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| Registros recuperados : 50 | |
| 21. |  | LOUREIRO, M, de F.; MARIANOWSKI, T.; NICOLÁS, M. F.; ELIAS NETO, N.; HUNGRIA, M. Uso de marcadores moleculares para la identificación de especies de Discolobium nativas del Pantanal Matogrosense de Brasil. In: REUNIÓN LATINOAMERICANA DE RHIZOBIOLOGIA, 21.; CONGRESO NACIONAL DE LA FIJACIÓN BIOLÓGICA DE NITRÓGENO, 6., 2002. Cocoyoc. Memorias... [S.l.]: Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno; Universidade Nacional Autónoma de México, 2002. p. 91.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 23. | | SOUZA, R. C. de; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLAS, M. F.; HUNGRIA, M. Biodiversidade de procariotos em solo sob plantio direto e plantio convencional em rotação ou sucessão de culturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 365-1.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 24. | | ELIAS NETO, N.; LOUREIRO, M. de F.; NICOLÁS, M. F.; MARIANOWSKI, T.; TORRES, A. R.; HUNGRIA, M. Identification of Discolobium species indigenous to the Brazilian Pantanal ecosystem by microsatellite (SSRs) markers. Semina, Ciência Agrárias, Londrina, v. 33, Supl. 1, p. 3017-3022, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 25. | | NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M.; ARIAS, C. A. A.; MARIANOWSKI, T.; CAMPO, R. J.; NODARI, R, O. Desempenho simbiótico de cultivares de soja e busca de marcadores moleculares relacionados à fixação biológica do nitrogênio (04.2001.338-2). In: HOFFMANN-CAMPO, C. B.; SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2002: microbiologia de solos. Londrina: Embrapa Soja, 2003. p. 59-75. (Embrapa Soja. Documentos, 216).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 26. | | HUNGRIA, M.; NICOLAS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. R. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 3, n. 1, p. 102-116, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 27. | | HUNGRIA, M.; NICOLÁS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. T. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, v. 3, n. 1, p. 102-116, Mar. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 28. | | MEDEIROS, J. D.; CANTAO, M. E.; CESAR, D. E.; NICOLÁS, M. F.; DINIZ, C. G.; SILVA, V. L.; VASCONCELOS, A. T. R. de; COELHO, C. M. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, SP, v. 47, n. 4, p. 835-845, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 29. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico e bioprospecção de genes de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (SEMIA 4080) utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 30. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 98-103. (Embrapa Soja. Documentos, 268).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 31. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 156-161. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 32. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NÍCOLAS, M. F.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe SEMIA 5079 (=CPAC 15) de Bradyrhizobium japonicum, recomendada para inoculantes comerciais na cultura da soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 33. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; ANDRE, E.; HUNGRIA, M. Panorama genômico de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (Semia 4080). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 50-55. (Embrapa Soja. Documentos, 268).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 35. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; SOUZA, L. G. R. C.; HUNGRIA, M. Sequênciamento genômico e bioprospecção de genes de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (SEMIA 4080) utilizada em inoculantes comerciais para a cultura do feijoeiro. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 116-121. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 36. | | GODOY, L. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; NICOLÁS, M. F.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M. Genomic panorama of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, a commercial inoculant strain largely established in Brazilian soils and belonging to the same serogroup as USDA 123. Soil Biology & Biochemistry, v. 40, n. 11, p. 2743-2753, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 37. | | HUNGRIA, M.; CAMPO, R. J.; CHUEIRE, L. M. O.; MENDES, I. C.; FRANCHINI, J. C.; ANDRADE, D. S.; NICOLÁS, M. F.; GRANGE, L.; LOUREIRO, M. de F. Aspectos agronômicos da fixação simbiótica do nitrogênio no Brazil. In: REUNIÓN LATINOAMERICANA DE RHIZOBIOLOGIA, 21.; CONGRESO NACIONAL DE LA FIJACIÓN BIOLÓGICA DE NITRÓGENO, 6., 2002. Cocoyoc. Memorias... [S.l.]: Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno; Universidade Nacional Autónoma de México, 2002. p. 53.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 38. | | BELLINI, R. G.; CORONADO, M. A.; PASCHOAL, A. R.; REGO, T. G. do; HUNGRIA, M.; VASCONCELOS, A. T. R. de; NICOLAS, M. F. Structural analysis of a novel N-carbamoyl-D-amino acid amidohydrolase from a Brazilian Bradyrhizobium japonicum strain: In silico insights by molecular modelling, docking and molecular dynamics. Journal of Molecular Graphics & Modelling, v. 86, p. 35-42, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 39. | | BINDE, D. R.; HUNGRIA, M.; CHUEIRE, L. M. de O.; LUCAS, I. H.; NICOLÁS, M. F.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; MARTINEZ-ROMERO, E.; BARCELLOS, F. G.; SILVA, M. F. da. Análise estrutural do plasmídio simbiótico de Rhizobium tropici CFN299. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 102-105. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 40. | | PINTO, F. G. S.; CHUEIRE, L. M. O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; ALMEIDA, L. G. P.; SOUZA, R. C.; MENNA, P.; BARCELLOS, F. G.; MEGÍAS, M.; HUNGRIA, M. Novel genes related to nodulation, secretion systems, and surface structures revealed by a genome draft of Rhizobium tropici strain PRF 81. Functional & Integrative Genomics, Heidelberg, v. 9, n. 2, p. 263-270, May 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| Registros recuperados : 50 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
11/02/2009 |
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Data da última atualização: |
03/08/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
Internacional - A |
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Autoria: |
GODOY, L. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; NICOLÁS, M. F.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M. |
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Afiliação: |
Leandro Pereira Godoy, CNPSo/UEL; Ana Tereza Ribeiro Vasconcelos Laboratório Nacional de Computação Científica Petrópolis RJ; Ligia Maria Oliveira Chueire, CNPSo; Rangel Celso Souza Laboratório Nacional de Computação Científica Petrópolis RJ; Marisa Fabiana Nicolás Laboratório Nacional de Computação Científica Petrópolis RJ; Fernando Gomes Barcellos, CNPS; Mariangela Hungria, CNPSo. |
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Título: |
Genomic panorama of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, a commercial inoculant strain largely established in Brazilian soils and belonging to the same serogroup as USDA 123. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Soil Biology & Biochemistry, v. 40, n. 11, p. 2743-2753, 2008. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Of the many genomes of prokaryotes that have been sequenced, most are pathogenic organisms and very few of agriculturally beneficial bacteria. Soybean, the most important cash crop in Brazil, can provide its need for nitrogen through a symbiosis with exotic strains of bradyrhizobia. Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (equates to SEMIA 5079, the same serogroup as USDA 123), which is a highly competitive commercial strain applied to soybean crops since the early 1990s, is now established on several millions of hectares. As financial resources for sequencing genomes are still very limited in developing countries, a panoramic genomic view of CPAC 15 was generated. A total of 4328 shotgun reads resulted in 2,046,740 bp with a phred score_ 20; the assemblage resulted in 1106 phrap contigs scattered by 69 scaffolds and 966 isolated contigs, with an average of 2.5 reads per contig, covering approximately 13% of the genome. Annotation identified 1371 coding DNA sequences (CDSs), 53% with putative known functions, 23% encoding conserved hypothetical and 24% hypothetical genes, representing about 16% of the estimated putative genes. Several comparisons - on COG and KEGG databases, tRNAs, transposases, Gþ C content of CPAC 15 with the complete genome of B. japonicum strain USDA 110 indicated a successful coverage of the whole genome. However, the two strains were surprisingly different, as at least 35% of the CDS of CPAC 15 shows higher similarity to microorganisms other than strain USDA 110. Several new putative genes and others with low similarity to USDA 110, were identified. These were related to nodulation, interaction with the host plant and adaptation, e.g., nodB, nodW, ndvA, effector nopP, genes of secretion systems, transporters and environmentally related genes. MenosOf the many genomes of prokaryotes that have been sequenced, most are pathogenic organisms and very few of agriculturally beneficial bacteria. Soybean, the most important cash crop in Brazil, can provide its need for nitrogen through a symbiosis with exotic strains of bradyrhizobia. Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (equates to SEMIA 5079, the same serogroup as USDA 123), which is a highly competitive commercial strain applied to soybean crops since the early 1990s, is now established on several millions of hectares. As financial resources for sequencing genomes are still very limited in developing countries, a panoramic genomic view of CPAC 15 was generated. A total of 4328 shotgun reads resulted in 2,046,740 bp with a phred score_ 20; the assemblage resulted in 1106 phrap contigs scattered by 69 scaffolds and 966 isolated contigs, with an average of 2.5 reads per contig, covering approximately 13% of the genome. Annotation identified 1371 coding DNA sequences (CDSs), 53% with putative known functions, 23% encoding conserved hypothetical and 24% hypothetical genes, representing about 16% of the estimated putative genes. Several comparisons - on COG and KEGG databases, tRNAs, transposases, Gþ C content of CPAC 15 with the complete genome of B. japonicum strain USDA 110 indicated a successful coverage of the whole genome. However, the two strains were surprisingly different, as at least 35% of the CDS of CPAC 15 shows higher similarity to microorganisms other than strai... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Solo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02467naa a2200205 a 4500
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005 2017-08-03
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100 1 $aGODOY, L. P.
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260 $c2008
520 $aOf the many genomes of prokaryotes that have been sequenced, most are pathogenic organisms and very few of agriculturally beneficial bacteria. Soybean, the most important cash crop in Brazil, can provide its need for nitrogen through a symbiosis with exotic strains of bradyrhizobia. Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (equates to SEMIA 5079, the same serogroup as USDA 123), which is a highly competitive commercial strain applied to soybean crops since the early 1990s, is now established on several millions of hectares. As financial resources for sequencing genomes are still very limited in developing countries, a panoramic genomic view of CPAC 15 was generated. A total of 4328 shotgun reads resulted in 2,046,740 bp with a phred score_ 20; the assemblage resulted in 1106 phrap contigs scattered by 69 scaffolds and 966 isolated contigs, with an average of 2.5 reads per contig, covering approximately 13% of the genome. Annotation identified 1371 coding DNA sequences (CDSs), 53% with putative known functions, 23% encoding conserved hypothetical and 24% hypothetical genes, representing about 16% of the estimated putative genes. Several comparisons - on COG and KEGG databases, tRNAs, transposases, Gþ C content of CPAC 15 with the complete genome of B. japonicum strain USDA 110 indicated a successful coverage of the whole genome. However, the two strains were surprisingly different, as at least 35% of the CDS of CPAC 15 shows higher similarity to microorganisms other than strain USDA 110. Several new putative genes and others with low similarity to USDA 110, were identified. These were related to nodulation, interaction with the host plant and adaptation, e.g., nodB, nodW, ndvA, effector nopP, genes of secretion systems, transporters and environmentally related genes.
650 $aSolo
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700 1 $aCHUEIRE, L. M. O.
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700 1 $aHUNGRIA, M.
773 $tSoil Biology & Biochemistry$gv. 40, n. 11, p. 2743-2753, 2008.
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Embrapa Soja (CNPSO) |
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