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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
Data corrente: |
03/11/2022 |
Data da última atualização: |
12/12/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KAUFFMANN, C. M.; BOARI, A. de J.; SILVA, J. M. F.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
Afiliação: |
CATERYNNE MELO KAUFFMANN, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; JOÃO MARCOS FAGUNDES SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ROSANA BLAWID, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
Título: |
Complete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
A cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed. |
Palavras-Chave: |
Patchouli. |
Thesagro: |
Genoma; Vírus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 01523naa a2200217 a 4500 001 2147984 005 2022-12-12 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00705-022-05594-5$2DOI 100 1 $aKAUFFMANN, C. M. 245 $aComplete genome sequence of patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus, a new cytorhabdovirus infecting patchouli plants in Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aA cytorhabdovirus, tentatively named "patchouli chlorosis-associated cytorhabdovirus" (PCaCV), was identified in a patchouli plant, using high-throughput sequencing, and its genome sequence was confirmed by Sanger sequencing. The PCaCV genome consists of 12,913 nucleotides and contains six open reading frames in the order 3'-N-P'-P-P3-M-(G)-L-5'. The glycoprotein gene was found to contain stop codons in the coding frame; hence, this gene is considered defective. PCaCV is most closely related to tomato yellow mottle-associated virus, sharing 61.1% nucleotide sequence identity in the complete genome and 73.9% amino acid sequence identity in the L protein. These data suggest that PCaCV should be considered a new member of the genus Cytorhabdovirus, and the binomial species name "Cytorhabdovirus patchoulii" is proposed. 650 $aGenoma 650 $aVírus 653 $aPatchouli 700 1 $aBOARI, A. de J. 700 1 $aSILVA, J. M. F. 700 1 $aBLAWID, R. 700 1 $aNAGATA, T. 773 $tArchives of Virology$gv. 167, n. 12, p. 2817-2820, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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URL |
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Registros recuperados : 6 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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5. |  | ANDRADE, L. R. M. de; AQUINO, F. de G.; MIRANDA, Z. de J. G.; ECHEVARRIA, G.; BECQUER, T.; OLIVEIRA FILHO, E. C. de; NASCIMENTO, C. T. C.; VIANA, R. M. Assessment of Ni levels and plant species diversity in ultramafic soils unde Ni mining in Barro Alto (Go) - Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON SERPENTINE ECOLOGY, 7., 2011, Coimbra. Abrastract book... Coimbra: University of Coimbra, 2011. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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6. |  | OLIVEIRA, C. E. B.; ZART, S. C.; ATAÍDE, M. V. R. de; HERTEL JÚNIOR, C. R.; NOGUEIRA, A. C.; CARVALHO, M. A.; NASCIMENTO, C. T. C.; ANDRADE, L. R. M. de; AQUINO, F. de G. Estratégias para a recuperação de áreas degradadas pela mineração de níquel: avaliação do desenvolvimento de espécies vegetais condicionadoras de solo em substratos ultramáficos. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE ECOLOGIA, 1.; CONGRESSO DE ECOLOGIA DO BRASIL, 11., 2013, Porto Seguro, BA. Anais... Porto Seguro: SEB, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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