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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
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Data corrente: |
11/06/2014 |
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Data da última atualização: |
06/07/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, C. C.; MANTELLO, C. C.; CAMPOS, T. de; SOUZA, L. M.; GONÇALVES, P. S.; SOUZA, A. P. |
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Afiliação: |
Carla C. Silva, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); Camila C. Mantello, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC; Livia M. Souza, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); Paulo S. Gonçalves, Instituto Agronômico de Campinas (IAC); Anete P. Souza, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp). |
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Título: |
Leaf-, panel- and latex-expressed sequenced tags from the rubber tree (Hevea brasiliensis) under cold-stressed and suboptimal growing conditions: the development of gene-targeted Functional markers for stress response. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, Berlim, v. 34, n. 3, p. 1035-1053, Oct. 2014. |
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ISSN: |
1380-3743 (impresso) / 1572-9788 (on-line) |
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DOI: |
10.1007/s11032-014-0095-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Hevea brasiliensis is a native species of the Amazon Basin of South America and the primary source of natural rubber worldwide. Due to the occurrence of South American Leaf Blight disease in this area, rubber plantations have been extended to suboptimal regions. Rubber tree breeding is time-consuming and expensive, but molecular markers can serve as a tool for early valuation, thus reducing time and costs. In this work, we constructed six different cDNA libraries with the aim of developing gene-targeted molecular markers for the rubber tree. A total of 8,263 reads were assembled, generating 5,025 unigenes that were analyzed; 912 expressed sequence tags (ESTs) represented new transcripts, and two sequences were highly up-regulated by cold stress. These unigenes were scanned for microsatellite (SSR) regions and single nucleotide polymorphisms (SNPs). In total, 169 novel EST-SSR markers were developed; 138 loci were polymorphic in the rubber tree, and 98 % presented transferability to six other Hevea species. Locus duplication was observed in H. brasil-iensis and other species. Additionally, 43 SNP markers in 13 sequences that showed similarity to proteins involved in stress response, latex biosynthesis and developmental processes were characterized. cDNA libraries are a rich source of SSR and SNP markers and enable the identification of new transcripts. The new markers developed here will be a valuable resource for linkage mapping, QTL identification and other studies in the rubber tree and can also be used to evaluate the genetic variability of other Hevea species, which are valuable assets in rubber tree breeding. MenosHevea brasiliensis is a native species of the Amazon Basin of South America and the primary source of natural rubber worldwide. Due to the occurrence of South American Leaf Blight disease in this area, rubber plantations have been extended to suboptimal regions. Rubber tree breeding is time-consuming and expensive, but molecular markers can serve as a tool for early valuation, thus reducing time and costs. In this work, we constructed six different cDNA libraries with the aim of developing gene-targeted molecular markers for the rubber tree. A total of 8,263 reads were assembled, generating 5,025 unigenes that were analyzed; 912 expressed sequence tags (ESTs) represented new transcripts, and two sequences were highly up-regulated by cold stress. These unigenes were scanned for microsatellite (SSR) regions and single nucleotide polymorphisms (SNPs). In total, 169 novel EST-SSR markers were developed; 138 loci were polymorphic in the rubber tree, and 98 % presented transferability to six other Hevea species. Locus duplication was observed in H. brasil-iensis and other species. Additionally, 43 SNP markers in 13 sequences that showed similarity to proteins involved in stress response, latex biosynthesis and developmental processes were characterized. cDNA libraries are a rich source of SSR and SNP markers and enable the identification of new transcripts. The new markers developed here will be a valuable resource for linkage mapping, QTL identification and other studies in the r... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Biblioteca cDNA; CDNA library; Fitomejoramiento; Marcador microssatélite; Marcador SNP; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Rubber tree. |
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Thesagro: |
Caucho; DNA; Hevea brasiliensis; Marcador genético; Melhoramento genético vegetal; Seringueira. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic markers; Microsatellite repeats; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160345/1/25073.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
14/06/2022 |
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Data da última atualização: |
10/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Documentos |
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Autoria: |
SILVA, M. V. G. B.; FERREIRA JUNIOR, E.; PANETTO, J. C. do C.; MARTINS, M. F.; PAIVA, L. de C.; MACHADO, M. A.; REIS, D. R. de L.; DALTRO, D. dos S.; NEGRI, R.; KLUSKA, S. (ed.). |
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Afiliação: |
MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; EDIVALDO FERREIRA JUNIOR, ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DOS CRIADORES DE GIROLANDO; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; LEANDRO DE CARVALHO PAIVA, ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DOS CRIADORES DE GIROLANDO; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; DANIELE RIBEIRO DE LIMA REIS FAZA, CNPGL; DARLENE DOS SANTOS DALTRO, ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DOS CRIADORES DE GIROLANDO; RENATA NEGRI, ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DOS CRIADORES DE GIROLANDO; SABRINA KLUSKA, ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DOS CRIADORES DE GIROLANDO. |
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Título: |
Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando - avaliação genética/genômica de fêmeas - junho 2022. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2022. |
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Páginas: |
170 p. |
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Série: |
(Embrapa Gado de Leite. Documentos, 267). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A Embrapa Gado de Leite e a Associação Brasileira dos Criadores de Girolando realizam anualmente as avaliações genéticas e genômicas de vacas e de touros, utilizando os dados coletados pelo Serviço de Controle Leiteiro da Associação nos rebanhos associados e nos rebanhos colaboradores do Programa de Melhoramento Genético da Raça Girolando (PMGG). As provas dos touros são divulgadas anualmente no Sumário de Touros do PMGG desde 2005. As avaliações genéticas das 1000 vacas de maiores valores genéticos para a produção de leite passaram a ser divulgadas em 2013 e a partir de 2019, os resultados das avaliações de vacas passaram a utilizar a medida de PTAs (capacidade predita de transmissão), assim como já divulgado no Sumário de Touros Girolando. Em 2017, passou-se a divulgar o resultado das PTAs genômicas (GPTA) das 200 fêmeas jovens com idade inferior ou igual a 24 meses para produção de leite em até 305 dias. Dessa forma, por meio das informações disponibilizadas no sumário de vacas permitem que os criadores tenham conhecimento das vacas Girolando com maior potencial genético. O uso dessa informação possibilita selecionar, de modo mais eficiente, as vacas que poderão ser mães de touros e aquelas com potencial para serem submetidas a aplicação de biotecnologias reprodutivas. |
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Palavras-Chave: |
Bovine; Dairy Gir; Gyr cattle. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado Gir; Gir Leiteiro; Melhoramento Animal. |
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Thesaurus NAL: |
Genetic improvement. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144065/1/DOC-267-Programa-de-Melhoramento-Genetico-da-Raca-Girolando.pdf
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Marc: |
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650 $aGenetic improvement
650 $aBovino
650 $aGado Gir
650 $aGir Leiteiro
650 $aMelhoramento Animal
653 $aBovine
653 $aDairy Gir
653 $aGyr cattle
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700 1 $aPANETTO, J. C. do C.
700 1 $aMARTINS, M. F.
700 1 $aPAIVA, L. de C.
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aREIS, D. R. de L.
700 1 $aDALTRO, D. dos S.
700 1 $aNEGRI, R.
700 1 $aKLUSKA, S.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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