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| Registros recuperados : 481 | |
| 81. |  | SOLLERO, B. P.; YAMAKI, M.; GUIMARÃES, S. E. F.; CARNEIRO, P. L. S.; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S. Análise de componentes principais como ferramenta na avaliação da diversidade genética de suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 82. | | SANTOS, S. A.; PAIVA, S. R.; JULIANO, R. S.; COMASTRI FILHO, J. A.; MARQUES, M. C. de A. Sistema de criação. In: SANTOS, S. A.; SALIS, S. M. de; COMASTRI FILHO, J. A. (Ed.). Cavalo pantaneiro: rústico por natureza. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 123-145.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 86. | | AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; PAIVA, S. R.; BARRETO NETO, A. D.; MELO, E. de O. Prolificidade de ovelhas Santa Inês do genótipo FECGE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 88. | | MARIANTE, A. da S.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; EGITO, A. A.; PAIVA, S. R.; CASTRO, S. T. R. Raças crioulas brasileiras: cinco séculos de seleção natural das raças autóctones portuguesas no Brasil. REUNIÃO DA SOCIEDADE PORTUGUESA DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 2.; CONGRESSO IBÉRICO SOBRE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 4., 2004, Ponte de Lima. Resumo das comunicações... Ponte de Lima: Escola Superior Agrária Ponte de Lima: Sociedade Portuguesa de Recursos Genéticos Animais, 2004. p. 29-30.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 89. | | ARAUJO, A. R.; LOBO, A. M. B. O.; MCMANUS, C. M.; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R. Prospecção de marcadores snp nos genes GHR, GHRHR e IGF em ovinos de corte. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 147. p. 197.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 90. | | PAIVA, S. R.; LOBO, A. M. B. O.; ARAÚJO, A. R. de; McMANUS, C.; LOBO, R. N. B. Prospecção de marcadores SNP nos genes GHR, GHRHR e IGF em ovinos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008. 4 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 91. | | PAIVA, S. R.; LOBO, A, M. B. O.; ARAÚJO, A. R. de; PIMENTEL, C. M.; LÔBO, R. N. B. Prospecção de marcadores SNP nos genes GHR, GHRHR e IGF em ovinos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 92. | | CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R. Estimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 93. | | CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R. Estimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 f. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 94. | | PIMENTEL, F.; MCMANUS, C.; SOARES, K.; CAETANO, A. R.; FARIA, D. A. de; PAIVA, S. R.; IANELLA, P. Landscape genetics for Brazilian equines. Journal of Equine Veterinary Science, v. 126, 104251, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 95. | | BLUME, G. R.; BONORINO, R.; REIS, F. C.; PAIVA, S. R.; BRAVO, R. P. B.; MARTINS, C. F. Isolamento e cultivo de fibroblastos obtidos de mamíferos silvestres mortos para formação de um banco de germoplasma. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 96. | | BLUME, G. R.; BONORINO, R.; REIS, F. C.; PAIVA, S. R.; BRAVO, R. P. B.; MARTINS, C. F. Isolamento e cultivo de fibroblastos obtidos de mamíferos silvestres mortos para formação de um banco de germoplasma. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 99. | | ARAUJO, A. R. de; IANELLA, P.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; PAIVA, S. R. Manejo de diversidade genética en um núcleo de conservação da raça ovina Crioula lanada (Ovis aries), Brasil In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 7., 2009, Pucón. Proceeding... Santiago: INIA, 2009. p. 221-222. VII SIRGEALC.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 100. | | MARIANTE, A. S.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; EGITO, A. A.; PAIVA, S. R.; CASTRO, S. T. R. Situação atual dos grupamentos raciais em vias de extinção das diferentes espécies animais no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 16., 2005, Goiânia, GO. [Anais...]. [Belo Horizonte: CBRA], 2005. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 481 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
09/01/2020 |
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Data da última atualização: |
09/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
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Afiliação: |
PATRICIA IANELLA, Cenargen; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, CNPASA; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen. |
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Título: |
Tambaqui (Colossoma macropomum) single nucleotide polymorphism discovery by reduced representation library deep sequencing. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Aquaculture: the big choice! abstracts. [S.l.: s.n.], 2019. |
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Páginas: |
p. 491. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most important native freshwater fish farmed in Brazil. Production and supply chains are consistently growing, while current yearly production levels of this species exceed 200.000mt. Recent efforts of our research team have produced a draft genome sequence for this species. Here we describe results from SNP discovery efforts using deep sequencing of reduced representation libraries (RRLs) of varying fragment sizes. Ten micrograms of bulked DNA samples from 63 unrelated fish (males and females) were completely digested with HaeIII. Fragments between 400?500bp; 500?650 bp; and 650?850bp representing around 12% of the tambaqui genome were sequenced with a depth of >100x. Nearly 720 million reads (2x150bp) were generated with a HiSeq2000 using TruSeq v3 chemistry, 2.444.604 putative SNPs were identified and their allele frequencies estimated. A total of 2.011.219 SNPs were observed with read depths RD>150 and minor allele frequencies >0.05 (Fig. 1). This represents the first report of an extensive effort to identify SNP markers for this species and will be a valuable source of information for designing marker panels with varying applications. These results can affect the use of genomic tools in broodstock management, assisted genetic evaluations and breeding for tambaqui. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Colossoma Macropomum; Tambaqui. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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001 2118463
005 2020-01-09
008 2019 bl uuuu u01u1 u #d
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245 $aTambaqui (Colossoma macropomum) single nucleotide polymorphism discovery by reduced representation library deep sequencing.$h[electronic resource]
260 $aIn: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Aquaculture: the big choice! abstracts. [S.l.: s.n.], 2019.$c2019
300 $ap. 491.
520 $aTambaqui (Colossoma macropomum) is the most important native freshwater fish farmed in Brazil. Production and supply chains are consistently growing, while current yearly production levels of this species exceed 200.000mt. Recent efforts of our research team have produced a draft genome sequence for this species. Here we describe results from SNP discovery efforts using deep sequencing of reduced representation libraries (RRLs) of varying fragment sizes. Ten micrograms of bulked DNA samples from 63 unrelated fish (males and females) were completely digested with HaeIII. Fragments between 400?500bp; 500?650 bp; and 650?850bp representing around 12% of the tambaqui genome were sequenced with a depth of >100x. Nearly 720 million reads (2x150bp) were generated with a HiSeq2000 using TruSeq v3 chemistry, 2.444.604 putative SNPs were identified and their allele frequencies estimated. A total of 2.011.219 SNPs were observed with read depths RD>150 and minor allele frequencies >0.05 (Fig. 1). This represents the first report of an extensive effort to identify SNP markers for this species and will be a valuable source of information for designing marker panels with varying applications. These results can affect the use of genomic tools in broodstock management, assisted genetic evaluations and breeding for tambaqui.
650 $aBioinformatics
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aColossoma Macropomum
650 $aTambaqui
653 $aBioinformática
653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
700 1 $aVARELA, E. S.
700 1 $aVILLELA, L. C. V.
700 1 $aPAIVA, S. R.
700 1 $aCAETANO, A. R.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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