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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  20/02/2009
Data da última atualização:  15/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; CECÍLIO, P. L.; PELLIGRINELLI, T. V.; NESHICH, G.
Afiliação:  JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; LUIZ CÉSAR BORRO; DANIEL ALVARENGA; PABLO LIRA CECÍLIO; THAÍS VITAL PELLIGRINELLI; GORAN NESHICH, CNPTIA.
Título:  How did the structure function descriptors of proteins change with introduction of 'remediated' PDB files.
Ano de publicação:  2008
Fonte/Imprenta:  In: RED IBEROAMERICANA DE BIOINFORMÁTICA CONGRESS, 5., 2008, Santiago. Program and abstracts... Santiago. Pontificia Universidade Católica de Chile, 2008.
Páginas:  p. 15.
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Due to reasons related mainly to modernization of structure annotation data, the RCSB/PDB implemented in August of 2007, a "remediated" PDB files. The major difference introduced by this format is related to the number of chains present in the PDB file. Namely, files such as the 1cho.pdb, suffered a change in number of chains present in the enzyme structure: from previous 1 to current 3. The reason for such change is based on the fact that the enzyme structure contains two gaps, which are treated with certain degree of difficulty by the software producers. We have invested a significant amount of time and CPU resources in order to curate and analyze what are the consequences for in-silicon analysis of the active site 3D environment after implementing remediated PDB files to STING_DB. For this purpose, we analyzed a number of proteins, chosen to represent both files which suffered a change in total numb er of chains as well as those which did not.
Palavras-Chave:  Bioinformática; PDB files; Proteínas.
Thesaurus Nal:  Bioinformatics; Proteins.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
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CNPTIA12559 - 2UPCRA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, M. de J. P. de; SILVA, P. H. S. da; PÁDUA, L. E. de M. Potencial de extratos de frutos frescos e desidratados de Piper tuberculatum Jacq. (Piperaceae) no desenvolvimento da lagarta-do-cartucho do milho. Magistra, Cruz das Almas, v. 22, n. 2, p. 88-95, abr./jun. 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, M. de J. P. de; SILVA, P. H. S. da; PÁDUA, L. E. de M. Atividade de extrato de Piper tuberculatum Jacq. (Piperaceae) sobre Spodoptera frugiperda (J. E. Smith). Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 39, n. 3, p. 437-442, jul./set. 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, M. de J. P. de; SILVA, P. H. S. da; PÁDUA, L. E. de M. Atividade de extratos de frutos frescos de Piper tuberculatum Jacq. (Piperaceae) sobre a fase larval de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith). In: SIMPÓSIO DE ENTOMOLOGIA, 1., REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE DE ENTOMOLOGIA DA PARAÍBA, 3., 2007, Campina Grande. Entomologia e biodiversidade: anais. Campina Grande: Sociedade de Entomologia da Paraíba, 2007. p. 80.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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4.Imagem marcado/desmarcadoLOPES, M. T. do R.; SILVA, P. H. S. da; PADUA, L. E. de M. Avaliacao da resistencia de genotipos de feijao macassar (Vigna unguiculata) ao gorgulho Callosobruchus maculatus. In: REUNIAO NACIONAL DE PESQUISA DE CAUPI, 3., 1991, Fortaleza. Resumos. Fortaleza: UFC, 1991. p. 33.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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5.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, V. S.; SILVA, P. H. S. da; PÁDUA, L. E. Bioatividade do óleo essencial de Lippia sidoides Cham. (alecrim-pimenta) sobre Callosobruchus maculatus (Fabr.) (Coleoptera: Crysomelidae). EntomoBrasilis, v. 11, n. 2, p. 113-117, 2018. Autoria na publicação: Paulo Henrique Silva.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, M. de J. P. de; P. H. S. da; PÁDUA, L. E. de M. Influência de extratos de frutos frescos e desidratados de Piper tuberculatum JACQ. (Piperaceae) no desenvolvimento da lagarta-do-cartucho. In: SIMPÓSIO EM PROTEÇÃO DE PLANTAS - SIMPROT, 1., 2009, Botucatu. Resumos...Botucatu: FCA/UNESP: FEPAF, 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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7.Imagem marcado/desmarcadoPAZ NETO, F. R.; SILVA, P. H. S. da; PADUA, L. E. de M. Eficiencia de inseticidas no controle de vaquinha, (Cerotoma arcuata (Olivier, 1791), Coleoptera Chrysomelidade) em condicoes de laboratorio. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 12., 1989, Belo Horizonte. Resumos. Belo Horizonte: SEB /EMBRAPA-CNPMS, 1989. p.332.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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8.Imagem marcado/desmarcadoPAZ NETO, F. R.; SILVA, P. H. S. da; PADUA, L. E. de M. Eficiência de inseticidas no controle de vaquinha, Cerotoma arcuata (Olivier, 1791) (Coleoptera: Chrysomelidae) em condições de laboratório. In: SEMINARIO DE PESQUISA AGROPECUARIA DO PIAUI, 5., 1988, Teresina. Anais... Teresina: EMBRAPA-UEPAE de Teresina, 1988. p.35-39. (EMBRAPA-UEPAE de Teresina. Documentos, 9).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, M. A.; SILVA, P. H. S. da; PÁDUA, L. E. M. Eficiência e toxicidade de óleos essenciais e fixos sobre Aphis cracccivora Koch em feijão-caupi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., Gramado. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Gramado: SEB, 2018. p. 1231.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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10.Imagem marcado/desmarcadoZANON, J.; PÁDUA, L. E. de M.; SILVA, S. S. da; SILVA, P. R. R.; SILVA, P. H. S. da. Avaliação de extratos de folhas de angico branco e talos de pimenta de macaco sobre a biologia de Spodoptera frugiperda (J. F. Smith. 1797). In: ENCONTRO DE ZOOLOGIA DA UFPI, 1., 2003, Teresina. Anais... Teresina: EDUFPI, 2003. p. 64-68
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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11.Imagem marcado/desmarcadoALVES, S. B.; PADUA, L. E. de M.; AZEVEDO, E. M. V. M. de; ALMEIDA, L. C. de. Controle da broca da cana-de-acucar pelo uso de Beauveria bassiana. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.20, n.4, p.403-406, abr. 1985.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, E. P. da S.; SILVA, P. H. S. da; PÁDUA, L. E. de M.; BARRETO, A. L. H. Efeito de repelência de doses do óleo essencial de Piper tuberculatum em ninfas de primeiro ínstar de Crinocerus sanctus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE DEFENSIVOS AGRÍCOLAS NATURAIS, 5., 2011, Jaguariúna. [Anais...]. Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2011. 1 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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13.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, E. P. da S.; SILVA, P. H. S. da; PÁDUA, L. E. de M.; BARRETO, A. L. H. Toxicidade do óleo essencial de Piper tuberculatum Jacq. em ninfas de segundo ínstar do percevejo-vermelho-do-caupi Crinocerus sanctus (Fabr.) (Hemiptera; Coreidea). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE DEFENSIVOS AGRÍCOLAS NATURAIS, 5., 2011, Jaguariúna. [Anais...] Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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14.Imagem marcado/desmarcadoPÁDUA, L. E. de M.; PINHEIRO, J. C. A.; SILVA, P. R. R.; CARVALHO, P. R. dos S.; CARVALHO, E. M. S.; SILVA, P. H. S. da. Exigências térmicas de Spodoptera frugiperda (Smith, 1797) e seu zoneamento ecológico no Estado do Piauí. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 20., 2004, Gramado. Programa e resumos... Gramado: Sociedade Entomológica do Brasil, 2004. p. 251
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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15.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, J. F.; PÁDUA, L. E. M.; SILVA, P. R. R.; CARVALHO, E. M. S.; SILVA, P. H. S. da; ARAÚJO, F. S. Influência do extrato do fruto verde da mamona (Ricinus communis L.) sobre a biologia de Spodoptera frugiperda (SMITH, 1797) criada em dieta artificial. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE ECOLOGIA QUÍMICA, 5., 2007, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2007. p. 129 Organizado por: Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Lenita Jacob Oliveira, Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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16.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, J. F.; PÁDUA, L. E. M.; SILVA, P. R. R.; CARVALHO, P. R. S.; SILVA, P. H. S. da; ARAÚJO, F. S.; FERNANDES, T. S. Efeito do extrato aquoso de folhas e ramos de alecrim-pimenta (Lippia sidoides CHAM.) sobre a biologia de Spodoptera frugiperda (SMITH, 1797) criada em dieta artificial. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE ECOLOGIA QUÍMICA, 5., 2007, Londrina. Resumos...Londrina: Embrapa Soja, 2007. p. 128. Organizado por Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Lenita Jacob Oliveira, Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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17.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. H. S. da; OLIVEIRA, J. R. P.; PADUA, L. E. de M.; MARTINS, H. B.; RABELO, R. L.; ARAUJO, E. C. E. Insetos associados ao babacu Orbignya spp. no estado do Piaui. Teresina: EMBRAPA-UEPAE de Teresina, 1985. 3p. (EMBRAPA-UEPAE de Teresina. Pesquisa em Andamento, 40).
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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18.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, P. H. S. da; SOUSA, E. P. da S.; PÁDUA, L. E. de M.; BARRETO, A. L. H.; CASTRO, M. de J. P. de. Toxicidade do óleo essencial de Piper Tuberculatum JACQ. (Piperaceae) sobre ninfas de primeiro ínstar de Crinocerus Sanctus (FABR.) (Hemiptera, Coreidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia: Emparn, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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19.Imagem marcado/desmarcadoGIRÃO FILHO, J. E.; PÁDUA, L. E. M.; PORTELA, G. L. F.; SILVA, P. R. R.; SILVA, P. H. S. da. Zoneamento ecológico de Aphis craccivora (Koch) no estado do Piauí através das suas exigências térmicas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., Gramado. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Gramado: SEB, 2018. p. 1137.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoZANON, J.; PÁDUA, L. E. de M.; SILVA, P. R. R.; SILVA, P. H. S. da; SILVA FILHO, S. S. da; SANTIAGO, G. P.; ARAÚJO NETO, P. R. de. Avaliação de extratos de plantas sobre a biologia de Spodoptera frugiperda (J. F. Smith, 1797). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 12., 2004, Teresina. Resumos...Teresina: UFPI, 2004. p. 06
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