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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido; Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais. MenosEmbrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido... Mostrar Todas |
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Data corrente: |
29/05/2002 |
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Data da última atualização: |
22/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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Autoria: |
MORETZSOHN, M. de C.; COELHO, P. J. A.; AMARAL, Z. P. de S.; HERCOS, A. P.; TUPINAMBÁ, E. A. |
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Título: |
Desenvolvimento e uso de marcadores microssatélites na análise da variabilidade genética de ecótipos de coqueiro (Cocos nuciFera L.). |
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Ano de publicação: |
2001 |
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Fonte/Imprenta: |
Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2001. |
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Páginas: |
25 p. |
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Série: |
(Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 16). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O coqueiro (Cocos nucifera L.) é uma planta de grande importância nas regiões tropicais úmidas, onde é cultivada tanto comercialmente como para subsistência. No entanto, pouco se sabe sobre a quantidade e distribuição da variabilidade genética entre e dentre os diversos ecótipos existentes, principalmente, os brasileiros. Marcadores microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats) constituem uma das técnicas mais indicadas para estudos desta natureza, por serem codominantes, abundantes, aparentemente distribuídos por todo o genoma, multi-alélicos, dependentes de pequena quantidade de DNA e baseados em PCR. Os objetivos deste trabalho foram: (1) desenvolver e caracterizar marcadores microssatélites em ecótipos de coqueiro e (2) analisar a variabilidade genética entre e dentre ecótipos de coqueiro gigante e anão, mantidos no Banco Ativo de Germoplasma de Coco, da Embrapa Tabuleiros Costeiros, através de marcadores microssatélites. Foram analisadas de 9 a 10 plantas de cada um de 7 ecótipos de gigante e 3, de coqueiro anão. Dezesseis primers SSR, desenvolvidos no Laboratório de Genética Vegetal da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, foram incluídos nestas análises. Desses, 3 mostraram-se monomórficos e 3 não apresentaram resoluções de bandas satisfatórias. Para os demais 10 primers, de 2 a 14 alelos por loco foram detectados, com uma média de 8,25. A heterozigosidade variou de 0,472 a 0,867, com uma média de 0,686 entre os ecótipos de gigante (alógamos), enquanto a diversidade gènica variou de 0,000 a 0,771, com uma média de 0,371 entre os ecótipos de anão (autógamos). Bandas específicas para cada variedade e para determinados ecótipos foram observadas nesta análise. No entanto, quase todos os alelos encontrados nos ecótipos anões foram também detectados nos gigantes, sugerindo que os anões originaram-se a partir de populações de gigantes. A análise de agrupamento (UPGMA) evidenciou a formação de três grupos principais, um contendo os ecótipos da variedade anão, o outro com ecótipos asiáticos da variedade gigante, e o terceiro, com os ecótipos brasileiros e africanos da variedade gigante. Ecótipos da variedade anão, provenientes do Brasil e da Ásia, mostraram maior similaridade com ecótipos gigantes da Ásia, do que com os ecótipos gigantes da Ásia, do que com os ecótipos gigantes brasileiros. Esses resultados corroboram a hipótese de que o coqueiro anão originou-se na Ásia. Apesar dos ecótipos gigantes brasileiros estarem num nível de caracterização genética e agronômica inferior, em relação aos ecótipos asiáticos, seria estratégico para o melhoramento, planejar cruzamentos entre os genótipos anões com gigantes brasileiros, geneticamente mais distantes, para obtençao de maiores ganhos genéticos. MenosO coqueiro (Cocos nucifera L.) é uma planta de grande importância nas regiões tropicais úmidas, onde é cultivada tanto comercialmente como para subsistência. No entanto, pouco se sabe sobre a quantidade e distribuição da variabilidade genética entre e dentre os diversos ecótipos existentes, principalmente, os brasileiros. Marcadores microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats) constituem uma das técnicas mais indicadas para estudos desta natureza, por serem codominantes, abundantes, aparentemente distribuídos por todo o genoma, multi-alélicos, dependentes de pequena quantidade de DNA e baseados em PCR. Os objetivos deste trabalho foram: (1) desenvolver e caracterizar marcadores microssatélites em ecótipos de coqueiro e (2) analisar a variabilidade genética entre e dentre ecótipos de coqueiro gigante e anão, mantidos no Banco Ativo de Germoplasma de Coco, da Embrapa Tabuleiros Costeiros, através de marcadores microssatélites. Foram analisadas de 9 a 10 plantas de cada um de 7 ecótipos de gigante e 3, de coqueiro anão. Dezesseis primers SSR, desenvolvidos no Laboratório de Genética Vegetal da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, foram incluídos nestas análises. Desses, 3 mostraram-se monomórficos e 3 não apresentaram resoluções de bandas satisfatórias. Para os demais 10 primers, de 2 a 14 alelos por loco foram detectados, com uma média de 8,25. A heterozigosidade variou de 0,472 a 0,867, com uma média de 0,686 entre os ecótipos de gigante (alógamos), enquanto a d... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Brasília; Coco - Diversidade; Coco - Genética; Coconut; Coconut: Variacao genetica; Distrito Federal; Genetic variability; Germoplasm; Marcadores microssatelites; Marcadores RAPD; Microsatellite; Microsatellites; Microssatélite; Microssatélites; SSR; Variabilidade genética. |
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Thesagro: |
Amendoim; Coco; Cocos Nucifera; Genética Vegetal; Germoplasma; Marcador Molecular; Variação Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Arachis; coconuts; genetic markers; genetic variation; germplasm. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/180525/1/54400001.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Café. Para informações adicionais entre em contato com biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
17/03/2011 |
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Data da última atualização: |
28/10/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVESTRINI, M.; RAMIRO, D. A.; GUERREIRO-FILHO, O.; MALUF, M. P. |
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Afiliação: |
Coffee Center "Alcides Carvalho"; IAC; IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, SAPC. |
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Título: |
Defense-related gene expression in response to leaf-miner infection. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In Brazilian coffee plantations, the leaf-miner (Leucoptera coffeella) represents a major threat. Insect control is mainly based on the use of pesticides, as resistant cultivars are not yet available. However, the coffee breeding program of IAC has already selected promising genotypes bearing resistance to the leaf-miner, which was transferred from the diploid species Coffea racemosa. In order to characterize molecular aspects of defense mechanisms associated to the resistance response, expression of key genes was evaluated in coffee leaves, from both resistant and susceptible plants, in response to leaf-miner infection. Infected leavesb were collected at different time-intervals during insect development. Defense-related genes were identified in the Coffee Genome Database, through Blast searches. Gene specific primers were used to amplify corresponding transcripts on sampled leaves using a quantitative RT-PCR approach. Results indicated that there are no significant differences in the expression patterns of evaluated genes when comparing resistant and susceptible infected leaves. Major differences were observed for lipoxygenase, glutathione transferase, protein-kinase receptor and glucanase. However, these differences are mainly associated with expression timing along insect infection rather than with gene regulation, suggesting that resistance to leafminer in coffee may be associated with a previously built basal defense-response. |
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Thesagro: |
Leucoptera Coffeella. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aIn Brazilian coffee plantations, the leaf-miner (Leucoptera coffeella) represents a major threat. Insect control is mainly based on the use of pesticides, as resistant cultivars are not yet available. However, the coffee breeding program of IAC has already selected promising genotypes bearing resistance to the leaf-miner, which was transferred from the diploid species Coffea racemosa. In order to characterize molecular aspects of defense mechanisms associated to the resistance response, expression of key genes was evaluated in coffee leaves, from both resistant and susceptible plants, in response to leaf-miner infection. Infected leavesb were collected at different time-intervals during insect development. Defense-related genes were identified in the Coffee Genome Database, through Blast searches. Gene specific primers were used to amplify corresponding transcripts on sampled leaves using a quantitative RT-PCR approach. Results indicated that there are no significant differences in the expression patterns of evaluated genes when comparing resistant and susceptible infected leaves. Major differences were observed for lipoxygenase, glutathione transferase, protein-kinase receptor and glucanase. However, these differences are mainly associated with expression timing along insect infection rather than with gene regulation, suggesting that resistance to leafminer in coffee may be associated with a previously built basal defense-response.
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700 1 $aRAMIRO, D. A.
700 1 $aGUERREIRO-FILHO, O.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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