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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
17/01/2014 |
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Data da última atualização: |
17/05/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GARCIA, A. A. F.; MOLLINARI, M.; MARCONI, T. G.; SERANG, O. R.; SILVA, R. R.; VIEIRA, M. L. C.; VICENTINI, R.; COSTA, E. A.; MANCINI, M. C.; GARCIA, M. O. S.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; MARTINS, E. R. F.; DAHMER, N.; SFORÇA, D. A.; SILVA, C. B. C.; BUNDOCK, P.; HENRY, R. J.; SOUZA, G. M.; SLUYS, M.-A. V.; LANDELL, M. G. A.; CARNEIRO, M. S.; VINCENTZ, M. A. G.; PINTO, L. R.; VENCOVSKY, R.; SOUZA, A. P. |
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Afiliação: |
MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
SNP genotyping allows an in-depth characterisation of the genome of sugarcane and other complex autopolyploids. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 3, p. 1-10, 2013. |
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DOI: |
10.1038/srep03399 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Many plant species of great economic value (e.g., potato, wheat, cotton, and sugarcane) are polyploids. Despite the essential roles of autopolyploid plants in human activities, our genetic understanding of these species is still poor. Recent progress in instrumentation and biochemical manipulation has led to the accumulation of an incredible amount of genomic data. In this study, we demonstrate for the first time a successful genetic analysis in a highly polyploid genome (sugarcane) by the quantitative analysis of single-nucleotide polymorphism (SNP) allelic dosage and the application of a new data analysis framework. This study provides a better understanding of autopolyploid genomic structure and is a sound basis for genetic studies. The proposed methods can be employed to analyse the genome of any autopolyploid and will permit the future development of high-quality genetic maps to assist in the assembly of reference genome sequences for polyploid species. |
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Thesagro: |
Cana de açúcar; Genética vegetal; Genoma; Genótipo. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Genotype; Plant genetics. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/95484/1/SNP-genotyping.pdf
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Marc: |
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245 $aSNP genotyping allows an in-depth characterisation of the genome of sugarcane and other complex autopolyploids.$h[electronic resource]
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520 $aMany plant species of great economic value (e.g., potato, wheat, cotton, and sugarcane) are polyploids. Despite the essential roles of autopolyploid plants in human activities, our genetic understanding of these species is still poor. Recent progress in instrumentation and biochemical manipulation has led to the accumulation of an incredible amount of genomic data. In this study, we demonstrate for the first time a successful genetic analysis in a highly polyploid genome (sugarcane) by the quantitative analysis of single-nucleotide polymorphism (SNP) allelic dosage and the application of a new data analysis framework. This study provides a better understanding of autopolyploid genomic structure and is a sound basis for genetic studies. The proposed methods can be employed to analyse the genome of any autopolyploid and will permit the future development of high-quality genetic maps to assist in the assembly of reference genome sequences for polyploid species.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registro |
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Status |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 3. |  | SILVA, W. C. da; MARTORANO, L. G.; SILVA, L. K. X.; ROCHA, S. L. C. S. Nuances na temperatura corporal de bezerros a partir de scaner com termografia infravermelho. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 22., 2018, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2018. p. 163-168.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | PIRES, A. P.; MARTORANO, L. G.; PACHECO, A.; ROCHA, S. L. C. S.; MORAES, A. F. F. Avaliação do conforto térmico em colônias de abelhas nativas Scaptotrigona SP (canudo-amarela) em quintais agroflorestais em Belterra, Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE APICULTURA, 22.; CONGRESSO BRASILEIRO DE MELIPONICULTURA, 8., 2018, Joinville. Anais. Joinville: CBA, 2018. p. 68.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | ROCHA, S. L. C. S.; MARTORANO, L. G.; SOUSA, A. R. B. de; MELLO, K. K. de S. Condições térmicas em viveiro com criação de pirarucu (Arapaima Gigas) na comunidade Pixuna do Tapará, município de Santarém, PA. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 22., 2018, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2018. p. 157-162.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 8. | | ROCHA, D. T.; SALLE, F. O.; PERDONCINI, G.; ROCHA, S. L. S.; FORTES, B. B.; MORAES, H. L. S.; NASCIMENTO, V. P.; SALLE, C. T. P. Classification of antimicrobial resistance using artificial neural networks and the relationship of 38 genes associated with the virulence of Escherichia coli isolates from broilers. Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n.2, p. 137-140, fev. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | MARTORANO, L. G.; GARCIA, A. R.; SILVA, L. K. X.; AMARAL JÚNIOR, J. M. DO; BARROS, D. V.; RUFINO, J. P. F.; ROCHA, S. L. C. S.; FERNANDES, P. C. C.; OLIVEIRA, P. P. A. Infrared thermography to diagnose bioclimatic conditions in livestock systems in the amazon biome. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W . G. da (ed.). Adapting to climate change: strategies for Brazilian agricultural and livestock systems. Brasília, DF: MAPA, 2021. p.104-105.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 13. | | MARTORANO, L. G.; GARCIA, A. R.; SILVA, L. K. X.; AMARAL JÚNIOR, J. M. DO; BARROS, D. V.; RUFINO, J. P. F.; ROCHA, S. L. C. S.; FERNANDES, P. C. C.; OLIVEIRA, P. P. A. Termografia infravermelho para diagnosticar condições bioclimáticas em sistemas pecuários no Bioma Amazônia. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W. G. da. Estratégias de adaptação às mudanças do clima dos sistemas agropecuários brasileiros. Brasília, DF: MAPA, 2021. p.104-105.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 14. | | LERY, L. M. S.; COELHO, A.; KRUGER, W. M. A. von; GONÇALVES, M. S. M.; SANTOS, M. F.; VALENTE, R. H.; SANTOS, E. O.; ROCHA, S. L. G.; PERALES, J.; DOMONT, G. B.; TEIXEIRA, K. R. dos S.; BISCH, P. M. Protein expression profile of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5, a sugarcane endophytic plant growth-promoting bacterium. Proteomics, Weinheim, v. 8, n. 8, p. 1631-1644, abr. 2008. Parceria: Proteomics Network-RJ; UFRJ; Instituto Oswaldo Cruz.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 15. | | FRAZÃO, H. da S.; LIMA, L. H. C.; ROCHA, S. L. da; DIAS, J. M. C. de S.; AMARAL, Z. P.; PRAÇA, L. B.; SILVA, A. C. e; OLIVEIRA, H. F. F. de; OLIVEIRA, M. W. M. de; MORAES, M. C. B.; ANJOS, S. S. N.; CASTRO, C. S. P. de; COUTINHO, M. V.; SANTANA, E. de F. Treinamento em noções de segurança e sistema da qualidade em laboratório. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. 79 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 218).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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