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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
06/08/2020 |
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Data da última atualização: |
07/05/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, A. A. de; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; FERRÃO, L. F. V.; AMADEU, R. R.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T.; PASTINA, M. M.; MARGARIDO, G. R. A. |
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Afiliação: |
Amanda Avelar de Oliveira, Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz"; Marcio F. R. Resende Júnior, University of Florida; Luís Felipe Ventorim Ferrão, University of Florida; Rodrigo Rampazo Amadeu, University of Florida; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; Gabriel Rodrigues Alves Margarido, Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz'. |
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Título: |
Genomic prediction applied to multiple traits and environments in second season maize hybrids. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Heredity, v. 125, n. 1/2, p. 60-72, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41437-020-0321-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic selection has become a reality in plant breeding programs with the reduction in genotyping costs. Especially in maize breeding programs, it emerges as a promising tool for predicting hybrid performance. The dynamics of a commercial breeding program involve the evaluation of several traits simultaneously in a large set of target environments. Therefore, multi-trait multi-environment (MTME) genomic prediction models can leverage these datasets by exploring the correlation between traits and Genotype-by-Environment (G×E) interaction. Herein, we assess predictive abilities of univariate and multivariate genomic prediction models in a maize breeding program. To this end, we used data from 415 maize hybrids evaluated in 4 years of second season field trials for the traits grain yield, number of ears, and grain moisture. Genotypes of these hybrids were inferred in silico based on their parental inbred lines using single nucleotide polymorphisms (SNPs) markers obtained via genotyping-by-sequencing (GBS). Because genotypic information was available for only 257 hybrids, we used the genomic and pedigree relationship matrices to obtain the H matrix for all 415 hybrids. Our results demonstrated that in the single-environment context the use of multi-trait models was always superior in comparison to their univariate counterparts. Besides that, although MTME models were not particularly successful in predicting hybrid performance in untested years, they improved the ability to predict the performance of hybrids that had not been evaluated in any environment. However, the computational requirements of this kind of model could represent a limitation to its practical implementation and further investigation is necessary. MenosGenomic selection has become a reality in plant breeding programs with the reduction in genotyping costs. Especially in maize breeding programs, it emerges as a promising tool for predicting hybrid performance. The dynamics of a commercial breeding program involve the evaluation of several traits simultaneously in a large set of target environments. Therefore, multi-trait multi-environment (MTME) genomic prediction models can leverage these datasets by exploring the correlation between traits and Genotype-by-Environment (G×E) interaction. Herein, we assess predictive abilities of univariate and multivariate genomic prediction models in a maize breeding program. To this end, we used data from 415 maize hybrids evaluated in 4 years of second season field trials for the traits grain yield, number of ears, and grain moisture. Genotypes of these hybrids were inferred in silico based on their parental inbred lines using single nucleotide polymorphisms (SNPs) markers obtained via genotyping-by-sequencing (GBS). Because genotypic information was available for only 257 hybrids, we used the genomic and pedigree relationship matrices to obtain the H matrix for all 415 hybrids. Our results demonstrated that in the single-environment context the use of multi-trait models was always superior in comparison to their univariate counterparts. Besides that, although MTME models were not particularly successful in predicting hybrid performance in untested years, they improved the ability to pre... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genética; Milho; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 9 | |
| 1. |  | MAFFILI, V. V.; TORRES, C. A. A.; FONSECA, J. F. da; MORAES, E. A.; PONTES, R. A. M. Sincronização de estro em cabras da raça Saanen com esponja intravaginal e CIFR-G. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 57, n. 5, p. 591-598, out. 2005.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 2. | | MAFFILI, V. V.; TORRES, C. A. A.; FONSECA, J. F. da; BRUSCHI, J. H.; VIANA, J. H. M.; PROSPERI, C. P.; MORAES, E. A.; PONTES, R. A. M. Eficiência do CIDR novo e reutilizado em protocolo de sincronização do estro de curta duração em cabras da raça Toggenburg. Acta Scientiae Veterinariae, v. 33, supl. 1, p. s252, 2005. Edição dos resumos da 19a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Angra dos Reis, RJ, ago., 2005.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | MAFFILI, V. V.; TORRES, C. A. A.; FONSECA, J. F.; PROSPERI, C. P.; PONTES, R. A. M.; SANTOS, A. D. F.; MORAES, E. A. Taxa de gestação de cabras das raças Alpina e Saanen tratadas com gonadotrofina coriônica humana no quinto e vigésimo dia após a monta natural. Acta Scientiae Veterinariae, Porto Alegre, v. 31, p. 446, 2003. Suplemento. Edição de anais da 17a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Beberibe, CE, ago. 2003.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 4. | | MAFFILI, V. V.; TORRES, C. A. A.; FONSECA, J. F. da; BRUSCHI, J. H.; VIANA, J. H. M.; PROSPERI, C. P.; MORAES, E. A.; PONTES, R. A. M. Sincronização do estro de cabras com protocolos de curta duração utilizando CIDR-G e esponja intravaginal. Acta Scientiae Veterinariae, v. 33, supl. 1, p. s251, 2005. Edição dos resumos da 19a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Angra dos Reis, RJ, ago., 2005.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | MORAES, E. A.; TORRES, C. A. A.; AMORIM, L. da S.; PONTES, R. A. M.; FONSECA, J. F. da; MAFFILI, V. V.; PROSPERI, C. P.; CECON, P. R. Parâmetros reprodutivos de cabras da raça Toggenburg em lactação tratadas com somatotropina bovina recombinante (r-bST) e sincronizadas com CIDR reutilizado. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 6 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | MOARES, E. A.; TORRES, C. A. A.; AMORIM, L. da S.; BRUSCHI, J. H.; FONSECA, J. F. da; CECON, P. R.; SILVA, M. R.; PONTES, R. A. M. Produção e composição do leite, parâmetros sanguíneos de cabras da raça Toggenburg tratadas com somatotropina bovina recombinante (r-bST). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 5 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 7. | | AMORIM, E. A. M.; TORRES, C. A. A.; AMORIM, L. da S.; FONSECA, J. F. da; GUIMARÃES, J. D.; PONTES, R. A. M.; MAFFILI, V. V.; BORGES, A. M. Dinâmica folicular em cabras da raça Toggenburg em lactação, tratadas com somatotopina bovina recombinante (R-BST). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 6 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 8. | | MAFFILI, V. V.; TORRES, C. A. A.; PROSPERI, C. P.; FONSECA, J. F. da; FURST, R.; PONTES, R. A. M.; SANTOS, A. D. F.; AMORIM, L. S.; MORAES, E. A.; LEITE, P. A. G. Fertilidade de sêmen caprino congelado com diluente a base de gema de ovo adicionado de Equex(R) em programas de indução de estro por via hormonal. Acta Scientiae Veterinariae, Porto Alegre, v. 31, p. 448, 2003. Suplemento. Edição de anais da 17a. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Beberibe, CE, ago. 2003.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 9. | | MAFFILI, V. V.; TORRES, C. A. A.; PROSPERI, C. P.; FONSECA, J. F. da; PONTES, R. A. M.; MORAES, E. A. de; COSTA, E. P. da; SANTOS, A. D. F. Performance reprodutiva de cabras Alpinas e Saanen tratadas com gonadotrofina coriônica humana no quinto e vigésimo dia pós-serviço durante a estação de monta induzida. Veterinária Notícias, Uberlândia, v. 11, n. 1, p. 75-80, 2005.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| Registros recuperados : 9 | |
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