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Registros recuperados : 644 | |
2. | | RESENDE, M. D. V. de. Estatística. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 56-129. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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3. | | RESENDE, M. D. V. de. Estatística espacial, séries temporais e competição (interação social). In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 504-558. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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10. | | RESENDE, M. D. V. de. REML e componentes de variância. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 395-448. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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20. | | RESENDE, M. D. V. de. Matemática. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 7-55. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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Registros recuperados : 644 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
14/02/2017 |
Data da última atualização: |
18/12/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 2 |
Autoria: |
ALMEIDA, I. F. de; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de. |
Afiliação: |
ÍSIS FERNANDA DE ALMEIDA, Instituto Federal do Triângulo Mineiro; COSME DAMIÃO CRUZ, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. |
Título: |
Validação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 12, p. 1973-1982, dez. 2016. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Título em ingles: Validation and phenotypic correction in genome-wide selection. |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores ? 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na
validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RRBlup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas.
No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado. |
Palavras-Chave: |
Acurácia; Blasso; Genotipagem em larga escala; Large-scale genotyping; RR-Blup. |
Thesagro: |
Marcador molecular. |
Thesaurus NAL: |
Accuracy; Genetic markers. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155551/1/Validacao-e-correcao-de-fenotipos.pdf
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Marc: |
LEADER 02184naa a2200253 a 4500 001 2082801 005 2017-12-18 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aALMEIDA, I. F. de 245 $aValidação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla. 260 $c2016 500 $aTítulo em ingles: Validation and phenotypic correction in genome-wide selection. 520 $aO objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores ? 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RRBlup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas. No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado. 650 $aAccuracy 650 $aGenetic markers 650 $aMarcador molecular 653 $aAcurácia 653 $aBlasso 653 $aGenotipagem em larga escala 653 $aLarge-scale genotyping 653 $aRR-Blup 700 1 $aCRUZ, C. D. 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 51, n. 12, p. 1973-1982, dez. 2016.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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