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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
19/12/2022 |
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Data da última atualização: |
19/12/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OSBORNE, O. G.; DOBREVA, M. P.; PAPADOPULOS, A. S. T.; MOURA, M. S. B. de; BRUNELLO, A. T.; QUEIROZ, L. P. de; PENNINGTON, R. T.; LLOYD, J.; SAVOLAINEN, V. |
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Afiliação: |
OWEN G. OSBORNE, Georgina Mace Centre for the Living Planet, Department of Life Sciences, Imperial College London; MARIYA P. DOBREVA, Georgina Mace Centre for the Living Planet, Department of Life Sciences, Imperial College London; ALEXANDER S. T. PAPADOPULOS, Molecular Ecology and Evolution Bangor, School of Natural Sciences, Bangor University, Environment Centre Wales; MAGNA SOELMA BESERRA DE MOURA, CPATSA; ALEXANDRE T. BRUNELLO, Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo; LUCIANO P. DE QUEIROZ, Universidade Estadual de Feira de Santana; R. TOBY PENNINGTON, Geography, University of Exeter, Amory Building; JON LLOYD, School of Biological Sciences, The University of Western Australia; VINCENT SAVOLAINEN, Royal Botanic Gardens. |
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Título: |
Mapping the root systems of individual trees in a natural community using genotyping-by-sequencing |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
New Phytologist, Nov. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1111/nph.18645 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
On-line. |
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Conteúdo: |
The architecture of root systems is an important driver of plant fitness, competition and ecosystem processes. However, the methodological difficulty of mapping roots hampers the study of these processes. Existing approaches to match individual plants to belowground samples are low-throughput and species-specific. Here, we developed a scalable sequencing-based method to map the root systes of individual trees across multiple species. We successfully applied it to a tropical dry forest community in the Brazilian Caatinga containing 14 species We sequenced all 42 individual shrubs and trees in a 14 by 14 m plot using double-digest restriction-site associated sequencing (ddRADseq). We identified species-specific markers and individual-specific haplotypes from the data. We matched these markers to ddRADseq data from 100 mixed root samples from across the centre (10 by 10 m) of the plot at four different depths, using a newly developed R package We identified individual root samples for all species and all but one individual. There was a strong significant correlation between below and aboveground size measurements, and we also detected significant species-level root-depth preference for two species.? The method is more scalable and less labour-intensive than current techniques, and is broadly applicable to ecology, forestry and agricultural biology. |
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Palavras-Chave: |
Comunidade tropical; DdRADseq; Distribuição de densidade de raízes individuais; Genotipagem; Mapeamento dos sistemas radiculares. |
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Thesagro: |
Árvore Florestal; Caatinga; Ecologia Vegetal; Floresta Tropical. |
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Thesaurus Nal: |
Plant ecology; Tropical forests. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/244008/1/Mapping-the-root-systems-of-individual-trees-in-a-natural-community-using-genotyping-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
13/03/2008 |
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Data da última atualização: |
14/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
Internacional - C |
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Autoria: |
PASSOS, A. R.; SILVA, S. A.; CRUZ, P. J.; ROCHA, M. de M.; CRUZ, E. M. de O.; ROCHA, M. A. C. da; BAHIA, H. F.; SALDANHA, R. B. |
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Afiliação: |
ADRIANA RODRIGUES PASSOS, UFBA; SIMONE ALVES SILVA, UFBA; PEDRO JACINTO CRUZ, UFBA; MAURISRAEL DE MOURA ROCHA, CPAMN; ELIZANGELA MÉRCIA DE OLIVEIRA CRUZ, UFBA; MOEMA ANGÉLICA CHAVES DA ROCHA, UFBA; HENRIQUE FORTES BAHIA, UFBA; RODRIGO BRITO SALDANHA, UFBA. |
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Título: |
Divergência genética em feijão-caupi. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Bragantia, Campinas, v. 66, n. 4, p. 579-586, 2007. |
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ISSN: |
0006-8705 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho objetivou avaliar a divergência genética entre genótipos de feijão-caupi, visando à seleção dos mais divergentes e de maior potencial produtivo para indicar como genitores em cruzamentos genéticos para futura recomendação de cultivares aos agricultores do Recôncavo Baiano. Os experimentos foram desenvolvidos na Escola de Agronomia da Universidade Federal da Bahia, Cruz das Almas (BA), utilizando-se 22 genótipos do tipo prostrado e 20 do tipo semi-ereto, dispostos em delineamento de blocos casualizados, com quatro repetições. Foram analisados os caracteres altura da planta, comprimento de vagem, massa de vagens, massa de grãos por vagem, número de grãos por vagem, massa de cem grãos, índice de grãos, produtividade de vagem e de grãos. A divergência genética foi obtida através da distância generalizada de Mahalanobis. Novas combinações gênicas promissoras podem surgir nos cruzamentos entre os genótipos TE97-309G-1, TE97-367G-3, TE97-367G-11 e TE97-430G-12 do tipo prostrado e TE97-321G-4 e TE97-404-1E-1 do tipo semi-ereto. A seleção dos genótipos TE93-244-23F-1, TE97-299G-10 e BR 17-Gurguéia tipo prostrado e os genótipos TE97-321G-4, TE97-406-2E, TE96-282-22G e EV x 91-2E-1 tipo semi-ereto demonstram superioridade para a produtividade de grãos. Os caracteres comprimento de vagem, massa de grãos por vagem e produtividade de vagens são os que mais contribuem para a divergência genética. |
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Palavras-Chave: |
Dissimilaridade; Variabilidade genética. |
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Thesagro: |
Seleção; Vigna Unguiculata. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/69522/1/Divergencia-21525.pdf
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Marc: |
LEADER 02172naa a2200265 a 4500
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520 $aEste trabalho objetivou avaliar a divergência genética entre genótipos de feijão-caupi, visando à seleção dos mais divergentes e de maior potencial produtivo para indicar como genitores em cruzamentos genéticos para futura recomendação de cultivares aos agricultores do Recôncavo Baiano. Os experimentos foram desenvolvidos na Escola de Agronomia da Universidade Federal da Bahia, Cruz das Almas (BA), utilizando-se 22 genótipos do tipo prostrado e 20 do tipo semi-ereto, dispostos em delineamento de blocos casualizados, com quatro repetições. Foram analisados os caracteres altura da planta, comprimento de vagem, massa de vagens, massa de grãos por vagem, número de grãos por vagem, massa de cem grãos, índice de grãos, produtividade de vagem e de grãos. A divergência genética foi obtida através da distância generalizada de Mahalanobis. Novas combinações gênicas promissoras podem surgir nos cruzamentos entre os genótipos TE97-309G-1, TE97-367G-3, TE97-367G-11 e TE97-430G-12 do tipo prostrado e TE97-321G-4 e TE97-404-1E-1 do tipo semi-ereto. A seleção dos genótipos TE93-244-23F-1, TE97-299G-10 e BR 17-Gurguéia tipo prostrado e os genótipos TE97-321G-4, TE97-406-2E, TE96-282-22G e EV x 91-2E-1 tipo semi-ereto demonstram superioridade para a produtividade de grãos. Os caracteres comprimento de vagem, massa de grãos por vagem e produtividade de vagens são os que mais contribuem para a divergência genética.
650 $aSeleção
650 $aVigna Unguiculata
653 $aDissimilaridade
653 $aVariabilidade genética
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773 $tBragantia, Campinas$gv. 66, n. 4, p. 579-586, 2007.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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