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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
29/01/2008 |
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Data da última atualização: |
29/07/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MENDES, A. M. S.; DUDA, G. P.; LIMA, J. A. G.; AMORIN, L. B. do. |
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Afiliação: |
ALESSANDRA MONTEIRO SALVIANO MENDES, CPATSA; Gustavo Pereira Duda, UFERSA; José Alexsandro Guimarães Lima, INCRA; Laerte Bezerra do Amorim, UFRPE. |
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Título: |
Variabilidade espacial de características químicas de um Cambissolo cultivado com mamão no semi-árido do Rio Grande do Norte. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista de Biologia e Ciências da Terra, Campina Grande, v. 7, n. 2, p. 169-174, 2007. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade espacial de atributos químicos de um Cambissolo Háplico léptico (CX), sob cultivo de mamão, por meio da geoestatística. A área amostrada apresentou 43 pontos amostrais, onde foram coletadas amostras de solo, na camada de 0 - 0,2 m, e amostras do tecido foliar. Nas amostras de solo determinou-se pH, CE, Ca, Mg, Na, K, P, C. A partir dessas análises calculou-se a CTC, S, V e PST. Os dados foram avaliados por estatística descritiva e por meio de técnicas geoestatísticas. O coeficiente de variação indicou variabilidade baixa para pH e V (%), e alta para P e CE, enquanto as demais variáveis apresentaram variação alta. A maioria das variáveis apresentaram dependência espacial, sendo o esférico o modelo ajustado a todos os semivariogramas. O efeito pepita teve pequena contribuição na variância total dos dados, indicando forte dependência espacial para todas as variáveis estudadas. Houve pequena variação na distância até onde as características químicas do solo apresentaram dependência espacial. |
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Palavras-Chave: |
Geoestatística; Semivariogramas. |
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Thesagro: |
Fertilidade; Mamão; Solo. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CPATSA/36755/1/OPB1610.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sudeste. Para informações adicionais entre em contato com cppse.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
29/11/2018 |
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Data da última atualização: |
30/11/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
OKINO, C. H.; GIGLIOTI, R.; Silva, P. C.; OLIVEIRA, H. N. de; OLIVEIRA, M. C. de S. |
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Afiliação: |
CINTIA HIROMI OKINO, CPPSE; Rodrigo Giglioti, UNESP; Pamella Cristini Silva, UNICEP; Henrique Nunes de Oliveira, UNESP; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE. |
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Título: |
Comparative evaluation of DNA extraction kit, matrix sample and qPCR assays for bovine babesiosis monitoring. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 45, n. 6, p. 2671-2680, 2018. |
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DOI: |
10.1007/s11033-018-4436-9 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bovine babesiosis caused by protozoan parasites Babesia bovis and B. bigemina is one of the most important causes of losses for the livestock industry in tropical and subtropical regions of the world. Therefore, highly sensitive and specific tools for these hemoparasites detection and monitoring are required, especially in carrier animals, in which low parasite levels were usually present. In this context, qPCR assays have been successfully and fairly used in last years. Aiming to improve the performance of Babesia levels monitoring by qPCR, some of main aspects of this methodology that may influence results were tested: DNA extraction kits, whole blood EDTA pre-treatment, blood source (tip of tail or jugular vein), erythrocytes isolation, FTA card interference and qPCR system of detection. Under our experimental conditions, both EDTA pre-treatment and FTA card application have no influence on the sensitivity of detection, and two DNA extraction kits provided higher sensitivity compared to others. As expected, blood samples collected from the tip of tail vessels presented higher levels of B. bovis DNA compared to those obtained from the jugular vein, and erythrocytes processed isolated has also improved the sensitivity compared to whole blood. Moreover, both qPCR assays here developed using hydrolysis probes for B. bovis and B. bigemina detection, presented enhanced reproducibility compared to qPCR assays using intercalating dye system. Even, qPCR for B. bigemina using hydrolysis probe here developed presented higher sensitivity compared to intercalating dye system. This study has contributed to the improvement of molecular diagnosis of bovine babesiosis, which may improve epidemiological studies related to these pathogens. MenosBovine babesiosis caused by protozoan parasites Babesia bovis and B. bigemina is one of the most important causes of losses for the livestock industry in tropical and subtropical regions of the world. Therefore, highly sensitive and specific tools for these hemoparasites detection and monitoring are required, especially in carrier animals, in which low parasite levels were usually present. In this context, qPCR assays have been successfully and fairly used in last years. Aiming to improve the performance of Babesia levels monitoring by qPCR, some of main aspects of this methodology that may influence results were tested: DNA extraction kits, whole blood EDTA pre-treatment, blood source (tip of tail or jugular vein), erythrocytes isolation, FTA card interference and qPCR system of detection. Under our experimental conditions, both EDTA pre-treatment and FTA card application have no influence on the sensitivity of detection, and two DNA extraction kits provided higher sensitivity compared to others. As expected, blood samples collected from the tip of tail vessels presented higher levels of B. bovis DNA compared to those obtained from the jugular vein, and erythrocytes processed isolated has also improved the sensitivity compared to whole blood. Moreover, both qPCR assays here developed using hydrolysis probes for B. bovis and B. bigemina detection, presented enhanced reproducibility compared to qPCR assays using intercalating dye system. Even, qPCR for B. bigemina using hydro... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
DNA extraction; Hydrolysis probe; Matrix sample; QPCR. |
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Thesagro: |
Babesia Bovis. |
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Thesaurus NAL: |
Babesiosis. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02517naa a2200253 a 4500
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005 2018-11-30
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100 1 $aOKINO, C. H.
245 $aComparative evaluation of DNA extraction kit, matrix sample and qPCR assays for bovine babesiosis monitoring.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aBovine babesiosis caused by protozoan parasites Babesia bovis and B. bigemina is one of the most important causes of losses for the livestock industry in tropical and subtropical regions of the world. Therefore, highly sensitive and specific tools for these hemoparasites detection and monitoring are required, especially in carrier animals, in which low parasite levels were usually present. In this context, qPCR assays have been successfully and fairly used in last years. Aiming to improve the performance of Babesia levels monitoring by qPCR, some of main aspects of this methodology that may influence results were tested: DNA extraction kits, whole blood EDTA pre-treatment, blood source (tip of tail or jugular vein), erythrocytes isolation, FTA card interference and qPCR system of detection. Under our experimental conditions, both EDTA pre-treatment and FTA card application have no influence on the sensitivity of detection, and two DNA extraction kits provided higher sensitivity compared to others. As expected, blood samples collected from the tip of tail vessels presented higher levels of B. bovis DNA compared to those obtained from the jugular vein, and erythrocytes processed isolated has also improved the sensitivity compared to whole blood. Moreover, both qPCR assays here developed using hydrolysis probes for B. bovis and B. bigemina detection, presented enhanced reproducibility compared to qPCR assays using intercalating dye system. Even, qPCR for B. bigemina using hydrolysis probe here developed presented higher sensitivity compared to intercalating dye system. This study has contributed to the improvement of molecular diagnosis of bovine babesiosis, which may improve epidemiological studies related to these pathogens.
650 $aBabesiosis
650 $aBabesia Bovis
653 $aDNA extraction
653 $aHydrolysis probe
653 $aMatrix sample
653 $aQPCR
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700 1 $aSilva, P. C.
700 1 $aOLIVEIRA, H. N. de
700 1 $aOLIVEIRA, M. C. de S.
773 $tMolecular Biology Reports$gv. 45, n. 6, p. 2671-2680, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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