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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
02/09/2021 |
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Data da última atualização: |
02/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, T. M. M.; LEAO, A. P.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. |
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Afiliação: |
THALITA M. M. FERREIRA, Universidade Federal de Lavras; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; CARLOS ANTONIO FERREIRA DE SOUSA, CPAMN; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
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Título: |
Genes highly overexpressed in salt-stressed young oil palm (Elaeis guineensis) plants. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Engenharia Agrícola e Ambiental, Campina Grande, v. 25, n. 12, p. 813-818, 2021. |
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ISSN: |
1807-1929 |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/1807-1929/agriambi.v25n12p813-818 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Genes altamente superexpressos em dendezeiros jovens (Elaeis guineensis) estressados por sal. |
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Conteúdo: |
Abstract: RNA-seq is a technique based on the large-scale sequencing of transcript-derived cDNAs using next-generation sequencing platforms mostly used today to characterize an organism?s transcriptome. The analysis of RNA-seq data allows for identifying genes differentially expressed in a given condition, such as salt stress. This study aimed to search and characterize genes from the African oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) highly up-regulated during salt stress, with a long-term goal of gene promoter prospection and validation. The apical leaves from the control (electrical conductivity of ~2 dS m-1) and salt-stressed (~40 dS m-1) young oil palm plants, collected at 5 and 12 days after the beginning of the stress, were subjected to extraction of total RNA, with three plants (replicates) per treatment. The complete genome of E. guineensis, available at the National Center for Biotechnology Information, was used as the reference genome - BioProject PRJNA192219. The differential expression analysis led to the selection for further characterization of seven genes, which had increased expressions of 37?84 times under salt stress. The strategy used in this study enabled the selection of seven salt-responsive genes highly up-regulated during salt stress, and some of them coded for proteins already reported as responsible for salinity tolerance in other plant species through over-expression or knockout. Resumo: O RNA-seq é uma técnica baseada no sequenciamento em larga escala de cDNAs derivados de transcritos - por meio de plataformas de sequenciamento de nova geração ? amplamente utilizada atualmente para caracterizar o transcriptoma de um organismo. A análise dos dados de RNA-seq permite identificar genes diferencialmente expressos em uma determinada condição, como o estresse salino. Este estudo teve como objetivo prospectar genes do dendê (Elaeis guineensis) responsivos ao estresse salino e realizar sua caracterização funcional e estrutural. A folha apical de plantas jovens de dendê controle (condutividade elétrica de ~2 dS m-1) e estressadas (~40 dS m-1), coletadas aos 5 e 12 dias após o início do estresse, foi submetida à extração de RNA total, com três plantas (repetições) por tratamento. O genoma completo de E. guineensis, disponível no ?National Center for Biotechnology Information?, foi utilizado como genoma de referência - BioProject PRJNA192219. A análise da expressão diferencial levou à seleção de sete genes, cujo nível de expressão aumentou entre 37 e 84 vezes sob estresse salino, para posterior caracterização. A estratégia utilizada neste estudo permitiu a seleção de sete genes responsivos ao sal suprarregulados durante o estresse, e alguns deles codificam proteínas já relatadas como responsáveis pela tolerância à salinidade em outras espécies de plantas por superexpressão ou knock-out. MenosAbstract: RNA-seq is a technique based on the large-scale sequencing of transcript-derived cDNAs using next-generation sequencing platforms mostly used today to characterize an organism?s transcriptome. The analysis of RNA-seq data allows for identifying genes differentially expressed in a given condition, such as salt stress. This study aimed to search and characterize genes from the African oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) highly up-regulated during salt stress, with a long-term goal of gene promoter prospection and validation. The apical leaves from the control (electrical conductivity of ~2 dS m-1) and salt-stressed (~40 dS m-1) young oil palm plants, collected at 5 and 12 days after the beginning of the stress, were subjected to extraction of total RNA, with three plants (replicates) per treatment. The complete genome of E. guineensis, available at the National Center for Biotechnology Information, was used as the reference genome - BioProject PRJNA192219. The differential expression analysis led to the selection for further characterization of seven genes, which had increased expressions of 37?84 times under salt stress. The strategy used in this study enabled the selection of seven salt-responsive genes highly up-regulated during salt stress, and some of them coded for proteins already reported as responsible for salinity tolerance in other plant species through over-expression or knockout. Resumo: O RNA-seq é uma técnica baseada no sequenciamento em larga escala de... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análise de expressão diferencial; Differential expression analysis; Estresse salino; Genes responsivos ao sal; RNAseq; Salt-responsive genes; Transcriptômica. |
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Thesagro: |
Dendê; Elaeis Guineensis; Gene; RNA. |
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Thesaurus Nal: |
Salt stress; Transcriptomics. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225681/1/Genes-highly-overexpressed-in-salt-stressed-2021.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
22/11/2017 |
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Data da última atualização: |
22/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; CARVALHO, E. J. M.; MACHADO, W. F.; SANTOS, D. B. dos; OLIVEIRA, D. R. de. |
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Afiliação: |
RAIMUNDO COSME DE OLIVEIRA JUNIOR, CPATU; EDUARDO JORGE MAKLOUF CARVALHO, CPATU; Willey Ferreira Machado, MESTRANDO UFOPA; Darlisson Bentes dos Santos, ULBRA; Daniel Rocha de Oliveira, ULBRA. |
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Título: |
Estoques de nitrogênio e carbono sob diferentes sistemas de uso e manejo de um Latossolo amarelo no município de Paragominas. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. |
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Páginas: |
p. 135-138. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Trata-se de dois elementos chaves que potencialmente atuam para acelerar as mudanças climáticas globais. A região amazônica apresenta a problemática da conversão de cobertura vegetal de extensas áreas, em prol da pecuária e da agricultura e sem o manejo apropriado de produção, o que tem gerado a rápida degradação dos solos desses ambientes. O referido estudo tem como objetivo verificar os teores de nitrogênio e carbono sob diferentes sistemas de manejo em Latossolo Amarelo, no município de Paragominas, estado do Pará. A amostragem foi realizada sob quatro sistemas diferentes de manejo do solo: sistema de plantio direto com soja; área de plantio convencional com soja; área de pastagem, com a presença de gado e, capoeira. Para cada sistema foram coletadas amostras de solo nas profundidades 0-10 e 10-20. O carbono orgânico (C.org) e o nitrogênio foram determinados segundo a metodologia descrita no Manual da EMBRAPA. O carbono orgânico, o sistema de plantio direto apresentou valores significantemente mais elevados do que os demais, com 25,3 g kg-1. Concluiu-se que o sistema de plantio direto acumula mais carbono do que os outros sistemas estudados, especialmente na camada mais superficial (0-10cm) e apresentou menor valor para densidade global. |
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Thesagro: |
Carbono; Manejo; Nitrogênio; Solo. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/167274/1/ANAIS-ULBRA2017-11.pdf
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Marc: |
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520 $aTrata-se de dois elementos chaves que potencialmente atuam para acelerar as mudanças climáticas globais. A região amazônica apresenta a problemática da conversão de cobertura vegetal de extensas áreas, em prol da pecuária e da agricultura e sem o manejo apropriado de produção, o que tem gerado a rápida degradação dos solos desses ambientes. O referido estudo tem como objetivo verificar os teores de nitrogênio e carbono sob diferentes sistemas de manejo em Latossolo Amarelo, no município de Paragominas, estado do Pará. A amostragem foi realizada sob quatro sistemas diferentes de manejo do solo: sistema de plantio direto com soja; área de plantio convencional com soja; área de pastagem, com a presença de gado e, capoeira. Para cada sistema foram coletadas amostras de solo nas profundidades 0-10 e 10-20. O carbono orgânico (C.org) e o nitrogênio foram determinados segundo a metodologia descrita no Manual da EMBRAPA. O carbono orgânico, o sistema de plantio direto apresentou valores significantemente mais elevados do que os demais, com 25,3 g kg-1. Concluiu-se que o sistema de plantio direto acumula mais carbono do que os outros sistemas estudados, especialmente na camada mais superficial (0-10cm) e apresentou menor valor para densidade global.
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700 1 $aMACHADO, W. F.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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