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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
26/11/2018 |
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Data da última atualização: |
26/11/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ESCOBAR, J. A. D.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F.; BARBOSA, M. H. P.; NUNES, A. C. P.; ALVES, R. S.; NASCIMENTO, M. |
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Afiliação: |
José Alfredo Diaz ESCOBAR, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Camila Ferreira AZEVEDO, UFV; Fabyano Fonseca SILVA, UFV; Márcio Henrique Pereira BARBOSA, UFV; Andrei Caíque Pires NUNES, UFV; Rodrigo Silva ALVES, UFV; Moysés NASCIMENTO, UFV. |
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Título: |
Teoria de valores extremos e tamanho amostral para o melhoramento genético do quantil máximo em plantas. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Biometria, Lavras, v. 36, n. 1, p. 108-127, 2018. |
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DOI: |
10.28951/rbb.v36i1.129 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho objetivou propor e avaliar uma metodologia estatística para o melhoramento genético do valor extremo das distribuições de caracteres quantitativos. Essa abordagem baseia-se nos quantis superiores da GEV (Distribuição de Valores Extremos Generalizada) e da DEV (Distribuições de Valores Extremos) dos valores genotípicos individuais entre e dentro de famílias de plantas ou animais. Usando bases de dados reais e simulados de progênies ou famílias de cana-de-açúcar, distribuições de valores extremos (Gumbel, Fréchet e Weibull) foram ajustadas aos máximos das famílias. Simulações estocásticas e reamostragens de dados experimentais indicaram consistentemente que a avaliação de 200 famílias maximiza a eficiência do melhoramento visando à seleção de indivíduos extremos. A distribuição Weibull foi a de melhor ajuste (seguida pela Gumbel) e indicou aumento da eficiência seletiva de 1,10 (ganho de 10%) quando se passa de 20 para 100 indivíduos por família e de 1,12 (ganho de 2%) quando se passa de 100 para 200 indivíduos. Esses números são aproximadamente constantes independentemente do número de famílias avaliadas. Uma boa opção prática seria a avaliação de 200 famílias com 100 indivíduos, num total de 20000 indivíduos. A metodologia é adequada também para classificar famílias pela capacidade de geração de indivíduos superiores e informar os tamanhos amostrais em cada família para capturar esses indivíduos. |
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Palavras-Chave: |
Distribuições de probabilidade; Indivíduo extremo; Número de famílias; Tamanho de família. |
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Thesagro: |
Propagação Vegetativa. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/187015/1/2018-M.Deon-RBB-Teoria.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
03/12/2021 |
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Data da última atualização: |
03/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
OGBONNA, A. C.; ANDRADE, L. R. B. de; MUELLER, L. A.; OLIVEIRA, E. J. de; BAUCHET, G. J. |
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Afiliação: |
ALEX C. OGBONNA, Cornell University; LUCIANO ROGERIO BRAATZ DE ANDRADE; LUKAS A. MUELLER, Cornell University; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; GUILLAUME J. BAUCHET, Boyce Thompson Institute for Plant Research. |
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Título: |
Comprehensive genotyping of a Brazilian cassava (Manihot esculenta Crantz) germplasm bank: insights into diversification and domestication. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v.134, P.1343-1362, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cassava (Manihot esculenta Crantz) is a major staple root crop of the tropics, originating from the Amazonian region. In this study, 3354 cassava landraces and modern breeding lines from the Embrapa Cassava Germplasm Bank (CGB) were characterized. All individuals were subjected to genotyping-by-sequencing (GBS), identifying 27,045 single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Identity-by-state and population structure analyses revealed a unique set of 1536 individuals and 10 distinct genetic groups with heterogeneous linkage disequilibrium (LD). On this basis, a density of 1300?4700 SNP markers were selected for large-effect quantitative trait loci (QTL) detection. Identified genetic groups were further characterized for population genetics parameters including minor allele frequency (MAF), observed heterozygosity (Ho), effective population size estimate (Ne?) and polymorphism information content (PIC). Selection footprints and introgressions of M. glaziovii were detected. Spatial population structure analysis revealed five ancestral populations related to distinct Brazilian ecoregions. Estimation of historical relationships among identified populations suggests an early population split from Amazonian to Atlantic forest and Caatinga ecoregions and active gene flows. This study provides a thorough genetic characterization of ex situ germplasm resources from cassava?s center of origin, South America, with results shedding light on Brazilian cassava characteristics and its biogeographical landscape. These findings support and facilitate the use of genetic resources in modern breeding programs including implementation of association mapping and genomic selection strategies. MenosCassava (Manihot esculenta Crantz) is a major staple root crop of the tropics, originating from the Amazonian region. In this study, 3354 cassava landraces and modern breeding lines from the Embrapa Cassava Germplasm Bank (CGB) were characterized. All individuals were subjected to genotyping-by-sequencing (GBS), identifying 27,045 single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Identity-by-state and population structure analyses revealed a unique set of 1536 individuals and 10 distinct genetic groups with heterogeneous linkage disequilibrium (LD). On this basis, a density of 1300?4700 SNP markers were selected for large-effect quantitative trait loci (QTL) detection. Identified genetic groups were further characterized for population genetics parameters including minor allele frequency (MAF), observed heterozygosity (Ho), effective population size estimate (Ne?) and polymorphism information content (PIC). Selection footprints and introgressions of M. glaziovii were detected. Spatial population structure analysis revealed five ancestral populations related to distinct Brazilian ecoregions. Estimation of historical relationships among identified populations suggests an early population split from Amazonian to Atlantic forest and Caatinga ecoregions and active gene flows. This study provides a thorough genetic characterization of ex situ germplasm resources from cassava?s center of origin, South America, with results shedding light on Brazilian cassava characteristics and its biogeogra... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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520 $aCassava (Manihot esculenta Crantz) is a major staple root crop of the tropics, originating from the Amazonian region. In this study, 3354 cassava landraces and modern breeding lines from the Embrapa Cassava Germplasm Bank (CGB) were characterized. All individuals were subjected to genotyping-by-sequencing (GBS), identifying 27,045 single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Identity-by-state and population structure analyses revealed a unique set of 1536 individuals and 10 distinct genetic groups with heterogeneous linkage disequilibrium (LD). On this basis, a density of 1300?4700 SNP markers were selected for large-effect quantitative trait loci (QTL) detection. Identified genetic groups were further characterized for population genetics parameters including minor allele frequency (MAF), observed heterozygosity (Ho), effective population size estimate (Ne?) and polymorphism information content (PIC). Selection footprints and introgressions of M. glaziovii were detected. Spatial population structure analysis revealed five ancestral populations related to distinct Brazilian ecoregions. Estimation of historical relationships among identified populations suggests an early population split from Amazonian to Atlantic forest and Caatinga ecoregions and active gene flows. This study provides a thorough genetic characterization of ex situ germplasm resources from cassava?s center of origin, South America, with results shedding light on Brazilian cassava characteristics and its biogeographical landscape. These findings support and facilitate the use of genetic resources in modern breeding programs including implementation of association mapping and genomic selection strategies.
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773 $tTheoretical and Applied Genetics$gv.134, P.1343-1362, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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