectively. The mapping population, which was previously mapped, was constructed with 1,062 markers, among which only 576 SNPs came from GBS, reducing the average interval between two adjacent markers to 4.4 cM. SNPs from GBS genotyping were used for the analysis of genetic structure and LD estimation in the germplasm accessions. Two groups, which largely corresponded to the cultivated and wild populations, were detected usin... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Comportamento de Variedade; Hevea Brasiliensis; População de Planta; Seringueira; Variação Genética. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181926/1/DL-Hevea-brasiliensis-Livia-public-Frontiers-3.07.2018apagar.pdf
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Marc: |
LEADER 03139naa a2200349 a 4500
001 2094508
005 2018-11-20
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.3389/fpls.2018.00815$2DOI
100 1 $aSOUZA, L. M. de
245 $aLinkage disequilibrium and population structure in wild and cultivated populations of rubber tree (Hevea brasiliensis).$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aAbstract: Among rubber tree species, which belong to the Hevea genus of the Euphorbiaceae family, Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr.de Juss.) Muell. Arg. is the main commercial source of natural rubber production worldwide. Knowledge of the population structure and linkage disequilibrium (LD) of this species is essential for the efficient organization and exploitation of genetic resources. Here, we obtained single-nucleotide polymorphisms (SNPs) using a genotyping-by-sequencing (GBS) approach and then employed the SNPs for the following objectives: (i) to identify the positions of SNPs on a genetic map of a segregating mapping population, (ii) to evaluate the population structure of a germplasm collection, and (iii) to detect patterns of LD decay among chromosomes for future genetic association studies in rubber tree. A total of 626 genotypes, including both germplasm accessions (368) and individuals from a genetic mapping population (254), were genotyped. A total of 77,660 and 21,283 SNPs were detected by GBS in the germplasm and mapping populations, respectively. The mapping population, which was previously mapped, was constructed with 1,062 markers, among which only 576 SNPs came from GBS, reducing the average interval between two adjacent markers to 4.4 cM. SNPs from GBS genotyping were used for the analysis of genetic structure and LD estimation in the germplasm accessions. Two groups, which largely corresponded to the cultivated and wild populations, were detected using STRUCTURE and via principal coordinate analysis. LD analysis, also using the mapped SNPs, revealed that non-random associations varied along chromosomes, with regions of high LD interspersed with regions of low LD. Considering the length of the genetic map (4,693 cM) and the mean LD (0.49 for cultivated and 0.02 for wild populations), a large number of evenly spaced SNPs would be needed to perform genome-wide association studies in rubber tree, and the wilder the genotypes used, the more difficult the mapping saturation.
650 $aComportamento de Variedade
650 $aHevea Brasiliensis
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650 $aSeringueira
650 $aVariação Genética
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700 1 $aSOUZA, A. P. de
773 $tFrontiers in Plant Science$gv. 9, article 815, 03 July 2018.
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