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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
16/03/2020 |
Data da última atualização: |
24/05/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PARAENSE, L. C. R.; PENA, D. N.; DARNET, S. H.; RODRIGUES, S. de M.; MENEZES, I. C. de; CUNHA, E. F. M. |
Afiliação: |
LUANY CAROLINE RIBEIRO PARAENSE, UFRA; DAYANE NASCIMENTO PENA, UFRA; SYLVAIN HENRI DARNET, UFPA; SIMONE DE MIRANDA RODRIGUES, CPATU; ILMARINA CAMPOS DE MENEZES, CPATU; ELISA FERREIRA MOURA CUNHA, CPATU. |
Título: |
First genomic microsatellite markers developed for Platonia insignis (Clusiaceae), a Brazilian fruit tree. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, n. 4, p. 2985-2989, fev. 2020. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-020-05301-0 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Short Comunication. |
Conteúdo: |
Platonia insignis is a fruit tree native of Brazil with allogamous and asexual reproduction. The production of fruits is mainly obtained by exploitation of natural populations and the impact of genetic structuring on plant production may be evaluated. For this purpose, codominant and multiallelic markers such as microsatellite are the most suitable, but they need to be developed for this species. Thus, the aim of this work was to develop and validate microsatellite markers for P. insignis. We used Roche 454 GS FLX sequencing platform of a single P. insignis genotype and 1702 microsatellite sequences were identified. Based on some pre-requisites, we could develop 50 primer pairs to be tested. Twenty-two primer pairs successfully amplified fragments and they were tested in 31 genotypes of P. insignis that belong to a germplasm bank and were sampled in the northeast of Pará State, Brazil. Thirteen primers were polymorphic and the number of alleles per loci varied from 5 (PI18 and PI27) to 2 (PI08, PI25, PI31, PI33 and PI 37). Expected heterozygosity (HE) varied from 0.74 (PI27) to 0.12 (PI31)b and observed heterozygosity (HO) varied from 1.00 (PI25) to 0.00 (PI08, PI31, PI33 and PI37). Principal coordinates could separate the genotypes of P. insignis in clusters and we can conclude that the primers can estimate the genetic diversity of P. insignis populations. |
Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Genetic diversity; Next generation sequencing; Sequenciamento genético; Simple sequence repeats. |
Thesagro: |
Bacuri; Platonia Insignis. |
Thesaurus Nal: |
Clusiaceae; Oligonucleotides. |
Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/211920/1/Paraense2020-Article-FirstGenomicMicrosatelliteMark.pdf
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Marc: |
LEADER 02375naa a2200313 a 4500 001 2121255 005 2021-05-24 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11033-020-05301-0$2DOI 100 1 $aPARAENSE, L. C. R. 245 $aFirst genomic microsatellite markers developed for Platonia insignis (Clusiaceae), a Brazilian fruit tree.$h[electronic resource] 260 $c2020 500 $aShort Comunication. 520 $aPlatonia insignis is a fruit tree native of Brazil with allogamous and asexual reproduction. The production of fruits is mainly obtained by exploitation of natural populations and the impact of genetic structuring on plant production may be evaluated. For this purpose, codominant and multiallelic markers such as microsatellite are the most suitable, but they need to be developed for this species. Thus, the aim of this work was to develop and validate microsatellite markers for P. insignis. We used Roche 454 GS FLX sequencing platform of a single P. insignis genotype and 1702 microsatellite sequences were identified. Based on some pre-requisites, we could develop 50 primer pairs to be tested. Twenty-two primer pairs successfully amplified fragments and they were tested in 31 genotypes of P. insignis that belong to a germplasm bank and were sampled in the northeast of Pará State, Brazil. Thirteen primers were polymorphic and the number of alleles per loci varied from 5 (PI18 and PI27) to 2 (PI08, PI25, PI31, PI33 and PI 37). Expected heterozygosity (HE) varied from 0.74 (PI27) to 0.12 (PI31)b and observed heterozygosity (HO) varied from 1.00 (PI25) to 0.00 (PI08, PI31, PI33 and PI37). Principal coordinates could separate the genotypes of P. insignis in clusters and we can conclude that the primers can estimate the genetic diversity of P. insignis populations. 650 $aClusiaceae 650 $aOligonucleotides 650 $aBacuri 650 $aPlatonia Insignis 653 $aDiversidade genética 653 $aGenetic diversity 653 $aNext generation sequencing 653 $aSequenciamento genético 653 $aSimple sequence repeats 700 1 $aPENA, D. N. 700 1 $aDARNET, S. H. 700 1 $aRODRIGUES, S. de M. 700 1 $aMENEZES, I. C. de 700 1 $aCUNHA, E. F. M. 773 $tMolecular Biology Reports$gv. 47, n. 4, p. 2985-2989, fev. 2020.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
28/10/2008 |
Data da última atualização: |
26/11/2008 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
COVA, A. M. W.; TRINDADE, A. V.; SILVA, A. B. da; SACRAMENTO, J. A. A. S. do. |
Afiliação: |
Alide Mitsue Watanabe Cova, UFRB; Aldo Vilar Trindade, CNPMF; Audenice Bezerra da Silva, UFBA; José Augusto Amorim Silva do Sacramento, UFRB. |
Título: |
Produção de mudas de helicônia em substrato inerte irrigado com águas residuárias. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 2., 2008, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2008. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
RESUMO_008. |
Conteúdo: |
Atualmente, com a grande geração de esgoto doméstico, o destino final das águas residuárias são os rios, mares e fossas. O tratamento desses efluentes pode torná-los úteis para a agricultura, já que são ricos em nutrientes essenciais para o desenvolvimento vegetal. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a eficiência de água residuária no cultivo de Heliconia dwarf. Para tanto, instalou-se um experimento com quatro tratamentos à base de água residuária servida da Unidade de Tratamento da UFBA (1. Urina diluída a 1,5%; 2. Efluente de filtro anaeróbio - FAN; 3. Efluente de filtro intermitente aeróbico - FILA; 4. Tratamento controle com aplicação de solução nutritiva convencional) com três repetições, em delineamento inteiramente ao acaso. A irrigação foi feita com aplicação de 540 mL por dia com o uso do temporizador aplicando o volume durante 1 minuto durante 170 dias. Pelos resultados parciais, pode-se observar que o tratamento convencional proporcionou maior quantidade de massa seca foliar e raiz seguido da urina, FILA e FAN. A aplicação da solução proveniente do FAN aumentou os teores de amônio e nitrato+nitrito no substrato em valores semelhantes ao da testemunha. Em contrapartida, foi o tratamento que apresentou o maior teor de sódio, o que deve explicar o menor desenvolvimento das mudas. |
Thesagro: |
Mineralização; Reciclagem; Resíduo. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02042naa a2200205 a 4500 001 1655075 005 2008-11-26 008 2008 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCOVA, A. M. W. 245 $aProdução de mudas de helicônia em substrato inerte irrigado com águas residuárias. 260 $c2008 500 $aRESUMO_008. 520 $aAtualmente, com a grande geração de esgoto doméstico, o destino final das águas residuárias são os rios, mares e fossas. O tratamento desses efluentes pode torná-los úteis para a agricultura, já que são ricos em nutrientes essenciais para o desenvolvimento vegetal. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a eficiência de água residuária no cultivo de Heliconia dwarf. Para tanto, instalou-se um experimento com quatro tratamentos à base de água residuária servida da Unidade de Tratamento da UFBA (1. Urina diluída a 1,5%; 2. Efluente de filtro anaeróbio - FAN; 3. Efluente de filtro intermitente aeróbico - FILA; 4. Tratamento controle com aplicação de solução nutritiva convencional) com três repetições, em delineamento inteiramente ao acaso. A irrigação foi feita com aplicação de 540 mL por dia com o uso do temporizador aplicando o volume durante 1 minuto durante 170 dias. Pelos resultados parciais, pode-se observar que o tratamento convencional proporcionou maior quantidade de massa seca foliar e raiz seguido da urina, FILA e FAN. A aplicação da solução proveniente do FAN aumentou os teores de amônio e nitrato+nitrito no substrato em valores semelhantes ao da testemunha. Em contrapartida, foi o tratamento que apresentou o maior teor de sódio, o que deve explicar o menor desenvolvimento das mudas. 650 $aMineralização 650 $aReciclagem 650 $aResíduo 700 1 $aTRINDADE, A. V. 700 1 $aSILVA, A. B. da 700 1 $aSACRAMENTO, J. A. A. S. do 773 $tIn: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA TROPICAL, 2., 2008, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2008.
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Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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