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| Registros recuperados : 365 | |
| 341. |  | LIMA, G. F. da C.; AGUIAR, E. M. de; RÊGO, M. M. T.; CASTRO, O. P. da C. M. de; LOBO, R. N. B.; RANGEL, A. H. do N. Características fermentativas da silagem de Sorgo com níveis crescentes de girassol. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringa: SBZ: UEM, 2009. 3 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 342. | | SOUSA, J. E. R. de; OLIVEIRA, S. M. P. de; LOBO, R. N. B.; LIMA, F. de A. M.; FERREIRA, I. C.; CORRÊA, G. da S. S.; FRIDRICH, A. B. Parâmetros genéticos e fenotípicos de características ponderais em ovinos da raça Santa Inês. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 4 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 343. | | SILVÉRIO, V. C.; PAIVA, S. R.; FARIA, D. A. de; MCMANUS, C.; DERGAM, J. A.; OLIVEIRA, A. A.; LOBO, R. N. B.; SOUSA, W. H. de; MARIANTE, A. S.; EGITO, A. A.; ALBUQUERQUE, M. S. M. Phylogenetic study on the main brazilian naturalized sheep breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 8., 2006, Belo Horizonte, MG. Proceedings... Belo Horizonte: Instituto Prociência, 2006. 4 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 344. | | BRITO, R. L. L. de; INÁCIO, S. V.; OLIVEIRA, D. A. dos S.; SOUSA, M. M. de; MEIRELES, M. V.; LOBO, R. N. B.; VIEIRA, L. da S.; BRESCIANI, K. D. S. Ocorrência da infecção por Cryptosporidium spp. em cabritos (Capra hircus). Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 34, n. 8, p. 728-732, ago. 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 345. | | ELOY, A. M. X.; ANDRADE, M. L. R. de; PINHEIRO, R. R.; SILVA, N. M. M. da; BRITO, R. L. L.; SANTIAGO, L. B.; LOBO, R. N. B.; FURTADO, J. R. Estudo da dinâmica da absorção protéica do colostro em crias Moxotó e Saanen no Ceará. Revista Brasileira de Medicina Veterinária, Rio de Janeiro, v. 35, n. 4, p. 351-357, out./dez. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 346. | | OLIVEIRA, S. Z. R. de; LOPES, E. A.; BOMFIM, M. A. D.; CAVALCANTE, A. C. R.; LOBO, R. N. B.; PEREIRA, L. P. da S.; GOMES, G. M. F. Efeito da quebra de dormência e utilização de inoculante sobre a taxa de emergência e desenvolvimento de mudas de leucena (Leucaena leucocephala (LAM.) de WIT). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 43., 2006, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBZ; UFPB, 2006. 4 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 347. | | LOBO, A. M. B. O.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; FONSECA, J. F. da; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; CAETANO, A. R.; FERRAZ, J. B. S.; BIAZIO, G. R. de. Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros Capragene®, 1º sumário de avaliação genética genômica, 2º sumário de avaliação genética, raça Saanen - Ano 2017. 2. ed. rev. ampl. Brasília, DF: Embrapa, 2017. 51 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 348. | | LOBO, A. M. B. O.; LOBO, R. N. B.; FACO, O.; FONSECA, J. F. da; PAIVA, S. R.; SILVA, M. V. G. B.; CAETANO, A. R.; FERRAZ, J. B. S.; BIAZIO, G. R. de. Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros Capragene®, 2º sumário de avaliação genética, 1º sumário de avaliação genética genômica raça Saanen - Ano 2017. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2017. 39 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 349. | | FACO, O.; SILVA, M. V. G. B.; PANETTO, J. C. do C.; OTTO, P. I.; LOBO, A. M. B. O.; FONSECA, J. F. da; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. Programa de Melhoramento Genético de Caprinos Leiteiros - Capragene, 3º Sumário de Avaliação Genética, 2º Sumário de Avaliação Genética Genômica, Ano 2020 - Raça Saanen. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2020. 52 p.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 350. | | POMPEU, R. C. F. F.; UCHÔA, F. C.; NEIVA, J. N. M.; OLIVEIRA FILHO, G. S.; PAULA NETO, F. L.; SILVA, E. S; LOBO, R. N. B.; BOTREL, M. A. Produção de matéria seca e qualidade de quatorze cultivares de alfafa (Medicago sativa L.) sob irrigação no Estado do Ceará. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 34, n. 2, p. 153-160, 2003.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 351. | | FONSECA, J. F. da; LOBO, R. N. B.; ALVES, J. U.; BOMFIM, M. A. D.; PINHEIRO, R. R.; ALVES, F. S. F.; VIEIRA, L. da S.; SILVA, M. R. Produção de caprinos leiteiros. In: MARTINS, C. E.; COSER, A. C.; LEMOS, A. de M.; SOUZA, A. D. de; FRANCO, P. R. V. (Ed.). Aspectos técnicos, econômicos, sociais e ambientais da atividade leiteira. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2005. Cap.4, p. 27-45.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 352. | | SARMENTO, J. L. R.; TORRES, R. de A.; SOUSA, J. E. R. de; SOUSA, W. H. de; LOBO, R. N. B.; DO Ó, A. O.; REGO NETO, A. A.; CARVALHO, G. B. de; SANTOS, G. V. dos. Comparação de modelos regressão aleatória para descrição das herdabilidades associadas à curva de crescimento de ovinos Santa Inês. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: SBMA: Embrapa Pecuária Sudeste, 2008. 4 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 353. | | FACO, O.; LOBO, R. N. B.; GUIMARÃES, M. P. S. L. M. P.; GUIMARÃES, M. P. S. L. M. P.; FONSECA, J. F. da; SANTOS, T. N. M.; SILVA, M. A. A.; VILLELA, L. C. V. Dairy goat breeding program: a brazilian experience. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON GOATS, 10., 2010, Recife. Technological development and associative attempts to a sustainable small livestock production: annals. Little Rock: IGA, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 354. | | LOBO, A. M. B. O.; FACO, O.; LÔBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; VILLELA, L. C. V.; FERNANDES JÚNIOR, G. A.; SANTOS, T. N. M. dos. Desempenho na fase de cria de ovinos puros e F1's das raças Morada Nova e Somalis Brasileira. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE CAPRINOS E OVINOS DE CORTE, 4.; FEIRA NACIONAL DO AGRONEGÓCIO DA CAPRINO-OVINOCULTURA DE CORTE, 3., 2009, João Pessoa. Anais... João Pessoa: EMEPA-PB, 2009. 5 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 355. | | AZEVÊDO, D. M. M. R.; MARTINS FILHO, R.; LOBO, R. N. B.; MALHADO, C. H. M.; LOBO, R. B.; MOURA, A. de A. A. N.; PIMENTA FILHO, E. C. Desempenho reprodutivo de vacas Nelore no Norte e Nordeste do Brasil. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 35, n. 3 supl., p. 988-996, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 356. | | PAIVA, S. R.; DIAS, C.; FARIA, D. A.; MCMANUS, C.; OLIVEIRA, A. A.; LÔBO, R. N. B.; SOUZA, W. H. de; DERGAM, J. A.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; EGITO, A. A. do; CASTRO, S. R.; MARIANTE, A. S. Y-chromosome variability of brazilian sheep breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 8., 2006, Belo Horizonte, MG. Proceedings... Belo Horizonte: Instituto Prociência, 2006. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 357. | | PAIVA, S. R.; DIAS, C.; FARIA, D. A.; MCMANUS, C.; OLIVEIRA, A. A.; LOBO, R. N. B.; SOUZA, W. H. de; DERGAM, J. A.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; EGITO, A. A. do; CASTRO, S. R.; MARIANTE, A. S. Y-chromosome variability of brazilian sheep breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 8., 2006, Belo Horizonte. Proceedings... Belo Horizonte: Instituto Prociência, 2006. 2 f. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 358. | | PAIVA, S. R.; PAIVA, D. A. de F.; SILVÉRIO, V. C.; McMANUS, C.; OLIVEIRA, A. A.; DERGAM, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA, M. S.; EGITO, A. A. do; AZEVEDO, H. C. A.; LOBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; CASTRO, S. R.; MARIANTE, A. da S. Aplicação de marcadores moleculares na conservação e melhoramento de um rebanho da raça Santa Inês. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005. 4 f. CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 359. | | BIAZIO, G. R. de; MCMANUS, C. M.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A. de; SILVA, N. C. da; DALLAGO, B. S. L.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; ARAUJO, A. M.; AZEVEDO, H. C.; CARNEIRO, P. L. S.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R. Integração de dados de georeferenciamento e dados genéticos para o manejo da biodiversidade de recursos genéticos de ovinos no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 360. | | BIAZIO, G. R. de; MCMANUS, C. M.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A.; SILVA, N. C. DA.; DALLAGO, B. S. L.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; ARAUJO, A. M. de; AZEVEDO, H. C.; CARNEIRO, P. L. S.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; LOBO, R. N. B.; PAIVA, S. R. Integração de dados de georeferenciamento e dados genéticos para o manejo da biodiversidade de recursos genéticos de ovinos no Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM. 4 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| Registros recuperados : 365 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
20/12/2018 |
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Data da última atualização: |
19/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; REECY, J. M.; POLETI, M. D.; OLIVEIRA, P. S. N. de; OLIVEIRA, G. B. de; MOREIRA, G. C. M.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. L.; KOLTES, J. E.; Fritz-Waters, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; BEIKI, H.; GEISTLINGER, L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
ALINE S. M. CESAR, USP, Iowa State University; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; JAMES M. REECY, Iowa State University; MIRELE D. POLETI, USP; Priscila Silva Neubern de Oliveira, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; GABRIELLA B. DE OLIVEIRA, USP; GABRIEL C. M. MOREIRA, USP; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; POLYANA C. TIZIOTO, USP; JAMES EUGENE KOLTES, Iowa State University; Elyn Fritz-Waters, Iowa State University; LUKE KRAMER, Iowa State University; DORIAN GARRICK, Massey University; HAMID BEIKI, Iowa State University; LUDWIG GEISTLINGER, Bolsista/Embrapa Pecuária Sudeste; GERSON B. MOURÃO, USP; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; Luiz Lehmann Coutinho, USP. |
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Título: |
Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 19, p. 1-20, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1186/s12864-018-4871-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article number: 499. Na publicação: Luciana C. A. Regitano, Maurício A. Mudadu, Adhemar Zerlotini. |
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Conteúdo: |
Background: Integration of high throughput DNA genotyping and RNA-sequencing data allows for the identification of genomic regions that control gene expression, known as expression quantitative trait loci (eQTL), on a whole genome scale. Intramuscular fat (IMF) content and carcass composition play important roles in metabolic and physiological processes in mammals because they influence insulin sensitivity and consequently prevalence of metabolic diseases such as obesity and type 2 diabetes. However, limited information is available on the genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. Thus, our hypothesis was that eQTL analyses could identify putative regulatory regions and transcription factors (TFs) associated with intramuscular fat (IMF) content traits. Results: We performed an integrative eQTL study in skeletal muscle to identify putative regulatory regions and factors associated with intramuscular fat content traits. Data obtained from skeletal muscle samples of 192 animals was used for association analysis between 461,466 SNPs and the transcription level of 11,808 genes. This yielded 1268 cis- and 10,334 trans-eQTLs, among which we identified nine hotspot regions that each affected the expression of > 119 genes. These putative regulatory regions overlapped with previously identified QTLs for IMF content. Three of the hotspots respectively harbored the transcription factors USF1, EGR4 and RUNX1T1, which are known to play important roles in lipid metabolism. From co-expression network analysis, we further identified modules significantly correlated with IMF content and associated with relevant processes such as fatty acid metabolism, carbohydrate metabolism and lipid metabolism. Conclusion: This study provides novel insights into the link between genotype and IMF content as evident from the expression level. It thereby identifies genomic regions of particular importance and associated regulatory factors. These new findings provide new knowledge about the biological processes associated with genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. MenosBackground: Integration of high throughput DNA genotyping and RNA-sequencing data allows for the identification of genomic regions that control gene expression, known as expression quantitative trait loci (eQTL), on a whole genome scale. Intramuscular fat (IMF) content and carcass composition play important roles in metabolic and physiological processes in mammals because they influence insulin sensitivity and consequently prevalence of metabolic diseases such as obesity and type 2 diabetes. However, limited information is available on the genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. Thus, our hypothesis was that eQTL analyses could identify putative regulatory regions and transcription factors (TFs) associated with intramuscular fat (IMF) content traits. Results: We performed an integrative eQTL study in skeletal muscle to identify putative regulatory regions and factors associated with intramuscular fat content traits. Data obtained from skeletal muscle samples of 192 animals was used for association analysis between 461,466 SNPs and the transcription level of 11,808 genes. This yielded 1268 cis- and 10,334 trans-eQTLs, among which we identified nine hotspot regions that each affected the expression of > 119 genes. These putative regulatory regions overlapped with previously identified QTLs for IMF content. Three of the hotspots respectively harbored the transcription factors USF1, EGR4 and RUNX1T1, which are known to play important roles in l... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Ácidos graxos; Doenças metabólicas; EQTL; Expressão gênica; Expression quantitative trait loci. |
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Thesaurus NAL: |
Fatty acids; Gene expression; Mammals; Metabolic diseases. |
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Categoria do assunto: |
--
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189052/1/AP-Identification-Cesar-etal.pdf
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Marc: |
LEADER 03558naa a2200457 a 4500
001 2106227
005 2019-02-19
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1186/s12864-018-4871-y$2DOI
100 1 $aCESAR, A. S. M.
245 $aIdentification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits.$h[electronic resource]
260 $c2018
500 $aArticle number: 499. Na publicação: Luciana C. A. Regitano, Maurício A. Mudadu, Adhemar Zerlotini.
520 $aBackground: Integration of high throughput DNA genotyping and RNA-sequencing data allows for the identification of genomic regions that control gene expression, known as expression quantitative trait loci (eQTL), on a whole genome scale. Intramuscular fat (IMF) content and carcass composition play important roles in metabolic and physiological processes in mammals because they influence insulin sensitivity and consequently prevalence of metabolic diseases such as obesity and type 2 diabetes. However, limited information is available on the genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals. Thus, our hypothesis was that eQTL analyses could identify putative regulatory regions and transcription factors (TFs) associated with intramuscular fat (IMF) content traits. Results: We performed an integrative eQTL study in skeletal muscle to identify putative regulatory regions and factors associated with intramuscular fat content traits. Data obtained from skeletal muscle samples of 192 animals was used for association analysis between 461,466 SNPs and the transcription level of 11,808 genes. This yielded 1268 cis- and 10,334 trans-eQTLs, among which we identified nine hotspot regions that each affected the expression of > 119 genes. These putative regulatory regions overlapped with previously identified QTLs for IMF content. Three of the hotspots respectively harbored the transcription factors USF1, EGR4 and RUNX1T1, which are known to play important roles in lipid metabolism. From co-expression network analysis, we further identified modules significantly correlated with IMF content and associated with relevant processes such as fatty acid metabolism, carbohydrate metabolism and lipid metabolism. Conclusion: This study provides novel insights into the link between genotype and IMF content as evident from the expression level. It thereby identifies genomic regions of particular importance and associated regulatory factors. These new findings provide new knowledge about the biological processes associated with genetic variants and mechanisms associated with IMF deposition in mammals.
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650 $aMetabolic diseases
653 $aÁcidos graxos
653 $aDoenças metabólicas
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653 $aExpression quantitative trait loci
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aREECY, J. M.
700 1 $aPOLETI, M. D.
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700 1 $aOLIVEIRA, G. B. de
700 1 $aMOREIRA, G. C. M.
700 1 $aMUDADU, M. de A.
700 1 $aTIZIOTO, P. L.
700 1 $aKOLTES, J. E.
700 1 $aFritz-Waters, E.
700 1 $aKRAMER, L.
700 1 $aGARRICK, D.
700 1 $aBEIKI, H.
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700 1 $aMOURÃO, G. B.
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700 1 $aCOUTINHO, L. L.
773 $tBMC Genomics$gv. 19, p. 1-20, 2018.
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