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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
09/01/2024 |
Data da última atualização: |
09/01/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MALUF, M. P.; SILVESTRINI, M.; RUGGIERO, L. M. de C.; GUERREIRO FILHO, O.; COLOMBO, C. A. |
Afiliação: |
MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa; MILENE SILVESTRINI, INSTITUTO AGRONÔMICO; LUCIANA MACHADO DE CAMPOS RUGGIERO, INSTITUTO AGRONÔMICO; OLIVEIRO GUERREIRO FILHO, INSTITUTO AGRONÔMICO; CARLOS AUGUSTO COLOMBO, INSTITUTO AGRONÔMICO. |
Título: |
Genetic diversity of cultivated Coffea arabica inbred lines assessed by RAPD, AFLP and SSR marker systems. |
Ano de publicação: |
2005 |
Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, v. 62, n. 4, p. 366-373, 2005. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Título em português: Caracterização da diversidade genética de linhagens comerciais de Coffea arabica através de marcadores moleculares do tipo RAPD, AFLP e SSR. |
Conteúdo: |
ABSTRACT: One of the greatest problems in Coffea arabica breeding is identifying precisely any inbred line, based only on botanical and agronomical descriptors, because of the reduced genetic variability of the species, close pedigree origin, which results in small phenotypic variation. Recently, molecular markers have been used for plant germplasm characterization and identification in several commercial species. This work evaluates the reliability of three marker systems: RAPD, AFLP and SSR, to characterize the genetic variability of commercially-used Coffea inbred lines developed by the Instituto Agronômico (IAC), and their potential for cultivar identification. All methods identified polymorphisms among the cultivars. The genetic diversity recognized by the methods is very similar, although is very narrow. RAPD and SSR marker systems grouped more efficiently the evaluated cultivars according to parental origin. None of the methods allowed inbred line identification. Therefore for varietal protection, it would be necessary using a combination of botanical, agronomical and molecular markers descriptors for precise cultivar identification. RESUMO: A identificação de linhagens de Coffea arabica a partir de descritores botânicos e agronômicos é um problema para o desenvolvimento de cultivares. Basicamente, a limitada variação fenotípica observada em cultivares é o resultado de uma estreita variabilidade genética em C. arabica associada com uma origem genealógica próxima. Recentemente, os uso de marcadores moleculares tem contribuído para a caracterização e identificação de várias espécies de interesse comercial. O objetivo deste trabalho foi comparar a confiabilidade de três tipos de marcadores moleculares, RAPD, AFLP e SSR, para a caracterização da variabilidade genética e uma possível identificação de linhagens comerciais de Coffea desenvolvidas pelo IAC. Os métodos avaliados permitiram identificar polimorfismos entre cultivares. A variabilidade genética detectada por eles é muito semelhante, ainda que reduzida. Marcadores do tipo RAPD e SSR foram mais eficientes em análises de parentesco, e o agrupamento das linhagens correspondeu à sua origem genealógica. No entanto, nenhum dos métodos testados permitiu a identificação individual de linhagens. Neste caso, a utilização conjunta de descritores botânicos, agronômicos e marcadores moleculares é recomendada para a identificação precisa de linhagens, visando processos de proteção legal de cultivares de Coffea. MenosABSTRACT: One of the greatest problems in Coffea arabica breeding is identifying precisely any inbred line, based only on botanical and agronomical descriptors, because of the reduced genetic variability of the species, close pedigree origin, which results in small phenotypic variation. Recently, molecular markers have been used for plant germplasm characterization and identification in several commercial species. This work evaluates the reliability of three marker systems: RAPD, AFLP and SSR, to characterize the genetic variability of commercially-used Coffea inbred lines developed by the Instituto Agronômico (IAC), and their potential for cultivar identification. All methods identified polymorphisms among the cultivars. The genetic diversity recognized by the methods is very similar, although is very narrow. RAPD and SSR marker systems grouped more efficiently the evaluated cultivars according to parental origin. None of the methods allowed inbred line identification. Therefore for varietal protection, it would be necessary using a combination of botanical, agronomical and molecular markers descriptors for precise cultivar identification. RESUMO: A identificação de linhagens de Coffea arabica a partir de descritores botânicos e agronômicos é um problema para o desenvolvimento de cultivares. Basicamente, a limitada variação fenotípica observada em cultivares é o resultado de uma estreita variabilidade genética em C. arabica associada com uma origem genealógica próxima. Rece... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Coffea Arábica; Identificação; Marcador Molecular; Variedade. |
Thesaurus Nal: |
Cultivar identification. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1160620/1/Genetic-diversity.pdf
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Marc: |
LEADER 03433naa a2200241 a 4500 001 2160620 005 2024-01-09 008 2005 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMALUF, M. P. 245 $aGenetic diversity of cultivated Coffea arabica inbred lines assessed by RAPD, AFLP and SSR marker systems.$h[electronic resource] 260 $c2005 500 $aTítulo em português: Caracterização da diversidade genética de linhagens comerciais de Coffea arabica através de marcadores moleculares do tipo RAPD, AFLP e SSR. 520 $aABSTRACT: One of the greatest problems in Coffea arabica breeding is identifying precisely any inbred line, based only on botanical and agronomical descriptors, because of the reduced genetic variability of the species, close pedigree origin, which results in small phenotypic variation. Recently, molecular markers have been used for plant germplasm characterization and identification in several commercial species. This work evaluates the reliability of three marker systems: RAPD, AFLP and SSR, to characterize the genetic variability of commercially-used Coffea inbred lines developed by the Instituto Agronômico (IAC), and their potential for cultivar identification. All methods identified polymorphisms among the cultivars. The genetic diversity recognized by the methods is very similar, although is very narrow. RAPD and SSR marker systems grouped more efficiently the evaluated cultivars according to parental origin. None of the methods allowed inbred line identification. Therefore for varietal protection, it would be necessary using a combination of botanical, agronomical and molecular markers descriptors for precise cultivar identification. RESUMO: A identificação de linhagens de Coffea arabica a partir de descritores botânicos e agronômicos é um problema para o desenvolvimento de cultivares. Basicamente, a limitada variação fenotípica observada em cultivares é o resultado de uma estreita variabilidade genética em C. arabica associada com uma origem genealógica próxima. Recentemente, os uso de marcadores moleculares tem contribuído para a caracterização e identificação de várias espécies de interesse comercial. O objetivo deste trabalho foi comparar a confiabilidade de três tipos de marcadores moleculares, RAPD, AFLP e SSR, para a caracterização da variabilidade genética e uma possível identificação de linhagens comerciais de Coffea desenvolvidas pelo IAC. Os métodos avaliados permitiram identificar polimorfismos entre cultivares. A variabilidade genética detectada por eles é muito semelhante, ainda que reduzida. Marcadores do tipo RAPD e SSR foram mais eficientes em análises de parentesco, e o agrupamento das linhagens correspondeu à sua origem genealógica. No entanto, nenhum dos métodos testados permitiu a identificação individual de linhagens. Neste caso, a utilização conjunta de descritores botânicos, agronômicos e marcadores moleculares é recomendada para a identificação precisa de linhagens, visando processos de proteção legal de cultivares de Coffea. 650 $aCultivar identification 650 $aCoffea Arábica 650 $aIdentificação 650 $aMarcador Molecular 650 $aVariedade 700 1 $aSILVESTRINI, M. 700 1 $aRUGGIERO, L. M. de C. 700 1 $aGUERREIRO FILHO, O. 700 1 $aCOLOMBO, C. A. 773 $tScientia Agricola$gv. 62, n. 4, p. 366-373, 2005.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
21/06/1999 |
Data da última atualização: |
27/06/2019 |
Autoria: |
OLIVEIRA JUNIOR, A.; MIRANDA, G. V.; CRUZ, C. D. |
Afiliação: |
ANTONIO OLIVEIRA JÚNIOR, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitotecnia; GLAUCO VIEIRA MIRANDA, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitotecnia; COSME DAMIÃO CRUZ, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Biologia Geral. |
Título: |
Predição de populações F3 a partir de dialelos desbalanceados. |
Ano de publicação: |
1999 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 34, n. 5, p. 781-87, maio 1999 |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Título em inglês: Prediction of F3 populations based on unbalanced diallel crossing systems. |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi predizer as propriedades de populacoes segregantes F3 (combinacoes hidridas) a partir de estudos dialelicos na geracao F1. Para isso, foram avaliados oito combinacoes hibridas, obtidas de cruzamentos compativeis entre sete progenitores (Diacol Andino, Ica Lhanogrande, Ica Tundama, Rojo 70, Rio Tibagi, Carioca e Roxo), por meio dos esquemas de analises de cruzamentos dialelicos desbalanceados circulante e de meia-tabela. As combinacoes hibridas F1 e os progenitores foram conduzidos no delineamento inteiramente casualizado, com numero de repeticoes por tratamento variavel, e em casa de vegetacao. A geracao F3 foi conduzida em dois locais, em condicoes de campo, em delineamento de blocos completos casualizados. Foram avaliados os caracteres numero de vagens por planta (NVP) e peso de sementes por planta (PSP). A predicao por meio dos efeitos da capacidade geral de combinacao (CGC) na F1 foi mais eficiente que a predicao a partir do desempenho observado no F1 com relacao a media dos dois caracteres agronomicos das populacoes segregantes F3 (combinacoes hibridas). Foram constatadas correlacoes negativas entre as geracoes observadas e preditas, quando se utilizaram as informacoes do dialelo circulante desbalanceado. |
Palavras-Chave: |
Capacidade geral de combinacao; Dry bean; Feijao comum; General combing ability; Hibridos. |
Thesaurus NAL: |
hybrids. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/AI-SEDE/11854/1/PAB97082.pdf
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Marc: |
LEADER 01998naa a2200229 a 4500 001 1095969 005 2019-06-27 008 1999 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aOLIVEIRA JUNIOR, A. 245 $aPredição de populações F3 a partir de dialelos desbalanceados. 260 $c1999 500 $aTítulo em inglês: Prediction of F3 populations based on unbalanced diallel crossing systems. 520 $aO objetivo deste trabalho foi predizer as propriedades de populacoes segregantes F3 (combinacoes hidridas) a partir de estudos dialelicos na geracao F1. Para isso, foram avaliados oito combinacoes hibridas, obtidas de cruzamentos compativeis entre sete progenitores (Diacol Andino, Ica Lhanogrande, Ica Tundama, Rojo 70, Rio Tibagi, Carioca e Roxo), por meio dos esquemas de analises de cruzamentos dialelicos desbalanceados circulante e de meia-tabela. As combinacoes hibridas F1 e os progenitores foram conduzidos no delineamento inteiramente casualizado, com numero de repeticoes por tratamento variavel, e em casa de vegetacao. A geracao F3 foi conduzida em dois locais, em condicoes de campo, em delineamento de blocos completos casualizados. Foram avaliados os caracteres numero de vagens por planta (NVP) e peso de sementes por planta (PSP). A predicao por meio dos efeitos da capacidade geral de combinacao (CGC) na F1 foi mais eficiente que a predicao a partir do desempenho observado no F1 com relacao a media dos dois caracteres agronomicos das populacoes segregantes F3 (combinacoes hibridas). Foram constatadas correlacoes negativas entre as geracoes observadas e preditas, quando se utilizaram as informacoes do dialelo circulante desbalanceado. 650 $ahybrids 653 $aCapacidade geral de combinacao 653 $aDry bean 653 $aFeijao comum 653 $aGeneral combing ability 653 $aHibridos 700 1 $aMIRANDA, G. V. 700 1 $aCRUZ, C. D. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 34, n. 5, p. 781-87, maio 1999
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