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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
17/12/2020 |
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Data da última atualização: |
17/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
RODRIGUES, A. F. G. |
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Afiliação: |
ARIENE FERNANDA GRANDO RODRIGUES, UDESC/Chapecó. |
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Título: |
Comparação dos transcriptomas de suínos afetados com hérnia escrotal e hérnia umbilical. 2020. 101 f. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
2020. |
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Páginas: |
101 f. |
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Descrição Física: |
Dissertação (Mestrado em Zootecnia) - Universidade do Estado de Santa Catarina, Chapecó, SC. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Orientação Mônica Corrêa Ledur e Coorientação Jane de Oliveira Peixoto. |
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Conteúdo: |
Resumo: A hérnia é considerada um dos defeitos congênitos mais comuns encontrados em suínos. As mais observadas são escrotais (HE), inguinais (HI) e umbilicais (HU). As hérnias causam prejuízo para a suinocultura mundial devido a redução da eficiência produtiva, além de afetar negativamente o bem-estar do animal. Vários estudos genômicos já foram conduzidos, porém, ainda não foi possível identificar os genes responsáveis pela formação das hérnias em suínos, dificultando a seleção contra essas características. Dessa forma, buscou-se comparar o perfil de expressão dos transcriptomas relacionados às hérnias escrotal e umbilical e identificar genes candidatos aos dois tipos de hérnia, utilizando análises de RNA-Seq. Coletaram-se amostras biológicas de anel inguinal e umbilical de suínos com HE, HU e livres destes defeitos, as quais passaram pela extração do RNA. Após, foram preparadas bibliotecas de cDNA e estas sequenciadas na plataforma Illumina. As sequências passaram por análise de controle de qualidade e foram alinhadas e mapeadas contra o genoma de referência do suíno (Sus scrofa, v11.1). Posteriormente, foram identificados os genes expressos nos tecidos e os genes diferencialmente expressos (DE) quando comparados os grupos controle e afetados. O perfil de expressão dos transcriptomas relacionados à HE e HU foi comparado para identificar genes DE nos dois tipos de hérnia. Realizaram-se análises para a descoberta de polimorfismos nesses genes com posterior anotação daqueles encontrados para as duas hérnias estudadas. Em cada grupo, compararam-se os genes DE e foi verificado se estes estavam em regiões de QTL (Quantitative trait loci) já relatadas para suínos. Após comparação dos dois transcriptomas (HE e HU), observou-se que 94,91% dos genes encontrados estavam contidos em ambos os grupos. Quando comparadas amostras de animais afetados com aquelas de seus respectivos grupos controle, identificaram-se 627 genes DE para HE e 199 para HU, dos quais 35 genes estavam DE em ambos os grupos. Estes genes participam de 108 processos biológicos que envolvem desde o sistema imunológico até a organização celular. Dos genes DE em ambos os grupos, dois (ACAN e BCHE) estão em regiões de QTL já relatadas para hérnia escrotal. Considerou-se os genes MAP1LC3C, VIT, ACAN, ACER2, KCNMA1 e SYNPO2 candidatos ao surgimento dos dois tipos de defeito por apresentarem expressão equivalente em ambas as hérnias e participarem nos processos de adesão celular, organização do citoesqueleto, produção de colágeno, relaxamento muscular e autofagia. Identificaram-se 67 polimorfismos no tecido do anel inguinal e 76 no anel umbilical dos quais 11 e 14 são novos, respectivamente. Além disso, foi observada uma variante com função deletéria localizada no gene ITGAM, que participa do processo biológico de diferenciação celular ectodérmica. Considera-se que o perfil da expressão desses genes possa interferir no desenvolvimento normal do tecido, causar enfraquecimento e diminuir a resistência do local, podendo levar a formação de ambas as hérnias em suínos. Assim, avançou-se no conhecimento dos genes relacionados ao surgimento da HE e HU, contribuindo para a compreensão do mecanismo genético relacionado aos dois tipos de hérnia em suínos. MenosResumo: A hérnia é considerada um dos defeitos congênitos mais comuns encontrados em suínos. As mais observadas são escrotais (HE), inguinais (HI) e umbilicais (HU). As hérnias causam prejuízo para a suinocultura mundial devido a redução da eficiência produtiva, além de afetar negativamente o bem-estar do animal. Vários estudos genômicos já foram conduzidos, porém, ainda não foi possível identificar os genes responsáveis pela formação das hérnias em suínos, dificultando a seleção contra essas características. Dessa forma, buscou-se comparar o perfil de expressão dos transcriptomas relacionados às hérnias escrotal e umbilical e identificar genes candidatos aos dois tipos de hérnia, utilizando análises de RNA-Seq. Coletaram-se amostras biológicas de anel inguinal e umbilical de suínos com HE, HU e livres destes defeitos, as quais passaram pela extração do RNA. Após, foram preparadas bibliotecas de cDNA e estas sequenciadas na plataforma Illumina. As sequências passaram por análise de controle de qualidade e foram alinhadas e mapeadas contra o genoma de referência do suíno (Sus scrofa, v11.1). Posteriormente, foram identificados os genes expressos nos tecidos e os genes diferencialmente expressos (DE) quando comparados os grupos controle e afetados. O perfil de expressão dos transcriptomas relacionados à HE e HU foi comparado para identificar genes DE nos dois tipos de hérnia. Realizaram-se análises para a descoberta de polimorfismos nesses genes com posterior anotação daqueles... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Expressão gênica; RNA-Seq; Sequenciamento. |
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Thesagro: |
Genética Animal; Melhoramento Genético Animal; Suinocultura. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
28/11/2014 |
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Data da última atualização: |
28/11/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MOURA, M. S. B. de; OLIVEIRA, L. D. S.; SOUZA, L. S. B.; YURI, J. E.; RODRIGUES, G. D. S.; SILVA, F. Z.; ARAGÃO, C. A. |
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Afiliação: |
MAGNA SOELMA BESERRA DE MOURA, CPATSA; Graduanda da UPE; UFRPE, Unidade Acadêmica de Serra Talhada, Serra Talhada, PE; JONY EISHI YURI, CPATSA; Graduando da UPE; Mestranda da Universidade do Estado da Bahia, Juazeiro-ba; Universidade do Estado da Bahia, Juazeiro, BA. |
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Título: |
Microclima de ambientes com diferentes telas de cobertura no cultivo do tomate cereja em Juazeiro, Bahia. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE METEOROLOGIA, 18., 2014, Recife. O papel da meteorologia na construção de uma sociedade sustentável. Recife: SBMET, 2014. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi analisar o microclima em área de cultivo de tomate do tipo cereja em ambiente protegido com diferentes coberturas de tela no Submédio do Vale São Francisco. |
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Palavras-Chave: |
Licopersicon esculentum; Temperatura do ar; Tomate cereja. |
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Thesagro: |
Microclima; Radiação Solar. |
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Thesaurus NAL: |
Cherry tomatoes. |
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Categoria do assunto: |
A Sistemas de Cultivo |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112568/1/Magna-1.pdf
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Marc: |
LEADER 01063nam a2200253 a 4500
001 2001087
005 2014-11-28
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100 1 $aMOURA, M. S. B. de
245 $aMicroclima de ambientes com diferentes telas de cobertura no cultivo do tomate cereja em Juazeiro, Bahia.$h[electronic resource]
260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE METEOROLOGIA, 18., 2014, Recife. O papel da meteorologia na construção de uma sociedade sustentável. Recife: SBMET$c2014
520 $aO objetivo deste trabalho foi analisar o microclima em área de cultivo de tomate do tipo cereja em ambiente protegido com diferentes coberturas de tela no Submédio do Vale São Francisco.
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700 1 $aRODRIGUES, G. D. S.
700 1 $aSILVA, F. Z.
700 1 $aARAGÃO, C. A.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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