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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
09/01/2024 |
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Data da última atualização: |
09/01/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MALUF, M. P.; SILVESTRINI, M.; RUGGIERO, L. M. de C.; GUERREIRO FILHO, O.; COLOMBO, C. A. |
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Afiliação: |
MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa; MILENE SILVESTRINI, INSTITUTO AGRONÔMICO; LUCIANA MACHADO DE CAMPOS RUGGIERO, INSTITUTO AGRONÔMICO; OLIVEIRO GUERREIRO FILHO, INSTITUTO AGRONÔMICO; CARLOS AUGUSTO COLOMBO, INSTITUTO AGRONÔMICO. |
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Título: |
Genetic diversity of cultivated Coffea arabica inbred lines assessed by RAPD, AFLP and SSR marker systems. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, v. 62, n. 4, p. 366-373, 2005. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Caracterização da diversidade genética de linhagens comerciais de Coffea arabica através de marcadores moleculares do tipo RAPD, AFLP e SSR. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT: One of the greatest problems in Coffea arabica breeding is identifying precisely any inbred line, based only on botanical and agronomical descriptors, because of the reduced genetic variability of the species, close pedigree origin, which results in small phenotypic variation. Recently, molecular markers have been used for plant germplasm characterization and identification in several commercial species. This work evaluates the reliability of three marker systems: RAPD, AFLP and SSR, to characterize the genetic variability of commercially-used Coffea inbred lines developed by the Instituto Agronômico (IAC), and their potential for cultivar identification. All methods identified polymorphisms among the cultivars. The genetic diversity recognized by the methods is very similar, although is very narrow. RAPD and SSR marker systems grouped more efficiently the evaluated cultivars according to parental origin. None of the methods allowed inbred line identification. Therefore for varietal protection, it would be necessary using a combination of botanical, agronomical and molecular markers descriptors for precise cultivar identification. RESUMO: A identificação de linhagens de Coffea arabica a partir de descritores botânicos e agronômicos é um problema para o desenvolvimento de cultivares. Basicamente, a limitada variação fenotípica observada em cultivares é o resultado de uma estreita variabilidade genética em C. arabica associada com uma origem genealógica próxima. Recentemente, os uso de marcadores moleculares tem contribuído para a caracterização e identificação de várias espécies de interesse comercial. O objetivo deste trabalho foi comparar a confiabilidade de três tipos de marcadores moleculares, RAPD, AFLP e SSR, para a caracterização da variabilidade genética e uma possível identificação de linhagens comerciais de Coffea desenvolvidas pelo IAC. Os métodos avaliados permitiram identificar polimorfismos entre cultivares. A variabilidade genética detectada por eles é muito semelhante, ainda que reduzida. Marcadores do tipo RAPD e SSR foram mais eficientes em análises de parentesco, e o agrupamento das linhagens correspondeu à sua origem genealógica. No entanto, nenhum dos métodos testados permitiu a identificação individual de linhagens. Neste caso, a utilização conjunta de descritores botânicos, agronômicos e marcadores moleculares é recomendada para a identificação precisa de linhagens, visando processos de proteção legal de cultivares de Coffea. MenosABSTRACT: One of the greatest problems in Coffea arabica breeding is identifying precisely any inbred line, based only on botanical and agronomical descriptors, because of the reduced genetic variability of the species, close pedigree origin, which results in small phenotypic variation. Recently, molecular markers have been used for plant germplasm characterization and identification in several commercial species. This work evaluates the reliability of three marker systems: RAPD, AFLP and SSR, to characterize the genetic variability of commercially-used Coffea inbred lines developed by the Instituto Agronômico (IAC), and their potential for cultivar identification. All methods identified polymorphisms among the cultivars. The genetic diversity recognized by the methods is very similar, although is very narrow. RAPD and SSR marker systems grouped more efficiently the evaluated cultivars according to parental origin. None of the methods allowed inbred line identification. Therefore for varietal protection, it would be necessary using a combination of botanical, agronomical and molecular markers descriptors for precise cultivar identification. RESUMO: A identificação de linhagens de Coffea arabica a partir de descritores botânicos e agronômicos é um problema para o desenvolvimento de cultivares. Basicamente, a limitada variação fenotípica observada em cultivares é o resultado de uma estreita variabilidade genética em C. arabica associada com uma origem genealógica próxima. Rece... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Coffea Arábica; Identificação; Marcador Molecular; Variedade. |
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Thesaurus Nal: |
Cultivar identification. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1160620/1/Genetic-diversity.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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| 26. |  | AFONSO, R. F.; FONSECA, A. P.; PELLEGRIN, A. O. O javali na mídia nacional (2017-2023): temas, impactos e stakeholders. In: EVENTO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DO PANTANAL, 10., 2023, Corumbá. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 13. (Embrapa Pantanal. Eventos técnicos & científicos, 1). Evinci 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 27. | | BARROS, A. T. M. de; PELLEGRIN, A. O. Manejo produtivo. In: SANTOS, S. A.; PELLEGRIN, A. O.; MORAES, A. S.; BARROS, A. T. M. de; COMASTRI FILHO, J. A.; SERENO, J. R. B.; SILVA, R. A. M. S. e; ABREU, U. G. P. de. Sistema de produção de gado de corte do Pantanal. Corumbá: Embrapa Pantanal, 2002. (Embrapa Pantanal. Sistemas de Produção, 01). p.41-45.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 31. | | PELLEGRIN, A. O.; SILVA, R. A. M. S. Saúde. In: SANTOS, S. A.; PELLEGRIN, A. O.; MORAES, A. S.; BARROS, A. T. M. de; COMASTRI FILHO, J. A.; SERENO, J. R. B.; SILVA, R. A. M. S. e; ABREU, U. G. P. de. Sistema de produção de gado de corte do Pantanal. Corumbá: Embrapa Pantanal, 2002. (Embrapa Pantanal. Sistemas de Produção, 01). p.46-57.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 35. | | PÉRES, I. A. H. F. S.; OLIVEIRA, C. E. de; TOMAS, W. M.; PELLEGRIN, A. O. Association between brucellosis prevalence and taxes of pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) found without fawns in southwestern Nhecolândia region, Pantanal wetland, Brazil. BRUCELLOSIS RESEARCH CONFERENCE, 64., 2011, Buenos Aires. [Resumos]. [Buenos Aires: Asociación Argentina de Microbiologia], 2011. p. 105.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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