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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
03/11/2022 |
Data da última atualização: |
12/12/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
Afiliação: |
CATERYNNE MELO KAUFFMANN, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; JOÃO MARCOS FAGUNDES SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ROSANA BLAWID, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
Título: |
Complete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed. |
Palavras-Chave: |
Patchouli. |
Thesagro: |
Genoma; Vírus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01523naa a2200217 a 4500 001 2147984 005 2022-12-12 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5$2DOI 100 1 $aKAUFFMANN, C. M. 245 $aComplete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aA cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed. 650 $aGenoma 650 $aVírus 653 $aPatchouli 700 1 $aBOARI, A. de J. 700 1 $aSILVA, J. M. F. 700 1 $aBLAWID, R. 700 1 $aNAGATA, T. 773 $tArchives of Virology$gv. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Origem |
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Status |
URL |
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Registros recuperados : 5 | |
1. |  | FUKAMI, J.; NOGUEIRA, M. A.; MEGÍAS, M.; OLLERO MÁRQUEZ, F. J.; HUNGRIA, M. Atividade de enzimas antioxidantes em milho (Zea mays) submetidas à inoculação com azospirillum brasilense. In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 190. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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2. |  | ABRANTES, J. L. F.; FUKAMI, J.; MÉGIAS, M.; OLLERO MÁRQUEZ, F. J.; HUNGRIA, M. Blockade of N-acyl homoserine lactones-based quorum sensing impairs soybean-bradyrhizobium and maize-azospirillum symbiosis. In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 176. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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3. |  | MEGÍAS SAAVEDRA, M. E.; REIS JUNIOR, F. B. dos; MOYANO, I.; HUNGRIA, M.; OLLERO MÁRQUEZ, F. J.; MEGÍAS, M. Aplicaciones agronómicas de una nueva especie del género pantoea aislada de plantas de arroz. In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 226. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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4. |  | GOMES, D. F.; NAKATANI, A. S.; DEL-CERRO, P.; OLLERO MÁRQUEZ, F. J.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M. Probable roles of the HsnT, nodF and nodE genes in rhizobium tropici ciat 899 nodulation factor biosynthesis and decoration. In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 183. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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5. |  | DEL-CERRO, P.; PÉREZ-MONTAÑO, F.; JIMÉNEZ-GUERRERO, I.; LÓPEZ BAENA, F. J.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M.; OLLERO MÁRQUEZ, F. J. RNA-SEQ analysis of rhizobium tropici ciat 899 genome in the presence of apigenin and salt. In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 184. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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Registros recuperados : 5 | |
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