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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
08/12/2017 |
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Data da última atualização: |
15/12/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R. de; ZAMBOLIM, L. |
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Afiliação: |
TIAGO VIEIRA SOUSA, BIOAGRO/Biocafé/UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; EMILLY RUAS ALKIMIM, BIOAGRO/Biocafé/UFV; ANTONIO CARLOS BAIAO DE OLIVEIRA, SAPC; ANTONIO ALVES PEREIRA, EPAMIG; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV; MARCIO FERNANDO RIBEIRO DE RESENDE JÚNIOR, Horticultural Sciences Department/University of Florida; LAÉRCIO ZAMBOLIM, DF/UFV. |
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Título: |
Population structure and genetic diversity of coffee progenies derived from Catuaí and Híbrido de Timor revealed by genome-wide SNP marker. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 13, n. 6, Dec. 2017. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The use of single nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers has provided advances in selection methodologies used in breeding programs of different crops, reducing cost and time of cultivar release. Despite the great economic and social importance of Coffea arabica, studies with SNP markers are scarce and a small number of SNP are available for this species, when compared with other crops of agronomic mportance. Thus, the objective of this study was to identify and validate SNP molecular markers for the species Coffea arabica and to introduce these markers to genetic breeding by means of an accurate analysis of the diversity and genetic structure of breeding populations of this species. After quality filtering, 11,187 SNP markers were selected from the coffee population obtained from crosses between the genotypes Catuaí and Híbrido de Timor. A great number of markers were distributed in the 11 chromosomes, within transcribed regions, and were used to estimate the genetic dissimilarity among the individuals of the breeding population. Dendrogram analysis and a Bayesian approach demonstrated the formation of two groups and the discrimination of all genotypes evaluated. The expressive number of SNP molecular markers distributed throughout C. arabica genome was efficient to discriminate all the accessions evaluated in the experiment, clustering them according to their genealogies. This work identified mixtures within the progenies. The genotyping data also provided detailed information about the parental genotypes and led to the identification of new candidate parents to be introduced to the breeding program. The study discussed population structure and its consequence in obtaining improved varieties of C. arabica. MenosThe use of single nucleotide polymorphism (SNP) molecular markers has provided advances in selection methodologies used in breeding programs of different crops, reducing cost and time of cultivar release. Despite the great economic and social importance of Coffea arabica, studies with SNP markers are scarce and a small number of SNP are available for this species, when compared with other crops of agronomic mportance. Thus, the objective of this study was to identify and validate SNP molecular markers for the species Coffea arabica and to introduce these markers to genetic breeding by means of an accurate analysis of the diversity and genetic structure of breeding populations of this species. After quality filtering, 11,187 SNP markers were selected from the coffee population obtained from crosses between the genotypes Catuaí and Híbrido de Timor. A great number of markers were distributed in the 11 chromosomes, within transcribed regions, and were used to estimate the genetic dissimilarity among the individuals of the breeding population. Dendrogram analysis and a Bayesian approach demonstrated the formation of two groups and the discrimination of all genotypes evaluated. The expressive number of SNP molecular markers distributed throughout C. arabica genome was efficient to discriminate all the accessions evaluated in the experiment, clustering them according to their genealogies. This work identified mixtures within the progenies. The genotyping data also provided detaile... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Molecular breeding; Next-generation sequence. |
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Thesagro: |
Coffea arabica. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic relationships; Introgression; Teachers. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/168492/1/Population-structure-and-genetic-diversity.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
26/01/2011 |
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Data da última atualização: |
05/07/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
COELHO, E. F.; COELHO FILHO, M. A.; CARVALHO, G. C.; RIBEIRO, R. N. da S.; AZEVEDO, N. F.; OLIVEIRA, P. M. |
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Afiliação: |
EUGENIO FERREIRA COELHO, CNPMF; MAURICIO ANTONIO COELHO FILHO, CNPMF; Gian Carlo Carvalho, UFRB; Rosangela Nascimento da Silva, UFRB; Nilo Ferreira Azevedo, UFRB; Polyanna Mara Oliveira, EPAMIG-URNM. |
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Título: |
Manejo de irrigação com deficit em bananeira BRS Tropical no norte de Minas Gerais. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In:CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
pdf 1660 |
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Conteúdo: |
A irrigação existe como alternativa para a suplementação ou complementação de água que falta durante períodos de déficit hídrico no solo e não funciona isoladamente, mas, sim, conjugada com outras práticas agrícolas, de forma a beneficiar a cultura. A bananeira, cultivar BRS Tropical, desenvolvida pela Embrapa Mandioca e Fruticultura vem tendo sua área expandida com boa aceitação comercial. As avaliações iniciais dessa cultivar sob irrigação demonstraram que a mesma tem relevante crescimento vegetativo com produtividades entre 17,0 e 25,0 t.ha-1 (Silva et al., 2003). Os resultados sobre necessidade hídrica da bananeira tem sido específicos para cultivares de elevada exigência hídrica, tais como a Prata Anã. Observações de campo tem mostrado que a cultivar tem comportamento diferenciado quanto a tolerância a estresses hídricos do solo. Coelho et al. (2009) avaliaram o comportamento dessa cultivar sob diferentes níveis de água em condições subumidas de Tabuleiros costeiros e não verificaram diferenças significativas entre as produtividades com redução de até 90% da laminas de irrigação calculada. Com esses resultados confirmou-se a hipótese da tolerância à estresse hídrico dessa cultivar, mas ficou a necessidade de confirmação da mesma em condições semi-aridas. Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito de quatro níveis de irrigação e três níveis de adubação abaixo dos valores calculados nas variáveis de produção da bananeira, cultivar BRS Tropical nas condições dos Norte de Minas Gerais. MenosA irrigação existe como alternativa para a suplementação ou complementação de água que falta durante períodos de déficit hídrico no solo e não funciona isoladamente, mas, sim, conjugada com outras práticas agrícolas, de forma a beneficiar a cultura. A bananeira, cultivar BRS Tropical, desenvolvida pela Embrapa Mandioca e Fruticultura vem tendo sua área expandida com boa aceitação comercial. As avaliações iniciais dessa cultivar sob irrigação demonstraram que a mesma tem relevante crescimento vegetativo com produtividades entre 17,0 e 25,0 t.ha-1 (Silva et al., 2003). Os resultados sobre necessidade hídrica da bananeira tem sido específicos para cultivares de elevada exigência hídrica, tais como a Prata Anã. Observações de campo tem mostrado que a cultivar tem comportamento diferenciado quanto a tolerância a estresses hídricos do solo. Coelho et al. (2009) avaliaram o comportamento dessa cultivar sob diferentes níveis de água em condições subumidas de Tabuleiros costeiros e não verificaram diferenças significativas entre as produtividades com redução de até 90% da laminas de irrigação calculada. Com esses resultados confirmou-se a hipótese da tolerância à estresse hídrico dessa cultivar, mas ficou a necessidade de confirmação da mesma em condições semi-aridas. Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito de quatro níveis de irrigação e três níveis de adubação abaixo dos valores calculados nas variáveis de produção da bananeira, cultivar BRS Tropical nas condições dos Nor... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Deficit hidrico. |
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Thesagro: |
Banana; Irrigação; Variedade. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/36185/1/ID27307pdf1660.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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