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Registros recuperados : 66 | |
41. | | PACHECO, R. S.; PASSOS, S. R.; DIAS, A.; LUCENA, R. L. de D.; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G. Inibição in vitro do crescimento de Rhizoctonia solani por isolados do grupo fluorescente das Pseudomonas spp. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2006. 4 p. Trabalho apresentado na XXVII Reunião Brasileira de Fertilidade do Solo e Nutrição de Plantas, XI Reunião Brasileira sobre Micorrizas, IX Simpósio Brasileiro de Microbiologia do Solo; VI Reunião Brasileira de Biologia do Solo, Bonito/MS,... Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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42. | | BRITO, L. F. de; PACHECO, R. S.; SILVA, J. D. C. da; STRALIOTTO, R.; ARAÚJO, A. P. Iniciação da noculação e da atividade da Nitrogenase em cinco cultivares de feijoeiro REUNIÃO BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2012. FERTBIO 2012. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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44. | | BRITO, L. F. de; PACHECO, R. S.; FERREIRA, E. P. de B.; ARAÚJO, A. P.; STRALIOTTO, R. Resposta de cultivo de feijoeiro inoculado com rizóbio ao enriquecimento das sementes com fósforo e molibdênio. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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45. | | BRITO, L. F. de; PACHECO, R. S.; FERREIRA, E. P. de B.; ARAÚJO, A. P.; STRALIOTTO, R. Resposta de cultivo de feijoeiro inoculado com rizóbio ao enriquecimento das sementes com fósforo e molibdênio. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2010. FertBio 2010. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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46. | | DIAS, A.; PACHECO, R. S.; SANTOS, S. G. dos; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G.; DUARTE, R. de L. R. Screening of fluorescent rhizobacteria for the biocontrol of soilborne plant pathogenic fungi. Revista Caatinga, v. 27, n. 2, p. 1-9, abr./jun., 2014 Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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47. | | PACHECO, R. S.; BRITO, L. F. de; CARVALHO, R. H. de; SOUZA FILHO, B. F. de; ARAUJO, A. P. de; STRALIOTTO, R. Aplicação de nitrogênio em feijoeiro inoculado com Rizhobium em área com cultivos sucessivos de feijão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 34., 2013, Florianópolis. Ciência do solo: para quê e para quem? Anais... Florianópolis: SBCS, 2013. 4 p. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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48. | | DIAS, A.; PINTON, R.; PACHECO, R. S.; PASSOS, S. R.; RUMJANEK, N. G.; XAVIER, G. R.; RIBEIRO, R. de L. D. Formação de biofilme por estirpes de rizobactérias isoladas de hortaliças. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2006. 4 p. Trabalho apresentado na XXVII Reunião Brasileira de Fertilidade do Solo e Nutrição de Plantas, XI Reunião Brasileira sobre Micorrizas, IX Simpósio Brasileiro de Microbiologia do Solo; VI Reunião Brasileira de Biologia do Solo, Bonito/MS,... Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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49. | | OLIVEIRA, F. F. de; GUERRA, J. G. M.; JUNQUEIRA, R. M.; PACHECO, R. S.; ALMEIDA, D. L. de; RIBEIRO, R. de L. D.; RICCI, M. dos S. F. Eficiência de fontes vegetais de cobertura morta na supressão de espécies de ocorrência espontânea e desempenho agronômico de alface (Lactuca sativa L.) sob manejo orgânico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 30., 2005, Recife. Solos: sustentabilidade e qualidade ambiental. Recife: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2005. 4 p. CD ROM. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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50. | | BRITO, L. F. de; PACHECO, R. S.; MOREIRA, L. L. Q.; FERREIRA, E. P. de B.; ARAÚJO, A. P.; STRALIOTTO, R. Produção de grãos e de biomassa de duas cultivares de feijoeiro inoculadas com diferentes estirpes de rizóbio In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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51. | | BRITO, L. F. de; PACHECO, R. S.; MOREIRA, L. L. Q.; FERREIRA, E. P. de B.; ARAÚJO, A. P.; STRALIOTTO, R. Produção de grãos e de biomassa de duas cultivares de feijoeiro inoculadas com diferentes estirpes de rizóbio. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2010. FertBio 2010. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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52. | | SILVA, M. V. B.; DIAS, A.; PACHECO, R. S.; CARVALHO, J. F.; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G.; RIBEIRO, R. de L. D. Diversidade de rizobactérias com capacidade antagonística in vitro contra fungos fitopatogênicos. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 7., 2007, Seropédica, RJ. Resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2007. 1 CD-ROM. Parceria: UFRJ; UFRRJ Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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53. | | GUARESCHI, R. F.; BATISTA, J. N.; PACHECO, R. S.; SILVA, E. P. da; ALVES, B. J. R.; JANTALIA, C. P.; URQUIAGA, S.; ZILLI, J. E. Desempenho de genótipos de soja nas condições edafoclimáticas da região Norte do estado do Rio de Janeiro. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 20., 2020, Seropédica. Inteligência artificial: a nova fronteira da ciência brasileira: impactos para a agricultura sustentável. Resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2020. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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54. | | ALMEIDA, J. C. de; PACHECO, R. S.; FERREIRA, N. dos S.; MORAES, C.; MESSIAS, M.; JANTALIA, C. P.; ZILLI, J. E. Desempenho produtivo de quatro cultivares de grão-de-bico nas condições edafoclimáticas do Rio de Janeiro. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 22., 2022, Seropédica. Bicentenário da Independência: 200 anos de ciência, tecnologia e inovação no Brasil: caderno de resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2022. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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55. | | PACHECO, R. S.; DIAS, A.; SILVA, M. V. B.; CARVALHO, J. F.; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G.; RIBEIRO, R. de L. D. Pseudomonas fluorescens e Pseudomonas putida antagonística à fungos fitopatógenos habitantes do solo. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 7., 2007, Seropédica, RJ. Resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2007. 1 CD-ROM. Parceria: UFRRJ; UFRJ Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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56. | | CARVALHO, J. F.; DIAS, A.; PACHECO, R. S.; SILVA, M. V. B.; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G.; RIBEIRO, R. de L. D. Pseudomonas fluorescens e Pseudomonas putida antagonísticas à Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2007. 4 p. Parceria: UFRRJ.
Trabalho apresentado no IX Reunião Brasileira sobre Controle Biológico de Doenças de Plantas, Campinas/SP, 05 a 09 de novembro de 2007. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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57. | | CARVALHO, J. F.; DIAS, A.; PACHECO, R. S.; SILVA, M. V. B.; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G.; RIBEIRO, R. de L. D. Pseudomonas fluorescens e Pseudomonas putida antagonísticas à Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 7., 2007, Seropédica, RJ. Resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2007. 1 CD-ROM. Parceria: UFRJ; UFRRJ Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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58. | | SILVA, M. V. B.; DIAS, A.; PACHECO, R. S.; CARVALHO, J. F.; XAVIER, G. R.; RUMJANEK, N. G.; RIBEIRO, R. de L. D. Gêneros e espécies de rizobactérias isoladas de um sistema orgânico de produção de hortaliças apresentando antagonismo contra Rhizoctonia solani e Sclerotium rolfsii in vitro. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2007. 4 p. Parceria: UFRRJ.
Trabalho apresentado no IX Reunião Brasileira sobre Controle Biológico de Doenças de Plantas, Campinas/SP, 05 a 09 de novembro de 2007. Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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59. | | BRITO, L. F. de; PACHECO, R. S.; SOUZA FILHO, B. F. de; FERREIRA, E. P. de B.; STRALIOTTO, R.; ARAÚJO, A. P. Resposta do feijoeiro comum à inoculação com rizóbio e suplementação com nitrogênio mineral em dois biomas brasileiros. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 39, n. 4, p. 981-992, jul./ago. 2015. Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Solos. |
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Registros recuperados : 66 | |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
Data corrente: |
09/11/2021 |
Data da última atualização: |
09/11/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
SOARES, I. C.; PACHECO, R. S.; SILVA, C. G. N. da; SANTOS, R. S.; BALDANI, J. I.; URQUIAGA, S.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. |
Afiliação: |
ISIS CAPELLA SOARES, UFRRJ; RAFAEL SANCHES PACHECO, UFRRJ; CLEUDISON GABRIEL NASCIMENTO DA SILVA, UFLA; RAFAEL SALAZAR SANTOS, UFRRJ; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; SEGUNDO SACRAMENTO U CABALLERO, CNPAB; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
Título: |
Real-time PCR method to quantify Sp245 strain of Azospirillum baldaniorum on Brachiaria grasses under field conditions. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Plant and Soil, 06 September 2021 |
ISSN: |
0032-079X |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11104-021-05137-y |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Bacterial quantification by qPCR is considered the gold standard for microbial molecular diagnosis. However, a fundamental pre-requisite in this methodology is the designing of specific primers for the bacterium of interest. With the increase in bacterial genome sequencing data in the recent years, it has become possible to design specific primers that can be used to quantify different strains of the same bacterial species. Methods: To develop a real-time PCR (qPCR) protocol for the specific quantification of Azospirillum baldaniorum Sp245 strain (old Azospirillum brasilense), the Sp245 genome sequence was fragmented into small contigs with 500 base pairs each, and analyzed for similarity against the NCBI non-redundant database. A. baldaniorum-specific contigs were used to design the primers. The best pair of primers was used to quantify these bacteria after inoculation in different cultivars of Brachiaria, grown under field conditions. Results: Our results showed that the primer pair Sp245p10 was highly specific for the Sp245 strain in the Brachiaria root and shoot field under different conditions. The qPCR assay using these primers showed differences among cultivars in the number of bacteria detected in plants after inoculation. Additionally, the number of bacteria observed in the roots was higher than that in the shoots. Conclusion: The qPCR methodology using a Sp245 strain-specific primer may be used to monitor A. baldaniorum inoculated into other plants and may find potential application in field experiments. MenosBacterial quantification by qPCR is considered the gold standard for microbial molecular diagnosis. However, a fundamental pre-requisite in this methodology is the designing of specific primers for the bacterium of interest. With the increase in bacterial genome sequencing data in the recent years, it has become possible to design specific primers that can be used to quantify different strains of the same bacterial species. Methods: To develop a real-time PCR (qPCR) protocol for the specific quantification of Azospirillum baldaniorum Sp245 strain (old Azospirillum brasilense), the Sp245 genome sequence was fragmented into small contigs with 500 base pairs each, and analyzed for similarity against the NCBI non-redundant database. A. baldaniorum-specific contigs were used to design the primers. The best pair of primers was used to quantify these bacteria after inoculation in different cultivars of Brachiaria, grown under field conditions. Results: Our results showed that the primer pair Sp245p10 was highly specific for the Sp245 strain in the Brachiaria root and shoot field under different conditions. The qPCR assay using these primers showed differences among cultivars in the number of bacteria detected in plants after inoculation. Additionally, the number of bacteria observed in the roots was higher than that in the shoots. Conclusion: The qPCR methodology using a Sp245 strain-specific primer may be used to monitor A. baldaniorum inoculated into other plants and may find pot... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Azospirillum baldanioru; Plant growth promoting bacteria; Quantification; Signal grass. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
LEADER 02397naa a2200277 a 4500 001 2135952 005 2021-11-09 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0032-079X 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11104-021-05137-y$2DOI 100 1 $aSOARES, I. C. 245 $aReal-time PCR method to quantify Sp245 strain of Azospirillum baldaniorum on Brachiaria grasses under field conditions.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aBacterial quantification by qPCR is considered the gold standard for microbial molecular diagnosis. However, a fundamental pre-requisite in this methodology is the designing of specific primers for the bacterium of interest. With the increase in bacterial genome sequencing data in the recent years, it has become possible to design specific primers that can be used to quantify different strains of the same bacterial species. Methods: To develop a real-time PCR (qPCR) protocol for the specific quantification of Azospirillum baldaniorum Sp245 strain (old Azospirillum brasilense), the Sp245 genome sequence was fragmented into small contigs with 500 base pairs each, and analyzed for similarity against the NCBI non-redundant database. A. baldaniorum-specific contigs were used to design the primers. The best pair of primers was used to quantify these bacteria after inoculation in different cultivars of Brachiaria, grown under field conditions. Results: Our results showed that the primer pair Sp245p10 was highly specific for the Sp245 strain in the Brachiaria root and shoot field under different conditions. The qPCR assay using these primers showed differences among cultivars in the number of bacteria detected in plants after inoculation. Additionally, the number of bacteria observed in the roots was higher than that in the shoots. Conclusion: The qPCR methodology using a Sp245 strain-specific primer may be used to monitor A. baldaniorum inoculated into other plants and may find potential application in field experiments. 653 $aAzospirillum baldanioru 653 $aPlant growth promoting bacteria 653 $aQuantification 653 $aSignal grass 700 1 $aPACHECO, R. S. 700 1 $aSILVA, C. G. N. da 700 1 $aSANTOS, R. S. 700 1 $aBALDANI, J. I. 700 1 $aURQUIAGA, S. 700 1 $aVIDAL, M. S. 700 1 $aARAUJO, J. L. S. de 773 $tPlant and Soil, 06 September 2021
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Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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