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210. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | PAÇÓ, A. N.; BERALDO, M. C. D.; RIBEIRO, A. B. R.; IBELLI, A. M. G.; GIGLIOTI, R.; CHAGAS, A. C. de S.; OLIVEIRA, M. C. de S.; OLIVEIRA, H. N. de. Avaliação de comportamento entre matrizes de ovinos de dois grupos genéticos no sistema de regime de pastagem. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 3., 2011, São Carlos. Anais... São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação, 2011 Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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211. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | CAMPOS, G. S.; CARDOSO, F. F.; GULIAS GOMES, C. C.; DOMINGUES, R.; REGITANO, L. C. de A.; OLIVEIRA, M. C. de S.; OLIVEIRA, H. N. DE; CARVALHEIRO, R.; ALBUQUERQUE, L. G.; MILLER, S.; MISTZAL, I.; LOURENCO, D. Development of genomic predictions for Angus cattle in Brazil incorporating genotypes from related american sires. Journal of Animal Science, v. 100, n. 2, p. 1-13, Feb. 2022. skac009. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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212. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | ARRIGONI, M. D. B.; ALVES JÚNIOR, A.; DIAS, P. M. A.; MARTINS, C. L.; CERVIERI, R. da C.; SILVEIRA, A. C.; OLIVEIRA, H. N. de; CHARDULO, L. A. L. Desempenho, fibras musculares e carne de bovinos jovens de três grupos genéticos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 10, p. 1033-1039, out. 2004 Título em inglês: Performance, muscle fibers and meat traits of young bulls of three genetic groups. Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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213. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | PEREIRA, F. F.; CARDOSO, C. R. G.; LUCCHETTA, J. T.; OLIVEIRA, H. N. de; RAMOS, L. F. N; ALENCAR, M. X.; VEIGA, V. C.; LEITE, M. K.; SOARES, I.; MENDES, J. E. P. Liberações inoculativas de eulofídeos para controle biológico de lepidópteros desfolhadores em plantios de eucalipto. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 16., 2019, Londrina. Controle biológico: da academia ao campo, rumo à sustentabilidade: anais. Londrina: Sociedade Entomológica do Brasil, 2019. p. 229 Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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214. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | CURI, R. A.; FORTES, M. R. S.; CHARDULO, L. A. L.; SILVEIRA, A. C.; DE BENI ARRIGONE, M.; MARTINS, C. L.; ASSUMPÇÃO, M. E. O. D'A.; OLIVEIRA, H. N. de. Genetic polymorphisms related to meat traits in purebred and crossbred Nelore cattle. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 12, p. 1660-1666, dez. 2009 Título em português: Polimorfi smos genéticos relacionados às características da carne em bovinos Nelore puros e cruzados. Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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215. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | PEREIRA, F. F.; CARDOSO, C. R. G.; LUCCHETTA, J. T.; OLIVEIRA, H. N. de; SANTOS, J. P.; RAMOS, L. N.; ALENCAR, M. X.; VEIGA, V. C.; LEITE, M. K.; MENDES, J. P. Protocolo de produção de eulofídeos para controle biológico de lepidópteros desfolhadores em plantios de eucalipto. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 16., 2019, Londrina. Controle biológico: da academia ao campo, rumo à sustentabilidade: anais. Londrina: Sociedade Entomológica do Brasil, 2019. p. 228 Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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216. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | BORGES, B. O.; CURI, R. A.; BALDI, F.; FEITOSA, F. L. B.; ANDRADE, W. B. F. de; ALBUQUERQUE, L. G. de; OLIVEIRA, H. N. de; CHARDULO, L. A. L. Polymorphisms in candidate genes and their association with carcass traits and meat quality in Nellore cattle. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 5, p. 364-371, maio. 2014. Título em português: Polimorfismos em genes-candidatos e suas associações com características de carcaça e qualidade da carne em bovinos Nelore. Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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217. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | AZEVEDO, B. T.; OLIVEIRA, H. N. DE; KATIKI, L. M.; VERCESI FILHO, A. E.; DOMINGOS, A. G.; ANTUNES, S.; OKINO, C. H.; OLIVEIRA, M. C. de S.; IBELLI, A. M. G.; GIGLIOTI, R. A small proportion of Zebu genetic background in crossbred calves may not be enough to improve resistance against natural bovine Babesia spp. infections. Veterinary Parasitology, v. 328, 2024, 110165. 7 p. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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218. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SILVA, P. C.; MARTINS, M. D. R.; TONELLI, M. F.; GOMES, H. C. S. F.; OLIVEIRA, H. N. DE; VELTRONI, Y. K.; SIMAS, P. V.; BASSETTO, C. C.; GIGLIOTI, R.; OLIVEIRA, M. C. de S.; OKINO, C. H. Perfis de anticorpos sistêmicos dos isótipos IgG e IgM anti-Babesia bovis e anti-Babesia bigemina em bezerros da raça Canchim do nascimento até 12 meses de idade. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 12., 2020, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2020. p.28. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 71). Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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219. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | GIGLIOTI, R.; OKINO, C. H.; AZEVEDO, B. T.; WEDY, B. C. R.; GUTMANIS, G.; VERÍSSIMO, C. J.; KATIKI, L. M.; VERCESI FILHO, A. E.; OLIVEIRA, H. N. DE; OLIVEIRA, M. C. de S. Semi-quantitative evaluation of Babesia bovis and B. bigemina infection levels estimated by HRM analysis. Ticks and Tick-borne Diseases, v.12, n.5, 101753, sep. 2021. 6 p. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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220. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | GIGLIOTI, R.; OLIVEIRA, H. N. de; GUTMANIS, G.; LUCIANI, G. F.; AZEVEDO, B. T.; FIORIN, C. F. de C.; ANDRADE, M. F. de; SILVA, M. A. F.; VERCESI FILHO, A. E.; KATIKI, L. M.; OKINO, C. H.; OLIVEIRA, M. C. de S.; VERÍSSIMO, C. J. Correlations and repeatability between Babesia spp. infection levels using two dairy cattle breeding systems. Experimental and Applied Acarology, v. 81, p. 599-607, jul. 2020. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
08/12/2020 |
Data da última atualização: |
08/12/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
CARDOSO, D. F.; FERNANDES JÚNIOR, G. A.; SCALEZ, D. C. B.; ALVEZ, A. A. C.; MAGALHÃES, A. F. B.; BRESOLIN, T.; VENTURA, R. V.; LI, C.; OLIVEIRA, M. C. de S.; PORTO NETO, L. R.; CARVALHEIRO, R.; OLIVEIRA, H. N. de; TONHATI, H.; ALBUQUERQUE, L. G. |
Afiliação: |
Diercles Francisco Cardoso, UNESP; Gerardo Alves Fernandes Júnior, UNESP; Daiane Cristina Becker Scalez, UNESP; Anderson Antonio Carvalho Alves, UNESP; Ana Fabrícia Braga Magalhães, UNESP; Tiago Bresolin, UNESP; Ricardo Vieira Ventura, USP; Changxi Li, University of Alberta; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; Laercio Ribeiro Porto-Neto, CSIRO; Roberto Carvalheiro, UNESP; Henrique Nunes de Oliveira, UNESP; Humberto Tonhati, UNESP; Lucia Galvão Albuquerque, UNESP. |
Título: |
Uncovering sub-structure and genomic profiles in across-countries subpopulations of Angus Cattle. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 10, article 8770, 2020. |
Páginas: |
11 p. |
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-020-65565-1 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Highlighting genomic profiles for geographically distinct subpopulations of the same breed may provide insights into adaptation mechanisms to different environments, reveal genomic regions divergently selected, and offer initial guidance to joint genomic analysis. Here, we characterized similarities and differences between the genomic patterns of Angus subpopulations, born and raised in Canada (N?= 382) and Brazil (N = 566). Furthermore, we systematically scanned for selection signatures based on the detection of autozygosity islands common between the two subpopulations, and signals of divergent selection, via FST and varLD tests. The principal component analysis revealed a sub-structure with a close connection between the two subpopulations. The averages of genomic relationships, inbreeding coefficients, and linkage disequilibrium at varying genomic distances were rather similar across them, suggesting non-accentuated differences in overall genomic diversity. Autozygosity islands revealed selection signatures common to both subpopulations at chromosomes 13 (63.77?65.25 Mb) and 14 (22.81?23.57 Mb), which are notably known regions affecting growth traits. Nevertheless, further autozygosity islands along with FST and varLD tests unravel particular sites with accentuated population subdivision at BTAs 7 and 18 overlapping with known QTL and candidate genes of reproductive performance, thermoregulation, and resistance to infectious diseases. Our findings indicate overall genomic similarity between Angus subpopulations, with noticeable signals of divergent selection in genomic regions associated with the adaptation in different environments. MenosHighlighting genomic profiles for geographically distinct subpopulations of the same breed may provide insights into adaptation mechanisms to different environments, reveal genomic regions divergently selected, and offer initial guidance to joint genomic analysis. Here, we characterized similarities and differences between the genomic patterns of Angus subpopulations, born and raised in Canada (N?= 382) and Brazil (N = 566). Furthermore, we systematically scanned for selection signatures based on the detection of autozygosity islands common between the two subpopulations, and signals of divergent selection, via FST and varLD tests. The principal component analysis revealed a sub-structure with a close connection between the two subpopulations. The averages of genomic relationships, inbreeding coefficients, and linkage disequilibrium at varying genomic distances were rather similar across them, suggesting non-accentuated differences in overall genomic diversity. Autozygosity islands revealed selection signatures common to both subpopulations at chromosomes 13 (63.77?65.25 Mb) and 14 (22.81?23.57 Mb), which are notably known regions affecting growth traits. Nevertheless, further autozygosity islands along with FST and varLD tests unravel particular sites with accentuated population subdivision at BTAs 7 and 18 overlapping with known QTL and candidate genes of reproductive performance, thermoregulation, and resistance to infectious diseases. Our findings indicate overall genomi... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Autozygosity islands; FST; Overall genomic diversity; Rather similar across; ROH islands; VarLD signals. |
Thesaurus NAL: |
Angus. |
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/218925/1/UncoveringSubStructure.pdf
|
Marc: |
LEADER 02787naa a2200385 a 4500 001 2127803 005 2020-12-08 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-020-65565-1$2DOI 100 1 $aCARDOSO, D. F. 245 $aUncovering sub-structure and genomic profiles in across-countries subpopulations of Angus Cattle.$h[electronic resource] 260 $c2020 300 $a11 p. 520 $aHighlighting genomic profiles for geographically distinct subpopulations of the same breed may provide insights into adaptation mechanisms to different environments, reveal genomic regions divergently selected, and offer initial guidance to joint genomic analysis. Here, we characterized similarities and differences between the genomic patterns of Angus subpopulations, born and raised in Canada (N?= 382) and Brazil (N = 566). Furthermore, we systematically scanned for selection signatures based on the detection of autozygosity islands common between the two subpopulations, and signals of divergent selection, via FST and varLD tests. The principal component analysis revealed a sub-structure with a close connection between the two subpopulations. The averages of genomic relationships, inbreeding coefficients, and linkage disequilibrium at varying genomic distances were rather similar across them, suggesting non-accentuated differences in overall genomic diversity. Autozygosity islands revealed selection signatures common to both subpopulations at chromosomes 13 (63.77?65.25 Mb) and 14 (22.81?23.57 Mb), which are notably known regions affecting growth traits. Nevertheless, further autozygosity islands along with FST and varLD tests unravel particular sites with accentuated population subdivision at BTAs 7 and 18 overlapping with known QTL and candidate genes of reproductive performance, thermoregulation, and resistance to infectious diseases. Our findings indicate overall genomic similarity between Angus subpopulations, with noticeable signals of divergent selection in genomic regions associated with the adaptation in different environments. 650 $aAngus 653 $aAutozygosity islands 653 $aFST 653 $aOverall genomic diversity 653 $aRather similar across 653 $aROH islands 653 $aVarLD signals 700 1 $aFERNANDES JÚNIOR, G. A. 700 1 $aSCALEZ, D. C. B. 700 1 $aALVEZ, A. A. C. 700 1 $aMAGALHÃES, A. F. B. 700 1 $aBRESOLIN, T. 700 1 $aVENTURA, R. V. 700 1 $aLI, C. 700 1 $aOLIVEIRA, M. C. de S. 700 1 $aPORTO NETO, L. R. 700 1 $aCARVALHEIRO, R. 700 1 $aOLIVEIRA, H. N. de 700 1 $aTONHATI, H. 700 1 $aALBUQUERQUE, L. G. 773 $tScientific Reports$gv. 10, article 8770, 2020.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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