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| Registros recuperados : 94 | |
| 61. |  | BASTOS, T. X.; ROCHA, A. M. A. da; PACHECO, N. A.; SILVA, B. N. R. da; NASCIMENTO, F. R. X. do; SANTOS, A. R. dos. Diagnóstico agroclimático de áreas com vegetação natural alterada no estado do Pará - estudo de caso do município de Santarém. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 8., 1993, Porto Alegre. Resumos. Santa Maria: UFSM, 1993. p. 17.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 62. | | CARVALHO, H. W. L. de; BRITO NETO, J.; FREIRE FILHO, F. R.; SANTOS, A. R. dos; OLIVEIRA, V. D. de; SOUZA, E. M. de; RIBEIRO, S. S. Desempenho de linhagens avançadas de feijão Caupi no Nordeste brasileiro. Revista Científica Rural, Bagé, v. 13, n. 1, p. 126-138, ago. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 64. | | SANTOS, A. R. dos; ALMEIDA, U. O. de; SILVA, F. C. G. da; RIBEIRO, R. da S.; RAMALHO, A. R.; MILITÃO, J. L. T. S.; ROCHA, R. B. Avaliação da variabilidade do teor de óleo de matrizes de pinhão manso (Jatropha curcas L.). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 61., 2010, Manaus. Diversidade vegetal brasileira: conhecimento, conservação e uso. Manaus: SBB, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 65. | | SANTOS, A. R. dos; BOAVENTURA, G. R.; PINELLI, M. P.; SILVA, J. E. da; DIAS, R. P.; RAMAGEM, R. D.; MEYER, S. T. Avaliacao da concentracao de metais em composto de lixo urbano processado no Distrito Federal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIENCIA DO SOLO, 25., 1995, Vicosa, MG. O solo nos grandes dominios morfoclimaticos do Brasil e o desenvolvimento sustentado: resumos expandidos. Vicosa: SBCS, 1995. v.4. p.2388-2389.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 66. | | SANTOS, A. R. dos; BOAVENTURA, G. R.; PINELLI, P.; SILVA, J. E. da; DIAS, R. P.; RAMAGEM, R. D.; MEYER, S. T. Avaliação da concentração de metais em composto de lixo urbano processado no Distrito Federal. IN: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNÇIA DO SOLO, 25., Viçosa, MG. Resumos expandidos. Viçosa: UFV, 1995. v.4, p. 2388-2389.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 67. | | PELUZIO, T. M. de O.; SANTOS, A. R. dos; FIEDLER, N. C.; BAUER, M. de O.; GARCIA, G. de O.; SIMÃO, J. B. P.; PELUZIO, J. B. E. Comparação fotointerpretativa entre aerofoto e imagem de satélite. Ciência Florestal, Santa Maria, RS, v. 23, n. 2, p. 537-544, abr./jun. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 68. | | PEREIRA, F. da S.; COSTA, J. N. M.; ROCHA, R. B.; SANTOS, A. R. dos; ALMEIDA, U. O. de; ALVES, J. D. Ocorrência de ácaro-branco Polyphagotarsonemus latus em pinhão-manso cultivado em Porto Velho, Rondônia, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal, RN. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 70. | | SANTOS, A. R. dos; ALMEIDA, U. O. de; RAMALHO, A. R.; FERREIRA, F. M.; VIEIRA JUNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F.; ROCHA, R. B. Quantificação da variabilidade genética entre procedências e famílias de pinhão manso (Jatropha curcas L.). In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 61., 2010, Manaus. Diversidade vegetal brasileira: conhecimento, conservação e uso. Manaus: SBB, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 71. | | ARAÚJO, E. F.; GIBSON, E. L.; SANTOS, A. R. dos; GONÇALVES, E. de O.; WENDLING, I.; ALEXANDRE, R. S.; PAOLA, L. A. V. Mini-cutting technique for vegetative propagation of Paratecoma peroba. Cerne, v. 25, n. 3, p. 314-325, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 72. | | COSTA, F. P.; BELAN, L. L.; FONSECA, S. O. da; SILVA, M. V. da; MARTINS, L. D.; SANTOS, A. R. dos. Influência da época de plantio na incidência e severidade do mofo cinzento (Botrytis ricini) na mamoneira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 6., 2009. Montes Claros. Biodiesel: inovação tecnológica – anais. Lavras: UFLA, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 73. | | COSTA, F. P.; BELAN, L. L.; FONSECA, S. O. da; MARTINS, L. D.; SANTOS, A. R. dos; SOUZA, A. F. de. Influência da época de plantio na severidade do mofo cinzento (Botrytis ricini L.) na mamoneira (Ricinus communis L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 6., 2009. Montes Claros. Biodiesel: inovação tecnológica - anais. Lavras: UFLA, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 74. | | RODRIGUES, M. do R. L.; SANTOS, A. R. dos; SILVA, A. C.; NEVES, C. S. V. J.; PAIVA, A. V. de; MELLO, S. L. de M. Concentração de nutrientes em folhas de diferentes estadios fenológicos em Hevea brasiliensis e Pinus oocarpa. IN: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNÇIA DO SOLO, 25., 1995, Viçosa, MG. Resumos expandidos. Viçosa: UFV, 1995. v.2, p. 564-565.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 75. | | RODRIGUES, M. do R. L.; NEVES, C. S. V. J.; SILVA, A. C.; SANTOS, A. R. dos; PAIVA, A. V. de; MELLO, S. L. de M. Concentração e redistribuição de nutrientes em folhas de Hevea brasiliensis e Pinus oocarpa. Semina: Ciências Agrárias, v. 21, n. 1, p. 61-66, mar. 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 76. | | SILVA, J. E. da; MEYER, S. T.; RESCK, D. V. S.; MIRANDA, L. N. de; RAMAGEM, R. D.; SANTOS, A. R. dos. Uso do lodo de esgoto como fonte de fosforo e nitrogenio para milho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIENCIA DO SOLO, 25., 1995, Vicosa, MG. O solo nos grandes dominios morfoclimaticos do Brasil e o desenvolvimento sustentado: resumos expandidos. Vicosa: SBCS, 1995. v.4. p.2276-2278.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 78. | | RESENDE, R. T.; SOARES, A. A. V.; FORRESTER, D. I.; MARCATTI, G. E.; SANTOS, A. R. dos; TAKAHASHI, E. K.; SILVA, F. F. e; GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; LEITE, H. G. Environmental uniformity, site quality and tree competition interact to determine stand productivity of clonal Eucalyptus. Forest Ecology and Management, v. 410, p. 76-83, Feb. 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 79. | | CARVALHO, C. G. P.; CALDEIRA, A.; CARVALHO, L. M. de; CARVALHO, H. W. L. de; RIBEIRO, J. L.; MANDARINO, J. M. G.; RESENDE, J. C. F. de; SANTOS, A. R. dos; SILVA, M. R. da; ARRIEL, N. H. C. Fatty acid profile of sunflower achene oil from the brazilian semi-arid region. Journal of Agricultural Science, v. 10, n. 10, p. 144-150, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Soja; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 80. | | SANTOS, A. R. dos; KUHN, C. E. S.; REIS, F. A. G. V.; CANIL, K.; FIGUEIRA, R. M.; PEREIRA FILHO, A. J.; NASCIMENTO, M. A. L. do; HOFF, R. Geologia de engenharia, riscos ambientais e planejamento territorial. In:REIS, F. A. G. V.; KUHN, C. E. S.; FIGUEIRA, R. M.; VIERO, A. P.(Ed.). Geologia na construção e desenvolvimento sustentável do Brasil. São Paulo: FEBRAGEO, 2019. p. 124-146.| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| Registros recuperados : 94 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
30/12/2019 |
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Data da última atualização: |
06/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
SBARDELLA, A. P.; WELLER, M. M. D. C. A.; I. FONSECA; N. B. STAFUZZA; P. A. BERNARDES; F. F. e SILVA; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; D. P. MUNARI. |
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Afiliação: |
A. P. SBARDELLA; M. M. D. C. A. WELLER; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL. |
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Título: |
Ribonucleic acid sequencing differential gene expression analysis of isolated perfused bovine udders experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Dairy Science, v. 102, n. 2, p. 1761-1767, 2019. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3168/jds.2018-15516 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to elucidate the differential gene expression in the RNA sequencing transcriptome of isolated perfused udders collected from 4 slaughtered Holstein × Zebu crossbred dairy cows experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae. We studied 3 different statistical tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). In summary, 2 quarters of each udder were experimentally inoculated with Strep. agalactiae and the other 2 were used as a control. Mammary tissue biopsies were collected at times 0 and 3 h after infection. The total RNA was extracted and sequenced on an Illumina HiSeq 2000 (Illumina Inc., San Diego, CA). Transcripts were assembled from the reads aligned to the bovine UMD 3.1 reference genome, and the statistical analyses were performed using the previously mentioned tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). Finally, the identified genes were submitted to pathway enrichment analysis. A total of 1,756, 1,161, and 3,389 genes with differential gene expression were identified when using edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2, respectively. A total of 122 genes were identified by the overlapping of the 3 methods; however, only the platelet activation presented a significantly enriched pathway. From the results, we suggest the FCER1G, GNAI2, ORAI1, and VASP genes shared among the 3 methods in this pathway for posterior biological validation. |
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Palavras-Chave: |
BaySeq; Crossbred dairy cow; Cuffdiff 2; EdgeR; RNA sequencing. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02292naa a2200289 a 4500
001 2117886
005 2024-02-06
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.3168/jds.2018-15516$2DOI
100 1 $aSBARDELLA, A. P.
245 $aRibonucleic acid sequencing differential gene expression analysis of isolated perfused bovine udders experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae.$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aThe aim of this study was to elucidate the differential gene expression in the RNA sequencing transcriptome of isolated perfused udders collected from 4 slaughtered Holstein × Zebu crossbred dairy cows experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae. We studied 3 different statistical tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). In summary, 2 quarters of each udder were experimentally inoculated with Strep. agalactiae and the other 2 were used as a control. Mammary tissue biopsies were collected at times 0 and 3 h after infection. The total RNA was extracted and sequenced on an Illumina HiSeq 2000 (Illumina Inc., San Diego, CA). Transcripts were assembled from the reads aligned to the bovine UMD 3.1 reference genome, and the statistical analyses were performed using the previously mentioned tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). Finally, the identified genes were submitted to pathway enrichment analysis. A total of 1,756, 1,161, and 3,389 genes with differential gene expression were identified when using edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2, respectively. A total of 122 genes were identified by the overlapping of the 3 methods; however, only the platelet activation presented a significantly enriched pathway. From the results, we suggest the FCER1G, GNAI2, ORAI1, and VASP genes shared among the 3 methods in this pathway for posterior biological validation.
653 $aBaySeq
653 $aCrossbred dairy cow
653 $aCuffdiff 2
653 $aEdgeR
653 $aRNA sequencing
700 1 $aWELLER, M. M. D. C. A.
700 1 $aI. FONSECA
700 1 $aN. B. STAFUZZA
700 1 $aP. A. BERNARDES
700 1 $aF. F. e SILVA
700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
700 1 $aMARTINS, M. F.
700 1 $aD. P. MUNARI
773 $tJournal of Dairy Science$gv. 102, n. 2, p. 1761-1767, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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