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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
Data corrente: |
07/11/2022 |
Data da última atualização: |
07/11/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MATOS, M. K. da S.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BEZERRA-NETO, J. P.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; WANG, Y.; LIU, H.; PANDOLFI, V.; AMORIM, L. L. B.; WILLADINO, L.; AMORIM, T. C. do V.; KIDO, E. A.; VIANELLO, R. P.; TIMKO, M. P.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. |
Afiliação: |
MITALLE KAREN DA SILVA MATOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ANA MARIA BENKO-ISEPPON, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOAO PACIFICO BEZERRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOSE RIBAMAR COSTA FERREIRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; YU WANG, UNIVERSITY OF VIRGINA; HAI LIU, UNIVERSITY OF VIRGINIA; VALESCA PANDOLFI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LIDIANE LINDINALVA BARBOSA AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LILIA WILLADINO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; THIALISSON CAACI DO VALE AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; EDERSON AKIO KIDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; MICHAEL P. TIMKO, UNIVERSITY OF VIRGINIA; ANA CHRISTINA BRASILEIRO-VIDAL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO. |
Título: |
The WRKY transcription factor family in cowpea: Genomic characterization and transcriptomic profiling under root dehydration. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Gene, v. 823, 146377, May 2022. |
ISSN: |
0378-1119 |
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146377 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress response, the data provide a foundation for the targeted modification of specific VuWRKY family members to improve drought tolerance in this important climate-resilient legume in the developing world and beyond. MenosCowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
QPCR; RNA-Seq. |
Thesagro: |
Seca; Vigna Unguiculata. |
Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Cowpeas; Drought tolerance; Gene expression. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 02849naa a2200397 a 4500 001 2148067 005 2022-11-07 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0378-1119 024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146377$2DOI 100 1 $aMATOS, M. K. da S. 245 $aThe WRKY transcription factor family in cowpea$bGenomic characterization and transcriptomic profiling under root dehydration.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aCowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress response, the data provide a foundation for the targeted modification of specific VuWRKY family members to improve drought tolerance in this important climate-resilient legume in the developing world and beyond. 650 $aAbiotic stress 650 $aCowpeas 650 $aDrought tolerance 650 $aGene expression 650 $aSeca 650 $aVigna Unguiculata 653 $aQPCR 653 $aRNA-Seq 700 1 $aBENKO-ISEPPON, A. M. 700 1 $aBEZERRA-NETO, J. P. 700 1 $aFERREIRA-NETO, J. R. C. 700 1 $aWANG, Y. 700 1 $aLIU, H. 700 1 $aPANDOLFI, V. 700 1 $aAMORIM, L. L. B. 700 1 $aWILLADINO, L. 700 1 $aAMORIM, T. C. do V. 700 1 $aKIDO, E. A. 700 1 $aVIANELLO, R. P. 700 1 $aTIMKO, M. P. 700 1 $aBRASILEIRO-VIDAL, A. C. 773 $tGene$gv. 823, 146377, May 2022.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
01/08/2023 |
Data da última atualização: |
02/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Autoria: |
PRADO, K. de A. C. dos; SILVA, A. C. C. P. da; PACHECO, C. S. G. R.; OLIVEIRA, F. F. de; SILVA, A. F.; MARINHO, C. M.; LIMA, R. L. F. de A.; PRADO, K. de A. C. do. |
Afiliação: |
KARINNE DE ALBUQUERQUE CAMPOS DO PRADO, UNIVASF; ANA CAROLINE COELHO PEREIRA DA SILVA, UNIVASF; CLECIA SIMONE GONCALVES ROSA PACHECO, Instituto Federal do Sertão Pernambucano - IFSertão-PE; FÁBIO FREIRE DE OLIVEIRA, Instituto Federal do Sertão Pernambucano - IFSertão-PE; ALINEAUREA FLORENTINO SILVA, CPATSA; CRISTIANE MORAES MARINHO, Instituto Federal do Sertão Pernambucano - IFSertão- PE; REGINA LÚCIA FÉLIX DE AGUIAR LIMA, UPE; KAROLLINE DE ALBUQUERQUE CAMPOS DO PRADO, UNIVASF. |
Título: |
Fungos micorrizicos arbusculares como indicadores de recuperação de áreas degradadas no ecossistema caatinga: uma revisão integrativa. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
In: PACHECO, C. S. G. R. (org.). Mudanças climáticas e seus impactos socioambientais: concepções, fundamentos, teorias e práticas mitigadora. Guarujá: Científica Digital, 2023. |
Páginas: |
Cap. 12, p. 198-206. |
DOI: |
10.37885/230613383 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Objetivo do oferecer subsídios para a construção do conhecimento prático, compactado e fácil sobre os fungos micorrizicos arbusculares como indicadores de recuperação de áreas degradadas no ecossistema caatinga a partir de uma revisão integrativa, mostrando também que é necessário cuidar deste ecossistema, a partir de uma iniciativa de recuperação de áreas degradadas, utilizando como aliado elementos que já fazem parte da natureza, com vistas a mitigar os impactos ambientais e evitar as severas consequências das mudanças climáticas no Semiárido brasileiro. |
Palavras-Chave: |
Área degradada; Bioma Caatinga; FMA; Fungos micorrizicos arbusculares; Recuperação de áreas degradadas. |
Thesagro: |
Caatinga; Degradação Ambiental; Ecossistema; Fungo; Micorriza; Micorriza Vesicular Arbuscular; Mudança Climática. |
Thesaurus NAL: |
Climate change. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1155530/1/FUNGOS-MICORRIZICOS-ARBUSCULARES-2023.pdf
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Marc: |
LEADER 01918naa a2200385 a 4500 001 2155530 005 2023-08-02 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.37885/230613383$2DOI 100 1 $aPRADO, K. de A. C. dos 245 $aFungos micorrizicos arbusculares como indicadores de recuperação de áreas degradadas no ecossistema caatinga$buma revisão integrativa.$h[electronic resource] 260 $c2023 300 $aCap. 12, p. 198-206. 520 $aObjetivo do oferecer subsídios para a construção do conhecimento prático, compactado e fácil sobre os fungos micorrizicos arbusculares como indicadores de recuperação de áreas degradadas no ecossistema caatinga a partir de uma revisão integrativa, mostrando também que é necessário cuidar deste ecossistema, a partir de uma iniciativa de recuperação de áreas degradadas, utilizando como aliado elementos que já fazem parte da natureza, com vistas a mitigar os impactos ambientais e evitar as severas consequências das mudanças climáticas no Semiárido brasileiro. 650 $aClimate change 650 $aCaatinga 650 $aDegradação Ambiental 650 $aEcossistema 650 $aFungo 650 $aMicorriza 650 $aMicorriza Vesicular Arbuscular 650 $aMudança Climática 653 $aÁrea degradada 653 $aBioma Caatinga 653 $aFMA 653 $aFungos micorrizicos arbusculares 653 $aRecuperação de áreas degradadas 700 1 $aSILVA, A. C. C. P. da 700 1 $aPACHECO, C. S. G. R. 700 1 $aOLIVEIRA, F. F. de 700 1 $aSILVA, A. F. 700 1 $aMARINHO, C. M. 700 1 $aLIMA, R. L. F. de A. 700 1 $aPRADO, K. de A. C. do 773 $tIn: PACHECO, C. S. G. R. (org.). Mudanças climáticas e seus impactos socioambientais: concepções, fundamentos, teorias e práticas mitigadora. Guarujá: Científica Digital, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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