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Registros recuperados : 104 | |
82. | | OLIVEIRA, F. S.; LIMA, T. P. C.; FERREIRA, A. B. R.; JULIANO, R. S.; FIORAVANTI, M. C. S.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; EGITO, A. A. do. Variabilidade do loco BoLA DRB3.2 em raças bovinas localmente adaptadas. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 16., 2015, Villavicencio, Colombia. Iberoamérica compartirá experiencias y logros científicos: libro de resúmenes. Villavicencio, Colombia: Asocriollanos: Red Conbiand Colombia: Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, 2015. p. 82. Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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83. | | BEZERRA, L. A. M.; RABELO, H. O.; DAVID, A. M. S. de S.; LIBRELON, S. S.; OLIVEIRA, F. S.; CALDEIRA, S. G.; LIMA, M. H. M. e; NOBRE, D. A. C. Avaliação da qualidade fisiológica de acessos de pinhão manso. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 6., 2009. Montes Claros. Biodiesel: inovação tecnológica – anais. Lavras: UFLA, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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84. | | ALVES, A. A.; LAVIOLA, B. G.; GURGEL, F. de L.; ROSADO, T. B.; ROCHA, R. B.; BHERING, L. L.; COSTA, J. Z.; COSTA, R. D.; OLIVEIRA, F. S.; TRENHAGO, E. D. Ganhos genéticos preditos com a seleção precoce de indivíduos de maior rendimento no banco de germoplasma de Pinhão Manso (Jatropha curcas L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil. [Búzios]: SBMP, 2011. Não paginado. Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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85. | | ROSADO, T. B.; ALVES, A. A.; LAVIOLA, B. G.; GURGEL, F. de L.; ROCHA, R. B.; ALBRECHT, J. C.; COSTA, R. D.; COSTA, J. Z.; TRENHAGO, E. D.; OLIVEIRA, F. S. de; BHERING, L. L. Estimativas de coeficientes de repetibilidade e número mínimo de medições para predição do valor genético em pinhão-manso. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil. [Búzios]: SBMP, 2011. Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados. |
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86. | | OLIVEIRA, F. S. de; PEREIRA, M. G.; SILVA, R. C. da; PINHEIRO JUNIOR, C. R.; SILVA NETO, E. C. da; FONTANA, A.; SOUZA, J. J. L. L. de; PEDRON, F. de A. Formation and degradation of textural pedofeatures in soils of ancient tropical coastal plains in southeastern Brazil. Catena, v. 245, 108313, Oct. 2024. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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87. | | PEREIRA, M. G.; SILVA, R. C. da; PINHEIRO JUNIOR, C. R.; OLIVEIRA, F. S. de; SILVA NETO, E. C. da; FONTANA, A.; PACHECO, A. A.; PEDRON, F. de A. Soil genesis on the soft slopes of ancient coastal plains, southeastern Brazil. Catena, v. 210, 105894, Mar. 2022. Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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88. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484. Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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89. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484. Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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90. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484. Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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91. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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92. | | PELÓGIA, M. E. S.; CERQUEIRA, E. S. F.; SILVEIRA, C. P. B.; ROLIM, G. S.; FECHIS, A. D. S.; ROCHA, T. A. S. S.; LAUS, J. L.; OLIVEIRA, F. S. Suture and venous traction test analysis in dogs fixed in alcohol and preserved in saline solution. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 9, p. 1834-1837, setembro 2018 Título em português: Análise de sutura e de teste de tração venosa em cães fixados em álcool e conservados em solução salina. Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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93. | | ALMEIDA, E. de P. C.; SCHAEFER, C. E. G. R.; OLIVEIRA, F. S.; ALBUQUERQUE FILHO, M. R.; ALVES, R. V.; SÁ, M. M. F.; MELO, V. de F.; CORRÊA, G. R. Topossequência de solos na Ilha da Trindade, Atlântico Sul. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Campinas, v. 33, n. 5, p. 1357-1371, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
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94. | | ALBUQUERQUE, J. R. T. de; LINS, H. A.; SANTOS, M. G. dos; FREITAS, M. A. M. de; OLIVEIRA, F. S. de; SOUZA, A. R. E. de; SILVEIRA, L. M. da; NUNES, G. H. de S.; BARROS JÚNIOR, A. P.; VIEIRA, P. F. de M. J. Adaptability and stability of soybean (Glycine max L.) genotypes in semiarid conditions. Euphytica, v. 218, n. 61, 2022. 12 p. Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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95. | | MATOSINHO, C. G. R.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S.; ASSIS, J. G.; OLIVEIRA, F. S.; ARAUJO, F.; SALIM, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; COIMBRA, R. S.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S. Identification and functional analysis in silico of polymorphisms in milk protein genes of Guzerá and Gir cattle. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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96. | | MATOSINHO, C. G. R.; ROSSE, I. C.; FONSECA, P. A. S.; OLIVEIRA, F. S. de; SANTOS, F. G. dos; ARAÚJO, F. M. G.; SALIM, A. C. de M.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; OLIVEIRA, G.; PIRES, D. E. V.; CARVALHO, M. R. S. Identifcation and in silico characterization of structural and functional impacts of genetic variants in milk protein genes in the Zebu breeds Guzerat and Gyr. Tropical Animal Health and Production, v. 53, n. 6, 524, 2021. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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97. | | ROSSE, I. C.; ASSIS, J. G.; OLIVEIRA, F. S.; LEITE, L. R.; ARAUJO, F.; ZERLOTINI, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. S.; GUIMARÃES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBRA, R. S.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S. Novel polymorphisms in genes associated with milk and meat production and disease resistance in the Guzerá breed identified by whole-genome sequencing. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DE MINAS GERAIS: PESQUISA E PÓS GRADUAÇÃO, 5., 2014, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 74. Engemig 2014. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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98. | | ROSSE, I. C.; OLIVEIRA, F. S.; LEITE, L. R.; ARAUJO, F.; ZERLOTINI NETO, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBRA, R. S.; OLIVEIRA, G.; CARVALHO, M. R. S. Novel polymorphisms in genes associated with milk and meat production and disease resistance in the guzera breed identified by whole-genome sequencing. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DE MINAS GERAIS: PESQUISA E PÓS GRADUAÇÃO, 5., 2014, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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99. | | CRUZ, I. R.; GERALDO, J. A.; OLIVEIRA, F. S. de; LEITE, L. R.; ARAÚJO, F.; ZERLOTINI, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBAR, R. S.; CARVALHO, M. R. S.; OLIVEIRA, G. New single sucleotide polymorphisms in Guzerá breed revealed by whole-genome re-sequencing. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C; BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFORMATICS, 2013, Recife. Abstract book... Recife: Brazilian Association for Bioinformatics and Computer Biology; Braziian Computer Society, 2013. Não paginado. X-meeting BSB 2013. Abstract 76. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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100. | | CRUZ, I. R.; GERALDO, L. A.; OLIVEIRA, F. S. DE; LEITE, L. R.; ARAUJO, F.; ZERLOTINI NETO, A.; LOPES, B. C.; ARBEX, W. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B.; COIMBRA, R. S.; CARVALHO, M. R. S.; OLIVEIRA, G. New single nucleotide polymorphisms in guzerá breed revealed by whole-genome re-sequencing. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C; BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFORMATICS, 2013, Recife. Abstract book... Recife: Brazilian Association for Bioinformatics and Computer Biology; Braziian Computer Society, 2013. Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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Registros recuperados : 104 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
Data corrente: |
18/04/2016 |
Data da última atualização: |
18/04/2016 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
Afiliação: |
PATRICIA IANELLA, CENARGEN; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; ANDERSON LUIS ALVES, CNPASA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, CNPASA; NAIARA MILAGRES AUGUSTO DA SILVA, CENARGEN; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; FERNANDA STRINGASSI DE OLIVEIRA, CNPTIA; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN. |
Título: |
SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. |
Páginas: |
Não paginado. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
PAG 2016. Pôster P0484. |
Conteúdo: |
Tambaqui is the most important native fresh water fish species cultured in Brazil, with current yearly production levels exceeding 200.000mt. Efforts to structure genetic improvement programs for increasing productivity are recent and will greatly benefit from the use of genomic tools for broodstock management and assisted genetic evaluations and breeding. Recent efforts have produced a draft genome sequence for this species. Reduced representation libraries of varying fragment sizes were produced with bulked DNA samples and sequenced with 2x160bp Illumina protocols to produce >720million reads. Generated reads were aligned with the draft reference genome sequence using BWA and SNP discovery was performed using Freebayes. An estimated 12% of the tambaqui genome was sequenced with a depth of >100 reads. A total of 993.935 SNPs were observed with read depths >60 (median: 438) and minor allele frequencies >0.05 (MAF 0.05-0.15: 94.102 SNPs; 0.15-0.25: 326.575; 0.25-0.35: 255.967; 0.35-0.45: 215.054; 0.45-0.50: 102.237).This represents the first report of an extensive effort to identify SNP markers for this species and will be a valuable source of information for designing marker panels with varying applications. |
Palavras-Chave: |
Genômica; Polimorfismo de nucleotídeo único. |
Thesagro: |
Colossoma Macropomum; Peixe de água doce; Tambaqui. |
Thesaurus NAL: |
Genomics; Single nucleotide polymorphism. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/140249/1/PAG-p0484.pdf
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Marc: |
LEADER 02304naa a2200325 a 4500 001 2043572 005 2016-04-18 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aIANELLA, P. 245 $aSNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries.$h[electronic resource] 260 $c2016 300 $aNão paginado. 500 $aPAG 2016. Pôster P0484. 520 $aTambaqui is the most important native fresh water fish species cultured in Brazil, with current yearly production levels exceeding 200.000mt. Efforts to structure genetic improvement programs for increasing productivity are recent and will greatly benefit from the use of genomic tools for broodstock management and assisted genetic evaluations and breeding. Recent efforts have produced a draft genome sequence for this species. Reduced representation libraries of varying fragment sizes were produced with bulked DNA samples and sequenced with 2x160bp Illumina protocols to produce >720million reads. Generated reads were aligned with the draft reference genome sequence using BWA and SNP discovery was performed using Freebayes. An estimated 12% of the tambaqui genome was sequenced with a depth of >100 reads. A total of 993.935 SNPs were observed with read depths >60 (median: 438) and minor allele frequencies >0.05 (MAF 0.05-0.15: 94.102 SNPs; 0.15-0.25: 326.575; 0.25-0.35: 255.967; 0.35-0.45: 215.054; 0.45-0.50: 102.237).This represents the first report of an extensive effort to identify SNP markers for this species and will be a valuable source of information for designing marker panels with varying applications. 650 $aGenomics 650 $aSingle nucleotide polymorphism 650 $aColossoma Macropomum 650 $aPeixe de água doce 650 $aTambaqui 653 $aGenômica 653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único 700 1 $aVARELA, E. S. 700 1 $aALVES, A. L. 700 1 $aVILLELA, L. C. V. 700 1 $aSILVA, N. M. A. da 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B. 700 1 $aOLIVEIRA, F. S. de 700 1 $aPAIVA, S. R. 700 1 $aCAETANO, A. R. 773 $tIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.$gn.], 2016.
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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