|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
30/06/2014 |
Data da última atualização: |
07/04/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SIQUEIRA, A. F.; ORMEÑO-ORRILLO, E.; SOUZA, R. C.; RODRIGUES, E. P.; ALMEIDA, L. G. P.; BARCELLOS, F. G.; BATISTA, J. S. S.; NAKATANI, A. S.; MARTÍNEZ-ROMERO, E.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M. |
Afiliação: |
ARTHUR FERNANDES SIQUEIRA, UEL; ERNESTO ORMEÑO-ORRILLO, Universidad Nacional Autónoma de México; RANGEL CELSO SOUZA, Laboratório Nacional de Computação Científica; ELISETE PAINS RODRIGUES, UEL; LUIZ GONZAGA PAULA ALMEIDA, Laboratório Nacional de Computação Científica; FERNANDO GOMES BARCELLOS, UEL; JESIANE STEFÂNIA SILVA BATISTA, UEPG; ANDRE SHIGUEYOSHI NAKATANI; ESPERANZA MARTÍNEZ-ROMERO, Universidad Nacional Autónoma de México; ANA TEREZA RIBEIRO VASCONCELOS, Laboratório Nacional de Computação Científica; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
Título: |
Comparative genomics of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15 and Bradyrhizobium diazoefficiens CPAC 7: elite model strains for understanding symbiotic performance with soybean. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 15, n. 420, June 2014. |
Páginas: |
20 p. |
ISSN: |
1471-2164 |
DOI: |
10.1186/1471-2164-15-420 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The soybean-Bradyrhizobium symbiosis can be highly efficient in fixing nitrogen, but few genomic sequences of elite inoculant strains are available. Here we contribute with information on the genomes of two commercial strains that are broadly applied to soybean crops in the tropics. B. japonicum CPAC 15 (=SEMIA 5079) is outstanding in its saprophytic capacity and competitiveness, whereas B. diazoefficiens CPAC 7 (=SEMIA 5080) is known for its high efficiency in fixing nitrogen. Both are well adapted to tropical soils. The genomes of CPAC 15 and CPAC 7 were compared to each other and also to those of B. japonicum USDA 6T and B. diazoefficiens USDA 110T. Differences in genome size were found between species, with B. japonicum having larger genomes than B. diazoefficiens. Although most of the four genomes were syntenic, genome rearrangements within and between species were observed, including events in the symbiosis island. In addition to the symbiotic region, several genomic islands were identified. Altogether, these features must confer high genomic plasticity that might explain adaptation and differences in symbiotic performance. It was not possible to attribute known functions to half of the predicted genes. About 10% of the genomes was composed of exclusive genes of each strain, but up to 98% of them were of unknown function or coded for mobile genetic elements. In CPAC 15, more genes were associated with secondary metabolites, nutrient transport, iron-acquisition and IAA metabolism, potentially correlated with higher saprophytic capacity and competitiveness than seen with CPAC 7. In CPAC 7, more genes were related to the metabolism of amino acids and hydrogen uptake, potentially correlated with higher efficiency of nitrogen fixation than seen with CPAC 15. Several differences and similarities detected between the two elite soybean-inoculant strains and between the two species of Bradyrhizobium provide new insights into adaptation to tropical soils, efficiency of N2 fixation, nodulation and competitiveness. MenosThe soybean-Bradyrhizobium symbiosis can be highly efficient in fixing nitrogen, but few genomic sequences of elite inoculant strains are available. Here we contribute with information on the genomes of two commercial strains that are broadly applied to soybean crops in the tropics. B. japonicum CPAC 15 (=SEMIA 5079) is outstanding in its saprophytic capacity and competitiveness, whereas B. diazoefficiens CPAC 7 (=SEMIA 5080) is known for its high efficiency in fixing nitrogen. Both are well adapted to tropical soils. The genomes of CPAC 15 and CPAC 7 were compared to each other and also to those of B. japonicum USDA 6T and B. diazoefficiens USDA 110T. Differences in genome size were found between species, with B. japonicum having larger genomes than B. diazoefficiens. Although most of the four genomes were syntenic, genome rearrangements within and between species were observed, including events in the symbiosis island. In addition to the symbiotic region, several genomic islands were identified. Altogether, these features must confer high genomic plasticity that might explain adaptation and differences in symbiotic performance. It was not possible to attribute known functions to half of the predicted genes. About 10% of the genomes was composed of exclusive genes of each strain, but up to 98% of them were of unknown function or coded for mobile genetic elements. In CPAC 15, more genes were associated with secondary metabolites, nutrient transport, iron-acquisition and IAA ... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Soja. |
Thesaurus Nal: |
Soybeans. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/104186/1/Comparative-genomics-of-Bradyrhizobium-japonicum-CPAC-15-and-Bradyrhizobium-diazoefficiens-CPAC-7-elite-model-strains-for-understanding-symbiotic-performance-with-soybean.pdf
|
Marc: |
LEADER 02978naa a2200301 a 4500 001 1989259 005 2022-04-07 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1471-2164 024 7 $a10.1186/1471-2164-15-420$2DOI 100 1 $aSIQUEIRA, A. F. 245 $aComparative genomics of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15 and Bradyrhizobium diazoefficiens CPAC 7$belite model strains for understanding symbiotic performance with soybean.$h[electronic resource] 260 $c2014 300 $a20 p. 520 $aThe soybean-Bradyrhizobium symbiosis can be highly efficient in fixing nitrogen, but few genomic sequences of elite inoculant strains are available. Here we contribute with information on the genomes of two commercial strains that are broadly applied to soybean crops in the tropics. B. japonicum CPAC 15 (=SEMIA 5079) is outstanding in its saprophytic capacity and competitiveness, whereas B. diazoefficiens CPAC 7 (=SEMIA 5080) is known for its high efficiency in fixing nitrogen. Both are well adapted to tropical soils. The genomes of CPAC 15 and CPAC 7 were compared to each other and also to those of B. japonicum USDA 6T and B. diazoefficiens USDA 110T. Differences in genome size were found between species, with B. japonicum having larger genomes than B. diazoefficiens. Although most of the four genomes were syntenic, genome rearrangements within and between species were observed, including events in the symbiosis island. In addition to the symbiotic region, several genomic islands were identified. Altogether, these features must confer high genomic plasticity that might explain adaptation and differences in symbiotic performance. It was not possible to attribute known functions to half of the predicted genes. About 10% of the genomes was composed of exclusive genes of each strain, but up to 98% of them were of unknown function or coded for mobile genetic elements. In CPAC 15, more genes were associated with secondary metabolites, nutrient transport, iron-acquisition and IAA metabolism, potentially correlated with higher saprophytic capacity and competitiveness than seen with CPAC 7. In CPAC 7, more genes were related to the metabolism of amino acids and hydrogen uptake, potentially correlated with higher efficiency of nitrogen fixation than seen with CPAC 15. Several differences and similarities detected between the two elite soybean-inoculant strains and between the two species of Bradyrhizobium provide new insights into adaptation to tropical soils, efficiency of N2 fixation, nodulation and competitiveness. 650 $aSoybeans 650 $aSoja 700 1 $aORMEÑO-ORRILLO, E. 700 1 $aSOUZA, R. C. 700 1 $aRODRIGUES, E. P. 700 1 $aALMEIDA, L. G. P. 700 1 $aBARCELLOS, F. G. 700 1 $aBATISTA, J. S. S. 700 1 $aNAKATANI, A. S. 700 1 $aMARTÍNEZ-ROMERO, E. 700 1 $aVASCONCELOS, A. T. R. 700 1 $aHUNGRIA, M. 773 $tBMC Genomics$gv. 15, n. 420, June 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Instrumentação; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. |
Data corrente: |
03/04/2018 |
Data da última atualização: |
13/11/2018 |
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Autoria: |
RIBEIRO, P. E. de A.; SILVA, M. S. L. da; COELHO, E. F.; BARROS, L. C. de; SIMOES, W. L.; MARMO, C. R.; GUILHERME, L. C.; CORREA, R. de O.; OTENIO, M. H.; TAVARES-DIAS, M.; PAULA, V. R. de; BERNARDES FILHO, R. |
Afiliação: |
PAULO EDUARDO DE AQUINO RIBEIRO, CNPMS; MARIA SONIA LOPES DA SILVA, CNPS; EUGENIO FERREIRA COELHO, CNPMF; LUCIANO CORDOVAL DE BARROS, CNPMS; WELSON LIMA SIMOES, CPATSA; CARLOS RENATO MARMO, CNPDIA; LUIZ CARLOS GUILHERME, CPAMN; ROSELANY DE OLIVEIRA CORREA, CPATU; MARCELO HENRIQUE OTENIO, CNPGL; MARCOS TAVARES DIAS, CPAF-AP; VANESSA ROMARIO DE PAULA, CNPGL; RUBENS BERNARDES FILHO, CNPDIA. |
Título: |
Gestão da água e saneamento em comunidades rurais. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
In: SILVA, M. S. L. da; MATTHIENSEN, A.; BRITO, L. T. de L.; LIMA, J. E. F. W.; CARVALHO, C. J. R. de (Ed.). Água e saneamento: contribuições da Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2018. |
Páginas: |
cap. 8, p. 125-147. |
Série: |
(Objetivos de Desenvolvimento Sustentável, 6). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Nos últimos anos, no Brasil, a gestão local e comunitária das águas e do saneamento vem se fortalecendo como uma alternativa viável, que tem contribuído com a melhoria da qualidade de vida e o desenvolvimento rural sustentável. Entretanto, ainda existem alguns grandes desafios a serem superados, no que diz respeito ao acesso regular e permanente a qualquer fonte de água e saneamento no meio rural. A Embrapa, ao longo de mais de 40 anos, vem desenvolvendo soluções tecnológicas que viabilizam o uso da água para o abastecimento humano, animal e agrícola, bem como o acesso a serviços adequados de saneamento básico para a propriedade rural, proporcionando às comunidades locais condições para o planejamento agrícola do uso dos recursos solo e água. O presente capítulo descreve práticas agropecuárias, produtos, processos, metodologias e serviços (treinamentos e consultorias) que poderão contribuir com a meta 6.b do Objetivo de Desenvolvimento Sustentável 6 (ODS 6), a qual preconiza apoiar e fortalecer a gestão da água e do saneamento na comunidade rural. |
Palavras-Chave: |
Lona plástica; Pecuária leiteira; Produção de peixes; Reúso de água; Sanitation management; Sistema de irrigação por bacias; Sistema de irrigação superficial; Uso e manejo da água. |
Thesagro: |
Agricultura familiar; Água; Comunidade rural; Irrigação; Manejo de água; Plasticultura; Saneamento rural. |
Thesaurus NAL: |
Irrigation; Rural communities; Rural development; Water; Water resources. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/183587/1/Gestao-agua.pdf
|
Marc: |
LEADER 02713naa a2200517 a 4500 001 2090192 005 2018-11-13 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aRIBEIRO, P. E. de A. 245 $aGestão da água e saneamento em comunidades rurais.$h[electronic resource] 260 $c2018 300 $acap. 8, p. 125-147. 490 $a(Objetivos de Desenvolvimento Sustentável, 6). 520 $aNos últimos anos, no Brasil, a gestão local e comunitária das águas e do saneamento vem se fortalecendo como uma alternativa viável, que tem contribuído com a melhoria da qualidade de vida e o desenvolvimento rural sustentável. Entretanto, ainda existem alguns grandes desafios a serem superados, no que diz respeito ao acesso regular e permanente a qualquer fonte de água e saneamento no meio rural. A Embrapa, ao longo de mais de 40 anos, vem desenvolvendo soluções tecnológicas que viabilizam o uso da água para o abastecimento humano, animal e agrícola, bem como o acesso a serviços adequados de saneamento básico para a propriedade rural, proporcionando às comunidades locais condições para o planejamento agrícola do uso dos recursos solo e água. O presente capítulo descreve práticas agropecuárias, produtos, processos, metodologias e serviços (treinamentos e consultorias) que poderão contribuir com a meta 6.b do Objetivo de Desenvolvimento Sustentável 6 (ODS 6), a qual preconiza apoiar e fortalecer a gestão da água e do saneamento na comunidade rural. 650 $aIrrigation 650 $aRural communities 650 $aRural development 650 $aWater 650 $aWater resources 650 $aAgricultura familiar 650 $aÁgua 650 $aComunidade rural 650 $aIrrigação 650 $aManejo de água 650 $aPlasticultura 650 $aSaneamento rural 653 $aLona plástica 653 $aPecuária leiteira 653 $aProdução de peixes 653 $aReúso de água 653 $aSanitation management 653 $aSistema de irrigação por bacias 653 $aSistema de irrigação superficial 653 $aUso e manejo da água 700 1 $aSILVA, M. S. L. da 700 1 $aCOELHO, E. F. 700 1 $aBARROS, L. C. de 700 1 $aSIMOES, W. L. 700 1 $aMARMO, C. R. 700 1 $aGUILHERME, L. C. 700 1 $aCORREA, R. de O. 700 1 $aOTENIO, M. H. 700 1 $aTAVARES-DIAS, M. 700 1 $aPAULA, V. R. de 700 1 $aBERNARDES FILHO, R. 773 $tIn: SILVA, M. S. L. da; MATTHIENSEN, A.; BRITO, L. T. de L.; LIMA, J. E. F. W.; CARVALHO, C. J. R. de (Ed.). Água e saneamento: contribuições da Embrapa. Brasília, DF: Embrapa, 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|