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Biblioteca(s): | Embrapa Pecuária Sudeste.
Tipo da produção científica: | Resumo em Anais de Congresso
Data corrente: | 26/12/2008
Data da última atualização: | 20/10/2014
Autoria: | CARVALHO, F. M.; BARIONI JUNIOR, W.; NAKATA, L. C.; REGITANO, L. C. de A.
Afiliação: | F. M. Carvalho, Pós-graduando UFSCar; WALDOMIRO BARIONI JUNIOR, CPPSE; L. C. Nakata, UFSCar; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título: | Avaliação de testes estatísticos em dados de Q-PCR.
Ano de publicação: | 2008
Fonte/Imprenta: | In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008
Páginas: | p. 410
Idioma: | Português
Conteúdo: | A Q-PCR (Quantitative Polymerase Chain Reaction) é uma técnica que permite quantificar de forma precisa, especifica e indireta a quantidade de RNA mensageiro presente em uma determinada amostra. A Q-PCR apresenta vantagens metodológicas para a quantificação do RNA mensageiro quando comparada às técnicas de Northern Blot e Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, facilitando estudos de expressão gênica diferenciada. No entanto, experimentos de Q-PCR freqüentemente apresentam limitações amostrais (6= N =12) e são analisados por testes estatísticos tradicionais (paramétricos) sem a devida verificação da condição de normalidade da variável resposta e de homogeneidade das variâncias dos grupos experimentais, exigidas nesses testes. O presente trabalho avaliou quatro testes estatísticos de comparação de médias e/ou medianas, entre os grupos controle(C) e tratado (T), com objetivo de propor o teste mais adequado para estudar expressão gênica com dados de Q-PCR. O experimento foi realizado na Embrapa Pecuária Sudeste ? São Carlos, Brasil, utilizando 10 bezerros Nelore (Bos indicus), divididos aleatoriamente em dois grupos de cinco animais: grupo tratado (T) infestado artificialmente com carrapatos Rhipicephalus (Boophilus) microplus e grupo controle (C) livre de infestação. Os dados foram submetidos a quatro diferentes testes estatísticos, sendo o primeiro paramétrico (ANOVA com teste t) e os demais não-paramétricos (teste de mediana, boot strap, e Rest.). Quando o gene referência (gene de expressão constitutiva) apresentou pequena variação entre os tratamentos (0,6 = P = 1) os testes estatísticos, com exceção do teste de mediana, apresentaram valores de probabilidade confiáveis e semelhantes. Porém, quando o gene referência apresentou variação entre os tratamentos (P = 0,6) todos os testes apresentaram resultados distintos, e o teste Rest©, não-paramétrico, de comparações das médias e com ajustes para eficiência de amplificação do primer e valores de probabilidade do gene referência, foi o mais adequado para analisar dados de Q-PCR.
Palavras-Chave: | Bovinos; Estatística não paramétrica; Q-PCR.
Thesagro: | Boophilus Microplus; Bos Indicus.
Thesaurus Nal: | Rhipicephalus.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/110193/1/PROCILCdeA2006.00198.PDF
Registro original: | Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE)
Exemplares: | CPPSE - (18163-1) - UPC - RA - -- - PROCI-2008.00205 - CAR - 2008.00205 - DIS