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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
09/02/2023 |
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Data da última atualização: |
10/02/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AFONSO, J.; SHIM, W. J.; BODEN, M.; FORTES, M. R. S.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; ROCHA, M. I. P.; CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. A.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
JULIANA AFONSO; WOO JUN SHIM, THE UNIVERSITY OF QUEENSLAND; MIKAEL BODEN, THE UNIVERSITY OF QUEENSLAND; MARINA RUFINO SALINAS FORTES, THE UNIVERSITY OF QUEENSLAND; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, AUBURN UNIVERSITY; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, UNIVERSITY OF WASHINGTON; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; JENNIFER JESSICA BRUSCADIN, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; CAIO FERNANDO GROMBONI, INSTITUTO FEDERAL DE EDUCAÇÃO, CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA BAHIA; ANA RITA ARAUJO NOGUEIRA; GERSON BARRETO MOURÃO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Repressive epigenetic mechanisms, such as the H3K27me3 histone modification, were predicted to affect muscle gene expression and its mineral content in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Biochemistry and Biophysics Reports, v. 33, 101420, Mar. 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.bbrep.2023.101420 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Epigenetic repression has been linked to the regulation of different cell states. In this study, we focus on the influence of this repression, mainly by H3K27me3, over gene expression in muscle cells, which may affect mineral content, a phenotype that is relevant to muscle function and beef quality. Based on the inverse relationship between H3K27me3 and gene expression (i.e., epigenetic repression) and on contrasting sample groups, we computationally predicted regulatory genes that affect muscle mineral content. To this end, we applied the TRIAGE predictive method followed by a rank product analysis. This methodology can predict regulatory genes that might be affected by repressive epigenetic regulation related to mineral concentration. Annotation of orthologous genes, between human and bovine, enabled our investigation of gene expression in the Longissimus thoracis muscle of Bos indicus cattle. The animals under study had a contrasting mineral content in their muscle cells. We identified candidate regulatory genes influenced by repressive epigenetic mechanisms, linking histone modification to mineral content in beef samples. The discovered candidate genes take part in multiple biological pathways, i.e., impulse transmission, cell signalling, immunological, and developmental pathways. Some of these genes were previously associated with mineral content or regulatory mechanisms. Our findings indicate that epigenetic repression can partially explain the gene expression profiles observed in muscle samples with contrasting mineral content through the candidate regulators here identified. MenosAbstract. Epigenetic repression has been linked to the regulation of different cell states. In this study, we focus on the influence of this repression, mainly by H3K27me3, over gene expression in muscle cells, which may affect mineral content, a phenotype that is relevant to muscle function and beef quality. Based on the inverse relationship between H3K27me3 and gene expression (i.e., epigenetic repression) and on contrasting sample groups, we computationally predicted regulatory genes that affect muscle mineral content. To this end, we applied the TRIAGE predictive method followed by a rank product analysis. This methodology can predict regulatory genes that might be affected by repressive epigenetic regulation related to mineral concentration. Annotation of orthologous genes, between human and bovine, enabled our investigation of gene expression in the Longissimus thoracis muscle of Bos indicus cattle. The animals under study had a contrasting mineral content in their muscle cells. We identified candidate regulatory genes influenced by repressive epigenetic mechanisms, linking histone modification to mineral content in beef samples. The discovered candidate genes take part in multiple biological pathways, i.e., impulse transmission, cell signalling, immunological, and developmental pathways. Some of these genes were previously associated with mineral content or regulatory mechanisms. Our findings indicate that epigenetic repression can partially explain the gene expressio... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Epigenetic regulation; Expressão gênica; Gene repression; H3K27me3. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de Corte; Gado Nelore; Mineral. |
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Thesaurus Nal: |
Epigenetics; Gene expression; Minerals. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151623/1/AP-Repressive-epigenetic-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 11. | | MAGALHÃES, B. P.; LEITE, L. G.; QUINTELA, E. D.; SANTOS, S. M.; ROBERTS, D. W. Patogenicidade de Beauveria bassiana e Metarhizium anisopliae, produzidos em diferentes substratos, sobre Cerotoma arcuata. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 11., 1987, Campinas. Resumos. Campinas: SEB, 1987. v. 1. p. 187.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 13. | | CUNHA, T. J. F.; SA, I. B.; TAURA, T. A.; SANTOS, S. M. dos. Uso atual e ocupação do solo sob irrigação no perímetro irrigado do projeto Salitre, Juazeiro-BA. In: SEMINÁRIO SOLO E ÁGUA NO CONTEXTO DE DESENVOLVIMENTO EM BACIAS HIDROGRÁFICAS, 1., 2015, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: CODEVASF, 2015. 51p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 15. | | OLIVEIRA, U. R.; ALVAREZ, I. A.; TAURA, T. A.; SANTOS, S. M. Uso de geotecnologias para a criação de corredores ecológicos urbanos na cidade de petrolina, Pernambuco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ECOLOGIA DE PAISAGENS, 2.; SIMPÓSIO SCGIS-BR, 2., 2012, Salvador, BA. Anais... Salvador, BA: IALE-BR, 2012. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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| 16. | | VASCONCELOS, L. S. M. de; SANTOS, S. M. dos; TAURA, T. A.; MELO, R. F. de; SA, I. B. Aplicação de técnicas de cartografia digital na elaboração do mapa de relevo do Campo Experimental da Caatinga da Embrapa Semi-Árido. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 4., 2009, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2009. p. 317-321. (Embrapa Semi-Árido. Documentos, 221).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | ALVAREZ, I. A.; OLIVEIRA, U. R.; SANTOS, S. M. dos; SILVA, M. P. da; VASCONCELLOS, V. A. F. de. Inventário arbóreo urbano da orla fluvial da cidade de Petrolina-PE para implantação de corredores ecológicos. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 61., 2010, Manaus. Diversidade vegetal brasileira: conhecimento, conservação e uso. Manaus: SBB, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 19. | | SILVA NETA, M. E. da; LEMOS, J. de J. S.; REIS, J. N. P.; SANTOS, S. M. dos. Produção piscícola escalonada no semiárido do Ceará com externalidades positivas. Revista de Política Agrícola, Brasília, DF, ano 25, n. 4, p. 6-17, out./nov./dez. 2016. Título em inglês: Fish staggered production in Ceará semiarid with positive externalities.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 20. | | PEDROSO, M. M.; COSTA, L. M.; NASCENTES, C. C.; SANTOS, S. M.; NOGUEIRA, A. R. de A.; NÓBREGA, J. A. Preparo de amostras utilizando forno de microondas com radiação focalizada através da adição de amostra ao reagente pré-aquecido. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE DE BRASILEIRA DE QUÍMICA, 26., 2003, Poços de Caldas, MG. Livros de resumos... Poços de Caldas: SBQ, 2003. QA-162.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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