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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
17/10/2017 |
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Data da última atualização: |
17/10/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; RECH, R. R.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; FIGUEIREDO, E. A. P. de; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
GABRIELI DE SOUZA ROMANO, UFBA; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; NELSON MORES, CNPSA; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; RAQUEL RÚBIA RECH, Texas A&M University; IGOR RICARDO SAVOLDI, UNC/Concórdia; KAMILLA BLEIL DO CARMO, UNC/Concórdia; ELSIO ANTONIO PEREIRA DE FIGUEIREDO, CNPSA; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Identificação de mecanismos genéticos envolvidos na oesteocondrose latens em suínos. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: A osteocondrose (OC) é uma das principais causas de claudicação em suínos, afetando até 80% dos animais reprodutores e de produção, levando a perdas econômicas e reduzindo o bem estar. Com o objetivo de identificar genes e mecanismos genéticos envolvidos em estágios iniciais de OC em suínos, amostras da cartilagem articular distal do fêmur de 3 marrãs normais (controle) e 3 afetadas com OC latens foram coletadas, submetidas a análise histológica e extração total do RNA. As bibliotecas de RNA foram preparadas e sequenciadas em equipamento HiSeq 2500 (2x100pb). As sequências foram submetidas ao controle de qualidade e 98% delas foram mapeadas no genoma do suíno (Ensembl 84). A expressão diferencial foi obtida utilizando-se o EdgeR e a anotação funcional foi realizada com a ferramenta DAVID. Um total de 11.231 genes foi expresso na cartilagem do fêmur e 2.019 genes foram diferencialmente expressos, sendo 1.040 mais expressos e 979 menos expressos no grupo afetado com OC, incluindo genes codificantes, lincRNA e miRNAs. Considerando a análise funcional, diversos processos biológicos foram encontrados, tais como regulação da matriz extracelular, ossificação, ativação endotelial e estresse oxidativo. Novos mecanismos envolvidos na manifestação da OC latens foram evidenciados, contribuindo para o melhor entendimento desta condição em suínos e outras espécies de mamíferos que apresentam problemas locomotores como similares a osteocondrose. Abstract: Osteochondrosis (OC) is a major cause of lameness in sows and finisher pigs, affecting up to 80% of the animals, leading to economic losses and reducing the animal welfare. Aiming to identify genes and genetic mechanisms involved in the early stage of OC in pigs, samples of the distal femoral articular cartilage of 3 gilts (5 months of age) with OC latens and 3 normal gilts (control) were collected, submitted to histological analysis and total RNA extraction. RNA-Seq libraries were prepared and sequenced in HiSeq 2500 equipment (2x100pb). The reads were processed, cleaned and 98% were mapped to the pig genome (Ensembl 84). Differential expression (DE) was obtained using EdgeR and functional annotation was performed with the DAVID database. A total of 11.231 genes was expressed in femoral cartilage and 2.019 were DE, being 1.040 upregulated and 979 downregulated in the OC group, including coding genes, lincRNA and miRNAs. Considering the functional analysis, several biological processes were found, such as those related to regulation of extracellular matrix, ossification, endothelial activation and oxidative stress. We demonstrated novel pathways involved with OC latens contributing to the understanding of its pathophysiology in swine and other mammalian species. MenosResumo: A osteocondrose (OC) é uma das principais causas de claudicação em suínos, afetando até 80% dos animais reprodutores e de produção, levando a perdas econômicas e reduzindo o bem estar. Com o objetivo de identificar genes e mecanismos genéticos envolvidos em estágios iniciais de OC em suínos, amostras da cartilagem articular distal do fêmur de 3 marrãs normais (controle) e 3 afetadas com OC latens foram coletadas, submetidas a análise histológica e extração total do RNA. As bibliotecas de RNA foram preparadas e sequenciadas em equipamento HiSeq 2500 (2x100pb). As sequências foram submetidas ao controle de qualidade e 98% delas foram mapeadas no genoma do suíno (Ensembl 84). A expressão diferencial foi obtida utilizando-se o EdgeR e a anotação funcional foi realizada com a ferramenta DAVID. Um total de 11.231 genes foi expresso na cartilagem do fêmur e 2.019 genes foram diferencialmente expressos, sendo 1.040 mais expressos e 979 menos expressos no grupo afetado com OC, incluindo genes codificantes, lincRNA e miRNAs. Considerando a análise funcional, diversos processos biológicos foram encontrados, tais como regulação da matriz extracelular, ossificação, ativação endotelial e estresse oxidativo. Novos mecanismos envolvidos na manifestação da OC latens foram evidenciados, contribuindo para o melhor entendimento desta condição em suínos e outras espécies de mamíferos que apresentam problemas locomotores como similares a osteocondrose. Abstract: Osteochondrosis (OC) is a ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Melhoramento genético animal; Suinocultura. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/165156/1/final8632.pdf
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Marc: |
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520 $aResumo: A osteocondrose (OC) é uma das principais causas de claudicação em suínos, afetando até 80% dos animais reprodutores e de produção, levando a perdas econômicas e reduzindo o bem estar. Com o objetivo de identificar genes e mecanismos genéticos envolvidos em estágios iniciais de OC em suínos, amostras da cartilagem articular distal do fêmur de 3 marrãs normais (controle) e 3 afetadas com OC latens foram coletadas, submetidas a análise histológica e extração total do RNA. As bibliotecas de RNA foram preparadas e sequenciadas em equipamento HiSeq 2500 (2x100pb). As sequências foram submetidas ao controle de qualidade e 98% delas foram mapeadas no genoma do suíno (Ensembl 84). A expressão diferencial foi obtida utilizando-se o EdgeR e a anotação funcional foi realizada com a ferramenta DAVID. Um total de 11.231 genes foi expresso na cartilagem do fêmur e 2.019 genes foram diferencialmente expressos, sendo 1.040 mais expressos e 979 menos expressos no grupo afetado com OC, incluindo genes codificantes, lincRNA e miRNAs. Considerando a análise funcional, diversos processos biológicos foram encontrados, tais como regulação da matriz extracelular, ossificação, ativação endotelial e estresse oxidativo. Novos mecanismos envolvidos na manifestação da OC latens foram evidenciados, contribuindo para o melhor entendimento desta condição em suínos e outras espécies de mamíferos que apresentam problemas locomotores como similares a osteocondrose. Abstract: Osteochondrosis (OC) is a major cause of lameness in sows and finisher pigs, affecting up to 80% of the animals, leading to economic losses and reducing the animal welfare. Aiming to identify genes and genetic mechanisms involved in the early stage of OC in pigs, samples of the distal femoral articular cartilage of 3 gilts (5 months of age) with OC latens and 3 normal gilts (control) were collected, submitted to histological analysis and total RNA extraction. RNA-Seq libraries were prepared and sequenced in HiSeq 2500 equipment (2x100pb). The reads were processed, cleaned and 98% were mapped to the pig genome (Ensembl 84). Differential expression (DE) was obtained using EdgeR and functional annotation was performed with the DAVID database. A total of 11.231 genes was expressed in femoral cartilage and 2.019 were DE, being 1.040 upregulated and 979 downregulated in the OC group, including coding genes, lincRNA and miRNAs. Considering the functional analysis, several biological processes were found, such as those related to regulation of extracellular matrix, ossification, endothelial activation and oxidative stress. We demonstrated novel pathways involved with OC latens contributing to the understanding of its pathophysiology in swine and other mammalian species.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre; Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
03/07/2014 |
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Data da última atualização: |
24/10/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
BRAZ, E. M.; THAINES, F.; MATTOS, P. P. de; OLIVEIRA, L. C. de; RIBAS, L. A.; OLIVEIRA, M. V. N. D.; THAINES, A. A. R. |
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Afiliação: |
EVALDO MUNOZ BRAZ, CNPF; Fabio Thaines, TECMAN; PATRICIA POVOA DE MATTOS, CNPF; LUIS CLAUDIO DE OLIVEIRA, CPAF-AC; LUCIANO ARRUDA RIBAS, CPAF-AC; MARCUS VINICIO NEVES D OLIVEIRA, CPAF-AC; Andréia Aparecida Ribeiro Thaines, TECMAN. |
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Título: |
Management of Amburana cearensis var. acreana in Acre state, Brazil. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciência Florestal, Santa Maria, v. 24, n. 2, p. 455-463, abr./jun. 2014. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This work has as its objectives: a) to assess the geographical distribution and population structure of Amburana cearensis var. acreana; b) to calculate sustainable cutting rates, according to stipulated cutting cycles, and c) to simulate the projected recovery potential in volume based on the calculated cutting rate. It was used data from sustainable forest management plans, and the results will contribute for future decisions about its endangered condition. The results did not corroborate the information that Amburana cearensis var. acreana is endangered in Acre state. However the management sustainability will only be feasible if considered the ideal remaining population structure and the estimative of the optimal cutting rate according to the cutting cycle. |
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Palavras-Chave: |
Acre; Amazonia Occidental; Amazônia Ocidental; Amburana cearensis; Amburana cearensis var acreana; Cerejeira da Amazônia; Ciclo de corte sustentável; Distribución geográfica; Estructura poblacional; Manejo florestal; Manejo florestal sustentável; Silvicultura sustentable; Sustainable cutting cycle; Sustainable cutting rate; Taxa de corte sustentável; Western Amazon; Yellow cherry tree. |
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Thesagro: |
Amburana acreana; Cerejeira amarela; Distribuição geográfica; Época de corte; Espécie Nativa; População de planta. |
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Thesaurus NAL: |
forest management; Geographical distribution; Population structure; Sustainable forestry. |
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Categoria do assunto: |
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K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/104502/1/2014-API-Evaldo-ManagementAmburana.pdf
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Marc: |
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520 $aThis work has as its objectives: a) to assess the geographical distribution and population structure of Amburana cearensis var. acreana; b) to calculate sustainable cutting rates, according to stipulated cutting cycles, and c) to simulate the projected recovery potential in volume based on the calculated cutting rate. It was used data from sustainable forest management plans, and the results will contribute for future decisions about its endangered condition. The results did not corroborate the information that Amburana cearensis var. acreana is endangered in Acre state. However the management sustainability will only be feasible if considered the ideal remaining population structure and the estimative of the optimal cutting rate according to the cutting cycle.
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653 $aAmburana cearensis var acreana
653 $aCerejeira da Amazônia
653 $aCiclo de corte sustentável
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653 $aEstructura poblacional
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653 $aManejo florestal sustentável
653 $aSilvicultura sustentable
653 $aSustainable cutting cycle
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653 $aWestern Amazon
653 $aYellow cherry tree
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700 1 $aMATTOS, P. P. de
700 1 $aOLIVEIRA, L. C. de
700 1 $aRIBAS, L. A.
700 1 $aOLIVEIRA, M. V. N. D.
700 1 $aTHAINES, A. A. R.
773 $tCiência Florestal, Santa Maria$gv. 24, n. 2, p. 455-463, abr./jun. 2014.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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